MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 336

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187073	ACT	2	6	71	76	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NT_187073	AG	3	6	81	86	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187073	CCTG	2	8	250	257	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NT_187073	CCGT	2	8	285	292	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NT_187073	TTA	2	6	301	306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187073	ATT	2	6	353	358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187073	AAATT	2	10	2220	2229	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NT_187073	CTG	2	6	2288	2293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NT_187073	ATT	2	6	3484	3489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187073	ACAAA	2	10	3507	3516	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NT_187073	AGTG	2	8	3535	3542	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187073	AGA	2	6	3559	3564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187073	TGC	2	6	4454	4459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NT_187073	GCG	2	6	5287	5292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NT_187073	TCG	2	6	5306	5311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NT_187073	GAC	2	6	6711	6716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NT_187073	AAT	2	6	7527	7532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187073	ATC	2	6	9554	9559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NT_187073	GCA	2	6	9575	9580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NT_187073	CCTG	2	8	9690	9697	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NT_187073	CCGT	2	8	9725	9732	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NT_187073	A	7	7	9779	9785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187073	T	9	9	9811	9819	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187073	CAG	2	6	9825	9830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NT_187073	CTT	2	6	9901	9906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NT_187073	AAT	2	6	14001	14006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NT_187073	TATT	2	8	16235	16242	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NT_187073	GGA	2	6	16248	16253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NT_187073	ATAA	2	8	16276	16283	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NT_187073	ATT	2	6	16308	16313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NT_187073	TAT	2	6	16328	16333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NT_187073	TCG	2	6	16336	16341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NT_187073	TTG	2	6	16350	16355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187073	T	6	6	16370	16375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NT_187073	ATT	2	6	16381	16386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NT_187073	ATT	2	6	16430	16435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NT_187073	TAAT	2	8	16457	16464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NT_187073	TTGTT	2	10	16480	16489	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NT_187073	T	6	6	16496	16501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NT_187073	TA	3	6	16526	16531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NT_187073	ATT	2	6	16549	16554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NT_187073	ATTT	2	8	21404	21411	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NT_187073	AT	3	6	21417	21422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NT_187073	ATA	2	6	21425	21430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NT_187073	AAT	2	6	22344	22349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NT_187073	TAA	2	6	22472	22477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NT_187073	CGG	2	6	23064	23069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NT_187073	AGA	2	6	23203	23208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NT_187073	GCG	2	6	23211	23216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NT_187073	TGA	2	6	24167	24172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NT_187073	AAGA	2	8	24183	24190	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NT_187073	TAA	2	6	24220	24225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NT_187073	TAG	2	6	24265	24270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NT_187073	GGC	2	6	28808	28813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NT_187073	TGG	2	6	28946	28951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NT_187073	GTA	2	6	28962	28967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NT_187073	ATT	2	6	29429	29434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NT_187073	TGG	2	6	34098	34103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NT_187073	GAA	2	6	34128	34133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NT_187073	TAA	2	6	34157	34162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NT_187073	GCA	2	6	34257	34262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NT_187073	ATA	2	6	34303	34308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NT_187073	T	8	8	34310	34317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NT_187073	ACG	2	6	34372	34377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NT_187073	T	6	6	34400	34405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NT_187073	ATTG	2	8	34484	34491	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NT_187073	AGT	2	6	34515	34520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NT_187073	TGG	2	6	34552	34557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NT_187073	AAT	2	6	35119	35124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NT_187073	TGG	2	6	35130	35135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NT_187073	GAA	2	6	35160	35165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NT_187073	TAA	2	6	35189	35194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NT_187073	TGC	3	9	35288	35296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NT_187073	ATA	2	6	35335	35340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NT_187073	TC	3	6	35349	35354	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NT_187073	CAT	2	6	35365	35370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NT_187073	TCAG	2	8	35372	35379	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NT_187073	TTC	2	6	35425	35430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NT_187073	A	6	6	35486	35491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NT_187073	GCT	2	6	35522	35527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NT_187073	TGG	2	6	35554	35559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NT_187073	CTG	2	6	35583	35588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NT_187073	AAT	2	6	35590	35595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NT_187073	TAT	2	6	35596	35601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NT_187073	CGGA	2	8	35605	35612	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NT_187073	TA	3	6	36914	36919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NT_187073	T	7	7	36951	36957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NT_187073	TA	4	8	37006	37013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NT_187073	TCA	2	6	37019	37024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NT_187073	GAAT	2	8	37026	37033	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NT_187073	TGG	2	6	37036	37041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NT_187073	T	6	6	37060	37065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NT_187073	ATT	2	6	37125	37130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NT_187073	G	6	6	37184	37189	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
95	NT_187073	TC	3	6	37216	37221	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NT_187073	GTT	2	6	37284	37289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NT_187073	TCA	2	6	37301	37306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NT_187073	TTA	2	6	37366	37371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NT_187073	TTC	2	6	37385	37390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NT_187073	ATT	2	6	45047	45052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NT_187073	TTA	2	6	45091	45096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NT_187073	AAT	2	6	45751	45756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NT_187073	TTAAAA	2	12	45761	45772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NT_187073	A	6	6	45790	45795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NT_187073	TTTGT	2	10	45798	45807	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NT_187073	TTG	2	6	45810	45815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NT_187073	GTT	2	6	45835	45840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NT_187073	GGA	2	6	45888	45893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NT_187073	AGG	2	6	45910	45915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NT_187073	A	6	6	45981	45986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NT_187073	TTCTA	2	10	45987	45996	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NT_187073	A	7	7	46071	46077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NT_187073	TAA	2	6	46094	46099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NT_187073	ATAA	2	8	46108	46115	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NT_187073	GAAA	2	8	46149	46156	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NT_187073	AAT	2	6	46176	46181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NT_187073	GCG	2	6	46219	46224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NT_187073	GCG	2	6	46226	46231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NT_187073	ATA	2	6	46662	46667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NT_187073	ATGG	2	8	46684	46691	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NT_187073	GGA	2	6	46752	46757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NT_187073	TAAT	2	8	46761	46768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NT_187073	TGCT	2	8	46770	46777	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NT_187073	AACG	2	8	46779	46786	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NT_187073	TTCC	2	8	46821	46828	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NT_187073	TA	3	6	46847	46852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NT_187073	T	6	6	46913	46918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NT_187073	TA	3	6	46980	46985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NT_187073	A	7	7	47006	47012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NT_187073	AATAAA	2	12	47053	47064	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NT_187073	TTG	2	6	47126	47131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NT_187073	GTA	2	6	47171	47176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NT_187073	ACG	2	6	47527	47532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NT_187073	AACT	2	8	50357	50364	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NT_187073	TGA	2	6	50400	50405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NT_187073	ATT	2	6	50458	50463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NT_187073	CAT	2	6	50495	50500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NT_187073	TA	3	6	50557	50562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NT_187073	A	6	6	50566	50571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NT_187073	GGC	2	6	50596	50601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NT_187073	ATA	2	6	50606	50611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NT_187073	ATT	2	6	50663	50668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NT_187073	TAT	2	6	50669	50674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NT_187073	A	8	8	50706	50713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NT_187073	TAA	2	6	50730	50735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NT_187073	GAAA	2	8	50797	50804	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NT_187073	TTTA	2	8	50827	50834	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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290	NT_187073	CGC	2	6	64913	64918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
291	NT_187073	CTC	2	6	65712	65717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
292	NT_187073	AAT	2	6	65750	65755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NT_187073	A	6	6	65756	65761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NT_187073	CTTG	2	8	68270	68277	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
295	NT_187073	AGG	2	6	68279	68284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
296	NT_187073	TGA	2	6	68297	68302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
297	NT_187073	ACA	2	6	68354	68359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
298	NT_187073	TTG	2	6	68369	68374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
299	NT_187073	GTTG	2	8	69106	69113	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
300	NT_187073	TCC	2	6	69159	69164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
301	NT_187073	ATT	2	6	69188	69193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
302	NT_187073	AC	3	6	70792	70797	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
303	NT_187073	CAC	2	6	70858	70863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
304	NT_187073	GT	3	6	70885	70890	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
305	NT_187073	CGC	2	6	70907	70912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
306	NT_187073	TCG	2	6	70915	70920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
307	NT_187073	GC	3	6	70965	70970	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
308	NT_187073	TTCTCA	2	12	72141	72152	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
309	NT_187073	AGG	2	6	72163	72168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
310	NT_187073	TCA	2	6	72170	72175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
311	NT_187073	T	6	6	72262	72267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
312	NT_187073	GGT	2	6	75669	75674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
313	NT_187073	GTA	2	6	75763	75768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
314	NT_187073	CAG	2	6	76361	76366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
315	NT_187073	AGG	2	6	76434	76439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
316	NT_187073	CTG	2	6	78154	78159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
317	NT_187073	A	6	6	79303	79308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
318	NT_187073	AC	3	6	82002	82007	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
319	NT_187073	AGC	2	6	82040	82045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
320	NT_187073	TAT	2	6	82080	82085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
321	NT_187073	TAAT	2	8	82135	82142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
322	NT_187073	T	6	6	82157	82162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
323	NT_187073	CCGT	2	8	82171	82178	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
324	NT_187073	A	6	6	84188	84193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
325	NT_187073	AAAG	2	8	84239	84246	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
326	NT_187073	TC	3	6	84298	84303	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
327	NT_187073	GGC	2	6	84675	84680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
328	NT_187073	TA	3	6	84746	84751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
329	NT_187073	AATA	2	8	84759	84766	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
330	NT_187073	TA	3	6	84765	84770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
331	NT_187073	TAC	2	6	84781	84786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
332	NT_187073	GAT	2	6	84811	84816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
333	NT_187073	AAAAT	2	10	84861	84870	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
334	NT_187073	TGTT	2	8	84922	84929	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
335	NT_187073	ATA	2	6	84983	84988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
336	NT_187073	CTT	2	6	85058	85063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.