MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium DT104 main chromosome

Total Repeats: 14715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_022569	GAT	2	6	2083815	2083820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6502	NC_022569	T	6	6	2083820	2083825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_022569	GCA	2	6	2083828	2083833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6504	NC_022569	A	6	6	2083878	2083883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_022569	AAT	2	6	2083921	2083926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6506	NC_022569	GAGT	2	8	2083960	2083967	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6507	NC_022569	A	6	6	2083983	2083988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6508	NC_022569	AGG	2	6	2088766	2088771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6509	NC_022569	CGA	2	6	2088773	2088778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6510	NC_022569	GGACA	2	10	2090485	2090494	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6511	NC_022569	CGC	3	9	2092856	2092864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6512	NC_022569	GCGG	2	8	2092899	2092906	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6513	NC_022569	TCA	2	6	2092945	2092950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6514	NC_022569	A	6	6	2094668	2094673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6515	NC_022569	AT	3	6	2094685	2094690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6516	NC_022569	TCAC	2	8	2094716	2094723	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6517	NC_022569	ACTTT	2	10	2094738	2094747	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6518	NC_022569	GAT	2	6	2094750	2094755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6519	NC_022569	TGAG	2	8	2094891	2094898	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_022569	TCC	2	6	2095769	2095774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6521	NC_022569	GGT	2	6	2095882	2095887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6522	NC_022569	A	7	7	2096129	2096135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_022569	AAG	2	6	2096173	2096178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6524	NC_022569	T	7	7	2096234	2096240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_022569	T	6	6	2096257	2096262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6526	NC_022569	ATGA	2	8	2096265	2096272	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6527	NC_022569	TGC	2	6	2096317	2096322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6528	NC_022569	CTT	2	6	2096359	2096364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6529	NC_022569	CCG	2	6	2096400	2096405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6530	NC_022569	TCA	2	6	2098993	2098998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6531	NC_022569	AGC	2	6	2099031	2099036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6532	NC_022569	CGA	2	6	2099048	2099053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6533	NC_022569	TCT	2	6	2100293	2100298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6534	NC_022569	CGG	2	6	2100338	2100343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6535	NC_022569	ATA	2	6	2100395	2100400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6536	NC_022569	GTGA	2	8	2100439	2100446	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6537	NC_022569	AAT	2	6	2103257	2103262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6538	NC_022569	CT	3	6	2104014	2104019	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6539	NC_022569	TTA	2	6	2104036	2104041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_022569	CCA	2	6	2104080	2104085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6541	NC_022569	ATTA	2	8	2104435	2104442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6542	NC_022569	ATTC	2	8	2104504	2104511	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6543	NC_022569	CTG	2	6	2104556	2104561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6544	NC_022569	AAC	2	6	2104618	2104623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6545	NC_022569	TTTTA	2	10	2104648	2104657	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6546	NC_022569	TTA	2	6	2104685	2104690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_022569	ATTT	2	8	2104701	2104708	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_022569	T	8	8	2104742	2104749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6549	NC_022569	T	6	6	2104753	2104758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6550	NC_022569	A	6	6	2104784	2104789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6551	NC_022569	CAA	2	6	2104806	2104811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6552	NC_022569	ATCAA	2	10	2104814	2104823	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6553	NC_022569	A	6	6	2104822	2104827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_022569	A	6	6	2104842	2104847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6555	NC_022569	AT	4	8	2104861	2104868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6556	NC_022569	TA	3	6	2104880	2104885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6557	NC_022569	TAT	2	6	2104891	2104896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6558	NC_022569	A	6	6	2104897	2104902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6559	NC_022569	T	6	6	2104951	2104956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6560	NC_022569	TTG	2	6	2104997	2105002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_022569	ATT	2	6	2105025	2105030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6562	NC_022569	TTA	2	6	2106287	2106292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_022569	ACA	2	6	2106362	2106367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6564	NC_022569	T	6	6	2106372	2106377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6565	NC_022569	GGAAA	2	10	2106412	2106421	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
6566	NC_022569	GAT	2	6	2106433	2106438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6567	NC_022569	GAT	2	6	2106456	2106461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6568	NC_022569	ATC	2	6	2106463	2106468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6569	NC_022569	A	6	6	2106476	2106481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6570	NC_022569	ATT	2	6	2106505	2106510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6571	NC_022569	A	6	6	2106586	2106591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6572	NC_022569	TTA	2	6	2106684	2106689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_022569	GAA	2	6	2106960	2106965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6574	NC_022569	AG	3	6	2106973	2106978	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6575	NC_022569	A	7	7	2106979	2106985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6576	NC_022569	ATG	2	6	2107012	2107017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6577	NC_022569	ACT	2	6	2107033	2107038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6578	NC_022569	A	7	7	2107112	2107118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6579	NC_022569	T	6	6	2107128	2107133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6580	NC_022569	GAT	2	6	2107334	2107339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6581	NC_022569	TA	3	6	2109087	2109092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6582	NC_022569	AGT	2	6	2109094	2109099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6583	NC_022569	GC	3	6	2109113	2109118	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6584	NC_022569	TCG	2	6	2109152	2109157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6585	NC_022569	TC	4	8	2109173	2109180	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6586	NC_022569	CGA	2	6	2109387	2109392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6588	NC_022569	CGC	2	6	2109417	2109422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6589	NC_022569	AGA	2	6	2109627	2109632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6590	NC_022569	GA	3	6	2109658	2109663	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6591	NC_022569	TAA	2	6	2109746	2109751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6592	NC_022569	A	6	6	2109758	2109763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6593	NC_022569	T	6	6	2109838	2109843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6594	NC_022569	CAA	2	6	2109875	2109880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6595	NC_022569	TGG	2	6	2109908	2109913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6597	NC_022569	T	6	6	2110002	2110007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6598	NC_022569	GT	3	6	2110050	2110055	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6599	NC_022569	TAGCT	2	10	2110223	2110232	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6600	NC_022569	GT	3	6	2110247	2110252	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6601	NC_022569	ATT	2	6	2110272	2110277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6602	NC_022569	TTG	2	6	2110297	2110302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6603	NC_022569	GAT	2	6	2110351	2110356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6605	NC_022569	TAT	2	6	2110473	2110478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6606	NC_022569	TGT	2	6	2110509	2110514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6608	NC_022569	AT	3	6	2111210	2111215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6609	NC_022569	ATA	2	6	2111229	2111234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6610	NC_022569	AAT	2	6	2111301	2111306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6611	NC_022569	TGA	2	6	2111318	2111323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6612	NC_022569	AAAC	2	8	2111328	2111335	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6613	NC_022569	A	6	6	2111368	2111373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6614	NC_022569	CAGA	2	8	2111658	2111665	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6615	NC_022569	TTA	2	6	2111691	2111696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6616	NC_022569	T	6	6	2111731	2111736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6617	NC_022569	CTCCAG	2	12	2120878	2120889	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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6619	NC_022569	CCG	2	6	2120908	2120913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6620	NC_022569	AGT	2	6	2123161	2123166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6622	NC_022569	CCT	2	6	2123187	2123192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6623	NC_022569	T	6	6	2125053	2125058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6624	NC_022569	CCGGG	2	10	2125134	2125143	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6625	NC_022569	GTC	2	6	2125152	2125157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6626	NC_022569	CCG	2	6	2128379	2128384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6627	NC_022569	CTG	2	6	2128390	2128395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6628	NC_022569	CCA	2	6	2128416	2128421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6629	NC_022569	CAA	3	9	2128452	2128460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6630	NC_022569	CCG	2	6	2128464	2128469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6631	NC_022569	CCA	2	6	2128521	2128526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6633	NC_022569	CCCCT	2	10	2130883	2130892	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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