MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 12819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_022525	ATT	2	6	4095124	4095129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11002	NC_022525	ACT	2	6	4095133	4095138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11003	NC_022525	GTC	2	6	4098273	4098278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11004	NC_022525	GTT	2	6	4101402	4101407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11005	NC_022525	TCC	2	6	4101456	4101461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11006	NC_022525	GAG	2	6	4101468	4101473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11007	NC_022525	GT	5	10	4101498	4101507	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11008	NC_022525	AAAG	2	8	4101521	4101528	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11009	NC_022525	AT	4	8	4102391	4102398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11010	NC_022525	CT	3	6	4102416	4102421	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11011	NC_022525	CGAA	2	8	4102532	4102539	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11012	NC_022525	A	6	6	4102538	4102543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11013	NC_022525	ATA	2	6	4103679	4103684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_022525	A	7	7	4103714	4103720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11015	NC_022525	A	6	6	4103744	4103749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11016	NC_022525	TATCAA	2	12	4103781	4103792	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11017	NC_022525	TAT	2	6	4103858	4103863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11018	NC_022525	T	6	6	4105031	4105036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11019	NC_022525	TTC	2	6	4105047	4105052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11020	NC_022525	AG	3	6	4105097	4105102	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11021	NC_022525	GGC	2	6	4105245	4105250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11022	NC_022525	TCA	2	6	4105258	4105263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11023	NC_022525	CGAA	2	8	4106298	4106305	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11024	NC_022525	TCGT	2	8	4106353	4106360	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11025	NC_022525	GGC	2	6	4106943	4106948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11026	NC_022525	A	6	6	4106971	4106976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11027	NC_022525	A	7	7	4108493	4108499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11028	NC_022525	AGCGC	2	10	4109489	4109498	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11029	NC_022525	CTT	2	6	4112311	4112316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11030	NC_022525	A	6	6	4112337	4112342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11031	NC_022525	ACCT	2	8	4112353	4112360	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11032	NC_022525	CAA	2	6	4112392	4112397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11033	NC_022525	CTA	2	6	4112430	4112435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11034	NC_022525	GTC	2	6	4112451	4112456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11035	NC_022525	A	7	7	4112488	4112494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11036	NC_022525	GC	3	6	4112505	4112510	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11037	NC_022525	AGG	2	6	4112575	4112580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11038	NC_022525	TCG	2	6	4113446	4113451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11039	NC_022525	GGC	2	6	4113488	4113493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11040	NC_022525	CGG	2	6	4113512	4113517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11041	NC_022525	TGC	2	6	4113571	4113576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11042	NC_022525	ATT	2	6	4115470	4115475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11043	NC_022525	T	6	6	4115474	4115479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11044	NC_022525	GCC	2	6	4115548	4115553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11045	NC_022525	A	6	6	4115608	4115613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11046	NC_022525	TCA	2	6	4115684	4115689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11047	NC_022525	CAA	2	6	4115715	4115720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11048	NC_022525	ATT	2	6	4115799	4115804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11049	NC_022525	GTT	2	6	4115807	4115812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11050	NC_022525	AT	3	6	4115834	4115839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11051	NC_022525	GTT	2	6	4115896	4115901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11052	NC_022525	TTTTA	2	10	4115916	4115925	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11053	NC_022525	TTTTAA	2	12	4116060	4116071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11054	NC_022525	TAT	2	6	4116775	4116780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11055	NC_022525	T	8	8	4116816	4116823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11056	NC_022525	TGA	2	6	4116830	4116835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11057	NC_022525	ATT	2	6	4116846	4116851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11058	NC_022525	TAA	2	6	4119752	4119757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11059	NC_022525	CTT	2	6	4119794	4119799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11060	NC_022525	AAAG	2	8	4119832	4119839	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11061	NC_022525	TCA	2	6	4119880	4119885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11062	NC_022525	A	6	6	4119910	4119915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11063	NC_022525	T	7	7	4119919	4119925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11064	NC_022525	TTAA	2	8	4119992	4119999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11065	NC_022525	AAT	2	6	4120048	4120053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11066	NC_022525	GAT	2	6	4120057	4120062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11067	NC_022525	TTGCA	2	10	4120686	4120695	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11068	NC_022525	TGA	2	6	4120714	4120719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11069	NC_022525	T	7	7	4120725	4120731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11070	NC_022525	AGC	2	6	4120746	4120751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11071	NC_022525	AGGA	2	8	4121445	4121452	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11072	NC_022525	A	6	6	4121867	4121872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11073	NC_022525	TCA	2	6	4124000	4124005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11074	NC_022525	GTT	2	6	4124030	4124035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11075	NC_022525	TC	3	6	4124078	4124083	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11076	NC_022525	ATG	2	6	4124667	4124672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11077	NC_022525	T	8	8	4124679	4124686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11078	NC_022525	TTA	2	6	4124707	4124712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11079	NC_022525	TAC	2	6	4124738	4124743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11080	NC_022525	AGA	2	6	4124748	4124753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11081	NC_022525	GCCAG	2	10	4125689	4125698	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11082	NC_022525	CCTGA	2	10	4125728	4125737	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11083	NC_022525	CAG	2	6	4125745	4125750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11084	NC_022525	GC	3	6	4126826	4126831	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11085	NC_022525	GCC	2	6	4126895	4126900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11086	NC_022525	T	7	7	4126945	4126951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11087	NC_022525	TCA	2	6	4126990	4126995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11088	NC_022525	CAACA	2	10	4126996	4127005	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
11089	NC_022525	TAT	2	6	4128033	4128038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11090	NC_022525	T	6	6	4128048	4128053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11091	NC_022525	C	6	6	4128878	4128883	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11092	NC_022525	CT	3	6	4129008	4129013	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11093	NC_022525	TGG	2	6	4129035	4129040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11094	NC_022525	TA	3	6	4129047	4129052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11095	NC_022525	CAT	2	6	4129078	4129083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11096	NC_022525	TCA	2	6	4131439	4131444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11097	NC_022525	CTG	2	6	4132519	4132524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11098	NC_022525	CCTG	2	8	4133315	4133322	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11099	NC_022525	CGT	2	6	4133329	4133334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11100	NC_022525	A	6	6	4133345	4133350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11101	NC_022525	ATTGA	2	10	4135787	4135796	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11102	NC_022525	TTATT	2	10	4135805	4135814	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11103	NC_022525	ATC	2	6	4136890	4136895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11104	NC_022525	T	6	6	4136936	4136941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11105	NC_022525	ACT	2	6	4136951	4136956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11106	NC_022525	A	6	6	4136981	4136986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11107	NC_022525	GTCA	2	8	4137002	4137009	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11108	NC_022525	TTA	2	6	4139694	4139699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11109	NC_022525	GGT	2	6	4139784	4139789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11110	NC_022525	ATT	3	9	4139877	4139885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11111	NC_022525	CTA	2	6	4139889	4139894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11112	NC_022525	TTA	2	6	4139929	4139934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11113	NC_022525	TATT	2	8	4139979	4139986	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11114	NC_022525	TGG	2	6	4139987	4139992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11115	NC_022525	ATT	2	6	4139999	4140004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11116	NC_022525	TGGC	2	8	4140016	4140023	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11117	NC_022525	TGG	2	6	4140044	4140049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11118	NC_022525	ATTTC	2	10	4140081	4140090	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11119	NC_022525	T	7	7	4140112	4140118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11120	NC_022525	TG	3	6	4140121	4140126	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11121	NC_022525	CTGT	2	8	4140127	4140134	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11122	NC_022525	GCT	2	6	4140142	4140147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11123	NC_022525	CGC	2	6	4140280	4140285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11124	NC_022525	CGG	2	6	4140357	4140362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11125	NC_022525	GGC	2	6	4140389	4140394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11126	NC_022525	GGC	2	6	4140421	4140426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11127	NC_022525	GCT	2	6	4140427	4140432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11128	NC_022525	CAG	2	6	4140446	4140451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11130	NC_022525	A	7	7	4140624	4140630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11261	NC_022525	CA	3	6	4204411	4204416	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11262	NC_022525	GCC	2	6	4204418	4204423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11263	NC_022525	CGC	2	6	4204514	4204519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11282	NC_022525	AGA	2	6	4205686	4205691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11328	NC_022525	GCTG	2	8	4208438	4208445	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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11393	NC_022525	CTT	2	6	4216363	4216368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11500	NC_022525	G	6	6	4250099	4250104	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding

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