MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium DT104 main chromosome

Total Repeats: 14715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_022569	GAA	2	6	1509679	1509684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_022569	TCT	2	6	1509736	1509741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4503	NC_022569	A	6	6	1509782	1509787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_022569	GATA	2	8	1509899	1509906	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_022569	T	6	6	1509910	1509915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_022569	A	7	7	1509922	1509928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_022569	TGAT	2	8	1509993	1510000	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_022569	GC	3	6	1510031	1510036	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4509	NC_022569	GACG	2	8	1510043	1510050	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4510	NC_022569	A	6	6	1516359	1516364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_022569	GCC	2	6	1516365	1516370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4512	NC_022569	TAT	2	6	1516371	1516376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_022569	ACA	2	6	1516397	1516402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4514	NC_022569	TCT	2	6	1516862	1516867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4515	NC_022569	AGT	2	6	1517200	1517205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_022569	A	6	6	1517213	1517218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_022569	ACA	2	6	1517333	1517338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4518	NC_022569	T	8	8	1517374	1517381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_022569	C	6	6	1517406	1517411	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4520	NC_022569	CTT	2	6	1517465	1517470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4521	NC_022569	TGG	2	6	1517492	1517497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_022569	ATT	2	6	1517586	1517591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_022569	GAC	2	6	1517592	1517597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4524	NC_022569	AGGG	2	8	1517663	1517670	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_022569	GA	3	6	1518879	1518884	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_022569	TAA	2	6	1519928	1519933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_022569	TAC	2	6	1519949	1519954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4528	NC_022569	C	6	6	1520108	1520113	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4529	NC_022569	CGGTG	2	10	1520136	1520145	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4530	NC_022569	CCTT	2	8	1520271	1520278	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4531	NC_022569	TCA	2	6	1520294	1520299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4532	NC_022569	G	6	6	1520447	1520452	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_022569	GCC	2	6	1520485	1520490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4534	NC_022569	ACG	2	6	1520499	1520504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_022569	CGT	2	6	1520566	1520571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4536	NC_022569	GGA	2	6	1522167	1522172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_022569	GTT	2	6	1522202	1522207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_022569	A	6	6	1522208	1522213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_022569	A	6	6	1523508	1523513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_022569	CGC	2	6	1525251	1525256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4541	NC_022569	TCA	2	6	1525389	1525394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4542	NC_022569	TCAC	2	8	1527749	1527756	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4543	NC_022569	ACA	2	6	1527764	1527769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4544	NC_022569	CGC	2	6	1527793	1527798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4545	NC_022569	CG	3	6	1529156	1529161	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4546	NC_022569	TGG	2	6	1529192	1529197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_022569	AG	3	6	1530969	1530974	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_022569	GGT	2	6	1531030	1531035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_022569	A	6	6	1531040	1531045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_022569	CCG	2	6	1531053	1531058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4551	NC_022569	CGG	2	6	1531062	1531067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4552	NC_022569	GAA	2	6	1531074	1531079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_022569	ACTTA	2	10	1532241	1532250	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4554	NC_022569	AAT	2	6	1532305	1532310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_022569	ATT	2	6	1532311	1532316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_022569	TTA	2	6	1532344	1532349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_022569	AT	3	6	1532379	1532384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_022569	AT	3	6	1532394	1532399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_022569	TTA	2	6	1532403	1532408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_022569	ATGT	2	8	1532416	1532423	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_022569	A	6	6	1532449	1532454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_022569	GCG	2	6	1532467	1532472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4563	NC_022569	T	7	7	1532513	1532519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_022569	TAA	2	6	1532578	1532583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_022569	TAA	2	6	1532599	1532604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_022569	T	6	6	1532632	1532637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_022569	TGA	2	6	1532650	1532655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_022569	TGT	2	6	1533533	1533538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_022569	GTC	2	6	1533598	1533603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4570	NC_022569	ATTG	2	8	1533606	1533613	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_022569	CTG	2	6	1533616	1533621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4572	NC_022569	ATT	2	6	1533635	1533640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_022569	GAA	2	6	1535369	1535374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_022569	ATT	2	6	1535377	1535382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_022569	GA	3	6	1535434	1535439	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_022569	A	6	6	1535478	1535483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_022569	GGC	2	6	1535546	1535551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4578	NC_022569	GCC	2	6	1535601	1535606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4579	NC_022569	CG	3	6	1535632	1535637	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4580	NC_022569	AAT	2	6	1536588	1536593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_022569	ATT	2	6	1536649	1536654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_022569	TGA	2	6	1536716	1536721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_022569	A	7	7	1536742	1536748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_022569	GCTAA	2	10	1536762	1536771	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4585	NC_022569	TAA	2	6	1536787	1536792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_022569	TTAAT	2	10	1536794	1536803	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_022569	ATG	2	6	1536833	1536838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_022569	GCT	2	6	1536898	1536903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4589	NC_022569	A	6	6	1536939	1536944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_022569	T	6	6	1536950	1536955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_022569	AG	3	6	1536992	1536997	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_022569	CTG	2	6	1537015	1537020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4593	NC_022569	CAT	2	6	1537078	1537083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4594	NC_022569	GCG	2	6	1540052	1540057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4595	NC_022569	TTG	2	6	1540106	1540111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_022569	TTC	2	6	1540160	1540165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4597	NC_022569	GCC	2	6	1540170	1540175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4598	NC_022569	TGTA	2	8	1540199	1540206	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_022569	AAT	3	9	1541278	1541286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_022569	GTCG	2	8	1541292	1541299	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4601	NC_022569	AAG	2	6	1541333	1541338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_022569	ATC	2	6	1541407	1541412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4603	NC_022569	T	6	6	1541473	1541478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_022569	CCT	2	6	1541505	1541510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4605	NC_022569	AGC	2	6	1541529	1541534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4606	NC_022569	TC	3	6	1541555	1541560	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4607	NC_022569	ATTTT	2	10	1541599	1541608	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_022569	T	6	6	1541605	1541610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_022569	TGC	2	6	1541615	1541620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_022569	GCA	2	6	1541623	1541628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4611	NC_022569	GGTT	2	8	1542358	1542365	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_022569	TGG	2	6	1543215	1543220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_022569	ATT	2	6	1543230	1543235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_022569	AAC	2	6	1543236	1543241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4615	NC_022569	TAC	2	6	1543252	1543257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4616	NC_022569	T	6	6	1543386	1543391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_022569	GGC	2	6	1543404	1543409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4618	NC_022569	GC	3	6	1543452	1543457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4619	NC_022569	GCA	2	6	1543459	1543464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4620	NC_022569	AGT	2	6	1543489	1543494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_022569	TGGC	2	8	1543512	1543519	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4622	NC_022569	ACC	2	6	1543525	1543530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4623	NC_022569	T	6	6	1543531	1543536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_022569	GCC	2	6	1543550	1543555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4625	NC_022569	T	6	6	1543588	1543593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_022569	GTG	2	6	1543594	1543599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_022569	GGT	2	6	1543603	1543608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_022569	GTT	2	6	1543613	1543618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_022569	TGC	2	6	1543666	1543671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4630	NC_022569	AG	3	6	1543675	1543680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4631	NC_022569	CAA	2	6	1543695	1543700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4633	NC_022569	TTCA	2	8	1543744	1543751	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4899	NC_022569	CAA	2	6	1631615	1631620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4900	NC_022569	GTT	2	6	1631681	1631686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4902	NC_022569	GCT	2	6	1631722	1631727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4903	NC_022569	CGT	2	6	1631827	1631832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4931	NC_022569	CG	3	6	1633192	1633197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4932	NC_022569	GA	3	6	1633223	1633228	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4933	NC_022569	GCC	2	6	1633269	1633274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4948	NC_022569	A	6	6	1633965	1633970	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4959	NC_022569	TTA	2	6	1635255	1635260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4972	NC_022569	T	6	6	1639448	1639453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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