MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium DT104 main chromosome

Total Repeats: 14715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_022569	GCC	2	6	2702683	2702688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8002	NC_022569	TTA	2	6	2702774	2702779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_022569	TGCA	2	8	2702869	2702876	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8004	NC_022569	AAC	2	6	2702984	2702989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8005	NC_022569	TATCCG	2	12	2702994	2703005	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8006	NC_022569	GGT	3	9	2703166	2703174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_022569	TGGC	2	8	2703182	2703189	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8008	NC_022569	GCT	2	6	2703331	2703336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8009	NC_022569	CCG	2	6	2703384	2703389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8010	NC_022569	AC	3	6	2703463	2703468	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8011	NC_022569	CCG	2	6	2703509	2703514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8012	NC_022569	CCG	2	6	2703561	2703566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8013	NC_022569	CCA	2	6	2703568	2703573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8014	NC_022569	CCG	2	6	2703777	2703782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8015	NC_022569	CAG	2	6	2703784	2703789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8016	NC_022569	TCG	2	6	2703920	2703925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8017	NC_022569	ATC	2	6	2703964	2703969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8018	NC_022569	CCG	2	6	2704100	2704105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8019	NC_022569	CCCG	2	8	2704124	2704131	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8020	NC_022569	GCG	2	6	2704176	2704181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8021	NC_022569	CTT	2	6	2704228	2704233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8022	NC_022569	TAT	3	9	2704350	2704358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_022569	ACTG	2	8	2704380	2704387	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8024	NC_022569	C	6	6	2704422	2704427	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8025	NC_022569	TA	3	6	2704491	2704496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_022569	CCG	2	6	2704623	2704628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8027	NC_022569	GAA	2	6	2704631	2704636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_022569	GC	3	6	2704643	2704648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8029	NC_022569	AGC	2	6	2704649	2704654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8030	NC_022569	CTGT	2	8	2704766	2704773	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8031	NC_022569	TGC	2	6	2704779	2704784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8032	NC_022569	GGC	2	6	2704795	2704800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8033	NC_022569	CGG	2	6	2704821	2704826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8034	NC_022569	CAG	2	6	2704903	2704908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8035	NC_022569	GCG	2	6	2705048	2705053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8036	NC_022569	TGG	2	6	2705067	2705072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_022569	CTT	2	6	2705089	2705094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8038	NC_022569	GGT	2	6	2705110	2705115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_022569	CAGCGT	2	12	2705131	2705142	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8040	NC_022569	GGC	3	9	2705149	2705157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8041	NC_022569	GCG	2	6	2705163	2705168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8042	NC_022569	GTA	2	6	2705188	2705193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_022569	GTC	2	6	2705207	2705212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8044	NC_022569	CAT	2	6	2705220	2705225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8045	NC_022569	CGT	2	6	2705229	2705234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8046	NC_022569	CCG	2	6	2705247	2705252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8047	NC_022569	CCA	2	6	2705299	2705304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8048	NC_022569	GTT	3	9	2705317	2705325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_022569	CGGT	2	8	2705409	2705416	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8050	NC_022569	GCC	2	6	2705434	2705439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8051	NC_022569	GTA	2	6	2705497	2705502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_022569	CAG	2	6	2705554	2705559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8053	NC_022569	ACGCC	2	10	2705571	2705580	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
8054	NC_022569	GCT	2	6	2705581	2705586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8055	NC_022569	AGT	2	6	2705616	2705621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_022569	GCG	2	6	2705670	2705675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8057	NC_022569	CGC	2	6	2705701	2705706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8058	NC_022569	GCG	2	6	2705712	2705717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8059	NC_022569	CGC	2	6	2705730	2705735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8060	NC_022569	GCT	2	6	2705800	2705805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8061	NC_022569	CCG	4	12	2705835	2705846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8062	NC_022569	CCT	2	6	2705856	2705861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8063	NC_022569	CG	3	6	2705866	2705871	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8064	NC_022569	CGC	2	6	2705883	2705888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8065	NC_022569	CGG	2	6	2705910	2705915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8066	NC_022569	GTG	2	6	2705939	2705944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_022569	ATG	2	6	2705945	2705950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_022569	CGC	2	6	2706031	2706036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8069	NC_022569	GCAG	2	8	2706051	2706058	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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8072	NC_022569	CGG	2	6	2706156	2706161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8073	NC_022569	CTG	2	6	2706199	2706204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8074	NC_022569	GCC	2	6	2706217	2706222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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8082	NC_022569	GTC	2	6	2706413	2706418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8084	NC_022569	CGGG	2	8	2706559	2706566	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8085	NC_022569	TGA	2	6	2706573	2706578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8088	NC_022569	TGG	2	6	2706615	2706620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8090	NC_022569	CGC	2	6	2706672	2706677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8091	NC_022569	CGC	2	6	2706717	2706722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8092	NC_022569	TTCACC	2	12	2706806	2706817	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
8093	NC_022569	CGC	2	6	2706877	2706882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8094	NC_022569	GCC	2	6	2706943	2706948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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8098	NC_022569	GGCC	2	8	2707098	2707105	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8099	NC_022569	GGC	2	6	2707192	2707197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8100	NC_022569	CCG	2	6	2707206	2707211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8101	NC_022569	TGG	2	6	2707299	2707304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_022569	GCG	2	6	2707371	2707376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8103	NC_022569	GTG	2	6	2707526	2707531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_022569	GA	3	6	2707724	2707729	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_022569	GTTCG	2	10	2707732	2707741	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8106	NC_022569	GGT	2	6	2707789	2707794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8107	NC_022569	CCG	2	6	2707809	2707814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8108	NC_022569	TCG	2	6	2707935	2707940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8109	NC_022569	CCG	2	6	2707941	2707946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8110	NC_022569	CAG	2	6	2708020	2708025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8111	NC_022569	CCA	2	6	2708052	2708057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8112	NC_022569	GC	3	6	2708080	2708085	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8113	NC_022569	GAC	2	6	2708107	2708112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8114	NC_022569	CAC	2	6	2708155	2708160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8115	NC_022569	CGCC	2	8	2708178	2708185	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8116	NC_022569	ATC	2	6	2708284	2708289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8118	NC_022569	TGG	2	6	2708391	2708396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_022569	CGGTGA	2	12	2708403	2708414	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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8122	NC_022569	GTG	2	6	2708675	2708680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_022569	CGC	2	6	2708688	2708693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8124	NC_022569	GC	3	6	2708692	2708697	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8125	NC_022569	TTG	2	6	2708786	2708791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_022569	GCGGT	2	10	2708798	2708807	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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8128	NC_022569	GCT	3	9	2708911	2708919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8243	NC_022569	TTA	2	6	2728072	2728077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8245	NC_022569	ATA	2	6	2728202	2728207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8248	NC_022569	AAAAT	2	10	2728785	2728794	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8251	NC_022569	TAAAT	2	10	2733600	2733609	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8253	NC_022569	TGA	2	6	2740976	2740981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8255	NC_022569	ATT	2	6	2742054	2742059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8256	NC_022569	TAA	2	6	2742066	2742071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8257	NC_022569	T	6	6	2742079	2742084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8392	NC_022569	GTC	2	6	2800561	2800566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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