MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae A026 genome

Total Repeats: 8581

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_022655	TGA	2	6	2087612	2087617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8502	NC_022655	A	7	7	2087617	2087623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8503	NC_022655	A	6	6	2087628	2087633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8504	NC_022655	A	6	6	2087648	2087653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8505	NC_022655	GA	3	6	2087702	2087707	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8506	NC_022655	ACA	2	6	2087763	2087768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8507	NC_022655	GTA	2	6	2087775	2087780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8508	NC_022655	A	6	6	2087791	2087796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8509	NC_022655	TGAG	2	8	2087821	2087828	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8510	NC_022655	GGC	2	6	2087876	2087881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8511	NC_022655	AGG	2	6	2087911	2087916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8512	NC_022655	GCTT	2	8	2087918	2087925	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8513	NC_022655	CCTG	2	8	2087966	2087973	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8514	NC_022655	TGG	2	6	2088095	2088100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8515	NC_022655	CGA	2	6	2088119	2088124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8516	NC_022655	GCA	2	6	2088193	2088198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8517	NC_022655	CGC	2	6	2088240	2088245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8518	NC_022655	GTGA	2	8	2088246	2088253	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8519	NC_022655	TGT	2	6	2088279	2088284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8520	NC_022655	AGA	2	6	2088288	2088293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8521	NC_022655	CAG	2	6	2088362	2088367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8522	NC_022655	AGCG	2	8	2088417	2088424	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8523	NC_022655	TAG	2	6	2088469	2088474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8524	NC_022655	AT	3	6	2088546	2088551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8525	NC_022655	GGA	2	6	2088552	2088557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8526	NC_022655	CT	3	6	2088577	2088582	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8527	NC_022655	GAA	2	6	2088816	2088821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8528	NC_022655	GGT	2	6	2088890	2088895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8529	NC_022655	GTC	2	6	2088904	2088909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8530	NC_022655	TCGTG	2	10	2088913	2088922	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8531	NC_022655	CAT	2	6	2088972	2088977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8532	NC_022655	TAA	2	6	2089007	2089012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8533	NC_022655	GGA	2	6	2089016	2089021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8534	NC_022655	ATC	2	6	2089040	2089045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8535	NC_022655	AC	3	6	2089067	2089072	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8536	NC_022655	CGC	2	6	2089206	2089211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8537	NC_022655	AC	3	6	2089236	2089241	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8538	NC_022655	CAC	2	6	2089251	2089256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8539	NC_022655	AGCC	2	8	2089298	2089305	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8540	NC_022655	GAT	2	6	2089321	2089326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8541	NC_022655	CCT	2	6	2089377	2089382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8542	NC_022655	TAAGGA	2	12	2089386	2089397	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8543	NC_022655	AGG	2	6	2089476	2089481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8544	NC_022655	GA	3	6	2089514	2089519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8545	NC_022655	GTA	2	6	2089591	2089596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8546	NC_022655	TAA	2	6	2089598	2089603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8547	NC_022655	GTTAA	2	10	2089634	2089643	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8548	NC_022655	CGA	2	6	2089679	2089684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8549	NC_022655	ACG	2	6	2089697	2089702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8550	NC_022655	GTAA	2	8	2089720	2089727	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8551	NC_022655	GAT	2	6	2089730	2089735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8552	NC_022655	GAG	2	6	2089800	2089805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8553	NC_022655	TAG	2	6	2089868	2089873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8554	NC_022655	GCGA	2	8	2089876	2089883	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8555	NC_022655	AGA	2	6	2089955	2089960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8556	NC_022655	AG	3	6	2089983	2089988	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8557	NC_022655	CGG	2	6	2090039	2090044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8558	NC_022655	GGA	2	6	2090071	2090076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8559	NC_022655	GGGAG	2	10	2090152	2090161	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
8560	NC_022655	ACA	2	6	2090189	2090194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8561	NC_022655	ATG	2	6	2090256	2090261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8562	NC_022655	GGA	2	6	2090389	2090394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8563	NC_022655	TC	3	6	2090475	2090480	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8564	NC_022655	ACC	2	6	2090655	2090660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8565	NC_022655	AAT	2	6	2090675	2090680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8566	NC_022655	AGC	2	6	2090735	2090740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8567	NC_022655	ATTC	2	8	2090742	2090749	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8568	NC_022655	TG	3	6	2090864	2090869	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8569	NC_022655	GAG	2	6	2090885	2090890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8570	NC_022655	GA	3	6	2091015	2091020	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8571	NC_022655	ACA	2	6	2091041	2091046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8572	NC_022655	CTAA	2	8	2091096	2091103	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8573	NC_022655	GTCT	2	8	2091121	2091128	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8574	NC_022655	TAG	2	6	2091198	2091203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8575	NC_022655	GA	3	6	2091311	2091316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8576	NC_022655	CT	3	6	2091427	2091432	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8577	NC_022655	GAT	2	6	2091445	2091450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8578	NC_022655	CGG	2	6	2091536	2091541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8579	NC_022655	GA	3	6	2091634	2091639	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8580	NC_022655	TAGG	2	8	2091752	2091759	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8581	NC_022655	TAC	2	6	2091806	2091811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.