MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 12819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_022525	GT	4	8	4250157	4250164	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11502	NC_022525	GAC	2	6	4250201	4250206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11503	NC_022525	CAA	2	6	4250227	4250232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11504	NC_022525	GGT	2	6	4250299	4250304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11505	NC_022525	GA	3	6	4250329	4250334	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11506	NC_022525	AGTC	2	8	4250425	4250432	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11507	NC_022525	GCTG	2	8	4250443	4250450	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11508	NC_022525	TTA	2	6	4250458	4250463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11509	NC_022525	CGG	2	6	4250582	4250587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11510	NC_022525	ATG	2	6	4250658	4250663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11511	NC_022525	ACC	2	6	4250853	4250858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11512	NC_022525	TGG	2	6	4250913	4250918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11513	NC_022525	TCC	2	6	4250939	4250944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11514	NC_022525	GGA	2	6	4250956	4250961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11515	NC_022525	AGG	2	6	4250994	4250999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11516	NC_022525	GGT	2	6	4251076	4251081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11517	NC_022525	CGG	2	6	4251163	4251168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11518	NC_022525	TCA	2	6	4251191	4251196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11519	NC_022525	CGT	2	6	4251271	4251276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11520	NC_022525	G	6	6	4251320	4251325	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11521	NC_022525	GAC	3	9	4251502	4251510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11522	NC_022525	GT	3	6	4251524	4251529	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11523	NC_022525	GA	3	6	4251611	4251616	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11524	NC_022525	GGC	2	6	4251673	4251678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11525	NC_022525	AAGGA	2	10	4251684	4251693	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
11526	NC_022525	TGAC	2	8	4251713	4251720	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11527	NC_022525	GCA	2	6	4251739	4251744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11528	NC_022525	GGC	2	6	4251784	4251789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11529	NC_022525	GGT	2	6	4251798	4251803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11530	NC_022525	GAG	3	9	4251973	4251981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11531	NC_022525	CCG	2	6	4251986	4251991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11532	NC_022525	GCA	2	6	4252012	4252017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11533	NC_022525	CGCC	2	8	4252043	4252050	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11534	NC_022525	GAA	2	6	4252076	4252081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11535	NC_022525	CGTC	2	8	4252085	4252092	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11536	NC_022525	CTT	2	6	4252101	4252106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11537	NC_022525	GT	3	6	4252110	4252115	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11538	NC_022525	AGCGC	2	10	4252144	4252153	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11539	NC_022525	CCG	2	6	4252170	4252175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11540	NC_022525	T	6	6	4252677	4252682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11541	NC_022525	TTCTA	2	10	4252689	4252698	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11542	NC_022525	T	6	6	4253815	4253820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11543	NC_022525	TCA	2	6	4253837	4253842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11544	NC_022525	ATTTA	2	10	4253852	4253861	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11545	NC_022525	AATTA	2	10	4253887	4253896	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11546	NC_022525	TTTTGA	2	12	4253911	4253922	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11547	NC_022525	TTCG	2	8	4253974	4253981	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11548	NC_022525	CAA	2	6	4254002	4254007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11549	NC_022525	GAG	2	6	4254009	4254014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11550	NC_022525	CAC	2	6	4255626	4255631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11551	NC_022525	GCGCT	2	10	4256973	4256982	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11552	NC_022525	ATG	2	6	4257033	4257038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11553	NC_022525	A	7	7	4257055	4257061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11554	NC_022525	GCC	2	6	4260193	4260198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11555	NC_022525	GTGG	2	8	4260218	4260225	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
11556	NC_022525	GTT	2	6	4260252	4260257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11557	NC_022525	ACA	2	6	4264031	4264036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11558	NC_022525	TCTT	2	8	4264064	4264071	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11559	NC_022525	GAAG	2	8	4264091	4264098	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11560	NC_022525	GGC	2	6	4264122	4264127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11561	NC_022525	CAG	2	6	4264186	4264191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11562	NC_022525	TCA	2	6	4266682	4266687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11563	NC_022525	TAA	2	6	4266703	4266708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11564	NC_022525	ATG	2	6	4266748	4266753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_022525	CG	3	6	4266773	4266778	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11566	NC_022525	GAC	2	6	4266791	4266796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11567	NC_022525	ATT	2	6	4266851	4266856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11568	NC_022525	AG	3	6	4267452	4267457	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11569	NC_022525	TGT	2	6	4269660	4269665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11570	NC_022525	GAAG	2	8	4269720	4269727	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11571	NC_022525	ATT	2	6	4269728	4269733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11572	NC_022525	CAAA	2	8	4269734	4269741	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11573	NC_022525	AT	3	6	4269845	4269850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11574	NC_022525	TGG	2	6	4269859	4269864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11575	NC_022525	GAAG	2	8	4269892	4269899	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11576	NC_022525	CAA	2	6	4270697	4270702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11577	NC_022525	TAAT	2	8	4270754	4270761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11578	NC_022525	TTA	2	6	4270774	4270779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11579	NC_022525	AT	3	6	4270780	4270785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11580	NC_022525	TGGGA	2	10	4270860	4270869	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
11581	NC_022525	GAA	2	6	4271179	4271184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11582	NC_022525	TAAA	2	8	4271196	4271203	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11583	NC_022525	TTA	2	6	4271206	4271211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11584	NC_022525	AGG	2	6	4271216	4271221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11585	NC_022525	A	6	6	4271303	4271308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11586	NC_022525	ATA	2	6	4271312	4271317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11587	NC_022525	TTAAT	2	10	4271325	4271334	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11588	NC_022525	CCG	2	6	4271341	4271346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11589	NC_022525	GA	3	6	4271362	4271367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11590	NC_022525	CGG	2	6	4276312	4276317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11591	NC_022525	G	6	6	4276316	4276321	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11592	NC_022525	AAT	2	6	4276346	4276351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11593	NC_022525	AAG	2	6	4279303	4279308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11594	NC_022525	CAG	2	6	4279359	4279364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11595	NC_022525	A	6	6	4279394	4279399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11596	NC_022525	AT	3	6	4279422	4279427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11597	NC_022525	GC	3	6	4279471	4279476	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11598	NC_022525	TCC	2	6	4279513	4279518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11599	NC_022525	CCA	2	6	4279595	4279600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11600	NC_022525	CAG	2	6	4279603	4279608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11601	NC_022525	GCT	2	6	4284932	4284937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11602	NC_022525	TCG	2	6	4285416	4285421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11603	NC_022525	GA	3	6	4288068	4288073	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11604	NC_022525	TC	3	6	4288080	4288085	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11605	NC_022525	A	6	6	4288150	4288155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11606	NC_022525	CGG	2	6	4288190	4288195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11607	NC_022525	GA	4	8	4289446	4289453	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11608	NC_022525	GAA	2	6	4289476	4289481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11609	NC_022525	TAA	2	6	4289494	4289499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11610	NC_022525	A	6	6	4289508	4289513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11611	NC_022525	CAA	2	6	4289538	4289543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11612	NC_022525	AATA	2	8	4289551	4289558	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11613	NC_022525	TGC	2	6	4289634	4289639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11614	NC_022525	ATA	2	6	4289643	4289648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11615	NC_022525	A	7	7	4289739	4289745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11616	NC_022525	A	6	6	4289749	4289754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11617	NC_022525	TA	3	6	4289762	4289767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11618	NC_022525	ATG	2	6	4289786	4289791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11619	NC_022525	AAAT	2	8	4289820	4289827	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11620	NC_022525	AT	3	6	4289849	4289854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11621	NC_022525	TA	4	8	4289899	4289906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11622	NC_022525	AT	3	6	4289913	4289918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11623	NC_022525	T	6	6	4289940	4289945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11624	NC_022525	AGC	2	6	4290395	4290400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11625	NC_022525	CAGAA	2	10	4291877	4291886	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11626	NC_022525	TAAA	2	8	4291921	4291928	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11627	NC_022525	T	6	6	4291967	4291972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11628	NC_022525	GCC	2	6	4292022	4292027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11629	NC_022525	ATT	2	6	4292042	4292047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11631	NC_022525	AGA	2	6	4292160	4292165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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