MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 14153

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_022544	CTG	2	6	2758777	2758782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8002	NC_022544	GCCA	2	8	2758817	2758824	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8003	NC_022544	TAA	2	6	2758841	2758846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_022544	GT	3	6	2758856	2758861	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_022544	CTG	2	6	2758911	2758916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8006	NC_022544	CGG	2	6	2758942	2758947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8007	NC_022544	GAT	2	6	2758968	2758973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_022544	CGAA	2	8	2759012	2759019	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8009	NC_022544	G	7	7	2759027	2759033	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_022544	TTA	2	6	2759044	2759049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_022544	T	8	8	2759223	2759230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_022544	TTA	2	6	2759272	2759277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_022544	GCT	2	6	2759378	2759383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8014	NC_022544	TGC	2	6	2759458	2759463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8015	NC_022544	TGCA	2	8	2759472	2759479	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8016	NC_022544	CAT	2	6	2759519	2759524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8017	NC_022544	CG	3	6	2759537	2759542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8018	NC_022544	CAG	2	6	2759585	2759590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8019	NC_022544	CCA	2	6	2759631	2759636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8020	NC_022544	CTG	2	6	2759870	2759875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8021	NC_022544	CT	3	6	2759951	2759956	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8022	NC_022544	TGG	2	6	2759977	2759982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_022544	GTT	2	6	2760031	2760036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_022544	CTTGG	2	10	2760049	2760058	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8025	NC_022544	TTGGGT	2	12	2760070	2760081	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_022544	AGT	2	6	2760207	2760212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_022544	TAA	2	6	2760340	2760345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_022544	GAAA	2	8	2760370	2760377	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_022544	A	6	6	2760375	2760380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_022544	TCA	2	6	2760382	2760387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8031	NC_022544	CGA	2	6	2760589	2760594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8032	NC_022544	CGA	2	6	2760613	2760618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8033	NC_022544	TTC	2	6	2760675	2760680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8034	NC_022544	TAT	2	6	2760684	2760689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_022544	GAAGG	2	10	2760733	2760742	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_022544	CG	3	6	2760750	2760755	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8037	NC_022544	AAT	2	6	2760815	2760820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_022544	TTA	2	6	2760844	2760849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_022544	AAC	2	6	2760872	2760877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8040	NC_022544	TCAAT	2	10	2760950	2760959	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8041	NC_022544	CAAA	2	8	2761017	2761024	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8042	NC_022544	GAT	2	6	2761209	2761214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_022544	AAC	2	6	2761215	2761220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8044	NC_022544	CCT	2	6	2761257	2761262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8045	NC_022544	TTG	2	6	2761291	2761296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_022544	ACT	2	6	2761333	2761338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8047	NC_022544	GTG	2	6	2761368	2761373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_022544	TGA	3	9	2761436	2761444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_022544	CAAG	2	8	2761459	2761466	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8050	NC_022544	GAA	2	6	2761482	2761487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_022544	CTT	2	6	2761505	2761510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8052	NC_022544	TACG	2	8	2761527	2761534	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8053	NC_022544	GCA	2	6	2761550	2761555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8054	NC_022544	AAG	2	6	2761586	2761591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_022544	GTGA	2	8	2761644	2761651	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_022544	ACA	2	6	2761670	2761675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8057	NC_022544	ATG	2	6	2761772	2761777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_022544	TTG	2	6	2761787	2761792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_022544	GTT	2	6	2761825	2761830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_022544	AGAA	2	8	2761881	2761888	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_022544	T	6	6	2761937	2761942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_022544	AGA	3	9	2761947	2761955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_022544	A	7	7	2761969	2761975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_022544	ATAA	2	8	2762033	2762040	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_022544	TGA	2	6	2762114	2762119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_022544	ATT	2	6	2762175	2762180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_022544	CA	3	6	2762200	2762205	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8068	NC_022544	TAAA	2	8	2762260	2762267	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_022544	TGG	2	6	2762345	2762350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_022544	ACG	3	9	2762369	2762377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8071	NC_022544	AGA	2	6	2762403	2762408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_022544	TA	3	6	2762439	2762444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_022544	CTG	2	6	2762658	2762663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8074	NC_022544	CAA	2	6	2762722	2762727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8075	NC_022544	T	6	6	2762733	2762738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_022544	T	8	8	2762790	2762797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8077	NC_022544	CAC	2	6	2762915	2762920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8078	NC_022544	ACC	2	6	2762922	2762927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8079	NC_022544	CAGG	2	8	2762928	2762935	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8080	NC_022544	TGA	2	6	2763194	2763199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8081	NC_022544	A	6	6	2763212	2763217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8082	NC_022544	GC	3	6	2763249	2763254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8083	NC_022544	TAG	2	6	2763319	2763324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_022544	ATGAA	2	10	2763334	2763343	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8085	NC_022544	TAA	2	6	2763440	2763445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8086	NC_022544	AAAG	2	8	2763470	2763477	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8087	NC_022544	GCT	2	6	2763587	2763592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8088	NC_022544	CCAT	2	8	2763679	2763686	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8089	NC_022544	AAC	2	6	2763752	2763757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8090	NC_022544	AT	3	6	2763761	2763766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8091	NC_022544	GCAAA	2	10	2763847	2763856	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
8092	NC_022544	ATC	2	6	2763860	2763865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8093	NC_022544	TGA	2	6	2763896	2763901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_022544	TCT	2	6	2763932	2763937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8095	NC_022544	ATT	2	6	2763964	2763969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8096	NC_022544	CTA	2	6	2763982	2763987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8097	NC_022544	GCC	2	6	2764010	2764015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8098	NC_022544	CAT	2	6	2764105	2764110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8099	NC_022544	GCC	3	9	2764116	2764124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8100	NC_022544	GCG	2	6	2764125	2764130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8101	NC_022544	TCG	2	6	2764141	2764146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8102	NC_022544	CAGCCC	2	12	2764231	2764242	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
8103	NC_022544	TGT	2	6	2764253	2764258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_022544	AGGTGA	2	12	2764301	2764312	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_022544	A	6	6	2764341	2764346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_022544	CTG	2	6	2764395	2764400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8107	NC_022544	GCC	2	6	2764404	2764409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8108	NC_022544	A	7	7	2764473	2764479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_022544	ATCG	2	8	2764557	2764564	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8110	NC_022544	GCG	2	6	2764627	2764632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8111	NC_022544	GCA	2	6	2764821	2764826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8112	NC_022544	ATT	2	6	2764852	2764857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_022544	CGC	2	6	2764862	2764867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8114	NC_022544	GC	3	6	2764888	2764893	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8115	NC_022544	AC	3	6	2765000	2765005	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8116	NC_022544	AGA	2	6	2765024	2765029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_022544	AGC	2	6	2766782	2766787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8118	NC_022544	AC	3	6	2766985	2766990	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8119	NC_022544	GTTC	2	8	2767206	2767213	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8120	NC_022544	GTT	2	6	2767279	2767284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8121	NC_022544	TGA	2	6	2767398	2767403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_022544	GAA	2	6	2767417	2767422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_022544	TCCAG	2	10	2767440	2767449	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8124	NC_022544	GC	3	6	2767496	2767501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8125	NC_022544	CGA	2	6	2767533	2767538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8126	NC_022544	A	6	6	2767647	2767652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8127	NC_022544	GCT	2	6	2767780	2767785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8128	NC_022544	CGA	2	6	2767800	2767805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8129	NC_022544	GAG	2	6	2767895	2767900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_022544	CAT	2	6	2769722	2769727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8332	NC_022544	T	6	6	2817687	2817692	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8333	NC_022544	CAA	2	6	2817715	2817720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8380	NC_022544	GCTCG	2	10	2834561	2834570	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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8383	NC_022544	GC	3	6	2834610	2834615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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8385	NC_022544	GCG	2	6	2834631	2834636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8389	NC_022544	GGCG	2	8	2834869	2834876	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8390	NC_022544	GAT	2	6	2834884	2834889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8391	NC_022544	CGC	2	6	2834948	2834953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8392	NC_022544	CG	3	6	2834977	2834982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8393	NC_022544	TTC	2	6	2834987	2834992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8394	NC_022544	GA	3	6	2835003	2835008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8395	NC_022544	GC	3	6	2835021	2835026	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8396	NC_022544	GCG	3	9	2835069	2835077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8397	NC_022544	GGC	2	6	2835090	2835095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8398	NC_022544	ATC	2	6	2835111	2835116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8399	NC_022544	GGT	2	6	2835128	2835133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8400	NC_022544	CGG	2	6	2835145	2835150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8402	NC_022544	GTC	2	6	2835296	2835301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8405	NC_022544	CGGAT	2	10	2835402	2835411	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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8408	NC_022544	AAG	2	6	2836641	2836646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8464	NC_022544	A	8	8	2847345	2847352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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