MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 14153

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_022544	AGA	2	6	2855706	2855711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8502	NC_022544	CAC	2	6	2855728	2855733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8503	NC_022544	CCA	2	6	2855782	2855787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8504	NC_022544	CAG	2	6	2855812	2855817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8505	NC_022544	CGG	2	6	2855905	2855910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8506	NC_022544	ACC	2	6	2855915	2855920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8507	NC_022544	GCG	2	6	2855945	2855950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8508	NC_022544	AGG	2	6	2855952	2855957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8509	NC_022544	GAA	2	6	2855986	2855991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8510	NC_022544	GAAG	2	8	2856002	2856009	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8511	NC_022544	GGC	2	6	2856040	2856045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8512	NC_022544	ATG	2	6	2856059	2856064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8513	NC_022544	CAG	2	6	2856256	2856261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8514	NC_022544	CGG	2	6	2856399	2856404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8515	NC_022544	GCA	2	6	2856408	2856413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8516	NC_022544	CAG	2	6	2856523	2856528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8517	NC_022544	A	7	7	2856571	2856577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8518	NC_022544	CGG	2	6	2856686	2856691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8519	NC_022544	CAT	2	6	2856697	2856702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8520	NC_022544	TAAGGG	2	12	2858426	2858437	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
8521	NC_022544	TCT	2	6	2858492	2858497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8522	NC_022544	T	6	6	2858518	2858523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8523	NC_022544	GCGG	2	8	2858705	2858712	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8524	NC_022544	TCCT	2	8	2858761	2858768	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8525	NC_022544	TCT	2	6	2858801	2858806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8526	NC_022544	CAT	2	6	2858830	2858835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8527	NC_022544	ATA	2	6	2858837	2858842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8528	NC_022544	TTAT	2	8	2858846	2858853	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8529	NC_022544	CAA	2	6	2858896	2858901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8530	NC_022544	GCT	2	6	2858976	2858981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8531	NC_022544	CGG	2	6	2859025	2859030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8532	NC_022544	GTT	2	6	2859055	2859060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8533	NC_022544	GCT	2	6	2859061	2859066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8534	NC_022544	CGG	2	6	2859150	2859155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8535	NC_022544	GCC	2	6	2859213	2859218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8536	NC_022544	CAT	2	6	2859257	2859262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8537	NC_022544	AGG	2	6	2859284	2859289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8538	NC_022544	ACG	2	6	2859314	2859319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8539	NC_022544	CTG	2	6	2859334	2859339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8540	NC_022544	AGGC	2	8	2859340	2859347	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8541	NC_022544	GTACC	2	10	2859365	2859374	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8542	NC_022544	CCA	2	6	2859375	2859380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8543	NC_022544	GGA	2	6	2859487	2859492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8544	NC_022544	TGTA	2	8	2860407	2860414	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8545	NC_022544	ACT	2	6	2860425	2860430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8546	NC_022544	TAGA	2	8	2860459	2860466	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8547	NC_022544	AT	3	6	2862468	2862473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8548	NC_022544	ATTT	2	8	2862505	2862512	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8549	NC_022544	T	7	7	2862541	2862547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8550	NC_022544	T	6	6	2862574	2862579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8551	NC_022544	AAT	2	6	2862588	2862593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8552	NC_022544	CATC	2	8	2862606	2862613	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8553	NC_022544	A	6	6	2862646	2862651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8554	NC_022544	TCA	2	6	2862654	2862659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8555	NC_022544	CT	3	6	2863976	2863981	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8556	NC_022544	ACA	2	6	2864104	2864109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8557	NC_022544	CTT	2	6	2864119	2864124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8558	NC_022544	T	6	6	2864123	2864128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8559	NC_022544	TGT	2	6	2864137	2864142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8560	NC_022544	ATCA	2	8	2864193	2864200	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8561	NC_022544	ATA	3	9	2864227	2864235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8562	NC_022544	CAA	2	6	2864241	2864246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8563	NC_022544	CAT	2	6	2864272	2864277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8564	NC_022544	CAC	2	6	2864278	2864283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8565	NC_022544	CCTTC	2	10	2864294	2864303	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
8566	NC_022544	A	6	6	2864309	2864314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8567	NC_022544	CAA	2	6	2864325	2864330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8568	NC_022544	CCA	2	6	2864346	2864351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8569	NC_022544	GCCA	2	8	2864363	2864370	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8570	NC_022544	GTT	2	6	2864378	2864383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8571	NC_022544	CTA	2	6	2864400	2864405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8572	NC_022544	GCACA	2	10	2864411	2864420	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
8573	NC_022544	T	6	6	2864433	2864438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8574	NC_022544	GTC	2	6	2864448	2864453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8575	NC_022544	AAG	2	6	2864506	2864511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8576	NC_022544	AAG	2	6	2864550	2864555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8577	NC_022544	CACTGA	2	12	2864558	2864569	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8578	NC_022544	AGCC	2	8	2864584	2864591	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8579	NC_022544	AGGG	2	8	2864653	2864660	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8580	NC_022544	TGA	2	6	2864768	2864773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8581	NC_022544	TTGC	2	8	2864784	2864791	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8582	NC_022544	ACAT	2	8	2864855	2864862	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8583	NC_022544	AAG	2	6	2864877	2864882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8584	NC_022544	TGA	2	6	2864888	2864893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8585	NC_022544	CAAT	2	8	2864986	2864993	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8586	NC_022544	AAC	2	6	2865037	2865042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8587	NC_022544	GAG	2	6	2865043	2865048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8588	NC_022544	TGAA	2	8	2865082	2865089	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8589	NC_022544	GGC	2	6	2865101	2865106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8590	NC_022544	AGA	2	6	2865110	2865115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8591	NC_022544	C	6	6	2865181	2865186	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8592	NC_022544	GCA	2	6	2865208	2865213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8593	NC_022544	ACT	2	6	2865246	2865251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8594	NC_022544	T	6	6	2865294	2865299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8595	NC_022544	TCC	2	6	2865333	2865338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8596	NC_022544	TTCA	2	8	2865416	2865423	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8597	NC_022544	TAAA	2	8	2865513	2865520	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8598	NC_022544	TCA	2	6	2865725	2865730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8599	NC_022544	ACG	2	6	2865751	2865756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8600	NC_022544	CAT	2	6	2865771	2865776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8601	NC_022544	GTT	2	6	2865852	2865857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8602	NC_022544	CAG	2	6	2865883	2865888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8603	NC_022544	AATA	2	8	2865891	2865898	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8604	NC_022544	GCC	2	6	2865933	2865938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8605	NC_022544	GCC	2	6	2865989	2865994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8606	NC_022544	TAA	2	6	2866005	2866010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8607	NC_022544	GT	3	6	2866023	2866028	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8608	NC_022544	TTG	2	6	2866424	2866429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8609	NC_022544	GATT	2	8	2866433	2866440	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8610	NC_022544	GGA	2	6	2866446	2866451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8611	NC_022544	TTG	2	6	2866520	2866525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8612	NC_022544	TGT	2	6	2866528	2866533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8613	NC_022544	TTC	2	6	2866597	2866602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8614	NC_022544	CAG	2	6	2866658	2866663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8615	NC_022544	TG	3	6	2866676	2866681	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8616	NC_022544	CTGG	2	8	2866753	2866760	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8617	NC_022544	TAAA	2	8	2866805	2866812	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8618	NC_022544	TG	3	6	2869529	2869534	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8619	NC_022544	A	8	8	2869584	2869591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8620	NC_022544	TCGTA	2	10	2869652	2869661	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8621	NC_022544	ACCT	2	8	2869688	2869695	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8622	NC_022544	CTTC	2	8	2870956	2870963	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8623	NC_022544	G	6	6	2871075	2871080	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8624	NC_022544	TTA	2	6	2871101	2871106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8625	NC_022544	ATT	2	6	2871376	2871381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8626	NC_022544	ATGA	2	8	2871431	2871438	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8627	NC_022544	ATC	2	6	2871445	2871450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8628	NC_022544	GAC	2	6	2871455	2871460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8629	NC_022544	TC	3	6	2871529	2871534	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8630	NC_022544	ATG	2	6	2871537	2871542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8631	NC_022544	CTT	2	6	2871580	2871585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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