MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus Z172 plasmid pZ172_1

Total Repeats: 213

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022610	TAA	2	6	25	30	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022610	TAA	2	6	48	53	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022610	TTA	2	6	55	60	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022610	TAA	2	6	65	70	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022610	GAT	2	6	81	86	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022610	TA	3	6	664	669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022610	AAAC	2	8	704	711	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_022610	TTC	2	6	856	861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_022610	TGA	2	6	896	901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022610	TA	3	6	919	924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022610	TAAT	2	8	957	964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022610	ACC	2	6	1780	1785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_022610	T	6	6	1795	1800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022610	TAC	2	6	1821	1826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_022610	ACT	2	6	1834	1839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_022610	GTG	2	6	1894	1899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022610	TA	3	6	1953	1958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022610	TAA	2	6	2033	2038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022610	TA	3	6	2060	2065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022610	T	6	6	2067	2072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022610	TAT	2	6	2081	2086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022610	AT	4	8	2085	2092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022610	TTA	2	6	2143	2148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022610	ATC	2	6	3176	3181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_022610	TGA	2	6	3194	3199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022610	CGA	2	6	3200	3205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_022610	A	7	7	3205	3211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022610	TGA	2	6	3618	3623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022610	T	7	7	3632	3638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022610	T	7	7	3643	3649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022610	A	6	6	3652	3657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022610	AT	3	6	3686	3691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022610	TTG	2	6	3743	3748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022610	A	7	7	3960	3966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022610	TTTA	2	8	3978	3985	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022610	AT	3	6	4008	4013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022610	TAGA	2	8	4056	4063	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022610	T	6	6	4154	4159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022610	TCT	2	6	4394	4399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_022610	T	6	6	4413	4418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022610	GTT	2	6	4431	4436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022610	CGA	2	6	4612	4617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_022610	ATT	2	6	4691	4696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022610	TCT	2	6	5751	5756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_022610	TA	3	6	5768	5773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022610	AAAAT	2	10	5845	5854	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022610	A	6	6	5863	5868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022610	TAT	2	6	5878	5883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022610	ATA	2	6	5902	5907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022610	CTAG	2	8	6103	6110	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_022610	ATG	2	6	6112	6117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022610	TA	3	6	6173	6178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022610	TTC	2	6	6328	6333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_022610	CGT	2	6	6365	6370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_022610	T	7	7	6376	6382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022610	A	7	7	6406	6412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022610	A	6	6	6416	6421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022610	TAAA	2	8	6474	6481	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022610	A	6	6	6479	6484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022610	A	7	7	6489	6495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022610	AAT	2	6	6503	6508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022610	ATAA	2	8	6516	6523	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022610	A	6	6	6534	6539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022610	A	6	6	6551	6556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022610	TCT	2	6	6644	6649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_022610	AAAT	2	8	6692	6699	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022610	AT	3	6	6698	6703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022610	T	6	6	6746	6751	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022610	TACA	2	8	7009	7016	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_022610	T	6	6	7044	7049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022610	A	6	6	7052	7057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022610	A	6	6	7063	7068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022610	TCA	2	6	7077	7082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_022610	TCGG	2	8	7876	7883	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_022610	T	6	6	7927	7932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022610	CAA	2	6	8008	8013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_022610	A	6	6	8012	8017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022610	TAT	2	6	8713	8718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022610	T	6	6	8743	8748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022610	TAT	2	6	8801	8806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022610	GAA	3	9	8855	8863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022610	A	7	7	8868	8874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022610	ACC	2	6	8897	8902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_022610	GTGG	2	8	8926	8933	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022610	ATTT	2	8	8946	8953	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022610	ATTT	2	8	8961	8968	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022610	GTT	2	6	8969	8974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022610	TGA	2	6	8976	8981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022610	A	6	6	8995	9000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022610	T	7	7	9028	9034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022610	TTA	2	6	9041	9046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022610	A	6	6	9198	9203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022610	A	6	6	9211	9216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022610	TAAAAT	2	12	9217	9228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022610	T	6	6	9244	9249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022610	AGGT	2	8	9252	9259	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022610	GAC	2	6	9308	9313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_022610	T	6	6	9317	9322	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022610	T	7	7	9407	9413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022610	A	9	9	9472	9480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022610	TA	3	6	9481	9486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022610	A	7	7	9507	9513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022610	ATG	2	6	9523	9528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022610	TA	3	6	9549	9554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022610	TGTA	2	8	9579	9586	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022610	A	6	6	9620	9625	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022610	T	7	7	9636	9642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022610	CAC	2	6	9673	9678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_022610	GTG	2	6	9704	9709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022610	GA	3	6	9779	9784	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022610	T	7	7	9789	9795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022610	TA	3	6	10312	10317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022610	TAA	3	9	10323	10331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022610	A	6	6	10330	10335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022610	GGA	2	6	10353	10358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022610	T	7	7	11024	11030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022610	T	6	6	11032	11037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022610	AGT	2	6	11051	11056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022610	TGA	2	6	11078	11083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022610	TAA	2	6	11105	11110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022610	GA	3	6	11122	11127	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022610	AT	3	6	11162	11167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022610	TATT	2	8	11242	11249	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022610	T	6	6	11256	11261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022610	TGA	2	6	11283	11288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022610	TCT	2	6	11303	11308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_022610	A	6	6	11325	11330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022610	TA	3	6	11337	11342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022610	GAC	2	6	11349	11354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_022610	TAA	2	6	11394	11399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022610	TC	3	6	11412	11417	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_022610	AG	3	6	11437	11442	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022610	TCA	2	6	11489	11494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_022610	TTG	2	6	11504	11509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022610	A	6	6	11569	11574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022610	TAG	2	6	11651	11656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022610	ATT	2	6	11703	11708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022610	TCT	2	6	11779	11784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_022610	T	7	7	12498	12504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022610	AGG	2	6	12567	12572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022610	TTA	2	6	13150	13155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022610	TATT	2	8	13190	13197	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022610	TAGA	2	8	13223	13230	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022610	CAT	2	6	13246	13251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_022610	TCC	2	6	13949	13954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_022610	CCT	2	6	13986	13991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_022610	CT	3	6	15751	15756	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_022610	T	6	6	15781	15786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_022610	TTC	2	6	15820	15825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_022610	AAC	2	6	15826	15831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_022610	TGC	2	6	15867	15872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_022610	ACC	2	6	15887	15892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
153	NC_022610	CAA	2	6	15944	15949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_022610	CAA	2	6	15967	15972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_022610	AAT	2	6	15997	16002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_022610	CATC	2	8	16052	16059	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
157	NC_022610	CAC	2	6	16065	16070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
158	NC_022610	A	8	8	16078	16085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_022610	TACA	2	8	16105	16112	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
160	NC_022610	T	6	6	16149	16154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_022610	T	6	6	16169	16174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_022610	ATT	2	6	17841	17846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_022610	T	6	6	17845	17850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_022610	AAT	2	6	17860	17865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_022610	A	6	6	17885	17890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_022610	TTAT	2	8	17893	17900	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_022610	T	6	6	17918	17923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_022610	AAG	2	6	17960	17965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
169	NC_022610	TTC	2	6	17971	17976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
170	NC_022610	A	6	6	17997	18002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_022610	TCT	2	6	18874	18879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_022610	GCT	2	6	19661	19666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_022610	TTC	2	6	19727	19732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_022610	C	6	6	19744	19749	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
175	NC_022610	ATC	2	6	22339	22344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
176	NC_022610	TTCA	2	8	22350	22357	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
177	NC_022610	ATTT	2	8	22361	22368	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_022610	TAT	2	6	22374	22379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_022610	TCA	2	6	22393	22398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
180	NC_022610	GCAA	2	8	22400	22407	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
181	NC_022610	TGAA	2	8	22413	22420	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
182	NC_022610	AAGT	2	8	22429	22436	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
183	NC_022610	AACG	2	8	22461	22468	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
184	NC_022610	AAT	2	6	22519	22524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_022610	CT	3	6	22573	22578	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
186	NC_022610	TA	5	10	22588	22597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_022610	TA	3	6	22688	22693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_022610	AAGA	2	8	23300	23307	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
189	NC_022610	AC	3	6	23322	23327	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
190	NC_022610	TTG	2	6	23347	23352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
191	NC_022610	TATT	2	8	23388	23395	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_022610	ATTG	2	8	24023	24030	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
193	NC_022610	TC	3	6	24047	24052	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
194	NC_022610	ATT	2	6	24077	24082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_022610	TAA	2	6	24095	24100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_022610	A	6	6	24110	24115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_022610	TA	3	6	24137	24142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_022610	TAA	2	6	24156	24161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_022610	AT	3	6	24173	24178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
200	NC_022610	CATT	2	8	24795	24802	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
201	NC_022610	AG	3	6	24813	24818	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
202	NC_022610	CT	3	6	24831	24836	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
203	NC_022610	GTA	3	9	24843	24851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
204	NC_022610	AACG	2	8	24872	24879	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
205	NC_022610	ATA	2	6	24890	24895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
206	NC_022610	AT	5	10	24914	24923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
207	NC_022610	A	6	6	25533	25538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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210	NC_022610	A	7	7	25606	25612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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213	NC_022610	ATT	2	6	27314	27319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.