MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium DT104 main chromosome

Total Repeats: 14715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_022569	GAAGT	2	10	2505826	2505835	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
7502	NC_022569	GCT	2	6	2505836	2505841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7503	NC_022569	TCA	2	6	2506986	2506991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7504	NC_022569	A	8	8	2507057	2507064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7505	NC_022569	T	6	6	2507111	2507116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7506	NC_022569	TCA	2	6	2507179	2507184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7507	NC_022569	CATTAA	2	12	2507186	2507197	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7508	NC_022569	G	6	6	2507230	2507235	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7509	NC_022569	TGT	2	6	2507242	2507247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7510	NC_022569	AC	4	8	2507280	2507287	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7511	NC_022569	A	7	7	2507526	2507532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7512	NC_022569	T	6	6	2507546	2507551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7513	NC_022569	T	6	6	2507567	2507572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7514	NC_022569	CTTA	2	8	2508701	2508708	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7515	NC_022569	ATA	2	6	2508714	2508719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7516	NC_022569	AT	3	6	2508739	2508744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7517	NC_022569	ATG	2	6	2508790	2508795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7518	NC_022569	AT	3	6	2508855	2508860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7519	NC_022569	TAT	2	6	2508968	2508973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7520	NC_022569	AAT	2	6	2508978	2508983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7521	NC_022569	ATT	2	6	2509024	2509029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7522	NC_022569	ATA	2	6	2509061	2509066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7523	NC_022569	ATTA	2	8	2509067	2509074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7524	NC_022569	CATT	2	8	2509085	2509092	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7525	NC_022569	C	6	6	2509118	2509123	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7526	NC_022569	GCC	2	6	2509124	2509129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7527	NC_022569	ATG	2	6	2509197	2509202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7528	NC_022569	TC	3	6	2509211	2509216	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7529	NC_022569	ACA	2	6	2509236	2509241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7530	NC_022569	A	6	6	2509243	2509248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7531	NC_022569	CATA	2	8	2509282	2509289	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7532	NC_022569	A	7	7	2509293	2509299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7533	NC_022569	CTAA	2	8	2509312	2509319	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7534	NC_022569	TCT	3	9	2509372	2509380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7535	NC_022569	CGT	2	6	2509401	2509406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7536	NC_022569	TCCC	2	8	2510734	2510741	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7537	NC_022569	GGC	2	6	2511392	2511397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7538	NC_022569	TTC	2	6	2511420	2511425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7539	NC_022569	A	7	7	2514572	2514578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7540	NC_022569	CTT	2	6	2514595	2514600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7541	NC_022569	A	6	6	2515109	2515114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7542	NC_022569	ACA	2	6	2515125	2515130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7543	NC_022569	GTC	2	6	2515227	2515232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7544	NC_022569	CAT	2	6	2515301	2515306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7545	NC_022569	A	7	7	2515311	2515317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7546	NC_022569	ATG	2	6	2515327	2515332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7547	NC_022569	T	7	7	2515385	2515391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7548	NC_022569	GGC	2	6	2518864	2518869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7549	NC_022569	T	6	6	2518972	2518977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7550	NC_022569	CTT	2	6	2519012	2519017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7551	NC_022569	CTTTG	2	10	2519032	2519041	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
7552	NC_022569	CACG	2	8	2524122	2524129	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7553	NC_022569	A	6	6	2524767	2524772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7554	NC_022569	A	6	6	2524822	2524827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7555	NC_022569	TGT	2	6	2524839	2524844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7556	NC_022569	CTT	2	6	2526451	2526456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7557	NC_022569	CTC	2	6	2527057	2527062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7558	NC_022569	TTC	2	6	2527777	2527782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7559	NC_022569	CTG	2	6	2527804	2527809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7561	NC_022569	CA	4	8	2527826	2527833	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7562	NC_022569	AGG	2	6	2527836	2527841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7563	NC_022569	CAT	2	6	2528553	2528558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7564	NC_022569	ATG	2	6	2528561	2528566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7565	NC_022569	A	6	6	2528584	2528589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7566	NC_022569	TCC	2	6	2528644	2528649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7567	NC_022569	GCC	2	6	2529596	2529601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7568	NC_022569	CTT	2	6	2529605	2529610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7569	NC_022569	CCTGT	2	10	2531793	2531802	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
7570	NC_022569	TG	4	8	2531803	2531810	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7571	NC_022569	TAA	2	6	2531817	2531822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7573	NC_022569	GCGCG	2	10	2532968	2532977	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7574	NC_022569	TG	3	6	2533819	2533824	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7575	NC_022569	TAA	2	6	2533894	2533899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7576	NC_022569	CGG	2	6	2533961	2533966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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7579	NC_022569	CGG	2	6	2536115	2536120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7580	NC_022569	CTT	2	6	2538692	2538697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7581	NC_022569	ATC	2	6	2538698	2538703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7582	NC_022569	GAC	2	6	2538705	2538710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7583	NC_022569	T	6	6	2540215	2540220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7584	NC_022569	AAT	2	6	2540226	2540231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7585	NC_022569	TCA	2	6	2540284	2540289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7587	NC_022569	ACA	2	6	2540320	2540325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7588	NC_022569	GTC	2	6	2543884	2543889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7592	NC_022569	A	6	6	2543970	2543975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7598	NC_022569	TAT	2	6	2547118	2547123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7600	NC_022569	ATT	2	6	2549806	2549811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7601	NC_022569	AAG	2	6	2549826	2549831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7602	NC_022569	GCC	2	6	2551027	2551032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7603	NC_022569	AT	3	6	2551037	2551042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7604	NC_022569	TAAT	2	8	2551066	2551073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7605	NC_022569	C	6	6	2553293	2553298	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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7607	NC_022569	TGA	2	6	2553825	2553830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7609	NC_022569	CTTT	2	8	2553865	2553872	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7610	NC_022569	CTTT	2	8	2553906	2553913	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7611	NC_022569	TCT	2	6	2553960	2553965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7612	NC_022569	CAA	2	6	2554266	2554271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7613	NC_022569	TAA	2	6	2554273	2554278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7614	NC_022569	TTA	2	6	2554289	2554294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7615	NC_022569	TTA	2	6	2554377	2554382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7616	NC_022569	TA	3	6	2556006	2556011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7617	NC_022569	TGT	2	6	2556026	2556031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7619	NC_022569	A	6	6	2556042	2556047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7627	NC_022569	CGG	2	6	2564151	2564156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7628	NC_022569	TCC	2	6	2564192	2564197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7629	NC_022569	GGC	2	6	2564808	2564813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7630	NC_022569	CAGC	2	8	2564839	2564846	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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