MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium DT104 main chromosome

Total Repeats: 14715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_022569	TAT	2	6	1334212	1334217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_022569	ACC	2	6	1334231	1334236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4003	NC_022569	GTT	2	6	1334290	1334295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_022569	CGGCG	2	10	1334315	1334324	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4005	NC_022569	A	6	6	1334336	1334341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_022569	ATA	2	6	1334353	1334358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_022569	GAC	2	6	1334375	1334380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_022569	GGTT	2	8	1334463	1334470	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_022569	GCG	2	6	1334905	1334910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_022569	CCT	2	6	1335570	1335575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4011	NC_022569	TCA	2	6	1335651	1335656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_022569	AGGCG	2	10	1336885	1336894	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4013	NC_022569	ACT	2	6	1338218	1338223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_022569	CGC	2	6	1338339	1338344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4015	NC_022569	TTG	2	6	1338369	1338374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_022569	TGA	2	6	1338422	1338427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_022569	CGT	2	6	1338434	1338439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_022569	GGGGA	2	10	1338488	1338497	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_022569	TAA	2	6	1340678	1340683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_022569	AAT	2	6	1340688	1340693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_022569	AT	3	6	1340692	1340697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_022569	TTAA	2	8	1340744	1340751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_022569	AAAAT	2	10	1340774	1340783	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_022569	TAT	2	6	1340790	1340795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_022569	ATA	2	6	1340824	1340829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_022569	CAA	2	6	1340875	1340880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_022569	GCTG	2	8	1340897	1340904	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4028	NC_022569	CGT	2	6	1340914	1340919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_022569	GATTTT	2	12	1340955	1340966	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_022569	T	6	6	1340980	1340985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_022569	CCT	2	6	1341024	1341029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4032	NC_022569	TAA	2	6	1341048	1341053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_022569	TAT	2	6	1341125	1341130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_022569	GTA	2	6	1341135	1341140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_022569	C	6	6	1342490	1342495	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4036	NC_022569	AAGCGC	2	12	1342582	1342593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_022569	T	6	6	1344561	1344566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_022569	TAG	2	6	1344595	1344600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_022569	A	8	8	1344643	1344650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_022569	AGA	2	6	1344677	1344682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_022569	CTT	2	6	1344704	1344709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_022569	TCA	2	6	1344782	1344787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_022569	TGG	2	6	1344800	1344805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_022569	ATC	2	6	1344838	1344843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_022569	ATC	2	6	1344849	1344854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_022569	AAT	2	6	1344859	1344864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_022569	A	6	6	1345865	1345870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_022569	TAA	2	6	1345924	1345929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_022569	TTG	2	6	1345930	1345935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_022569	GCTG	2	8	1345940	1345947	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4051	NC_022569	TTC	2	6	1345984	1345989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_022569	ATG	2	6	1347228	1347233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_022569	GCC	2	6	1348178	1348183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4054	NC_022569	GGC	2	6	1348205	1348210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_022569	A	8	8	1349423	1349430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_022569	CCA	2	6	1350475	1350480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4057	NC_022569	AATC	2	8	1350567	1350574	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4058	NC_022569	GCC	2	6	1350641	1350646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4059	NC_022569	ATA	2	6	1350670	1350675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_022569	GCC	2	6	1350701	1350706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4061	NC_022569	ATT	2	6	1351241	1351246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_022569	GCC	2	6	1351565	1351570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4063	NC_022569	CGG	2	6	1351574	1351579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_022569	ATT	2	6	1351699	1351704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_022569	GCCA	2	8	1351735	1351742	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4066	NC_022569	TGACG	2	10	1351814	1351823	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4067	NC_022569	GATAC	2	10	1351878	1351887	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4068	NC_022569	TCT	2	6	1352555	1352560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_022569	GTC	2	6	1352565	1352570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_022569	GGC	2	6	1353643	1353648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_022569	CGC	2	6	1353659	1353664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4072	NC_022569	TGA	2	6	1353681	1353686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_022569	AAC	2	6	1355567	1355572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_022569	CAG	2	6	1355638	1355643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4075	NC_022569	CTGC	2	8	1355650	1355657	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4076	NC_022569	AATA	2	8	1355693	1355700	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_022569	GAC	2	6	1359407	1359412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_022569	TA	3	6	1360777	1360782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_022569	A	7	7	1360865	1360871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_022569	GCT	2	6	1360876	1360881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4081	NC_022569	CGG	2	6	1360948	1360953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_022569	AAT	2	6	1362745	1362750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_022569	GCTG	2	8	1362880	1362887	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4084	NC_022569	TGC	2	6	1362895	1362900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_022569	ATTA	2	8	1362929	1362936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_022569	ATAA	2	8	1362941	1362948	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_022569	GAT	2	6	1369038	1369043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_022569	ATT	2	6	1369071	1369076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_022569	TAA	2	6	1369095	1369100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_022569	TGC	2	6	1369105	1369110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_022569	TGT	2	6	1369145	1369150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_022569	T	7	7	1369183	1369189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_022569	T	6	6	1369212	1369217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_022569	GTT	2	6	1369237	1369242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_022569	ACA	2	6	1369281	1369286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4096	NC_022569	AGGA	2	8	1369323	1369330	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_022569	CCG	2	6	1369843	1369848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4098	NC_022569	ACA	2	6	1369858	1369863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_022569	CGG	2	6	1369886	1369891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_022569	GGC	2	6	1370015	1370020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_022569	TTG	2	6	1370058	1370063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_022569	CT	3	6	1370094	1370099	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4103	NC_022569	GAA	2	6	1370167	1370172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_022569	CAGCG	2	10	1370209	1370218	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4105	NC_022569	CGAAA	2	10	1370227	1370236	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4106	NC_022569	GC	3	6	1370241	1370246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4107	NC_022569	CAG	2	6	1370270	1370275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_022569	GCC	2	6	1370325	1370330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4109	NC_022569	GCGG	2	8	1370384	1370391	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4110	NC_022569	GA	3	6	1370423	1370428	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_022569	TGT	2	6	1370472	1370477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_022569	CAG	2	6	1370498	1370503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_022569	CCG	2	6	1370543	1370548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4114	NC_022569	GCA	2	6	1370557	1370562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_022569	AT	3	6	1370662	1370667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_022569	GCC	2	6	1370733	1370738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4117	NC_022569	G	6	6	1370755	1370760	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_022569	A	6	6	1370832	1370837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_022569	AG	3	6	1370848	1370853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_022569	A	7	7	1371746	1371752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_022569	CGC	2	6	1371783	1371788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4122	NC_022569	ACA	2	6	1371793	1371798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_022569	ACA	2	6	1371827	1371832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_022569	T	7	7	1372335	1372341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_022569	TGCC	2	8	1372343	1372350	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4126	NC_022569	TTAT	2	8	1372357	1372364	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_022569	ATT	2	6	1372373	1372378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_022569	G	6	6	1372393	1372398	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_022569	GA	3	6	1372417	1372422	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_022569	GGT	2	6	1372452	1372457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_022569	A	6	6	1372487	1372492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_022569	GCG	2	6	1372543	1372548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4133	NC_022569	T	6	6	1372912	1372917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_022569	ATGCC	2	10	1374368	1374377	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4135	NC_022569	GAT	2	6	1374757	1374762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4138	NC_022569	GCG	2	6	1377863	1377868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4139	NC_022569	T	6	6	1377884	1377889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4148	NC_022569	GC	3	6	1381103	1381108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4149	NC_022569	GTA	2	6	1381127	1381132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4151	NC_022569	GACA	2	8	1381507	1381514	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4153	NC_022569	AATGG	2	10	1383053	1383062	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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4165	NC_022569	AATG	2	8	1387633	1387640	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4166	NC_022569	A	6	6	1387661	1387666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4167	NC_022569	ATTG	2	8	1387677	1387684	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4252	NC_022569	AGG	2	6	1405055	1405060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4256	NC_022569	AAT	2	6	1406744	1406749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4257	NC_022569	ATT	3	9	1406763	1406771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4258	NC_022569	AAT	2	6	1406775	1406780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4259	NC_022569	CG	4	8	1406822	1406829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4260	NC_022569	GA	3	6	1406830	1406835	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4261	NC_022569	GAA	2	6	1406855	1406860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4263	NC_022569	CTG	2	6	1408010	1408015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4265	NC_022569	AACC	2	8	1408069	1408076	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4266	NC_022569	TAAT	2	8	1409031	1409038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4269	NC_022569	A	6	6	1409146	1409151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4393	NC_022569	TCA	2	6	1461173	1461178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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