MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium DT104 main chromosome

Total Repeats: 14715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_022569	TAAA	2	8	1948873	1948880	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_022569	CAAAAA	2	12	1948910	1948921	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6003	NC_022569	A	7	7	1948949	1948955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_022569	TAA	2	6	1949088	1949093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_022569	TTA	2	6	1949120	1949125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_022569	TTAG	2	8	1949182	1949189	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_022569	TGC	2	6	1949226	1949231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_022569	A	6	6	1949241	1949246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_022569	A	6	6	1949260	1949265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_022569	CTG	2	6	1949274	1949279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_022569	AAG	2	6	1949328	1949333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_022569	ACC	2	6	1949384	1949389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6013	NC_022569	AGT	2	6	1949405	1949410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_022569	CAT	2	6	1949457	1949462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_022569	AATA	2	8	1949494	1949501	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_022569	T	6	6	1949548	1949553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_022569	CAA	2	6	1949633	1949638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_022569	AAC	2	6	1950893	1950898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6019	NC_022569	TAGT	2	8	1950914	1950921	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_022569	CTAAT	2	10	1950955	1950964	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6021	NC_022569	ATT	2	6	1951050	1951055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_022569	AAT	2	6	1952004	1952009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_022569	ATTT	2	8	1952010	1952017	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_022569	GAA	2	6	1952071	1952076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_022569	AAG	2	6	1952090	1952095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_022569	ACT	2	6	1952117	1952122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_022569	A	7	7	1952276	1952282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_022569	TAA	2	6	1952383	1952388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_022569	CCT	2	6	1952406	1952411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6030	NC_022569	T	6	6	1952417	1952422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_022569	AT	3	6	1952426	1952431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_022569	TGAT	2	8	1953915	1953922	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_022569	CCA	2	6	1954028	1954033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6034	NC_022569	GATTT	2	10	1954082	1954091	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_022569	GCA	2	6	1958078	1958083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_022569	GCG	2	6	1958128	1958133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_022569	GCAC	2	8	1958271	1958278	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6038	NC_022569	ATC	2	6	1958334	1958339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_022569	CAG	2	6	1958340	1958345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6040	NC_022569	GAA	2	6	1958369	1958374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_022569	CTC	2	6	1959936	1959941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6042	NC_022569	A	7	7	1960016	1960022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_022569	GTA	2	6	1960135	1960140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_022569	CTG	2	6	1960191	1960196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_022569	CGTT	2	8	1963128	1963135	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6046	NC_022569	AAT	2	6	1963151	1963156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_022569	GGA	2	6	1963223	1963228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_022569	CCA	2	6	1963267	1963272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6049	NC_022569	CGC	2	6	1963785	1963790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6050	NC_022569	AGC	2	6	1963858	1963863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_022569	CTG	2	6	1963891	1963896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_022569	ATG	2	6	1963951	1963956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_022569	CCG	2	6	1964132	1964137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6054	NC_022569	GTT	2	6	1964148	1964153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_022569	ACC	2	6	1966219	1966224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6056	NC_022569	CTG	2	6	1966326	1966331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_022569	ATC	2	6	1966401	1966406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6058	NC_022569	CTG	2	6	1966434	1966439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6059	NC_022569	CG	3	6	1966448	1966453	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6060	NC_022569	CAC	2	6	1966494	1966499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6061	NC_022569	CAG	2	6	1967380	1967385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_022569	GTC	2	6	1967428	1967433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_022569	TAT	2	6	1967436	1967441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_022569	GGC	2	6	1967473	1967478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_022569	TGCC	2	8	1967527	1967534	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6066	NC_022569	TCA	2	6	1967588	1967593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6067	NC_022569	GCCA	2	8	1967747	1967754	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6068	NC_022569	TACCTG	2	12	1967833	1967844	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_022569	GCT	2	6	1975206	1975211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6070	NC_022569	TAT	2	6	1975243	1975248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_022569	GCG	2	6	1975290	1975295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6072	NC_022569	CTG	2	6	1975301	1975306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6073	NC_022569	GTC	2	6	1975379	1975384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6074	NC_022569	GTA	3	9	1975544	1975552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_022569	CCT	2	6	1975619	1975624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6076	NC_022569	CAA	2	6	1976063	1976068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6077	NC_022569	T	7	7	1976643	1976649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_022569	CTC	2	6	1976678	1976683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6079	NC_022569	GCCT	2	8	1976694	1976701	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6080	NC_022569	T	9	9	1976720	1976728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_022569	TTA	2	6	1976736	1976741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_022569	GCCA	2	8	1976841	1976848	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6083	NC_022569	TGT	2	6	1976849	1976854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_022569	ATA	2	6	1976922	1976927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_022569	TCC	2	6	1976932	1976937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6086	NC_022569	CT	3	6	1976974	1976979	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6087	NC_022569	TTG	2	6	1977512	1977517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_022569	TAA	2	6	1977570	1977575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_022569	A	6	6	1977635	1977640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_022569	TAA	2	6	1977739	1977744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_022569	TCC	2	6	1978516	1978521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6092	NC_022569	T	7	7	1978554	1978560	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_022569	AAT	2	6	1978565	1978570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_022569	AAG	2	6	1978632	1978637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6098	NC_022569	GACC	2	8	1978799	1978806	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6099	NC_022569	CCA	2	6	1978832	1978837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6100	NC_022569	T	6	6	1978848	1978853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_022569	GAT	2	6	1978854	1978859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_022569	GTA	2	6	1978873	1978878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_022569	T	6	6	1978902	1978907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_022569	T	6	6	1978923	1978928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_022569	CAG	2	6	1978932	1978937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6107	NC_022569	TAA	2	6	1980827	1980832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_022569	T	7	7	1980857	1980863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_022569	TCA	2	6	1980891	1980896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6110	NC_022569	GC	4	8	1980970	1980977	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6111	NC_022569	GAC	2	6	1981041	1981046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_022569	GCT	2	6	1981085	1981090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_022569	CAC	2	6	1981167	1981172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6114	NC_022569	CGG	2	6	1981180	1981185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6115	NC_022569	CAC	2	6	1981187	1981192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6116	NC_022569	CGG	2	6	1981200	1981205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6117	NC_022569	TCA	2	6	1981240	1981245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6118	NC_022569	ATG	2	6	1981292	1981297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_022569	GCC	2	6	1981314	1981319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6120	NC_022569	TCA	2	6	1981329	1981334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6121	NC_022569	TGCCTT	2	12	1981348	1981359	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_022569	CA	3	6	1981393	1981398	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6123	NC_022569	GCAC	2	8	1981399	1981406	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6124	NC_022569	GCCA	2	8	1981428	1981435	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6125	NC_022569	T	6	6	1981436	1981441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_022569	TTTCA	2	10	1981454	1981463	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6127	NC_022569	GCAC	2	8	1981471	1981478	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6128	NC_022569	C	6	6	1981569	1981574	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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6130	NC_022569	TC	3	6	1982250	1982255	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6266	NC_022569	CTG	2	6	2012457	2012462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6269	NC_022569	CA	3	6	2012526	2012531	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6392	NC_022569	GACT	2	8	2054325	2054332	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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