MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium DT104 main chromosome

Total Repeats: 14715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_022569	ACT	2	6	2299070	2299075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7002	NC_022569	TTA	2	6	2299106	2299111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7003	NC_022569	TA	3	6	2300679	2300684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_022569	TCG	2	6	2300726	2300731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7005	NC_022569	TGTTTA	2	12	2301130	2301141	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7006	NC_022569	CAT	2	6	2301195	2301200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7007	NC_022569	AT	3	6	2301219	2301224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7008	NC_022569	TAA	2	6	2301311	2301316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7009	NC_022569	TC	3	6	2301490	2301495	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7010	NC_022569	CAG	2	6	2301540	2301545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7011	NC_022569	GAA	2	6	2301546	2301551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7012	NC_022569	TTG	2	6	2301639	2301644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7013	NC_022569	CGA	2	6	2301754	2301759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7014	NC_022569	TGA	2	6	2301817	2301822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_022569	CGG	3	9	2301856	2301864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7016	NC_022569	CCA	2	6	2301966	2301971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7017	NC_022569	ACC	2	6	2302109	2302114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7018	NC_022569	GCG	2	6	2302146	2302151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7019	NC_022569	TGA	2	6	2302173	2302178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7020	NC_022569	GTC	2	6	2302269	2302274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7021	NC_022569	GGC	2	6	2302280	2302285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7022	NC_022569	GCA	2	6	2302288	2302293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7023	NC_022569	ACG	2	6	2302317	2302322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7024	NC_022569	ATT	2	6	2302409	2302414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7025	NC_022569	TGC	2	6	2302512	2302517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7026	NC_022569	GCC	2	6	2302540	2302545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7027	NC_022569	TAA	2	6	2302565	2302570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_022569	TTC	2	6	2302607	2302612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7029	NC_022569	GACC	2	8	2303758	2303765	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7030	NC_022569	T	6	6	2303787	2303792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7031	NC_022569	CTG	2	6	2303802	2303807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7032	NC_022569	TAT	2	6	2303872	2303877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7033	NC_022569	TACCT	2	10	2303898	2303907	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
7034	NC_022569	ATT	2	6	2306218	2306223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7035	NC_022569	GAC	2	6	2307892	2307897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7036	NC_022569	GAA	2	6	2309521	2309526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7037	NC_022569	GGT	2	6	2309575	2309580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7038	NC_022569	AAG	2	6	2309604	2309609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7039	NC_022569	GTC	2	6	2309620	2309625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7040	NC_022569	CTGT	2	8	2309666	2309673	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7041	NC_022569	GCG	2	6	2309699	2309704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7042	NC_022569	TGC	2	6	2309777	2309782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7043	NC_022569	ACG	2	6	2309783	2309788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7044	NC_022569	CCA	2	6	2309851	2309856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7045	NC_022569	AC	3	6	2309868	2309873	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7046	NC_022569	T	6	6	2310269	2310274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7047	NC_022569	T	6	6	2310311	2310316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7048	NC_022569	TTA	2	6	2310418	2310423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7049	NC_022569	TTCA	2	8	2310441	2310448	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7050	NC_022569	AT	3	6	2310460	2310465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7051	NC_022569	A	6	6	2314717	2314722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7052	NC_022569	CGA	2	6	2314727	2314732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7053	NC_022569	CGC	2	6	2314734	2314739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7054	NC_022569	TTA	2	6	2315322	2315327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_022569	TTG	2	6	2315385	2315390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7056	NC_022569	CAA	2	6	2315424	2315429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7057	NC_022569	ATT	2	6	2315446	2315451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_022569	TTA	2	6	2315460	2315465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7059	NC_022569	ACA	2	6	2315498	2315503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7060	NC_022569	A	6	6	2315507	2315512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7061	NC_022569	TAA	2	6	2315552	2315557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7062	NC_022569	TGA	2	6	2315892	2315897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7063	NC_022569	A	6	6	2315933	2315938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7064	NC_022569	AAT	2	6	2315969	2315974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7065	NC_022569	ATT	2	6	2315985	2315990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7066	NC_022569	CTGT	2	8	2316003	2316010	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7067	NC_022569	TAT	2	6	2316038	2316043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7068	NC_022569	TTA	2	6	2316045	2316050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7069	NC_022569	AT	4	8	2316068	2316075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7070	NC_022569	AGG	2	6	2316113	2316118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7071	NC_022569	ATT	2	6	2317294	2317299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7072	NC_022569	T	6	6	2317364	2317369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7073	NC_022569	ACA	2	6	2317370	2317375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7074	NC_022569	GAA	2	6	2317376	2317381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7077	NC_022569	TAA	2	6	2319514	2319519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7078	NC_022569	TC	3	6	2319579	2319584	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7079	NC_022569	AATT	2	8	2319611	2319618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7080	NC_022569	ATT	2	6	2319626	2319631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7081	NC_022569	TA	3	6	2319648	2319653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7082	NC_022569	GGCA	2	8	2320129	2320136	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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7084	NC_022569	TCTTT	2	10	2320188	2320197	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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7087	NC_022569	ACAT	2	8	2323834	2323841	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7088	NC_022569	CTTT	2	8	2323855	2323862	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7089	NC_022569	CGC	2	6	2323908	2323913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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7091	NC_022569	TTA	2	6	2324792	2324797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7092	NC_022569	A	6	6	2328691	2328696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7093	NC_022569	GGCA	2	8	2328752	2328759	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7094	NC_022569	G	6	6	2328766	2328771	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7095	NC_022569	GCT	2	6	2328799	2328804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7097	NC_022569	TTTATC	2	12	2331138	2331149	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7098	NC_022569	CGA	2	6	2331151	2331156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7099	NC_022569	GAG	2	6	2331207	2331212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7100	NC_022569	GGC	2	6	2331282	2331287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7101	NC_022569	ACC	2	6	2331296	2331301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7102	NC_022569	CAC	2	6	2331374	2331379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7103	NC_022569	CGG	2	6	2333147	2333152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7104	NC_022569	TGCC	2	8	2333158	2333165	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7105	NC_022569	GCG	2	6	2333172	2333177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7106	NC_022569	ATG	2	6	2334126	2334131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7107	NC_022569	CG	3	6	2334152	2334157	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7108	NC_022569	CAT	2	6	2334206	2334211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7109	NC_022569	AGA	2	6	2334237	2334242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7110	NC_022569	TGC	2	6	2334255	2334260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7111	NC_022569	CTG	2	6	2334892	2334897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7112	NC_022569	CGC	2	6	2335634	2335639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7113	NC_022569	ATC	2	6	2336470	2336475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7114	NC_022569	A	7	7	2337935	2337941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7115	NC_022569	AG	3	6	2337949	2337954	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7116	NC_022569	T	6	6	2337974	2337979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7117	NC_022569	CAT	2	6	2337997	2338002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7118	NC_022569	ACA	2	6	2338006	2338011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7119	NC_022569	AAT	2	6	2338044	2338049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7120	NC_022569	T	6	6	2338063	2338068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7121	NC_022569	GAT	2	6	2338309	2338314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7122	NC_022569	A	7	7	2339333	2339339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7123	NC_022569	CT	3	6	2339358	2339363	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7124	NC_022569	GGC	2	6	2339390	2339395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7125	NC_022569	TC	4	8	2341991	2341998	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7126	NC_022569	TGT	2	6	2344440	2344445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7127	NC_022569	GGC	2	6	2344650	2344655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7128	NC_022569	GCC	2	6	2345278	2345283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7129	NC_022569	CTG	2	6	2345308	2345313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7131	NC_022569	ATG	2	6	2345376	2345381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7252	NC_022569	A	8	8	2396089	2396096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7253	NC_022569	AACA	2	8	2396129	2396136	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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7264	NC_022569	GTC	2	6	2399435	2399440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7394	NC_022569	TCCCG	2	10	2434665	2434674	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
7395	NC_022569	ATTC	2	8	2434723	2434730	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7396	NC_022569	CCTTCA	2	12	2434748	2434759	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
7397	NC_022569	CGC	2	6	2438208	2438213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7398	NC_022569	CT	3	6	2443943	2443948	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7399	NC_022569	ATT	2	6	2444184	2444189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7400	NC_022569	ATC	2	6	2448558	2448563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7403	NC_022569	TTG	2	6	2448629	2448634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7412	NC_022569	GTTC	2	8	2457490	2457497	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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7429	NC_022569	AGGCC	2	10	2463313	2463322	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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7431	NC_022569	A	6	6	2467859	2467864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7435	NC_022569	AGG	2	6	2469218	2469223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7450	NC_022569	ATCA	2	8	2484790	2484797	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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7454	NC_022569	AGGG	2	8	2486225	2486232	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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7461	NC_022569	CGG	2	6	2486467	2486472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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