MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptomyces rapamycinicus NRRL 5491 genome

Total Repeats: 51106

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_022785	GTT	2	6	3742062	3742067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15002	NC_022785	CTC	2	6	3742116	3742121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15003	NC_022785	CCT	2	6	3742153	3742158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15004	NC_022785	GCA	2	6	3743699	3743704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15005	NC_022785	CG	3	6	3743708	3743713	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15006	NC_022785	GC	3	6	3743744	3743749	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15007	NC_022785	CGG	2	6	3743766	3743771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15008	NC_022785	GCA	2	6	3744397	3744402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15009	NC_022785	GCC	2	6	3744426	3744431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15010	NC_022785	CGTT	2	8	3744481	3744488	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15011	NC_022785	AAT	2	6	3744897	3744902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15012	NC_022785	CGA	2	6	3744948	3744953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15013	NC_022785	GGC	2	6	3744967	3744972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15014	NC_022785	TCCT	2	8	3744984	3744991	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15015	NC_022785	GTG	2	6	3747226	3747231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15016	NC_022785	CCG	2	6	3747254	3747259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15017	NC_022785	GC	3	6	3747263	3747268	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15018	NC_022785	CGGGGC	2	12	3747283	3747294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15019	NC_022785	CCG	2	6	3747295	3747300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15020	NC_022785	GCCCCC	3	18	3752496	3752513	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
15021	NC_022785	CCCG	2	8	3752529	3752536	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15022	NC_022785	GAG	2	6	3756139	3756144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15023	NC_022785	GCCG	2	8	3757702	3757709	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15024	NC_022785	GC	3	6	3757711	3757716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15025	NC_022785	CGGTGA	2	12	3757740	3757751	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15026	NC_022785	GCGG	2	8	3757758	3757765	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15027	NC_022785	CGA	2	6	3757827	3757832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15028	NC_022785	AGC	2	6	3757833	3757838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15029	NC_022785	CCG	2	6	3757885	3757890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15030	NC_022785	GCGGTG	2	12	3757901	3757912	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
15031	NC_022785	G	6	6	3757922	3757927	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15032	NC_022785	GCC	2	6	3759020	3759025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15033	NC_022785	CGC	2	6	3759041	3759046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15034	NC_022785	CTAC	2	8	3759067	3759074	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15035	NC_022785	GCC	2	6	3759075	3759080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15036	NC_022785	CCGA	2	8	3759204	3759211	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15037	NC_022785	GCC	2	6	3759662	3759667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15038	NC_022785	CGG	2	6	3759671	3759676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15039	NC_022785	GCC	2	6	3759683	3759688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15040	NC_022785	CGG	2	6	3760749	3760754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15041	NC_022785	ACG	2	6	3760786	3760791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15042	NC_022785	AT	3	6	3760798	3760803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15043	NC_022785	CGG	2	6	3760930	3760935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15044	NC_022785	CGC	2	6	3762179	3762184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15045	NC_022785	CG	3	6	3762231	3762236	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15046	NC_022785	GCC	2	6	3762238	3762243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15047	NC_022785	CGG	2	6	3762246	3762251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15048	NC_022785	GTG	2	6	3762253	3762258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15049	NC_022785	CG	4	8	3762265	3762272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15050	NC_022785	CG	3	6	3762274	3762279	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15051	NC_022785	CGGT	2	8	3762321	3762328	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15052	NC_022785	GCCCC	2	10	3762337	3762346	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
15053	NC_022785	GCG	2	6	3762381	3762386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15054	NC_022785	GC	4	8	3762392	3762399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15055	NC_022785	CG	3	6	3762400	3762405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15056	NC_022785	CGC	2	6	3762422	3762427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15058	NC_022785	CCG	2	6	3762486	3762491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15059	NC_022785	GCG	2	6	3762509	3762514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15060	NC_022785	CG	3	6	3762521	3762526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15061	NC_022785	GCCG	2	8	3762553	3762560	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15062	NC_022785	CGG	2	6	3762621	3762626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15063	NC_022785	N	303	303	3763159	3763461	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15065	NC_022785	GC	3	6	3763481	3763486	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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15067	NC_022785	CGT	2	6	3763499	3763504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15068	NC_022785	CCG	2	6	3763537	3763542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15069	NC_022785	GCGCCC	2	12	3763562	3763573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15070	NC_022785	GC	3	6	3763590	3763595	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15071	NC_022785	GTGG	2	8	3763629	3763636	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
15072	NC_022785	TCGT	2	8	3763651	3763658	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15073	NC_022785	CGCC	2	8	3765818	3765825	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15074	NC_022785	TGG	2	6	3765858	3765863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15077	NC_022785	GGCCG	2	10	3765982	3765991	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
15078	NC_022785	CGG	2	6	3766051	3766056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15079	NC_022785	GC	4	8	3766100	3766107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15080	NC_022785	GCTC	2	8	3766126	3766133	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15081	NC_022785	TCG	3	9	3766959	3766967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15082	NC_022785	GGCACG	2	12	3767015	3767026	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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15085	NC_022785	TCCCC	2	10	3771693	3771702	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
15086	NC_022785	GCCCC	2	10	3771723	3771732	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
15087	NC_022785	CAC	2	6	3771758	3771763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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15089	NC_022785	CGCGC	3	15	3771781	3771795	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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15092	NC_022785	CCCGC	2	10	3771897	3771906	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
15093	NC_022785	TGG	2	6	3772871	3772876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15097	NC_022785	CTT	2	6	3774433	3774438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15098	NC_022785	ACT	2	6	3774440	3774445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15099	NC_022785	GCC	2	6	3774528	3774533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15100	NC_022785	GC	3	6	3774584	3774589	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15101	NC_022785	TCG	2	6	3774936	3774941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15104	NC_022785	GAT	2	6	3776191	3776196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15107	NC_022785	CGGG	2	8	3776845	3776852	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15108	NC_022785	GCC	2	6	3776874	3776879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15109	NC_022785	GCCC	2	8	3776927	3776934	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15110	NC_022785	CAC	2	6	3776936	3776941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15111	NC_022785	GGCCCG	2	12	3776970	3776981	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15112	NC_022785	GCC	2	6	3777041	3777046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15113	NC_022785	C	6	6	3777051	3777056	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15114	NC_022785	GTG	2	6	3777079	3777084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15115	NC_022785	CG	3	6	3779320	3779325	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15116	NC_022785	GCC	2	6	3779326	3779331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15125	NC_022785	CGG	2	6	3781926	3781931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15129	NC_022785	ATC	2	6	3789667	3789672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15130	NC_022785	ACC	2	6	3789796	3789801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15131	NC_022785	GAG	2	6	3789803	3789808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15132	NC_022785	TCA	2	6	3789940	3789945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15133	NC_022785	CAC	2	6	3789983	3789988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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15145	NC_022785	CG	3	6	3796351	3796356	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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15164	NC_022785	AC	3	6	3801405	3801410	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15165	NC_022785	CGG	2	6	3801462	3801467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15230	NC_022785	CGG	2	6	3819339	3819344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15231	NC_022785	GCG	2	6	3819499	3819504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15233	NC_022785	CG	4	8	3819554	3819561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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15239	NC_022785	N	147	147	3819658	3819804	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15242	NC_022785	GCG	2	6	3820501	3820506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15243	NC_022785	CG	4	8	3820585	3820592	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15244	NC_022785	CG	3	6	3820607	3820612	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15245	NC_022785	TCCTT	2	10	3821425	3821434	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
15246	NC_022785	CCGG	2	8	3821498	3821505	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15247	NC_022785	GCG	2	6	3821604	3821609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15248	NC_022785	T	6	6	3821673	3821678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15249	NC_022785	CAAAC	2	10	3821692	3821701	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
15250	NC_022785	CCG	2	6	3821795	3821800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15252	NC_022785	CGG	2	6	3821836	3821841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15253	NC_022785	TCG	2	6	3821867	3821872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15254	NC_022785	GGAC	2	8	3824728	3824735	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15255	NC_022785	GCC	2	6	3824764	3824769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15256	NC_022785	CG	3	6	3824834	3824839	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15257	NC_022785	GTG	2	6	3824840	3824845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15388	NC_022785	AC	3	6	3860680	3860685	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15389	NC_022785	GC	3	6	3861418	3861423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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15403	NC_022785	CGCAG	2	10	3866482	3866491	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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