MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 14153

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_022544	GCA	2	6	2342443	2342448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7002	NC_022544	CAG	2	6	2342459	2342464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7003	NC_022544	CGC	3	9	2342467	2342475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7004	NC_022544	CGGCG	2	10	2342504	2342513	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7005	NC_022544	AGC	3	9	2342538	2342546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7006	NC_022544	CAG	3	9	2342585	2342593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7007	NC_022544	CCA	2	6	2342596	2342601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7008	NC_022544	CAC	2	6	2342663	2342668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7009	NC_022544	GCA	3	9	2342686	2342694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7010	NC_022544	GCT	2	6	2342698	2342703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7011	NC_022544	GTC	2	6	2342723	2342728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7012	NC_022544	CAG	2	6	2342750	2342755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7013	NC_022544	CAG	2	6	2342762	2342767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7014	NC_022544	CGC	2	6	2342768	2342773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7015	NC_022544	GAT	2	6	2342780	2342785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7016	NC_022544	CAG	2	6	2342804	2342809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7017	NC_022544	CTGCGG	2	12	2342810	2342821	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7018	NC_022544	TGA	2	6	2342845	2342850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_022544	GAA	2	6	2342858	2342863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7020	NC_022544	AGA	2	6	2342920	2342925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7021	NC_022544	TCA	2	6	2343559	2343564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7022	NC_022544	TTG	2	6	2344688	2344693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7023	NC_022544	AGT	2	6	2349604	2349609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7024	NC_022544	TA	3	6	2349740	2349745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7025	NC_022544	TA	3	6	2349752	2349757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7026	NC_022544	TA	3	6	2349816	2349821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7027	NC_022544	TAA	2	6	2349839	2349844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_022544	ATA	2	6	2349877	2349882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7029	NC_022544	TGT	2	6	2349897	2349902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7030	NC_022544	CAG	2	6	2349919	2349924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7031	NC_022544	GCA	2	6	2350543	2350548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7032	NC_022544	A	6	6	2350548	2350553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7033	NC_022544	TGG	2	6	2350566	2350571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7034	NC_022544	ATA	2	6	2352313	2352318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7035	NC_022544	TAAC	2	8	2352332	2352339	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7036	NC_022544	AAT	3	9	2352354	2352362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7037	NC_022544	TGCT	2	8	2354107	2354114	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7038	NC_022544	GT	3	6	2354123	2354128	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7039	NC_022544	CGT	2	6	2355262	2355267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7040	NC_022544	A	6	6	2355292	2355297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7041	NC_022544	GTC	2	6	2356329	2356334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7042	NC_022544	AGT	2	6	2356340	2356345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7043	NC_022544	TTG	2	6	2356378	2356383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7044	NC_022544	TAT	2	6	2356391	2356396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7045	NC_022544	CCA	2	6	2356424	2356429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7046	NC_022544	AGG	2	6	2356444	2356449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7047	NC_022544	TTA	2	6	2356471	2356476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7048	NC_022544	T	6	6	2356502	2356507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7049	NC_022544	AAT	2	6	2356573	2356578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7050	NC_022544	T	6	6	2356659	2356664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7051	NC_022544	AT	3	6	2356704	2356709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7052	NC_022544	TGA	2	6	2356741	2356746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7053	NC_022544	ATC	2	6	2356806	2356811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7054	NC_022544	TTTA	2	8	2356818	2356825	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_022544	T	8	8	2356888	2356895	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7056	NC_022544	AC	3	6	2356908	2356913	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7057	NC_022544	AAT	2	6	2356996	2357001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_022544	AGT	2	6	2357031	2357036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7059	NC_022544	TCCCG	2	10	2357075	2357084	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
7060	NC_022544	ATTC	2	8	2357133	2357140	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7061	NC_022544	CCTTCA	2	12	2357158	2357169	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
7062	NC_022544	CGC	2	6	2360618	2360623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7063	NC_022544	AAAT	2	8	2363558	2363565	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7064	NC_022544	TCC	2	6	2363567	2363572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7065	NC_022544	CT	3	6	2363609	2363614	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7066	NC_022544	TTAC	2	8	2363668	2363675	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7067	NC_022544	ACT	2	6	2363869	2363874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7068	NC_022544	AC	3	6	2363904	2363909	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7069	NC_022544	CGG	2	6	2363917	2363922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7070	NC_022544	CA	3	6	2363991	2363996	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7071	NC_022544	TGC	2	6	2364009	2364014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7072	NC_022544	TC	3	6	2364030	2364035	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7073	NC_022544	TTG	2	6	2364147	2364152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7074	NC_022544	TAA	2	6	2364205	2364210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7075	NC_022544	CT	3	6	2367064	2367069	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7076	NC_022544	ATT	2	6	2367305	2367310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7077	NC_022544	A	6	6	2369959	2369964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7078	NC_022544	AT	3	6	2369998	2370003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7079	NC_022544	AGCA	2	8	2370005	2370012	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7080	NC_022544	AAC	2	6	2370033	2370038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7081	NC_022544	AT	3	6	2370068	2370073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7082	NC_022544	ATTA	2	8	2370096	2370103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7083	NC_022544	GGA	2	6	2370126	2370131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7084	NC_022544	GAA	2	6	2370132	2370137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7085	NC_022544	ATC	2	6	2371679	2371684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7086	NC_022544	GAA	2	6	2371707	2371712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7087	NC_022544	T	9	9	2371736	2371744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7088	NC_022544	TTG	2	6	2371750	2371755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7089	NC_022544	CTA	2	6	2371855	2371860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7090	NC_022544	TA	4	8	2371901	2371908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7091	NC_022544	G	6	6	2371954	2371959	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7092	NC_022544	TTTC	2	8	2371965	2371972	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7093	NC_022544	GCC	2	6	2374360	2374365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7094	NC_022544	GCTCA	2	10	2377012	2377021	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7095	NC_022544	AAC	2	6	2378016	2378021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7096	NC_022544	TTTA	2	8	2380588	2380595	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7097	NC_022544	GTTC	2	8	2380611	2380618	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7098	NC_022544	AAC	2	6	2380620	2380625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7099	NC_022544	GCT	2	6	2380629	2380634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7100	NC_022544	A	6	6	2380812	2380817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7101	NC_022544	ATT	2	6	2385009	2385014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7102	NC_022544	ACG	2	6	2385100	2385105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7103	NC_022544	AAT	3	9	2385184	2385192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7104	NC_022544	AAT	2	6	2385206	2385211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7105	NC_022544	AT	3	6	2385239	2385244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7106	NC_022544	TAA	3	9	2385252	2385260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7107	NC_022544	TACAT	2	10	2385279	2385288	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7108	NC_022544	AT	3	6	2385331	2385336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7109	NC_022544	TA	3	6	2385382	2385387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7110	NC_022544	AGA	2	6	2385389	2385394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7111	NC_022544	ATG	2	6	2386393	2386398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7112	NC_022544	GAA	2	6	2386405	2386410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7113	NC_022544	TA	3	6	2386419	2386424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7114	NC_022544	AGGCC	2	10	2386434	2386443	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7115	NC_022544	A	6	6	2390866	2390871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7116	NC_022544	A	6	6	2390980	2390985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7117	NC_022544	GAT	2	6	2390989	2390994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7118	NC_022544	ATG	2	6	2392280	2392285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7119	NC_022544	AGA	2	6	2392322	2392327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7120	NC_022544	AGG	2	6	2392339	2392344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7121	NC_022544	CGA	2	6	2392354	2392359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7122	NC_022544	TAC	2	6	2393037	2393042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7123	NC_022544	CAT	2	6	2393056	2393061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7124	NC_022544	CAA	2	6	2393089	2393094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7125	NC_022544	A	6	6	2393102	2393107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7126	NC_022544	TGG	2	6	2393176	2393181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7127	NC_022544	GAC	2	6	2393625	2393630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7128	NC_022544	GCAT	2	8	2394376	2394383	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7129	NC_022544	AAAGC	2	10	2394406	2394415	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
7130	NC_022544	TTAAT	2	10	2394464	2394473	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7131	NC_022544	A	6	6	2394505	2394510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7132	NC_022544	CGT	2	6	2401220	2401225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7133	NC_022544	AAGC	2	8	2401272	2401279	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7134	NC_022544	GT	3	6	2405459	2405464	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7135	NC_022544	ATCA	2	8	2407911	2407918	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7136	NC_022544	ATT	2	6	2407951	2407956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7137	NC_022544	CCCT	2	8	2409284	2409291	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7138	NC_022544	A	6	6	2409326	2409331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7140	NC_022544	G	6	6	2409371	2409376	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7141	NC_022544	TGT	2	6	2410213	2410218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7142	NC_022544	T	6	6	2411186	2411191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7143	NC_022544	A	6	6	2411213	2411218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7144	NC_022544	TACAG	2	10	2412262	2412271	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7145	NC_022544	TAT	2	6	2414137	2414142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7153	NC_022544	CCA	2	6	2414386	2414391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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7201	NC_022544	CTAA	2	8	2432433	2432440	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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7253	NC_022544	TCA	2	6	2463405	2463410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7256	NC_022544	GTC	2	6	2467005	2467010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7257	NC_022544	AGAAAA	2	12	2467032	2467043	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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7259	NC_022544	TAAA	2	8	2467073	2467080	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7260	NC_022544	A	6	6	2467091	2467096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7261	NC_022544	AGA	2	6	2467138	2467143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7263	NC_022544	GC	3	6	2467269	2467274	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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7392	NC_022544	GA	3	6	2513923	2513928	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7393	NC_022544	CCT	2	6	2514261	2514266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7394	NC_022544	GAC	2	6	2515686	2515691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7395	NC_022544	TTTTCA	2	12	2515744	2515755	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7396	NC_022544	CAGTA	2	10	2515760	2515769	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7397	NC_022544	TTA	2	6	2515814	2515819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7398	NC_022544	GT	4	8	2515822	2515829	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7399	NC_022544	T	7	7	2517145	2517151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7400	NC_022544	CAT	2	6	2519363	2519368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7401	NC_022544	TA	3	6	2519369	2519374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7402	NC_022544	AAT	2	6	2519384	2519389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7403	NC_022544	AGC	2	6	2519442	2519447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7404	NC_022544	CAAA	2	8	2519450	2519457	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7405	NC_022544	TGG	2	6	2519539	2519544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7407	NC_022544	TGG	2	6	2519657	2519662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7408	NC_022544	CATGC	2	10	2519694	2519703	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7409	NC_022544	CAT	2	6	2519764	2519769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7412	NC_022544	CTGCC	2	10	2520732	2520741	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
7413	NC_022544	ACG	2	6	2522361	2522366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7415	NC_022544	CA	3	6	2522428	2522433	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7416	NC_022544	AGG	2	6	2522475	2522480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7421	NC_022544	AGG	2	6	2522596	2522601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7422	NC_022544	CGG	2	6	2522606	2522611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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7425	NC_022544	AGG	2	6	2522713	2522718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7426	NC_022544	CGG	2	6	2522723	2522728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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7432	NC_022544	TGCGC	2	10	2522916	2522925	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7433	NC_022544	GAC	2	6	2522940	2522945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7436	NC_022544	TTAA	2	8	2526506	2526513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7437	NC_022544	TAA	2	6	2526519	2526524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7439	NC_022544	AGAT	2	8	2527361	2527368	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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7482	NC_022544	TGAAA	2	10	2550837	2550846	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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7497	NC_022544	GC	3	6	2565763	2565768	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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7500	NC_022544	AGAA	2	8	2569555	2569562	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

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