MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 12819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_022525	GGC	2	6	3738928	3738933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10002	NC_022525	GAG	2	6	3738983	3738988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_022525	CCG	2	6	3740850	3740855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10004	NC_022525	TCC	2	6	3741072	3741077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10005	NC_022525	TCTTT	2	10	3741193	3741202	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10006	NC_022525	AAT	2	6	3741238	3741243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_022525	GAA	2	6	3741293	3741298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_022525	TCAC	2	8	3741299	3741306	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10009	NC_022525	GC	3	6	3741308	3741313	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10010	NC_022525	TATC	2	8	3741325	3741332	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10011	NC_022525	GGA	2	6	3741757	3741762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_022525	TA	3	6	3741819	3741824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_022525	T	6	6	3741906	3741911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_022525	ATC	2	6	3741969	3741974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10015	NC_022525	A	7	7	3741979	3741985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_022525	CATA	2	8	3741990	3741997	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10017	NC_022525	ATTATA	2	12	3742001	3742012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_022525	ATAA	2	8	3742042	3742049	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_022525	GC	3	6	3742062	3742067	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10020	NC_022525	CGA	2	6	3742079	3742084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10021	NC_022525	ATG	2	6	3742135	3742140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_022525	TATAT	2	10	3742172	3742181	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_022525	ATT	2	6	3742184	3742189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10024	NC_022525	ATT	2	6	3742904	3742909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_022525	TCAT	2	8	3742927	3742934	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10026	NC_022525	GAATA	2	10	3742935	3742944	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10027	NC_022525	TGT	2	6	3742980	3742985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_022525	A	8	8	3743014	3743021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_022525	AGC	2	6	3743062	3743067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10030	NC_022525	GGA	2	6	3743146	3743151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_022525	CAATGG	2	12	3743384	3743395	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10032	NC_022525	GCG	2	6	3743414	3743419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10033	NC_022525	GCG	2	6	3743498	3743503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10034	NC_022525	GCT	2	6	3743512	3743517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10035	NC_022525	CAC	2	6	3743613	3743618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10036	NC_022525	CCA	2	6	3743660	3743665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10037	NC_022525	CCGA	2	8	3743717	3743724	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10038	NC_022525	CGG	2	6	3743727	3743732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10039	NC_022525	TGT	2	6	3743885	3743890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_022525	GGC	2	6	3743955	3743960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10041	NC_022525	GTT	2	6	3744006	3744011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10042	NC_022525	CTG	2	6	3744041	3744046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10043	NC_022525	CCA	2	6	3744053	3744058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10044	NC_022525	ACC	2	6	3744103	3744108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10045	NC_022525	ATCA	2	8	3744112	3744119	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10046	NC_022525	CCA	2	6	3744137	3744142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10047	NC_022525	ACC	2	6	3744145	3744150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10048	NC_022525	CAA	2	6	3744156	3744161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10049	NC_022525	CAC	2	6	3744176	3744181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10050	NC_022525	ATC	2	6	3744258	3744263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10051	NC_022525	CGC	2	6	3744269	3744274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10052	NC_022525	ACCA	2	8	3744330	3744337	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10053	NC_022525	GTTC	2	8	3744430	3744437	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10054	NC_022525	GCCA	2	8	3744441	3744448	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10055	NC_022525	AGT	2	6	3744453	3744458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_022525	ACAA	2	8	3744462	3744469	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10057	NC_022525	TGC	2	6	3744482	3744487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10058	NC_022525	GAA	2	6	3744501	3744506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_022525	CGC	2	6	3744578	3744583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10060	NC_022525	CGC	2	6	3744755	3744760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10061	NC_022525	GAA	2	6	3744909	3744914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_022525	GCCA	2	8	3744927	3744934	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10063	NC_022525	ACG	2	6	3745201	3745206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10064	NC_022525	CAG	4	12	3745247	3745258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10065	NC_022525	CAA	2	6	3745336	3745341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10066	NC_022525	CGT	2	6	3745349	3745354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10067	NC_022525	TACAA	2	10	3745362	3745371	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10068	NC_022525	CAGA	2	8	3745372	3745379	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10069	NC_022525	ACT	2	6	3745509	3745514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10070	NC_022525	TAC	2	6	3745527	3745532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10071	NC_022525	GAA	2	6	3745548	3745553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10072	NC_022525	GGTATT	2	12	3745620	3745631	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_022525	ACGC	2	8	3745687	3745694	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10074	NC_022525	GACT	2	8	3745754	3745761	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10075	NC_022525	ACA	2	6	3745771	3745776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10076	NC_022525	AC	3	6	3745780	3745785	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10077	NC_022525	CGG	2	6	3745852	3745857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10078	NC_022525	TGGCTC	2	12	3746093	3746104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10079	NC_022525	TGC	2	6	3746108	3746113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10080	NC_022525	TGTC	2	8	3746170	3746177	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10081	NC_022525	CAA	2	6	3746190	3746195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10082	NC_022525	AAC	2	6	3746226	3746231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10083	NC_022525	GGC	2	6	3746346	3746351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10084	NC_022525	GCG	2	6	3746376	3746381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10085	NC_022525	GAA	2	6	3746430	3746435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10086	NC_022525	GCG	2	6	3746506	3746511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10087	NC_022525	GCGATG	2	12	3746523	3746534	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10088	NC_022525	AAC	2	6	3746736	3746741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10089	NC_022525	TGT	2	6	3746794	3746799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10090	NC_022525	ATTAA	2	10	3746859	3746868	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10091	NC_022525	AATA	2	8	3746887	3746894	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10092	NC_022525	TGT	2	6	3746912	3746917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10093	NC_022525	ACA	2	6	3746930	3746935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10094	NC_022525	GGC	2	6	3751198	3751203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10095	NC_022525	CAT	2	6	3752388	3752393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10096	NC_022525	TAT	2	6	3752398	3752403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_022525	ATCAAC	2	12	3752487	3752498	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10098	NC_022525	TAA	3	9	3752520	3752528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10099	NC_022525	A	8	8	3752564	3752571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10100	NC_022525	CT	3	6	3753793	3753798	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10101	NC_022525	GAG	2	6	3753829	3753834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10102	NC_022525	TTC	2	6	3755168	3755173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10103	NC_022525	T	6	6	3755212	3755217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_022525	T	6	6	3757928	3757933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_022525	ACG	2	6	3757989	3757994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10106	NC_022525	AAC	2	6	3758439	3758444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10107	NC_022525	A	6	6	3758461	3758466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10108	NC_022525	A	8	8	3758546	3758553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_022525	CTTT	2	8	3758591	3758598	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10110	NC_022525	TCT	2	6	3758601	3758606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10111	NC_022525	GTA	2	6	3758630	3758635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_022525	ATT	2	6	3758646	3758651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10113	NC_022525	GCC	2	6	3763570	3763575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10114	NC_022525	TAAT	2	8	3763577	3763584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10115	NC_022525	AGCA	2	8	3763598	3763605	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10116	NC_022525	A	6	6	3763715	3763720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_022525	CATA	2	8	3763788	3763795	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10118	NC_022525	TCA	2	6	3766098	3766103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10119	NC_022525	CTT	2	6	3766104	3766109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10120	NC_022525	GCA	2	6	3766116	3766121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10121	NC_022525	TTA	2	6	3770435	3770440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_022525	CAT	2	6	3770459	3770464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10123	NC_022525	AAT	2	6	3771700	3771705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10124	NC_022525	TAAA	2	8	3772560	3772567	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10125	NC_022525	TC	3	6	3772602	3772607	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10126	NC_022525	GCA	2	6	3772625	3772630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10127	NC_022525	AGTC	2	8	3772637	3772644	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10128	NC_022525	TTAAA	2	10	3772651	3772660	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10129	NC_022525	AGGG	2	8	3773389	3773396	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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10250	NC_022525	TTTTA	2	10	3820713	3820722	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10254	NC_022525	A	6	6	3820783	3820788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10256	NC_022525	CGT	2	6	3821554	3821559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10259	NC_022525	ATT	2	6	3821635	3821640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10388	NC_022525	GTT	2	6	3872367	3872372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10498	NC_022525	A	7	7	3922218	3922224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10499	NC_022525	CGT	2	6	3924152	3924157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10500	NC_022525	AG	3	6	3924179	3924184	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

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