MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 12819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_022525	TAT	2	6	1326054	1326059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_022525	ATA	2	6	1326088	1326093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_022525	CAA	2	6	1326139	1326144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_022525	GCTG	2	8	1326161	1326168	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3505	NC_022525	CGT	2	6	1326178	1326183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_022525	GATTTT	2	12	1326219	1326230	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_022525	T	6	6	1326244	1326249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_022525	CCT	2	6	1326288	1326293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3509	NC_022525	TAA	2	6	1326312	1326317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_022525	TAT	2	6	1326389	1326394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_022525	GTA	2	6	1326399	1326404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_022525	C	6	6	1327754	1327759	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3513	NC_022525	AAGCGC	2	12	1327846	1327857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_022525	TAG	2	6	1329859	1329864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_022525	A	9	9	1329907	1329915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_022525	AGA	2	6	1329942	1329947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_022525	CTT	2	6	1329969	1329974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3518	NC_022525	TCA	2	6	1330047	1330052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_022525	TGG	2	6	1330065	1330070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_022525	ATC	2	6	1330103	1330108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_022525	ATC	2	6	1330114	1330119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_022525	GGT	3	9	1330131	1330139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_022525	GGC	2	6	1331056	1331061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_022525	A	6	6	1331130	1331135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_022525	TAA	2	6	1331189	1331194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_022525	TTG	2	6	1331195	1331200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_022525	GCTG	2	8	1331205	1331212	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3528	NC_022525	TTC	2	6	1331249	1331254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_022525	ATG	2	6	1332493	1332498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_022525	GCC	2	6	1333443	1333448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3531	NC_022525	GGC	2	6	1333470	1333475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_022525	AC	3	6	1334647	1334652	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3533	NC_022525	A	8	8	1334688	1334695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_022525	CCA	2	6	1335740	1335745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3535	NC_022525	AATC	2	8	1335832	1335839	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3536	NC_022525	GCC	2	6	1335906	1335911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3537	NC_022525	ATA	2	6	1335935	1335940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_022525	GCC	2	6	1335966	1335971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3539	NC_022525	ATT	2	6	1336506	1336511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_022525	GGT	2	6	1336841	1336846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_022525	TGC	2	6	1336885	1336890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_022525	ATT	2	6	1336964	1336969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_022525	CAGC	2	8	1337002	1337009	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3544	NC_022525	GCG	2	6	1337072	1337077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_022525	TGACG	2	10	1337079	1337088	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3546	NC_022525	GATAC	2	10	1337143	1337152	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3547	NC_022525	TCT	2	6	1337820	1337825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_022525	GTC	2	6	1337830	1337835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_022525	GGC	2	6	1338908	1338913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_022525	CGC	2	6	1338924	1338929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3551	NC_022525	TGA	2	6	1338946	1338951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_022525	AAC	2	6	1340832	1340837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_022525	CAG	2	6	1340903	1340908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_022525	CTGC	2	8	1340915	1340922	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3555	NC_022525	AATA	2	8	1340958	1340965	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_022525	GAC	2	6	1344672	1344677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_022525	TA	3	6	1346042	1346047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_022525	A	7	7	1346130	1346136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_022525	GCT	2	6	1346141	1346146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_022525	CGG	2	6	1346213	1346218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_022525	AAT	2	6	1348010	1348015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_022525	GCTG	2	8	1348145	1348152	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3563	NC_022525	TGC	2	6	1348160	1348165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_022525	ATTA	2	8	1348194	1348201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_022525	ATAA	2	8	1348206	1348213	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_022525	GAT	2	6	1354303	1354308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_022525	ATT	2	6	1354336	1354341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_022525	TAA	2	6	1354360	1354365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_022525	TGC	2	6	1354370	1354375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_022525	TGT	2	6	1354410	1354415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_022525	T	7	7	1354448	1354454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_022525	T	6	6	1354477	1354482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_022525	GTT	2	6	1354502	1354507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_022525	ACA	2	6	1354546	1354551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3575	NC_022525	AGGA	2	8	1354588	1354595	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_022525	CCG	2	6	1355108	1355113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3577	NC_022525	ACA	2	6	1355123	1355128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3578	NC_022525	CGG	2	6	1355151	1355156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3579	NC_022525	A	6	6	1356097	1356102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_022525	AG	3	6	1356113	1356118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_022525	A	6	6	1357011	1357016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_022525	CGC	2	6	1357047	1357052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3583	NC_022525	ACA	2	6	1357057	1357062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_022525	ACA	2	6	1357091	1357096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_022525	T	7	7	1357599	1357605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_022525	TTAT	2	8	1357621	1357628	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_022525	ATT	2	6	1357637	1357642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_022525	G	6	6	1357657	1357662	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_022525	GA	3	6	1357681	1357686	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_022525	CGG	2	6	1357715	1357720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3591	NC_022525	A	6	6	1357751	1357756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_022525	GCG	2	6	1357807	1357812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3593	NC_022525	T	6	6	1358176	1358181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_022525	ATGCC	2	10	1359632	1359641	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3595	NC_022525	ATTA	2	8	1360881	1360888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_022525	GCG	2	6	1363127	1363132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_022525	T	6	6	1363148	1363153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_022525	TCA	2	6	1365430	1365435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_022525	GTA	2	6	1365450	1365455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_022525	CG	3	6	1365542	1365547	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3601	NC_022525	TAGCCT	2	12	1365599	1365610	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_022525	A	6	6	1365872	1365877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_022525	GACA	2	8	1365912	1365919	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3604	NC_022525	T	7	7	1367378	1367384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_022525	AATGG	2	10	1367458	1367467	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_022525	GTG	2	6	1368147	1368152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_022525	A	6	6	1368928	1368933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_022525	ACG	2	6	1369027	1369032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3609	NC_022525	TC	3	6	1370498	1370503	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3610	NC_022525	A	6	6	1370549	1370554	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_022525	CGC	2	6	1370580	1370585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3612	NC_022525	GCG	2	6	1370926	1370931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_022525	GCC	2	6	1370937	1370942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3614	NC_022525	CCT	2	6	1371925	1371930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3615	NC_022525	TTTA	2	8	1372001	1372008	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_022525	AAG	2	6	1372009	1372014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_022525	TA	3	6	1372028	1372033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_022525	AATG	2	8	1372038	1372045	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_022525	A	6	6	1372066	1372071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_022525	ATTG	2	8	1372082	1372089	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_022525	CTT	2	6	1372105	1372110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3622	NC_022525	CGT	2	6	1372169	1372174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3623	NC_022525	T	6	6	1372181	1372186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_022525	TA	3	6	1372201	1372206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_022525	GTTAC	2	10	1372978	1372987	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3626	NC_022525	GTG	2	6	1373004	1373009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_022525	TAA	2	6	1374020	1374025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_022525	CAG	2	6	1374029	1374034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3629	NC_022525	ATG	2	6	1374036	1374041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_022525	CAG	2	6	1374083	1374088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3632	NC_022525	CAC	2	6	1375518	1375523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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