MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae A026 genome

Total Repeats: 8581

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022655	CCT	2	6	15	20	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_022655	GGT	2	6	151	156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022655	TCG	2	6	266	271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_022655	CGT	2	6	346	351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_022655	AGGGA	2	10	484	493	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022655	TA	3	6	550	555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022655	GA	3	6	570	575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022655	GAAGTG	2	12	595	606	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022655	ACTAAT	2	12	625	636	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_022655	TTGAA	2	10	688	697	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022655	AGT	2	6	804	809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022655	GTA	2	6	871	876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022655	ATG	2	6	894	899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022655	T	6	6	953	958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022655	TAA	3	9	965	973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022655	CTA	2	6	1085	1090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_022655	TAT	2	6	1091	1096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022655	TCC	2	6	1172	1177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_022655	TCTTGT	2	12	1281	1292	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_022655	GAA	2	6	1352	1357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022655	CTTT	2	8	1388	1395	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_022655	T	6	6	1393	1398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022655	TGA	2	6	1446	1451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022655	ATT	2	6	1453	1458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022655	GTG	2	6	1587	1592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022655	TTA	2	6	1636	1641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022655	TTG	2	6	1701	1706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022655	GAT	2	6	1754	1759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022655	AGTTGA	2	12	1945	1956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022655	TGA	2	6	1967	1972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022655	TGA	2	6	2025	2030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022655	TGA	2	6	2042	2047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022655	TTC	2	6	2048	2053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_022655	AAG	2	6	2119	2124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022655	T	7	7	2139	2145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022655	ATA	2	6	2165	2170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022655	TA	3	6	2173	2178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022655	TTG	2	6	2301	2306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022655	T	6	6	2353	2358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022655	A	6	6	2375	2380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022655	ATA	2	6	2682	2687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022655	T	6	6	2716	2721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022655	TCT	2	6	2754	2759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_022655	T	6	6	2774	2779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022655	TAA	2	6	2784	2789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022655	AAG	2	6	4204	4209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022655	CCT	2	6	4211	4216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_022655	TTG	2	6	4220	4225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022655	CTTTT	2	10	4242	4251	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_022655	ATA	2	6	4254	4259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022655	CTT	2	6	4290	4295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_022655	ATA	3	9	4315	4323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022655	ATA	2	6	4851	4856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022655	GGA	2	6	4894	4899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022655	CAG	2	6	4903	4908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_022655	TG	3	6	4926	4931	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022655	T	7	7	4935	4941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022655	AATA	2	8	4955	4962	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022655	AAT	2	6	4969	4974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022655	ATA	2	6	4987	4992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022655	A	6	6	5990	5995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022655	TCT	2	6	6071	6076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_022655	AGGTTG	2	12	6087	6098	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022655	AGAA	2	8	7924	7931	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022655	ATG	2	6	8769	8774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022655	CTT	2	6	8796	8801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_022655	TTGA	2	8	8808	8815	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022655	AT	3	6	8878	8883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022655	GGA	2	6	8887	8892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022655	GAT	2	6	9879	9884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022655	T	6	6	9892	9897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022655	T	6	6	9902	9907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022655	AATA	2	8	9911	9918	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022655	TAG	2	6	9921	9926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022655	ATA	2	6	9963	9968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022655	AAAAG	2	10	9969	9978	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022655	TCA	2	6	9994	9999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_022655	CAT	2	6	10014	10019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_022655	TAG	2	6	10067	10072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022655	TTC	2	6	10126	10131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_022655	CGT	2	6	10163	10168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_022655	GAT	2	6	10182	10187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022655	TG	3	6	10193	10198	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022655	TGA	2	6	10208	10213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022655	TTCT	2	8	10285	10292	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_022655	GTT	2	6	10298	10303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022655	T	10	10	10335	10344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022655	ATA	2	6	10361	10366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022655	T	6	6	10786	10791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022655	TTG	2	6	10834	10839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022655	TGT	2	6	10860	10865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022655	AAT	2	6	10910	10915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022655	T	6	6	10994	10999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022655	TGAT	2	8	11041	11048	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022655	A	6	6	11050	11055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022655	TGA	2	6	11059	11064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022655	AAT	2	6	11079	11084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022655	T	6	6	11200	11205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022655	AATCA	2	10	11274	11283	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_022655	TCC	2	6	11315	11320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_022655	TCC	2	6	11324	11329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_022655	AATT	2	8	11379	11386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022655	TAT	2	6	11417	11422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022655	TAT	2	6	11438	11443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022655	CTAT	2	8	11483	11490	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_022655	TCC	2	6	14217	14222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_022655	T	6	6	14223	14228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022655	GTA	2	6	14229	14234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022655	TGA	2	6	14268	14273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022655	AGG	2	6	14277	14282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022655	G	6	6	16107	16112	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022655	GTA	2	6	16118	16123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022655	AGG	2	6	16147	16152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022655	A	6	6	19680	19685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022655	T	6	6	19702	19707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022655	GAT	2	6	19717	19722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022655	A	6	6	19731	19736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022655	A	7	7	19778	19784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022655	TAAAAA	2	12	19836	19847	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022655	ATG	2	6	20232	20237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022655	ATT	2	6	20251	20256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022655	A	6	6	20293	20298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022655	TAA	2	6	20402	20407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022655	ATTT	2	8	20437	20444	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022655	A	6	6	20471	20476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022655	T	7	7	20530	20536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022655	GGGA	2	8	20554	20561	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022655	GAAG	2	8	20577	20584	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022655	GTT	2	6	20617	20622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022655	TA	3	6	20683	20688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022655	TGAC	2	8	20691	20698	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_022655	AGC	2	6	20737	20742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_022655	AGAGG	2	10	22962	22971	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022655	AAT	2	6	24342	24347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022655	TTC	2	6	24367	24372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_022655	T	6	6	24379	24384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022655	CTA	2	6	24407	24412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_022655	T	6	6	24435	24440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022655	T	6	6	24443	24448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022655	ATAG	2	8	28998	29005	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022655	TGA	2	6	29041	29046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022655	A	6	6	30543	30548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022655	TGA	2	6	32122	32127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022655	TTG	2	6	32166	32171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022655	GAA	2	6	34294	34299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022655	TTTC	2	8	34305	34312	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_022655	T	6	6	34314	34319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022655	T	6	6	34357	34362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_022655	AAT	2	6	34378	34383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_022655	GTC	2	6	35708	35713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_022655	GTG	2	6	35714	35719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
152	NC_022655	CCG	2	6	35914	35919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
153	NC_022655	GAT	2	6	35937	35942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_022655	TGG	2	6	36004	36009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
155	NC_022655	CTG	2	6	36010	36015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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158	NC_022655	T	6	6	39270	39275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_022655	A	6	6	43384	43389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_022655	AT	5	10	43393	43402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_022655	TTCTAT	2	12	43419	43430	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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169	NC_022655	A	7	7	44306	44312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_022655	TAG	2	6	44313	44318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_022655	AAT	2	6	44339	44344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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174	NC_022655	TG	3	6	44478	44483	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
175	NC_022655	TAAT	2	8	44549	44556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_022655	AAC	2	6	44559	44564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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183	NC_022655	GTTT	2	8	50548	50555	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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284	NC_022655	CTT	2	6	68916	68921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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441	NC_022655	A	6	6	95555	95560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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443	NC_022655	A	6	6	95582	95587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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485	NC_022655	AT	3	6	97753	97758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
486	NC_022655	TGG	2	6	97759	97764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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