MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 14153

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_022544	A	6	6	4759629	4759634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14002	NC_022544	TGC	2	6	4759664	4759669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14003	NC_022544	TAA	2	6	4759675	4759680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14004	NC_022544	T	6	6	4759723	4759728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14005	NC_022544	TAA	2	6	4759757	4759762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14006	NC_022544	CGT	2	6	4760363	4760368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14007	NC_022544	AAC	3	9	4761689	4761697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14008	NC_022544	CA	3	6	4761725	4761730	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14009	NC_022544	CAG	2	6	4761743	4761748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14010	NC_022544	CCA	2	6	4761757	4761762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14011	NC_022544	CAGG	2	8	4763172	4763179	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14012	NC_022544	ATG	2	6	4763262	4763267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14013	NC_022544	AAC	2	6	4763303	4763308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14014	NC_022544	ATGG	2	8	4763377	4763384	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14015	NC_022544	TTG	2	6	4763394	4763399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14016	NC_022544	ATGA	2	8	4763425	4763432	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14017	NC_022544	ATG	2	6	4763463	4763468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14018	NC_022544	TTAAT	2	10	4763503	4763512	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14019	NC_022544	CAAT	2	8	4763585	4763592	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14020	NC_022544	TAAT	2	8	4763620	4763627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14021	NC_022544	TTA	2	6	4763671	4763676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14022	NC_022544	GGC	2	6	4763694	4763699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14023	NC_022544	GGA	2	6	4763708	4763713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14024	NC_022544	TC	3	6	4765590	4765595	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14025	NC_022544	ATA	2	6	4765674	4765679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14026	NC_022544	CAG	3	9	4765691	4765699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14027	NC_022544	ATG	2	6	4766537	4766542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14028	NC_022544	AATGAT	2	12	4766551	4766562	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14029	NC_022544	TTAT	2	8	4767723	4767730	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14030	NC_022544	GTT	3	9	4767800	4767808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14031	NC_022544	TCA	2	6	4767853	4767858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14032	NC_022544	AT	3	6	4767913	4767918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14033	NC_022544	TTATCA	2	12	4767932	4767943	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14034	NC_022544	AGGA	2	8	4768212	4768219	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14035	NC_022544	G	8	8	4768237	4768244	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14036	NC_022544	GATT	2	8	4768404	4768411	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14037	NC_022544	GCGCT	2	10	4768485	4768494	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14038	NC_022544	GGC	2	6	4769557	4769562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14039	NC_022544	TAG	2	6	4769568	4769573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14040	NC_022544	CGC	2	6	4771228	4771233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14041	NC_022544	AAG	2	6	4771242	4771247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14042	NC_022544	CCG	2	6	4772866	4772871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14043	NC_022544	T	6	6	4772929	4772934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14044	NC_022544	T	6	6	4772949	4772954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14045	NC_022544	TGA	2	6	4773003	4773008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14046	NC_022544	TAA	2	6	4773086	4773091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14047	NC_022544	CGT	2	6	4773118	4773123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14048	NC_022544	TCG	2	6	4773866	4773871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14049	NC_022544	TCC	2	6	4773879	4773884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14050	NC_022544	CAC	2	6	4773911	4773916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14051	NC_022544	GCC	2	6	4774035	4774040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14052	NC_022544	TGG	2	6	4774052	4774057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14053	NC_022544	CTGG	2	8	4774059	4774066	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14054	NC_022544	CGGCG	2	10	4774076	4774085	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
14055	NC_022544	TCG	3	9	4774096	4774104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14056	NC_022544	AT	3	6	4774170	4774175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14057	NC_022544	A	7	7	4774251	4774257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14058	NC_022544	GCC	2	6	4776132	4776137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14059	NC_022544	GGC	2	6	4778585	4778590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14060	NC_022544	GAA	2	6	4778624	4778629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14061	NC_022544	CGG	2	6	4778640	4778645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14062	NC_022544	GCGCT	2	10	4779597	4779606	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14063	NC_022544	GCC	2	6	4779651	4779656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14064	NC_022544	AGG	2	6	4779691	4779696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14065	NC_022544	CTGAT	2	10	4781032	4781041	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14066	NC_022544	ATT	2	6	4781044	4781049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14067	NC_022544	TGT	2	6	4782304	4782309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14068	NC_022544	TCG	2	6	4782389	4782394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14069	NC_022544	AC	3	6	4782437	4782442	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14070	NC_022544	GCC	2	6	4782467	4782472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14071	NC_022544	AAC	2	6	4782483	4782488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14072	NC_022544	A	6	6	4786910	4786915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14073	NC_022544	TAA	3	9	4786932	4786940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14074	NC_022544	CTG	2	6	4786955	4786960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14076	NC_022544	ATA	2	6	4786999	4787004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14077	NC_022544	TGT	2	6	4788545	4788550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14078	NC_022544	TAA	2	6	4788556	4788561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14079	NC_022544	ATC	2	6	4788590	4788595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14080	NC_022544	TGA	2	6	4788601	4788606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14081	NC_022544	ATA	2	6	4788648	4788653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14082	NC_022544	TAG	2	6	4788670	4788675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14083	NC_022544	AGTG	2	8	4788678	4788685	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14084	NC_022544	TGT	2	6	4788726	4788731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14085	NC_022544	ATA	2	6	4788741	4788746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14086	NC_022544	TC	3	6	4788762	4788767	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14087	NC_022544	ATT	2	6	4788772	4788777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14088	NC_022544	TTA	2	6	4789815	4789820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14089	NC_022544	CTG	2	6	4790483	4790488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14091	NC_022544	TGTA	2	8	4793032	4793039	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14092	NC_022544	TGT	2	6	4793044	4793049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14093	NC_022544	TGT	2	6	4793110	4793115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14094	NC_022544	AAGCG	2	10	4793125	4793134	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
14095	NC_022544	AAGCGC	2	12	4794497	4794508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14096	NC_022544	CAGC	2	8	4796274	4796281	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14097	NC_022544	A	6	6	4796304	4796309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14098	NC_022544	GTTAT	2	10	4798350	4798359	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14099	NC_022544	CGG	2	6	4798386	4798391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14100	NC_022544	CGC	2	6	4798769	4798774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14101	NC_022544	A	8	8	4799381	4799388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14102	NC_022544	CAA	2	6	4800922	4800927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14103	NC_022544	ATA	2	6	4800953	4800958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14104	NC_022544	T	6	6	4800962	4800967	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14105	NC_022544	T	9	9	4800987	4800995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14106	NC_022544	T	7	7	4801008	4801014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14107	NC_022544	ATT	2	6	4801032	4801037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14108	NC_022544	ATTTT	2	10	4801059	4801068	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14109	NC_022544	TAA	2	6	4801077	4801082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14110	NC_022544	TGC	2	6	4802310	4802315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14111	NC_022544	GTCGCC	2	12	4802333	4802344	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14112	NC_022544	CCG	2	6	4802392	4802397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14113	NC_022544	CG	3	6	4802396	4802401	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14114	NC_022544	GCT	2	6	4802431	4802436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14115	NC_022544	GGC	2	6	4802437	4802442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14116	NC_022544	CGA	2	6	4802452	4802457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14117	NC_022544	CTG	2	6	4803747	4803752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14118	NC_022544	GC	4	8	4805132	4805139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14119	NC_022544	CCA	2	6	4806872	4806877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14120	NC_022544	GTAAAA	2	12	4809437	4809448	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14121	NC_022544	CCTG	2	8	4810188	4810195	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14122	NC_022544	TTG	2	6	4810769	4810774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14123	NC_022544	ATAAA	2	10	4810810	4810819	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14124	NC_022544	ATATT	2	10	4810820	4810829	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14125	NC_022544	CTT	2	6	4810844	4810849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14126	NC_022544	TCTGT	2	10	4810850	4810859	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
14127	NC_022544	GGC	2	6	4810869	4810874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14128	NC_022544	TAA	2	6	4810961	4810966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14129	NC_022544	AAG	2	6	4810977	4810982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14130	NC_022544	TGA	2	6	4810989	4810994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14131	NC_022544	T	6	6	4811018	4811023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14132	NC_022544	ATA	2	6	4811025	4811030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14133	NC_022544	TTA	2	6	4811032	4811037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14134	NC_022544	GGA	2	6	4811044	4811049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14135	NC_022544	TTTA	2	8	4811050	4811057	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14136	NC_022544	TAA	2	6	4811078	4811083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14137	NC_022544	ACG	2	6	4811087	4811092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14138	NC_022544	ATT	2	6	4811783	4811788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14139	NC_022544	CAA	2	6	4811873	4811878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14140	NC_022544	TGA	2	6	4811955	4811960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14141	NC_022544	T	6	6	4812508	4812513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14142	NC_022544	AGG	2	6	4812641	4812646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14143	NC_022544	CCTG	2	8	4813510	4813517	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14144	NC_022544	TAA	2	6	4813715	4813720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14145	NC_022544	AT	3	6	4813738	4813743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14146	NC_022544	TGA	2	6	4813772	4813777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14147	NC_022544	ATC	2	6	4813779	4813784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14148	NC_022544	TCA	2	6	4813803	4813808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14149	NC_022544	TAA	2	6	4813846	4813851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14150	NC_022544	TGA	2	6	4813855	4813860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14151	NC_022544	TAAAT	2	10	4813883	4813892	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14152	NC_022544	TAAA	2	8	4813898	4813905	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14153	NC_022544	ATA	2	6	4814796	4814801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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