MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 12819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_022525	CAT	2	6	4602846	4602851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12502	NC_022525	TTG	2	6	4602918	4602923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12503	NC_022525	TCG	2	6	4602950	4602955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12504	NC_022525	TA	3	6	4602984	4602989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12505	NC_022525	TA	3	6	4603082	4603087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12506	NC_022525	T	6	6	4603103	4603108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12507	NC_022525	ATT	2	6	4603904	4603909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12508	NC_022525	TAA	2	6	4603926	4603931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12509	NC_022525	ATA	2	6	4603960	4603965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12510	NC_022525	TA	3	6	4603964	4603969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12511	NC_022525	ATG	2	6	4604041	4604046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12512	NC_022525	TTC	2	6	4604066	4604071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12513	NC_022525	T	6	6	4604078	4604083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12514	NC_022525	TAA	2	6	4604089	4604094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12515	NC_022525	GCA	2	6	4604102	4604107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12516	NC_022525	TGG	2	6	4604123	4604128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12517	NC_022525	TCA	2	6	4604135	4604140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12518	NC_022525	TAC	2	6	4604270	4604275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12519	NC_022525	GC	3	6	4604294	4604299	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12520	NC_022525	TGG	2	6	4604334	4604339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12521	NC_022525	AT	3	6	4604356	4604361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12522	NC_022525	TTG	2	6	4604384	4604389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12523	NC_022525	CCT	2	6	4604428	4604433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12524	NC_022525	GAA	2	6	4606339	4606344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12525	NC_022525	ATC	2	6	4606353	4606358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12526	NC_022525	AC	3	6	4606376	4606381	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12527	NC_022525	GAT	2	6	4606454	4606459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12528	NC_022525	GTTGA	2	10	4606486	4606495	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
12529	NC_022525	CGT	2	6	4606506	4606511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12530	NC_022525	T	7	7	4606718	4606724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12531	NC_022525	A	6	6	4606809	4606814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12532	NC_022525	ATA	2	6	4607434	4607439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12533	NC_022525	ACG	2	6	4607474	4607479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12534	NC_022525	AAG	2	6	4607491	4607496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12535	NC_022525	TGA	2	6	4607590	4607595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12536	NC_022525	CAG	2	6	4607597	4607602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12537	NC_022525	TAAA	2	8	4607640	4607647	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12538	NC_022525	A	6	6	4607666	4607671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12539	NC_022525	A	6	6	4607676	4607681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12540	NC_022525	T	6	6	4607754	4607759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12541	NC_022525	GGA	2	6	4607777	4607782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12542	NC_022525	TCAG	2	8	4608713	4608720	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12543	NC_022525	CAT	2	6	4608725	4608730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12544	NC_022525	T	6	6	4608760	4608765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12545	NC_022525	T	7	7	4608779	4608785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12546	NC_022525	TGA	2	6	4608788	4608793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12547	NC_022525	AAT	2	6	4608806	4608811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12548	NC_022525	ATC	2	6	4608849	4608854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12549	NC_022525	GA	4	8	4608888	4608895	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12550	NC_022525	T	6	6	4608919	4608924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12551	NC_022525	TAA	2	6	4608951	4608956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12552	NC_022525	GGA	2	6	4608973	4608978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12553	NC_022525	CCTTT	2	10	4610227	4610236	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
12554	NC_022525	ATT	3	9	4610266	4610274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12555	NC_022525	TTG	2	6	4610275	4610280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12556	NC_022525	GCC	2	6	4612222	4612227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12557	NC_022525	CGG	2	6	4612231	4612236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12558	NC_022525	GCC	2	6	4612263	4612268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12559	NC_022525	CCA	2	6	4612282	4612287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12560	NC_022525	GTC	2	6	4612377	4612382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12561	NC_022525	TGC	2	6	4612449	4612454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12562	NC_022525	TTA	2	6	4612500	4612505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12563	NC_022525	GC	3	6	4612519	4612524	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12564	NC_022525	AT	3	6	4612539	4612544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12565	NC_022525	GTT	2	6	4612574	4612579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12566	NC_022525	TGATAT	2	12	4612685	4612696	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12567	NC_022525	T	6	6	4612700	4612705	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12568	NC_022525	TTG	2	6	4612801	4612806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12569	NC_022525	TTG	2	6	4612912	4612917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12570	NC_022525	G	6	6	4612963	4612968	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12571	NC_022525	AACAA	2	10	4613417	4613426	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
12572	NC_022525	TGA	2	6	4613489	4613494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12573	NC_022525	TAA	2	6	4613576	4613581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12574	NC_022525	T	6	6	4613589	4613594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12575	NC_022525	GT	3	6	4613615	4613620	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12576	NC_022525	GCC	2	6	4615320	4615325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12577	NC_022525	GGC	2	6	4615351	4615356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12578	NC_022525	T	7	7	4617749	4617755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12579	NC_022525	GAT	2	6	4617756	4617761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12580	NC_022525	GTTG	2	8	4617764	4617771	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12581	NC_022525	GTAT	2	8	4617839	4617846	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12582	NC_022525	AGC	2	6	4617868	4617873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12583	NC_022525	A	6	6	4617939	4617944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12584	NC_022525	A	6	6	4617987	4617992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12585	NC_022525	AAAT	2	8	4617997	4618004	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12586	NC_022525	GTT	2	6	4618039	4618044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12587	NC_022525	A	6	6	4618045	4618050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12588	NC_022525	T	6	6	4618056	4618061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12589	NC_022525	T	6	6	4618076	4618081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12590	NC_022525	GGTCA	2	10	4618117	4618126	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12591	NC_022525	TAA	2	6	4618174	4618179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12592	NC_022525	A	6	6	4618178	4618183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12593	NC_022525	AAT	2	6	4618186	4618191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12594	NC_022525	AATT	2	8	4618194	4618201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12595	NC_022525	ATG	2	6	4618204	4618209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12596	NC_022525	ATTT	2	8	4618212	4618219	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12597	NC_022525	TGA	2	6	4618227	4618232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12598	NC_022525	ATC	2	6	4618250	4618255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12599	NC_022525	AT	3	6	4618264	4618269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12600	NC_022525	AAT	2	6	4618276	4618281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12601	NC_022525	GAGT	2	8	4618306	4618313	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12602	NC_022525	ATGG	2	8	4618374	4618381	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12603	NC_022525	TA	3	6	4618429	4618434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12604	NC_022525	ATA	2	6	4618437	4618442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12605	NC_022525	TTG	3	9	4619831	4619839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12606	NC_022525	ATA	2	6	4619846	4619851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12607	NC_022525	AAGAA	2	10	4619880	4619889	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
12608	NC_022525	ATTAA	2	10	4619944	4619953	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12609	NC_022525	A	6	6	4621319	4621324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12610	NC_022525	ATG	2	6	4622641	4622646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12611	NC_022525	CAGG	2	8	4622680	4622687	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12612	NC_022525	ACAG	2	8	4622752	4622759	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12613	NC_022525	TAA	2	6	4622907	4622912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12614	NC_022525	GC	3	6	4622926	4622931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12615	NC_022525	ATGT	2	8	4622963	4622970	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12616	NC_022525	AGG	2	6	4623046	4623051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12617	NC_022525	GCA	2	6	4623059	4623064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12618	NC_022525	CTA	2	6	4624168	4624173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12619	NC_022525	TTAT	2	8	4625714	4625721	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12620	NC_022525	TTGT	2	8	4625756	4625763	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12621	NC_022525	ATG	2	6	4625774	4625779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12622	NC_022525	ATCTT	2	10	4626011	4626020	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12623	NC_022525	CCT	2	6	4626978	4626983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12624	NC_022525	TTA	2	6	4627070	4627075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12625	NC_022525	CTATTC	2	12	4629332	4629343	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12626	NC_022525	ACG	2	6	4629383	4629388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12627	NC_022525	TA	3	6	4629408	4629413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12628	NC_022525	TCA	2	6	4629414	4629419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12629	NC_022525	ATGA	2	8	4629447	4629454	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12630	NC_022525	ATT	2	6	4629481	4629486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.