MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 14153

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_022544	AGC	2	6	4396694	4396699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13002	NC_022544	CAGAA	2	10	4398176	4398185	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
13003	NC_022544	TAAA	2	8	4398220	4398227	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13004	NC_022544	T	6	6	4398266	4398271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13005	NC_022544	GCC	2	6	4398321	4398326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13006	NC_022544	ATT	2	6	4398341	4398346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13007	NC_022544	TA	3	6	4398352	4398357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13008	NC_022544	AGA	2	6	4398459	4398464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13009	NC_022544	CGC	2	6	4400184	4400189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13010	NC_022544	ATA	2	6	4400212	4400217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13011	NC_022544	T	7	7	4400241	4400247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13012	NC_022544	TTTG	2	8	4400398	4400405	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13013	NC_022544	TTAA	2	8	4400406	4400413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13014	NC_022544	CTT	2	6	4400429	4400434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13015	NC_022544	CATT	2	8	4400541	4400548	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13016	NC_022544	TAACCA	2	12	4400822	4400833	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13017	NC_022544	ATAA	2	8	4404408	4404415	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13018	NC_022544	A	6	6	4404414	4404419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13019	NC_022544	CGC	2	6	4404459	4404464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13020	NC_022544	A	7	7	4404957	4404963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13021	NC_022544	ATAAC	2	10	4405002	4405011	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
13022	NC_022544	TTA	2	6	4405953	4405958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13023	NC_022544	GGT	2	6	4408863	4408868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13024	NC_022544	TCC	2	6	4408909	4408914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13025	NC_022544	CA	3	6	4408983	4408988	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13026	NC_022544	GCGG	2	8	4409006	4409013	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13027	NC_022544	TCC	2	6	4409068	4409073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13028	NC_022544	CCT	2	6	4409076	4409081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13029	NC_022544	A	6	6	4409089	4409094	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13030	NC_022544	G	6	6	4409098	4409103	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13031	NC_022544	GGA	2	6	4409105	4409110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_022544	CAT	2	6	4409144	4409149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13033	NC_022544	A	7	7	4410312	4410318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13034	NC_022544	TGA	2	6	4411804	4411809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13035	NC_022544	GCC	2	6	4411835	4411840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13036	NC_022544	GC	3	6	4411863	4411868	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13037	NC_022544	GCA	2	6	4412855	4412860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13038	NC_022544	T	7	7	4412884	4412890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13039	NC_022544	T	7	7	4412912	4412918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13040	NC_022544	C	6	6	4412951	4412956	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13041	NC_022544	TAA	2	6	4416935	4416940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13042	NC_022544	TGT	2	6	4416983	4416988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13043	NC_022544	TAA	2	6	4417060	4417065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13044	NC_022544	T	6	6	4417479	4417484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13045	NC_022544	TA	3	6	4417519	4417524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13046	NC_022544	TA	3	6	4417540	4417545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13047	NC_022544	GCC	2	6	4418192	4418197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13048	NC_022544	GCGCT	2	10	4418222	4418231	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13049	NC_022544	GAT	2	6	4418261	4418266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13050	NC_022544	TCGTT	2	10	4418314	4418323	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
13051	NC_022544	ATT	2	6	4419722	4419727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13052	NC_022544	CAG	2	6	4419736	4419741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13053	NC_022544	ATG	2	6	4419788	4419793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13054	NC_022544	CT	3	6	4420083	4420088	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13055	NC_022544	GCC	2	6	4420092	4420097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13056	NC_022544	GCT	2	6	4420676	4420681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13057	NC_022544	AT	3	6	4420708	4420713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13058	NC_022544	AAC	2	6	4420774	4420779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13059	NC_022544	GGA	2	6	4420837	4420842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13060	NC_022544	ATA	2	6	4420856	4420861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13061	NC_022544	T	6	6	4422244	4422249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13062	NC_022544	TTAT	2	8	4422260	4422267	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13063	NC_022544	CAC	2	6	4423297	4423302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13064	NC_022544	TA	3	6	4423333	4423338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13065	NC_022544	AAT	2	6	4423341	4423346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13066	NC_022544	GCC	2	6	4423404	4423409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13067	NC_022544	ACT	2	6	4423447	4423452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13068	NC_022544	T	6	6	4423466	4423471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13069	NC_022544	ATT	2	6	4423739	4423744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13070	NC_022544	TACA	2	8	4423791	4423798	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13071	NC_022544	A	7	7	4423806	4423812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13072	NC_022544	TCC	2	6	4424843	4424848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13073	NC_022544	CGG	2	6	4427436	4427441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13074	NC_022544	GCGCTT	2	12	4427450	4427461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13075	NC_022544	CCA	2	6	4427533	4427538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13076	NC_022544	TCT	2	6	4427553	4427558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13077	NC_022544	TGT	2	6	4428857	4428862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13078	NC_022544	ATC	2	6	4428864	4428869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13079	NC_022544	T	6	6	4428873	4428878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13080	NC_022544	TCCT	2	8	4428899	4428906	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13081	NC_022544	T	6	6	4428938	4428943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13082	NC_022544	TAA	2	6	4428960	4428965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13083	NC_022544	A	7	7	4428999	4429005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13084	NC_022544	TGTT	2	8	4429029	4429036	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13085	NC_022544	CGCC	2	8	4429176	4429183	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13086	NC_022544	GAC	2	6	4429206	4429211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13088	NC_022544	CGA	2	6	4429271	4429276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13089	NC_022544	A	6	6	4429302	4429307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13090	NC_022544	AAC	2	6	4429310	4429315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13091	NC_022544	AAG	2	6	4429341	4429346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13092	NC_022544	CGG	2	6	4429467	4429472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13093	NC_022544	GAA	2	6	4429543	4429548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13094	NC_022544	TCT	2	6	4429557	4429562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13095	NC_022544	GC	3	6	4429627	4429632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13096	NC_022544	GCAG	2	8	4429660	4429667	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13097	NC_022544	T	6	6	4429734	4429739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13098	NC_022544	TGC	2	6	4429790	4429795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13099	NC_022544	GTTT	2	8	4429812	4429819	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13100	NC_022544	AGGA	2	8	4429822	4429829	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13101	NC_022544	GGC	2	6	4431428	4431433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13102	NC_022544	ATG	2	6	4431485	4431490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13103	NC_022544	GCG	2	6	4431513	4431518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13104	NC_022544	CAA	2	6	4434478	4434483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13105	NC_022544	CG	3	6	4434493	4434498	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13106	NC_022544	A	6	6	4435137	4435142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13107	NC_022544	CTG	2	6	4435180	4435185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13108	NC_022544	TAT	2	6	4435222	4435227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13109	NC_022544	A	6	6	4435246	4435251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13110	NC_022544	CAT	2	6	4435312	4435317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13111	NC_022544	AT	3	6	4435394	4435399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13112	NC_022544	T	6	6	4435412	4435417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13113	NC_022544	ACA	2	6	4435419	4435424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13114	NC_022544	TAT	2	6	4435461	4435466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13115	NC_022544	TTAA	2	8	4435473	4435480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13116	NC_022544	TGA	2	6	4435498	4435503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13117	NC_022544	ATATG	2	10	4435510	4435519	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13118	NC_022544	TA	3	6	4435576	4435581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13119	NC_022544	A	6	6	4435581	4435586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13120	NC_022544	T	7	7	4435603	4435609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13121	NC_022544	T	6	6	4435622	4435627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13122	NC_022544	TTA	2	6	4435637	4435642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13124	NC_022544	TTA	2	6	4435728	4435733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13125	NC_022544	CGG	2	6	4435821	4435826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13126	NC_022544	TGA	2	6	4435842	4435847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13127	NC_022544	T	6	6	4435851	4435856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13128	NC_022544	TAT	2	6	4435886	4435891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13129	NC_022544	TAGT	2	8	4435903	4435910	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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13131	NC_022544	A	7	7	4435935	4435941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13132	NC_022544	TTAA	2	8	4435954	4435961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13133	NC_022544	TGT	2	6	4435974	4435979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13263	NC_022544	ATT	2	6	4499477	4499482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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