MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium DT104 main chromosome

Total Repeats: 14715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_022569	GAC	2	6	3645912	3645917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11002	NC_022569	ATT	2	6	3647263	3647268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11003	NC_022569	CGC	2	6	3648237	3648242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11004	NC_022569	ACA	2	6	3648710	3648715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11005	NC_022569	AC	3	6	3648767	3648772	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11006	NC_022569	TTTG	2	8	3649639	3649646	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11007	NC_022569	GACC	2	8	3651740	3651747	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11008	NC_022569	ACC	2	6	3653006	3653011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11009	NC_022569	A	6	6	3653058	3653063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11010	NC_022569	GGC	2	6	3653649	3653654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11011	NC_022569	AGC	2	6	3654480	3654485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11012	NC_022569	GGC	2	6	3654521	3654526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11013	NC_022569	AG	3	6	3655134	3655139	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_022569	GCCAG	2	10	3655182	3655191	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11015	NC_022569	ACG	2	6	3655233	3655238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11016	NC_022569	ATG	2	6	3655259	3655264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11017	NC_022569	A	6	6	3655281	3655286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11018	NC_022569	TAA	2	6	3655308	3655313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11019	NC_022569	C	6	6	3656620	3656625	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11020	NC_022569	TA	3	6	3656754	3656759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11021	NC_022569	AGAAA	2	10	3656820	3656829	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
11022	NC_022569	T	6	6	3659736	3659741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11023	NC_022569	T	8	8	3659745	3659752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11024	NC_022569	CGG	2	6	3659792	3659797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11025	NC_022569	CAA	2	6	3659806	3659811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11026	NC_022569	GCTG	2	8	3659839	3659846	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11027	NC_022569	CAA	2	6	3659927	3659932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11028	NC_022569	ACT	2	6	3662206	3662211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11029	NC_022569	ATT	2	6	3662223	3662228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11030	NC_022569	AACT	2	8	3662251	3662258	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11031	NC_022569	ATA	3	9	3662282	3662290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11032	NC_022569	ATTC	2	8	3662332	3662339	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11033	NC_022569	AATA	2	8	3662344	3662351	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11034	NC_022569	TGACC	2	10	3662372	3662381	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11035	NC_022569	ATAAA	2	10	3662395	3662404	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11036	NC_022569	TCT	2	6	3662422	3662427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11039	NC_022569	ATTA	2	8	3662485	3662492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11040	NC_022569	TA	3	6	3668396	3668401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11041	NC_022569	TAA	2	6	3668406	3668411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11042	NC_022569	TCC	2	6	3668415	3668420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11043	NC_022569	CT	3	6	3668457	3668462	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11044	NC_022569	TTG	2	6	3668995	3669000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11046	NC_022569	TTA	3	9	3669130	3669138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11047	NC_022569	GAT	2	6	3669197	3669202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11049	NC_022569	CCA	2	6	3669250	3669255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11050	NC_022569	CAA	2	6	3669272	3669277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11051	NC_022569	A	8	8	3669366	3669373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11052	NC_022569	ATT	2	6	3669388	3669393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11053	NC_022569	TGC	2	6	3669394	3669399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11054	NC_022569	ATTTCT	2	12	3669408	3669419	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11055	NC_022569	ATT	2	6	3669423	3669428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11056	NC_022569	AAT	2	6	3669454	3669459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11057	NC_022569	A	7	7	3669480	3669486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11058	NC_022569	T	7	7	3669502	3669508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11059	NC_022569	ACTA	2	8	3672887	3672894	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11060	NC_022569	A	6	6	3674394	3674399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11061	NC_022569	TTG	2	6	3674432	3674437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11062	NC_022569	TAC	2	6	3676113	3676118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11063	NC_022569	GCA	2	6	3676163	3676168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11064	NC_022569	TTG	2	6	3676268	3676273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11065	NC_022569	AAC	2	6	3676309	3676314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11066	NC_022569	ATC	2	6	3676404	3676409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11067	NC_022569	GGCAA	2	10	3676428	3676437	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11068	NC_022569	T	6	6	3676554	3676559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11069	NC_022569	TAC	2	6	3679953	3679958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11075	NC_022569	TAA	2	6	3683315	3683320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11086	NC_022569	CGT	2	6	3689600	3689605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11087	NC_022569	A	7	7	3689620	3689626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11088	NC_022569	AG	3	6	3689630	3689635	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11089	NC_022569	CAA	2	6	3689749	3689754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11093	NC_022569	A	6	6	3689873	3689878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11094	NC_022569	AT	4	8	3689896	3689903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11095	NC_022569	GGC	2	6	3691556	3691561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11098	NC_022569	CAC	2	6	3692867	3692872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11099	NC_022569	AGGT	2	8	3692874	3692881	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11100	NC_022569	CAA	2	6	3693707	3693712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11101	NC_022569	GT	3	6	3693719	3693724	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11102	NC_022569	A	6	6	3693731	3693736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11103	NC_022569	CAG	2	6	3693803	3693808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11107	NC_022569	GCCA	2	8	3694426	3694433	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11108	NC_022569	CTT	2	6	3696837	3696842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11109	NC_022569	CTTT	2	8	3696875	3696882	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11110	NC_022569	T	6	6	3696880	3696885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11113	NC_022569	TTA	2	6	3696961	3696966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11114	NC_022569	TTAA	2	8	3696979	3696986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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