MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptomyces rapamycinicus NRRL 5491 genome

Total Repeats: 51106

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_022785	GTG	2	6	3175203	3175208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12502	NC_022785	GTGA	2	8	3175245	3175252	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12503	NC_022785	CCG	2	6	3175637	3175642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12504	NC_022785	TCCC	2	8	3175688	3175695	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
12505	NC_022785	CG	3	6	3175723	3175728	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12506	NC_022785	GCCG	2	8	3175760	3175767	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12507	NC_022785	CTCACC	3	18	3175821	3175838	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12508	NC_022785	CCG	2	6	3175846	3175851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12509	NC_022785	CGT	2	6	3175915	3175920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12510	NC_022785	GCC	2	6	3175939	3175944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12511	NC_022785	CCG	2	6	3175988	3175993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12512	NC_022785	CGC	2	6	3177856	3177861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12513	NC_022785	CGA	2	6	3177882	3177887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12514	NC_022785	GGC	2	6	3177901	3177906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12515	NC_022785	CG	3	6	3177910	3177915	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12516	NC_022785	GCC	2	6	3179286	3179291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12517	NC_022785	CGC	2	6	3179294	3179299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12518	NC_022785	GGGT	2	8	3179338	3179345	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
12519	NC_022785	TGC	2	6	3179416	3179421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12520	NC_022785	TC	3	6	3179443	3179448	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12521	NC_022785	GCG	2	6	3179458	3179463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12522	NC_022785	GTC	2	6	3179466	3179471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12523	NC_022785	TCG	2	6	3179481	3179486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12524	NC_022785	CTG	2	6	3179491	3179496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12525	NC_022785	CGA	2	6	3179500	3179505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12526	NC_022785	GAT	2	6	3179527	3179532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12527	NC_022785	GCC	2	6	3179551	3179556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12528	NC_022785	CAG	2	6	3179581	3179586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12529	NC_022785	CA	3	6	3179599	3179604	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12530	NC_022785	CGT	2	6	3179637	3179642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12531	NC_022785	AGA	2	6	3179703	3179708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12532	NC_022785	GC	3	6	3179726	3179731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12533	NC_022785	TGT	2	6	3179775	3179780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12534	NC_022785	CCA	2	6	3181653	3181658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12535	NC_022785	GGA	2	6	3181710	3181715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12536	NC_022785	CAC	2	6	3181727	3181732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12537	NC_022785	GCG	2	6	3181770	3181775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12538	NC_022785	AGG	2	6	3181846	3181851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12539	NC_022785	C	6	6	3181879	3181884	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12540	NC_022785	ACG	2	6	3181892	3181897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12541	NC_022785	CGC	2	6	3181912	3181917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12542	NC_022785	CGG	2	6	3182587	3182592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12543	NC_022785	G	6	6	3182615	3182620	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12544	NC_022785	CTC	3	9	3183428	3183436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12545	NC_022785	ACT	2	6	3183472	3183477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12546	NC_022785	CTGGG	2	10	3183561	3183570	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
12547	NC_022785	N	878	878	3183573	3184450	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12548	NC_022785	GAGCAT	2	12	3185725	3185736	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12549	NC_022785	AG	3	6	3187034	3187039	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12550	NC_022785	GAG	2	6	3188929	3188934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12551	NC_022785	TG	3	6	3188949	3188954	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12552	NC_022785	GAA	2	6	3188958	3188963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12553	NC_022785	CTGAC	2	10	3189210	3189219	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12554	NC_022785	GCA	2	6	3189223	3189228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12555	NC_022785	CGC	2	6	3189250	3189255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12556	NC_022785	AGC	3	9	3189274	3189282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12557	NC_022785	TC	3	6	3189294	3189299	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12558	NC_022785	AGTC	2	8	3189300	3189307	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12559	NC_022785	CAG	2	6	3189310	3189315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12560	NC_022785	CG	3	6	3190172	3190177	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12561	NC_022785	CCGTC	2	10	3190199	3190208	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
12562	NC_022785	CCG	2	6	3190252	3190257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12563	NC_022785	AGC	2	6	3190267	3190272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12564	NC_022785	C	6	6	3190281	3190286	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12565	NC_022785	CGGGC	2	10	3190296	3190305	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
12566	NC_022785	GCG	2	6	3190314	3190319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12567	NC_022785	ATG	2	6	3190406	3190411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12568	NC_022785	CGC	2	6	3190419	3190424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12569	NC_022785	CGGCG	2	10	3190428	3190437	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
12570	NC_022785	AGC	2	6	3190458	3190463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12571	NC_022785	CAG	2	6	3190477	3190482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12572	NC_022785	GCC	2	6	3190506	3190511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12573	NC_022785	CGGC	2	8	3190523	3190530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12574	NC_022785	CGG	3	9	3190538	3190546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12575	NC_022785	TCG	2	6	3190582	3190587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12576	NC_022785	GGCG	2	8	3190604	3190611	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12577	NC_022785	CGG	2	6	3190726	3190731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12578	NC_022785	CAC	2	6	3190831	3190836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12579	NC_022785	TTG	2	6	3191652	3191657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12580	NC_022785	AAC	2	6	3191661	3191666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12581	NC_022785	CATC	2	8	3191721	3191728	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12582	NC_022785	GAC	2	6	3191751	3191756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12583	NC_022785	GGC	2	6	3191772	3191777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12584	NC_022785	TGC	2	6	3192020	3192025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12585	NC_022785	GCC	2	6	3192039	3192044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12586	NC_022785	AGG	2	6	3192049	3192054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12587	NC_022785	CACC	2	8	3192066	3192073	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
12588	NC_022785	CG	3	6	3192083	3192088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12589	NC_022785	GCC	2	6	3195115	3195120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12590	NC_022785	CTC	2	6	3195123	3195128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12591	NC_022785	GGAA	2	8	3195172	3195179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12592	NC_022785	GCCG	2	8	3210047	3210054	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12593	NC_022785	GCC	2	6	3210089	3210094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12594	NC_022785	GC	3	6	3210123	3210128	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12595	NC_022785	GAT	2	6	3210144	3210149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12596	NC_022785	CAGT	2	8	3210190	3210197	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12597	NC_022785	G	8	8	3210239	3210246	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12598	NC_022785	CGG	2	6	3210312	3210317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12599	NC_022785	CGA	2	6	3210400	3210405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12601	NC_022785	GCT	2	6	3210544	3210549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12602	NC_022785	GCT	2	6	3210573	3210578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12603	NC_022785	GC	3	6	3210595	3210600	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12604	NC_022785	GTC	2	6	3210631	3210636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12605	NC_022785	CA	3	6	3210648	3210653	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12606	NC_022785	CACGC	2	10	3210658	3210667	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
12607	NC_022785	GGGC	2	8	3210685	3210692	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12608	NC_022785	GGTGC	2	10	3211232	3211241	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
12609	NC_022785	GGT	2	6	3211249	3211254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12610	NC_022785	CGG	2	6	3211304	3211309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12611	NC_022785	GGC	2	6	3211325	3211330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12612	NC_022785	CG	3	6	3211434	3211439	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12613	NC_022785	GCTG	2	8	3211442	3211449	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12614	NC_022785	GC	3	6	3211709	3211714	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12615	NC_022785	CGC	2	6	3211717	3211722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12616	NC_022785	GCC	2	6	3211752	3211757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12617	NC_022785	GCC	2	6	3211789	3211794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12618	NC_022785	GCC	2	6	3213209	3213214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12619	NC_022785	GGA	2	6	3214699	3214704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12620	NC_022785	CGG	2	6	3214731	3214736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12621	NC_022785	ACG	2	6	3214761	3214766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12623	NC_022785	GGTC	2	8	3214818	3214825	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12624	NC_022785	GCG	3	9	3214913	3214921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12625	NC_022785	GTCG	2	8	3214975	3214982	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12626	NC_022785	GC	3	6	3215004	3215009	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12627	NC_022785	GGC	2	6	3215088	3215093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12629	NC_022785	GCG	3	9	3215128	3215136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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