MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium DT104 main chromosome

Total Repeats: 14715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_022569	GCC	2	6	4374355	4374360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13002	NC_022569	A	6	6	4374456	4374461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13003	NC_022569	T	6	6	4374478	4374483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13004	NC_022569	TGC	2	6	4374988	4374993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13005	NC_022569	ATC	2	6	4375035	4375040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13006	NC_022569	TGA	2	6	4376037	4376042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13007	NC_022569	TATT	2	8	4379011	4379018	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13008	NC_022569	GCG	2	6	4379046	4379051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13009	NC_022569	CTG	2	6	4380137	4380142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13010	NC_022569	TCG	2	6	4382492	4382497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13011	NC_022569	GTA	2	6	4382499	4382504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13012	NC_022569	GGT	2	6	4382544	4382549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13013	NC_022569	CGC	2	6	4382566	4382571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13014	NC_022569	GTG	2	6	4382618	4382623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13015	NC_022569	A	8	8	4382897	4382904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13016	NC_022569	T	7	7	4382919	4382925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_022569	TTTTAC	2	12	4383773	4383784	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13018	NC_022569	ATTT	2	8	4385585	4385592	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13019	NC_022569	AATG	2	8	4385615	4385622	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13020	NC_022569	CTT	2	6	4385632	4385637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13021	NC_022569	A	6	6	4385652	4385657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13022	NC_022569	A	6	6	4385663	4385668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13023	NC_022569	AAT	2	6	4385690	4385695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13024	NC_022569	AT	3	6	4385768	4385773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13025	NC_022569	TAT	3	9	4385781	4385789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13026	NC_022569	TAAA	2	8	4385817	4385824	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13027	NC_022569	ATA	2	6	4385841	4385846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13028	NC_022569	T	6	6	4385876	4385881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13029	NC_022569	A	6	6	4385999	4386004	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13030	NC_022569	CG	3	6	4386419	4386424	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13031	NC_022569	AAG	2	6	4386530	4386535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_022569	TCA	2	6	4390264	4390269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13033	NC_022569	ATA	2	6	4392246	4392251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13034	NC_022569	CTTAA	2	10	4392286	4392295	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13035	NC_022569	T	6	6	4392398	4392403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13036	NC_022569	CAT	2	6	4392417	4392422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13037	NC_022569	A	7	7	4393628	4393634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13038	NC_022569	AACGT	2	10	4393643	4393652	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13039	NC_022569	GAA	2	6	4395284	4395289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13040	NC_022569	ACA	2	6	4395397	4395402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13041	NC_022569	CAA	2	6	4395403	4395408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13042	NC_022569	ATA	2	6	4395409	4395414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13043	NC_022569	TGA	2	6	4395424	4395429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13044	NC_022569	TTA	2	6	4396352	4396357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13045	NC_022569	GCT	2	6	4398697	4398702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13046	NC_022569	GT	3	6	4399371	4399376	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13047	NC_022569	GA	3	6	4399401	4399406	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13048	NC_022569	A	6	6	4399419	4399424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_022569	TGA	2	6	4399470	4399475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13050	NC_022569	GAT	2	6	4399499	4399504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13051	NC_022569	TC	3	6	4400722	4400727	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13052	NC_022569	CT	3	6	4403906	4403911	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13053	NC_022569	TC	3	6	4403923	4403928	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13054	NC_022569	AGG	2	6	4403942	4403947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13055	NC_022569	ATGTA	2	10	4403992	4404001	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13056	NC_022569	GCC	2	6	4405688	4405693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13057	NC_022569	CTC	2	6	4405718	4405723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13058	NC_022569	ATT	2	6	4410122	4410127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13059	NC_022569	GCG	2	6	4410136	4410141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13060	NC_022569	GA	3	6	4410166	4410171	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13061	NC_022569	AGCGTT	2	12	4410190	4410201	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13062	NC_022569	AAGA	2	8	4412045	4412052	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13063	NC_022569	CAGA	2	8	4412072	4412079	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13064	NC_022569	AT	3	6	4412081	4412086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13065	NC_022569	A	6	6	4412089	4412094	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13066	NC_022569	CAG	2	6	4412107	4412112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13067	NC_022569	GCC	2	6	4412121	4412126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13068	NC_022569	CT	3	6	4412150	4412155	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13069	NC_022569	GCC	2	6	4414921	4414926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13070	NC_022569	GAA	2	6	4415028	4415033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13071	NC_022569	TTA	2	6	4415045	4415050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13072	NC_022569	GCGCT	2	10	4415115	4415124	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13073	NC_022569	AC	3	6	4416340	4416345	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13074	NC_022569	ATTA	2	8	4416376	4416383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13075	NC_022569	GGC	2	6	4418229	4418234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13076	NC_022569	GAA	2	6	4418307	4418312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13077	NC_022569	T	7	7	4419765	4419771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13078	NC_022569	A	9	9	4419776	4419784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13079	NC_022569	GA	3	6	4419836	4419841	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13080	NC_022569	TAT	2	6	4419902	4419907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13081	NC_022569	TGCTA	2	10	4419941	4419950	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13082	NC_022569	GGA	2	6	4419978	4419983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13083	NC_022569	ATAAA	2	10	4422315	4422324	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13084	NC_022569	GAT	2	6	4422328	4422333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13085	NC_022569	T	6	6	4422370	4422375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13086	NC_022569	CTGT	2	8	4422394	4422401	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13087	NC_022569	AAT	2	6	4424658	4424663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13088	NC_022569	TGA	2	6	4424711	4424716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13089	NC_022569	TGAGA	2	10	4424843	4424852	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
13090	NC_022569	CGG	2	6	4424873	4424878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13091	NC_022569	TCA	2	6	4424883	4424888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13092	NC_022569	TCA	2	6	4424959	4424964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13093	NC_022569	CTT	2	6	4424995	4425000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13094	NC_022569	ATT	2	6	4427694	4427699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13095	NC_022569	CCA	2	6	4427743	4427748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13096	NC_022569	AAC	2	6	4427758	4427763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13097	NC_022569	CA	3	6	4427766	4427771	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13098	NC_022569	GCC	2	6	4427773	4427778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13099	NC_022569	CGC	2	6	4427869	4427874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13100	NC_022569	AAGCG	2	10	4427882	4427891	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
13101	NC_022569	TG	3	6	4427923	4427928	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13102	NC_022569	GGC	2	6	4428077	4428082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13103	NC_022569	AGC	2	6	4428117	4428122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13104	NC_022569	TGC	2	6	4428124	4428129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13105	NC_022569	ACT	2	6	4428191	4428196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13106	NC_022569	TTG	2	6	4428288	4428293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13107	NC_022569	CGA	2	6	4428316	4428321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13108	NC_022569	GCA	2	6	4428390	4428395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13109	NC_022569	GAA	2	6	4428449	4428454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13110	NC_022569	GGA	2	6	4428485	4428490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13111	NC_022569	TAA	2	6	4428503	4428508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13112	NC_022569	GCA	2	6	4428511	4428516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13113	NC_022569	AGA	2	6	4428532	4428537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13114	NC_022569	CAG	2	6	4428558	4428563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13115	NC_022569	G	6	6	4428705	4428710	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13116	NC_022569	GGA	2	6	4428749	4428754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13117	NC_022569	GGC	2	6	4428769	4428774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13118	NC_022569	GAA	2	6	4429012	4429017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13119	NC_022569	TGC	2	6	4429088	4429093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13120	NC_022569	GTC	2	6	4429100	4429105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13121	NC_022569	TTG	2	6	4429161	4429166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13122	NC_022569	GGA	2	6	4429213	4429218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13123	NC_022569	TCA	2	6	4429238	4429243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13124	NC_022569	AC	3	6	4429264	4429269	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13125	NC_022569	CGT	2	6	4429332	4429337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13126	NC_022569	AC	3	6	4429433	4429438	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13127	NC_022569	GTAG	2	8	4429474	4429481	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13128	NC_022569	CCT	2	6	4429574	4429579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13129	NC_022569	CA	3	6	4429609	4429614	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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13132	NC_022569	GGT	2	6	4429700	4429705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13250	NC_022569	TTA	2	6	4453459	4453464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13251	NC_022569	TTTA	2	8	4453474	4453481	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13252	NC_022569	AAT	2	6	4453787	4453792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13253	NC_022569	A	7	7	4453845	4453851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13254	NC_022569	TCGT	2	8	4453893	4453900	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13255	NC_022569	A	6	6	4459303	4459308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13256	NC_022569	GAC	2	6	4459328	4459333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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