MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 14153

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_022544	TCC	2	6	3005743	3005748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9002	NC_022544	TCA	2	6	3005761	3005766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9003	NC_022544	TTG	2	6	3005795	3005800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9004	NC_022544	CAAG	2	8	3005861	3005868	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9005	NC_022544	CT	3	6	3006026	3006031	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9006	NC_022544	TCT	3	9	3006029	3006037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9007	NC_022544	CCG	2	6	3006057	3006062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9008	NC_022544	ATCA	2	8	3006094	3006101	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9009	NC_022544	A	6	6	3006114	3006119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9010	NC_022544	AT	3	6	3006131	3006136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9011	NC_022544	TGA	2	6	3006150	3006155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9012	NC_022544	AAT	2	6	3006176	3006181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9013	NC_022544	CTT	2	6	3006232	3006237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9014	NC_022544	TAT	2	6	3006293	3006298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9015	NC_022544	AGG	2	6	3006322	3006327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9016	NC_022544	AAT	2	6	3007161	3007166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9017	NC_022544	CAA	2	6	3007245	3007250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9018	NC_022544	CCATCG	2	12	3007274	3007285	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9019	NC_022544	CACC	2	8	3007289	3007296	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
9020	NC_022544	GCC	2	6	3007326	3007331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9021	NC_022544	ACT	2	6	3007366	3007371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9022	NC_022544	ACG	2	6	3007374	3007379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9023	NC_022544	CTTT	2	8	3007391	3007398	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9024	NC_022544	TGC	2	6	3007411	3007416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9025	NC_022544	TTTGC	2	10	3007440	3007449	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
9026	NC_022544	CAA	2	6	3007506	3007511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9027	NC_022544	TTAA	2	8	3007618	3007625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9028	NC_022544	AT	4	8	3007638	3007645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9029	NC_022544	TAA	2	6	3007677	3007682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9030	NC_022544	T	6	6	3007721	3007726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9031	NC_022544	TA	3	6	3008438	3008443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9032	NC_022544	CCCT	2	8	3008451	3008458	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
9033	NC_022544	A	7	7	3008563	3008569	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9034	NC_022544	TGT	2	6	3009128	3009133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9035	NC_022544	ATG	2	6	3009143	3009148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9036	NC_022544	A	7	7	3009254	3009260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9037	NC_022544	ATGA	2	8	3009275	3009282	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9038	NC_022544	GC	3	6	3011879	3011884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9039	NC_022544	TCC	2	6	3013490	3013495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9040	NC_022544	AAT	2	6	3013564	3013569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9041	NC_022544	CGGA	2	8	3014527	3014534	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9042	NC_022544	GTT	2	6	3020700	3020705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9043	NC_022544	A	6	6	3020710	3020715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9044	NC_022544	T	6	6	3020731	3020736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9045	NC_022544	AAAG	2	8	3020803	3020810	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9046	NC_022544	GCG	2	6	3021589	3021594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9047	NC_022544	T	6	6	3022057	3022062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9048	NC_022544	ACGA	2	8	3022155	3022162	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9049	NC_022544	T	7	7	3024472	3024478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9050	NC_022544	TACT	2	8	3024487	3024494	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9051	NC_022544	CAG	2	6	3024640	3024645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9052	NC_022544	GC	3	6	3024655	3024660	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9053	NC_022544	AAC	2	6	3024692	3024697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9054	NC_022544	GTG	2	6	3024734	3024739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9055	NC_022544	TCA	2	6	3024860	3024865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9056	NC_022544	TTC	2	6	3024892	3024897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9057	NC_022544	GTGCG	2	10	3024936	3024945	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
9058	NC_022544	CCA	2	6	3025036	3025041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9059	NC_022544	CGG	2	6	3025160	3025165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9060	NC_022544	ACC	2	6	3025175	3025180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9061	NC_022544	CTT	3	9	3025254	3025262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9062	NC_022544	GTG	2	6	3025275	3025280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9063	NC_022544	AC	3	6	3025320	3025325	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9064	NC_022544	TG	3	6	3025328	3025333	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9065	NC_022544	CTT	2	6	3025353	3025358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9066	NC_022544	TCA	2	6	3025427	3025432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9067	NC_022544	CCG	2	6	3025537	3025542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9068	NC_022544	A	6	6	3026691	3026696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9069	NC_022544	AAC	2	6	3026704	3026709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9070	NC_022544	TCA	2	6	3026819	3026824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9071	NC_022544	CAT	3	9	3030801	3030809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9072	NC_022544	TTG	2	6	3030924	3030929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9078	NC_022544	CAG	2	6	3031186	3031191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9080	NC_022544	TGG	2	6	3031230	3031235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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9082	NC_022544	GGT	2	6	3031338	3031343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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9091	NC_022544	TTCG	2	8	3035846	3035853	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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9099	NC_022544	AC	3	6	3036957	3036962	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9100	NC_022544	TA	3	6	3036969	3036974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9101	NC_022544	T	6	6	3036991	3036996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9102	NC_022544	TTA	3	9	3037035	3037043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9105	NC_022544	T	6	6	3045568	3045573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9106	NC_022544	TA	3	6	3045636	3045641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9109	NC_022544	TAT	2	6	3045672	3045677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9110	NC_022544	TCT	2	6	3045695	3045700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9111	NC_022544	GAA	2	6	3045702	3045707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9112	NC_022544	TCC	2	6	3045723	3045728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9113	NC_022544	A	8	8	3045755	3045762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9114	NC_022544	GCG	2	6	3045772	3045777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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9119	NC_022544	TC	3	6	3045861	3045866	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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9122	NC_022544	A	6	6	3045892	3045897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9123	NC_022544	GA	3	6	3045898	3045903	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9124	NC_022544	AT	3	6	3045912	3045917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9125	NC_022544	AAT	2	6	3045934	3045939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9128	NC_022544	TGCCT	2	10	3047752	3047761	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
9129	NC_022544	GC	3	6	3051264	3051269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9130	NC_022544	CAGT	2	8	3051299	3051306	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9131	NC_022544	GTC	2	6	3051316	3051321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9132	NC_022544	CGT	2	6	3051325	3051330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9133	NC_022544	AAG	2	6	3051529	3051534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9134	NC_022544	TTA	2	6	3051583	3051588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9135	NC_022544	ATTG	2	8	3051609	3051616	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9136	NC_022544	ATT	2	6	3051620	3051625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9137	NC_022544	AATT	2	8	3051646	3051653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9138	NC_022544	A	6	6	3051691	3051696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9139	NC_022544	CGG	2	6	3051716	3051721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9140	NC_022544	T	7	7	3051722	3051728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9141	NC_022544	TTA	2	6	3052113	3052118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9142	NC_022544	ACG	2	6	3052159	3052164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9144	NC_022544	GTG	2	6	3052191	3052196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9145	NC_022544	TTTAC	2	10	3053038	3053047	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9146	NC_022544	GATTAT	2	12	3053077	3053088	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9147	NC_022544	TTG	2	6	3053102	3053107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9148	NC_022544	CTG	2	6	3053224	3053229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9150	NC_022544	GC	3	6	3053431	3053436	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9151	NC_022544	CA	3	6	3053496	3053501	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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9154	NC_022544	AAC	2	6	3053739	3053744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9155	NC_022544	TTTCG	2	10	3053756	3053765	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
9156	NC_022544	CTG	2	6	3053774	3053779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9159	NC_022544	ATCGA	2	10	3053976	3053985	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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9163	NC_022544	T	8	8	3054232	3054239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9164	NC_022544	CCTGTT	2	12	3054240	3054251	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9165	NC_022544	CAC	2	6	3054301	3054306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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9167	NC_022544	AT	3	6	3054543	3054548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9193	NC_022544	A	7	7	3060098	3060104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9194	NC_022544	CACCC	2	10	3060123	3060132	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
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9204	NC_022544	ATA	2	6	3060344	3060349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9205	NC_022544	TAT	2	6	3060354	3060359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9254	NC_022544	T	6	6	3079162	3079167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9262	NC_022544	CCG	3	9	3079624	3079632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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9264	NC_022544	ATG	2	6	3079666	3079671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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