MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 473

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187072	CAGC	2	8	21	28	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NT_187072	CAG	2	6	37	42	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NT_187072	CCG	2	6	45	50	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NT_187072	GGC	2	6	51	56	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NT_187072	CACCGG	2	12	106	117	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6	NT_187072	GCCG	2	8	145	152	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NT_187072	CCG	2	6	303	308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NT_187072	CTG	2	6	313	318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NT_187072	CCA	2	6	366	371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NT_187072	T	6	6	418	423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187072	GGA	2	6	550	555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187072	CAG	2	6	598	603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NT_187072	GGT	2	6	622	627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NT_187072	T	6	6	664	669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NT_187072	GGC	2	6	691	696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NT_187072	CAG	2	6	754	759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NT_187072	CCAG	2	8	774	781	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NT_187072	TGG	2	6	804	809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187072	GC	3	6	834	839	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NT_187072	CG	3	6	931	936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NT_187072	CAA	2	6	939	944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NT_187072	CCA	2	6	951	956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NT_187072	CAT	2	6	957	962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NT_187072	GCA	3	9	999	1007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NT_187072	T	6	6	1033	1038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NT_187072	CGC	2	6	1101	1106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NT_187072	TCA	2	6	1136	1141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NT_187072	GCA	3	9	1145	1153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NT_187072	GCA	2	6	1158	1163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NT_187072	ATC	2	6	1165	1170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NT_187072	GAC	2	6	1216	1221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NT_187072	TC	3	6	1246	1251	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NT_187072	ACG	2	6	1522	1527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NT_187072	GAC	2	6	1536	1541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NT_187072	GCC	2	6	1588	1593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NT_187072	CCG	2	6	1641	1646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NT_187072	T	7	7	1651	1657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NT_187072	TAA	2	6	3041	3046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NT_187072	TAAT	2	8	3096	3103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NT_187072	ATT	2	6	3107	3112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NT_187072	TTA	2	6	3114	3119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NT_187072	TTAA	2	8	3127	3134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NT_187072	TCT	2	6	8447	8452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NT_187072	TC	3	6	8458	8463	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NT_187072	GGC	2	6	8555	8560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NT_187072	GC	3	6	8567	8572	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NT_187072	TGTGGT	2	12	9462	9473	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NT_187072	AT	3	6	9502	9507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NT_187072	T	7	7	9521	9527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NT_187072	C	6	6	9529	9534	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
51	NT_187072	ATAA	2	8	9549	9556	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NT_187072	T	6	6	9903	9908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NT_187072	AAAGAA	2	12	9955	9966	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NT_187072	TTA	2	6	9996	10001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NT_187072	TTG	2	6	10023	10028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NT_187072	ATTTG	2	10	10041	10050	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NT_187072	T	6	6	10051	10056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NT_187072	AT	3	6	10066	10071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NT_187072	TGT	2	6	10090	10095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NT_187072	AGTG	2	8	10454	10461	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NT_187072	TAA	2	6	11638	11643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NT_187072	CGG	2	6	14887	14892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NT_187072	T	7	7	14950	14956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NT_187072	TAA	2	6	15012	15017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NT_187072	TTA	2	6	15096	15101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NT_187072	T	6	6	16233	16238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NT_187072	GGC	2	6	16246	16251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NT_187072	CGG	2	6	17140	17145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NT_187072	T	6	6	20017	20022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NT_187072	TAA	2	6	21280	21285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NT_187072	ATTT	2	8	22832	22839	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NT_187072	GTTT	2	8	22859	22866	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NT_187072	TAT	2	6	22870	22875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NT_187072	TTG	2	6	22883	22888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NT_187072	ATG	2	6	22928	22933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NT_187072	T	6	6	22972	22977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NT_187072	ATT	2	6	22984	22989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NT_187072	CCG	2	6	23244	23249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NT_187072	GGC	2	6	26717	26722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NT_187072	AAC	2	6	28184	28189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NT_187072	T	6	6	28446	28451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NT_187072	AAT	2	6	28466	28471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NT_187072	TC	3	6	28474	28479	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NT_187072	CAGG	2	8	28526	28533	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NT_187072	A	8	8	28652	28659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NT_187072	ATG	2	6	28697	28702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NT_187072	CTGC	2	8	29193	29200	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NT_187072	GC	4	8	29199	29206	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NT_187072	A	6	6	29246	29251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NT_187072	CT	3	6	29318	29323	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NT_187072	TAT	2	6	29324	29329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NT_187072	TGA	2	6	29677	29682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NT_187072	ATT	2	6	29717	29722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NT_187072	CCCA	2	8	29773	29780	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
95	NT_187072	ACTC	2	8	29879	29886	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NT_187072	GCC	2	6	29891	29896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NT_187072	ATT	2	6	29911	29916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NT_187072	TAA	2	6	29922	29927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NT_187072	TGT	3	9	29999	30007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NT_187072	ATA	2	6	30017	30022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NT_187072	ATA	2	6	30058	30063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NT_187072	TAT	2	6	30071	30076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NT_187072	TTTC	2	8	30226	30233	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NT_187072	TAA	2	6	30315	30320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NT_187072	T	7	7	30325	30331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NT_187072	TAAAA	2	10	30359	30368	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NT_187072	AAT	2	6	30388	30393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NT_187072	AT	3	6	30421	30426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NT_187072	TAA	2	6	30509	30514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NT_187072	TAA	2	6	30548	30553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NT_187072	TAC	2	6	32510	32515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NT_187072	GC	3	6	32534	32539	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NT_187072	CAA	2	6	32561	32566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NT_187072	GCGCT	2	10	32666	32675	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
115	NT_187072	TCA	2	6	32689	32694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NT_187072	AGCGC	2	10	32733	32742	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
117	NT_187072	AAG	2	6	32751	32756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NT_187072	GCT	2	6	32786	32791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NT_187072	ATC	2	6	32792	32797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NT_187072	CTGG	2	8	32885	32892	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NT_187072	T	6	6	32904	32909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NT_187072	AAT	2	6	32924	32929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NT_187072	TAA	2	6	32968	32973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NT_187072	A	6	6	32972	32977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NT_187072	ATC	2	6	32981	32986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NT_187072	A	6	6	35387	35392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NT_187072	ACT	2	6	35435	35440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NT_187072	CAG	2	6	35478	35483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NT_187072	CGA	2	6	35521	35526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NT_187072	GGC	2	6	35549	35554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NT_187072	T	8	8	35557	35564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NT_187072	TAAT	2	8	35576	35583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NT_187072	GGC	2	6	36078	36083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NT_187072	ATCA	2	8	40543	40550	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NT_187072	TATT	2	8	42920	42927	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NT_187072	CAT	2	6	42932	42937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NT_187072	AATG	2	8	44022	44029	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NT_187072	GGC	2	6	47805	47810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NT_187072	A	6	6	50192	50197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NT_187072	TAA	2	6	50278	50283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NT_187072	AAG	2	6	50299	50304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NT_187072	CCA	2	6	50316	50321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NT_187072	TGA	2	6	50349	50354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NT_187072	GCA	2	6	50396	50401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NT_187072	CCG	2	6	50460	50465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
146	NT_187072	ATC	2	6	50512	50517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NT_187072	CAAA	2	8	50950	50957	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NT_187072	AC	3	6	50964	50969	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NT_187072	GTC	2	6	52192	52197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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186	NT_187072	CAG	2	6	65348	65353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
187	NT_187072	ATA	2	6	65354	65359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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287	NT_187072	T	7	7	120925	120931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NT_187072	ATG	2	6	120957	120962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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293	NT_187072	AT	3	6	121155	121160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NT_187072	T	6	6	124130	124135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NT_187072	T	6	6	124143	124148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NT_187072	CTA	2	6	124213	124218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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431	NT_187072	CAA	2	6	192878	192883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
432	NT_187072	GC	3	6	192917	192922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
433	NT_187072	AC	3	6	192948	192953	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
434	NT_187072	AAC	2	6	192986	192991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
435	NT_187072	AC	4	8	192990	192997	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
436	NT_187072	GGC	2	6	193857	193862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
437	NT_187072	GTA	2	6	193970	193975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
438	NT_187072	GAG	2	6	194932	194937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
439	NT_187072	CTT	2	6	194952	194957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
440	NT_187072	CT	3	6	194965	194970	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
441	NT_187072	GAAA	2	8	195060	195067	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
442	NT_187072	TTA	2	6	195843	195848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NT_187072	TG	3	6	195893	195898	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
444	NT_187072	GTCTG	2	10	195902	195911	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
445	NT_187072	GTG	2	6	196550	196555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
446	NT_187072	AGA	2	6	196571	196576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
447	NT_187072	GCG	2	6	196595	196600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
448	NT_187072	AGA	2	6	197852	197857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
449	NT_187072	T	6	6	197924	197929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
450	NT_187072	T	6	6	197959	197964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NT_187072	TCAG	2	8	197979	197986	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
452	NT_187072	A	6	6	198137	198142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NT_187072	TTAG	2	8	201147	201154	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
454	NT_187072	GAA	2	6	201155	201160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
455	NT_187072	ATA	2	6	201164	201169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
456	NT_187072	TTA	2	6	205287	205292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
457	NT_187072	AGG	2	6	212814	212819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
458	NT_187072	T	8	8	212837	212844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
459	NT_187072	GCAG	2	8	212940	212947	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
460	NT_187072	T	6	6	214795	214800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
461	NT_187072	GCGCT	2	10	218756	218765	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
462	NT_187072	CAC	2	6	218813	218818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
463	NT_187072	CAA	2	6	218826	218831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
464	NT_187072	CCT	2	6	219289	219294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
465	NT_187072	CAA	2	6	221239	221244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
466	NT_187072	A	7	7	223024	223030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
467	NT_187072	AATG	2	8	224202	224209	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
468	NT_187072	AAT	2	6	224275	224280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
469	NT_187072	TGTGT	2	10	225147	225156	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
470	NT_187072	TAT	2	6	226849	226854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
471	NT_187072	AATGA	2	10	226858	226867	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
472	NT_187072	ATCA	2	8	226942	226949	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
473	NT_187072	CTG	2	6	226977	226982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.