MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 12819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_022525	AT	3	6	614901	614906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_022525	TGCAAT	2	12	614935	614946	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1503	NC_022525	ATT	2	6	614954	614959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_022525	GTT	2	6	614965	614970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_022525	GCG	2	6	619632	619637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_022525	GCC	2	6	619649	619654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1507	NC_022525	GCT	2	6	621267	621272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_022525	CGA	2	6	621344	621349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_022525	AG	3	6	622591	622596	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_022525	TGC	2	6	622675	622680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_022525	AAT	2	6	622691	622696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_022525	ATT	2	6	622712	622717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_022525	CA	3	6	622721	622726	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1514	NC_022525	GAT	2	6	626029	626034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_022525	AG	3	6	627181	627186	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_022525	GC	3	6	627328	627333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1517	NC_022525	TCA	2	6	627358	627363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_022525	TCG	2	6	627389	627394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_022525	GGC	2	6	627407	627412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_022525	CTT	2	6	627448	627453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_022525	T	6	6	627501	627506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_022525	TTA	2	6	627526	627531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_022525	ATTA	2	8	627559	627566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_022525	TAAT	2	8	627600	627607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_022525	ATCT	2	8	627615	627622	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1526	NC_022525	ATA	2	6	627663	627668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_022525	GT	4	8	627702	627709	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_022525	AGGGA	2	10	628301	628310	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_022525	AG	3	6	629630	629635	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_022525	AC	3	6	634581	634586	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1531	NC_022525	CA	3	6	634587	634592	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1532	NC_022525	AAT	2	6	634600	634605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_022525	TAA	2	6	634649	634654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_022525	CAA	2	6	634679	634684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_022525	A	6	6	634683	634688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_022525	GTG	2	6	634812	634817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_022525	AGT	2	6	634845	634850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_022525	TGT	2	6	634857	634862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_022525	ATA	2	6	634877	634882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_022525	TAA	2	6	634913	634918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_022525	A	6	6	634946	634951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_022525	GAG	2	6	634953	634958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_022525	A	7	7	634978	634984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_022525	A	6	6	635071	635076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_022525	CTC	2	6	636158	636163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1546	NC_022525	ATG	2	6	636173	636178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_022525	AT	3	6	636184	636189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_022525	CAT	2	6	636223	636228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_022525	A	7	7	636241	636247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_022525	ATT	2	6	636270	636275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_022525	A	6	6	636913	636918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_022525	GGC	2	6	636982	636987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_022525	CTTCA	2	10	637153	637162	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1554	NC_022525	GC	3	6	637236	637241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1555	NC_022525	CTT	2	6	637265	637270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_022525	TCC	2	6	637275	637280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1557	NC_022525	CAT	2	6	637309	637314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_022525	GTC	2	6	637325	637330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_022525	TG	3	6	637465	637470	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_022525	TCT	2	6	637493	637498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_022525	TG	3	6	637709	637714	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_022525	TTC	2	6	637727	637732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_022525	GTTCA	2	10	637777	637786	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1564	NC_022525	GAAT	2	8	637825	637832	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_022525	AT	3	6	637831	637836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_022525	TC	3	6	637870	637875	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1567	NC_022525	CTGT	2	8	638202	638209	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1568	NC_022525	AG	3	6	638255	638260	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_022525	TGA	2	6	638266	638271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_022525	T	6	6	638299	638304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_022525	GAT	2	6	638395	638400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_022525	TC	4	8	638438	638445	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1573	NC_022525	TGA	2	6	638497	638502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_022525	CAG	2	6	638512	638517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_022525	ATT	2	6	638582	638587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_022525	CCG	2	6	638636	638641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1577	NC_022525	CAA	2	6	638649	638654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_022525	ATC	2	6	638734	638739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_022525	CGAT	2	8	638790	638797	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1580	NC_022525	ATT	2	6	638836	638841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_022525	ATCAA	2	10	638856	638865	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1582	NC_022525	CAA	2	6	641644	641649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_022525	GTC	2	6	641818	641823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_022525	GAA	2	6	641928	641933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_022525	GTC	2	6	641988	641993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_022525	AC	3	6	641994	641999	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1587	NC_022525	CAT	2	6	642018	642023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_022525	CGC	2	6	642027	642032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1589	NC_022525	GCT	2	6	642100	642105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_022525	GAT	2	6	642118	642123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_022525	CTG	2	6	642127	642132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_022525	CA	3	6	642190	642195	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1593	NC_022525	TG	3	6	642578	642583	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_022525	TTC	2	6	642596	642601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_022525	GTT	2	6	642897	642902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_022525	AAT	2	6	645909	645914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_022525	TAT	2	6	645945	645950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_022525	GTT	2	6	645960	645965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_022525	AGT	2	6	645994	645999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_022525	AC	3	6	646016	646021	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1601	NC_022525	GTA	2	6	646085	646090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_022525	TTG	2	6	646101	646106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_022525	GC	3	6	646166	646171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1604	NC_022525	A	7	7	646538	646544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_022525	TAA	2	6	646596	646601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_022525	ATA	2	6	646607	646612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_022525	ATT	2	6	646662	646667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_022525	CAG	2	6	647056	647061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_022525	GCG	2	6	647341	647346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_022525	T	6	6	648385	648390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_022525	TTAT	2	8	648395	648402	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_022525	ATAA	2	8	649774	649781	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_022525	T	8	8	649803	649810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_022525	GAAA	2	8	649857	649864	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_022525	TAT	2	6	649886	649891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_022525	TCG	2	6	650774	650779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_022525	TGA	2	6	650809	650814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_022525	ATG	2	6	650815	650820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_022525	A	6	6	652071	652076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_022525	GC	3	6	652170	652175	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1621	NC_022525	CTTTT	2	10	652179	652188	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1622	NC_022525	T	7	7	652205	652211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_022525	TAACGT	2	12	652218	652229	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1624	NC_022525	T	6	6	653720	653725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_022525	TC	3	6	655010	655015	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1626	NC_022525	CAG	2	6	655025	655030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_022525	ATG	2	6	655034	655039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_022525	CTG	2	6	655041	655046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_022525	CGT	2	6	655159	655164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_022525	CAA	2	6	655207	655212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_022525	TGAA	2	8	655213	655220	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_022525	CGT	2	6	655281	655286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_022525	CAA	2	6	655293	655298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_022525	AGGG	2	8	657298	657305	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_022525	GTG	2	6	657314	657319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_022525	ATT	2	6	657420	657425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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