MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 14153

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_022544	ACT	2	6	3326217	3326222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10002	NC_022544	GAT	2	6	3326935	3326940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_022544	GCGCT	2	10	3328234	3328243	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10004	NC_022544	AT	3	6	3329185	3329190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_022544	A	6	6	3329204	3329209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_022544	ATT	2	6	3329216	3329221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_022544	CCTG	2	8	3329592	3329599	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10008	NC_022544	TAT	2	6	3329641	3329646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_022544	TAAA	2	8	3329659	3329666	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_022544	CTCC	2	8	3331652	3331659	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10011	NC_022544	A	6	6	3331679	3331684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_022544	AGC	3	9	3331703	3331711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10013	NC_022544	GCT	2	6	3332026	3332031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10014	NC_022544	AGTTGT	2	12	3332046	3332057	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_022544	TCAT	2	8	3332122	3332129	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10016	NC_022544	GGC	2	6	3332140	3332145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10017	NC_022544	AG	3	6	3332147	3332152	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_022544	GAA	2	6	3332220	3332225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_022544	ATCG	2	8	3334016	3334023	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10020	NC_022544	CGC	2	6	3335992	3335997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10021	NC_022544	CGC	3	9	3336009	3336017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10022	NC_022544	GGC	2	6	3336020	3336025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10023	NC_022544	T	7	7	3336027	3336033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10024	NC_022544	CAG	2	6	3336806	3336811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10025	NC_022544	CCA	2	6	3336815	3336820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10026	NC_022544	AT	3	6	3337692	3337697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10027	NC_022544	AATGAT	2	12	3337714	3337725	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_022544	T	6	6	3337750	3337755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_022544	CAA	2	6	3337825	3337830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10030	NC_022544	CAT	2	6	3337854	3337859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10031	NC_022544	AT	3	6	3337875	3337880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_022544	AGG	2	6	3337891	3337896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_022544	ATG	2	6	3337899	3337904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_022544	AAT	2	6	3340129	3340134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_022544	ATT	2	6	3340176	3340181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_022544	AGTA	2	8	3340182	3340189	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_022544	TAA	2	6	3340239	3340244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_022544	GAAA	2	8	3340246	3340253	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_022544	TTAT	2	8	3340277	3340284	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_022544	AATA	2	8	3340327	3340334	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10041	NC_022544	ATT	2	6	3340339	3340344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10042	NC_022544	CT	3	6	3340368	3340373	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10043	NC_022544	ATG	2	6	3340374	3340379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_022544	CTAC	2	8	3340453	3340460	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10045	NC_022544	GTT	2	6	3342067	3342072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_022544	CGC	3	9	3342216	3342224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10047	NC_022544	AC	3	6	3342232	3342237	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10048	NC_022544	ATT	2	6	3342313	3342318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10049	NC_022544	GC	3	6	3342459	3342464	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10050	NC_022544	T	6	6	3343856	3343861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_022544	CAC	2	6	3343877	3343882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10052	NC_022544	AGT	2	6	3343917	3343922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_022544	AAT	2	6	3343943	3343948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_022544	CCT	2	6	3347209	3347214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10055	NC_022544	GCG	2	6	3347228	3347233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10056	NC_022544	TGA	2	6	3347288	3347293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_022544	TGCC	2	8	3347863	3347870	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10058	NC_022544	T	6	6	3347903	3347908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_022544	TG	3	6	3349825	3349830	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_022544	TTG	2	6	3349888	3349893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10061	NC_022544	T	12	12	3349964	3349975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_022544	A	6	6	3351077	3351082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_022544	GCTT	2	8	3351344	3351351	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10064	NC_022544	TCG	2	6	3351362	3351367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10065	NC_022544	ACC	2	6	3351428	3351433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10066	NC_022544	A	6	6	3351443	3351448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10067	NC_022544	TCTT	2	8	3351467	3351474	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10068	NC_022544	GGC	2	6	3351504	3351509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10069	NC_022544	CCTTC	2	10	3351527	3351536	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
10070	NC_022544	GCC	2	6	3351573	3351578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10071	NC_022544	CTG	2	6	3351607	3351612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10072	NC_022544	GCT	2	6	3351642	3351647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10073	NC_022544	ACC	2	6	3351718	3351723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10074	NC_022544	TCA	2	6	3351813	3351818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10075	NC_022544	ACC	2	6	3351828	3351833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10076	NC_022544	CTG	2	6	3351864	3351869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10077	NC_022544	GTC	2	6	3351870	3351875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10078	NC_022544	TGC	2	6	3351889	3351894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10079	NC_022544	TGG	2	6	3351904	3351909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10080	NC_022544	TCG	2	6	3351938	3351943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10081	NC_022544	GCCT	2	8	3351966	3351973	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10082	NC_022544	GCG	2	6	3351982	3351987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10083	NC_022544	CTT	2	6	3351995	3352000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10084	NC_022544	GCC	2	6	3352014	3352019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10085	NC_022544	TACT	2	8	3352070	3352077	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10086	NC_022544	GGC	2	6	3352148	3352153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10087	NC_022544	GCT	3	9	3352193	3352201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10088	NC_022544	GTG	2	6	3352206	3352211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10089	NC_022544	TG	3	6	3352219	3352224	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10090	NC_022544	GCG	2	6	3352228	3352233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10091	NC_022544	TGC	2	6	3352258	3352263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10092	NC_022544	GTA	2	6	3352317	3352322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10093	NC_022544	TAT	2	6	3352334	3352339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_022544	TGTTC	2	10	3352388	3352397	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10095	NC_022544	CCCT	2	8	3352654	3352661	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10096	NC_022544	ACG	2	6	3352686	3352691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10097	NC_022544	TG	3	6	3352751	3352756	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10098	NC_022544	TGCT	2	8	3352761	3352768	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10099	NC_022544	TCAC	2	8	3353978	3353985	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10100	NC_022544	TAA	2	6	3354017	3354022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10101	NC_022544	TTA	2	6	3354044	3354049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10102	NC_022544	ACTC	2	8	3354489	3354496	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10103	NC_022544	GC	3	6	3354540	3354545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10104	NC_022544	GAA	2	6	3354574	3354579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_022544	AGA	2	6	3354609	3354614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10106	NC_022544	GC	4	8	3354642	3354649	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10107	NC_022544	AG	3	6	3354654	3354659	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10108	NC_022544	GTGAT	2	10	3354683	3354692	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_022544	CGC	3	9	3354711	3354719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10110	NC_022544	GAT	2	6	3354727	3354732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10111	NC_022544	CTG	2	6	3354799	3354804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10112	NC_022544	CGT	2	6	3354808	3354813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10113	NC_022544	TCTTT	2	10	3355516	3355525	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10114	NC_022544	TGG	2	6	3355554	3355559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10115	NC_022544	T	6	6	3355603	3355608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_022544	A	6	6	3355610	3355615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_022544	A	6	6	3356161	3356166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_022544	GA	4	8	3356202	3356209	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_022544	TCC	2	6	3357207	3357212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10120	NC_022544	TTA	2	6	3357221	3357226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10121	NC_022544	ATT	2	6	3357306	3357311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10124	NC_022544	CG	3	6	3357715	3357720	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10125	NC_022544	AG	3	6	3358710	3358715	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10126	NC_022544	TAA	2	6	3358718	3358723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10129	NC_022544	GGC	2	6	3359629	3359634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10130	NC_022544	AGCGC	2	10	3359674	3359683	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10131	NC_022544	AAC	3	9	3361039	3361047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10132	NC_022544	GTAG	2	8	3362414	3362421	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10133	NC_022544	T	8	8	3362425	3362432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10134	NC_022544	GCA	2	6	3362445	3362450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10135	NC_022544	TAA	2	6	3362489	3362494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10136	NC_022544	TGT	2	6	3362590	3362595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10137	NC_022544	CAA	2	6	3362621	3362626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10138	NC_022544	A	6	6	3362625	3362630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10139	NC_022544	TCT	2	6	3362666	3362671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10141	NC_022544	ATCCT	2	10	3369079	3369088	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
10142	NC_022544	TAAA	2	8	3371239	3371246	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10143	NC_022544	TCAA	2	8	3371301	3371308	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10144	NC_022544	A	6	6	3371307	3371312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10146	NC_022544	TCAA	2	8	3371393	3371400	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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10148	NC_022544	TTTG	2	8	3371520	3371527	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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10152	NC_022544	CTTT	2	8	3371975	3371982	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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10157	NC_022544	CGT	2	6	3372108	3372113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10161	NC_022544	CGT	2	6	3372224	3372229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10162	NC_022544	TCAT	2	8	3372236	3372243	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10163	NC_022544	CG	3	6	3372911	3372916	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10164	NC_022544	TC	3	6	3375062	3375067	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10165	NC_022544	GCC	2	6	3375895	3375900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10186	NC_022544	ACA	2	6	3384479	3384484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10240	NC_022544	A	6	6	3411126	3411131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10241	NC_022544	ATC	2	6	3411196	3411201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10242	NC_022544	CAA	2	6	3411221	3411226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10243	NC_022544	GGC	2	6	3411227	3411232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10244	NC_022544	GAGC	2	8	3411278	3411285	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10245	NC_022544	GAC	2	6	3411312	3411317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10246	NC_022544	TTCC	2	8	3414006	3414013	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10247	NC_022544	A	7	7	3416026	3416032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10248	NC_022544	A	6	6	3416068	3416073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10249	NC_022544	CGG	2	6	3416119	3416124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10250	NC_022544	T	7	7	3416147	3416153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10251	NC_022544	CGA	2	6	3416240	3416245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10252	NC_022544	CGA	2	6	3416263	3416268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10253	NC_022544	GCT	2	6	3416277	3416282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10254	NC_022544	CTG	2	6	3416340	3416345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10255	NC_022544	GGACG	2	10	3416360	3416369	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
10256	NC_022544	ATGA	2	8	3416433	3416440	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10257	NC_022544	GAT	2	6	3416544	3416549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10258	NC_022544	ATTT	2	8	3416563	3416570	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10259	NC_022544	TCAA	2	8	3416613	3416620	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10260	NC_022544	CGT	2	6	3417985	3417990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10261	NC_022544	T	6	6	3418017	3418022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10262	NC_022544	ACT	2	6	3419179	3419184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10263	NC_022544	ACT	2	6	3419243	3419248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10264	NC_022544	GAT	2	6	3419265	3419270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10265	NC_022544	AG	3	6	3419311	3419316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10266	NC_022544	ACAT	2	8	3419318	3419325	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10267	NC_022544	GTAT	2	8	3419328	3419335	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10268	NC_022544	CCT	2	6	3419396	3419401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10269	NC_022544	CT	3	6	3419400	3419405	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10270	NC_022544	A	8	8	3419426	3419433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10271	NC_022544	TCTT	2	8	3419448	3419455	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10272	NC_022544	ACC	2	6	3419510	3419515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10288	NC_022544	CTTT	2	8	3426312	3426319	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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10292	NC_022544	A	7	7	3426924	3426930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10374	NC_022544	A	6	6	3471799	3471804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10375	NC_022544	CT	3	6	3471805	3471810	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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10377	NC_022544	GCGCT	2	10	3471951	3471960	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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10381	NC_022544	CT	4	8	3473727	3473734	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10382	NC_022544	TAT	2	6	3473752	3473757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10383	NC_022544	TTCA	2	8	3473814	3473821	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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10385	NC_022544	GATGT	2	10	3475237	3475246	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10386	NC_022544	TGC	3	9	3475264	3475272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10387	NC_022544	T	6	6	3475280	3475285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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