MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 12819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_022525	CAC	2	6	3353435	3353440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9002	NC_022525	ATA	2	6	3353451	3353456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9003	NC_022525	TCA	2	6	3353508	3353513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9004	NC_022525	TCAT	2	8	3354573	3354580	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9005	NC_022525	TGA	2	6	3354589	3354594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9006	NC_022525	T	6	6	3354615	3354620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9007	NC_022525	CTG	2	6	3354627	3354632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9008	NC_022525	AAAG	2	8	3354705	3354712	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9009	NC_022525	AGC	2	6	3354780	3354785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9010	NC_022525	A	6	6	3354794	3354799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9011	NC_022525	AT	3	6	3354813	3354818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9012	NC_022525	TCA	2	6	3354936	3354941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9013	NC_022525	ATG	2	6	3355026	3355031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9014	NC_022525	CG	3	6	3355064	3355069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9015	NC_022525	TCCTC	2	10	3361057	3361066	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
9016	NC_022525	TC	3	6	3361071	3361076	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9017	NC_022525	AAT	2	6	3362334	3362339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9018	NC_022525	A	7	7	3362344	3362350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9019	NC_022525	TAT	2	6	3362389	3362394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9020	NC_022525	GCG	2	6	3362395	3362400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9021	NC_022525	T	6	6	3362403	3362408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9022	NC_022525	CAC	2	6	3364981	3364986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9023	NC_022525	CGA	2	6	3368607	3368612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9024	NC_022525	TGT	2	6	3368617	3368622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9025	NC_022525	GGC	2	6	3368636	3368641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9026	NC_022525	TGT	2	6	3368670	3368675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9027	NC_022525	GAT	2	6	3369619	3369624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9028	NC_022525	AT	3	6	3369627	3369632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9029	NC_022525	CTAC	2	8	3369636	3369643	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9030	NC_022525	AGC	2	6	3369672	3369677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9031	NC_022525	ATA	2	6	3369680	3369685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9032	NC_022525	ATA	2	6	3370552	3370557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9033	NC_022525	GAG	2	6	3370601	3370606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9034	NC_022525	CAAA	2	8	3370609	3370616	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9035	NC_022525	CCAG	2	8	3371836	3371843	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9036	NC_022525	A	6	6	3371864	3371869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9037	NC_022525	CAT	2	6	3371872	3371877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9038	NC_022525	A	6	6	3371894	3371899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9039	NC_022525	GAT	2	6	3371932	3371937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9040	NC_022525	AAT	2	6	3372889	3372894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9041	NC_022525	GGA	2	6	3372906	3372911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9042	NC_022525	A	7	7	3372940	3372946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9043	NC_022525	CCG	2	6	3372948	3372953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9044	NC_022525	T	6	6	3372961	3372966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9045	NC_022525	AAAT	2	8	3373849	3373856	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9046	NC_022525	A	6	6	3373968	3373973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9047	NC_022525	CT	3	6	3373974	3373979	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9048	NC_022525	TCGG	2	8	3374075	3374082	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9049	NC_022525	GCGCT	2	10	3374105	3374114	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
9050	NC_022525	TGTTAT	2	12	3375250	3375261	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9051	NC_022525	CGT	2	6	3375281	3375286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9052	NC_022525	A	7	7	3375299	3375305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9053	NC_022525	CT	4	8	3375881	3375888	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9054	NC_022525	TAT	2	6	3375906	3375911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9055	NC_022525	TTCA	2	8	3375968	3375975	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9056	NC_022525	AGC	2	6	3375985	3375990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9057	NC_022525	GATGT	2	10	3377391	3377400	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
9058	NC_022525	TGC	3	9	3377418	3377426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9059	NC_022525	T	6	6	3377434	3377439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9060	NC_022525	ACG	2	6	3377441	3377446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9061	NC_022525	ACG	2	6	3378527	3378532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9062	NC_022525	CGT	2	6	3378546	3378551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9063	NC_022525	CGA	2	6	3378553	3378558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9064	NC_022525	CAGG	2	8	3382669	3382676	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9065	NC_022525	ATA	2	6	3382710	3382715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9066	NC_022525	GCC	2	6	3382733	3382738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9067	NC_022525	TTA	3	9	3382757	3382765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9068	NC_022525	ACC	2	6	3382781	3382786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9069	NC_022525	CAAT	2	8	3385645	3385652	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9070	NC_022525	AT	3	6	3385654	3385659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9071	NC_022525	ATT	2	6	3385689	3385694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9072	NC_022525	A	7	7	3385700	3385706	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9073	NC_022525	GAA	2	6	3385797	3385802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9074	NC_022525	TAA	2	6	3387135	3387140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9075	NC_022525	GAG	2	6	3387153	3387158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9076	NC_022525	AAG	2	6	3387202	3387207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9078	NC_022525	CGG	2	6	3388226	3388231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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9080	NC_022525	AG	3	6	3388343	3388348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9081	NC_022525	GGT	2	6	3388362	3388367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9082	NC_022525	CTA	2	6	3388379	3388384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9084	NC_022525	AATT	2	8	3388414	3388421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9085	NC_022525	ATT	2	6	3388503	3388508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9086	NC_022525	AAT	2	6	3388559	3388564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9087	NC_022525	GTT	2	6	3388565	3388570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9088	NC_022525	TCC	2	6	3389074	3389079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9089	NC_022525	GTC	2	6	3389080	3389085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9090	NC_022525	CGG	2	6	3389089	3389094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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9093	NC_022525	A	6	6	3389289	3389294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9094	NC_022525	ATTA	2	8	3389339	3389346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9095	NC_022525	TGA	2	6	3389376	3389381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9098	NC_022525	CGA	2	6	3390082	3390087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9099	NC_022525	T	6	6	3390110	3390115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9100	NC_022525	GACA	2	8	3390414	3390421	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9101	NC_022525	TAC	2	6	3390433	3390438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9102	NC_022525	CAT	2	6	3390443	3390448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9103	NC_022525	A	7	7	3390532	3390538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9104	NC_022525	GA	4	8	3393701	3393708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9105	NC_022525	CGC	2	6	3393735	3393740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9106	NC_022525	AAT	2	6	3393788	3393793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9107	NC_022525	TAT	2	6	3393827	3393832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9108	NC_022525	GCGCT	2	10	3394862	3394871	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
9109	NC_022525	CA	3	6	3394888	3394893	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9110	NC_022525	GTT	2	6	3396421	3396426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9111	NC_022525	TC	3	6	3400312	3400317	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9112	NC_022525	A	6	6	3400328	3400333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9113	NC_022525	CGG	2	6	3400361	3400366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9114	NC_022525	ACCA	2	8	3405179	3405186	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9115	NC_022525	GCA	2	6	3405190	3405195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9116	NC_022525	ATC	2	6	3405212	3405217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9117	NC_022525	A	6	6	3405286	3405291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9118	NC_022525	CAG	2	6	3405293	3405298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9119	NC_022525	TGC	2	6	3405349	3405354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9120	NC_022525	GC	3	6	3405396	3405401	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9121	NC_022525	GC	3	6	3407442	3407447	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9122	NC_022525	TAC	2	6	3407461	3407466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9123	NC_022525	ATCT	2	8	3407475	3407482	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9124	NC_022525	A	7	7	3408564	3408570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9125	NC_022525	TTAA	2	8	3408578	3408585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9126	NC_022525	TATT	2	8	3408587	3408594	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9127	NC_022525	AC	3	6	3408606	3408611	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9128	NC_022525	TGT	2	6	3408637	3408642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9129	NC_022525	CGA	2	6	3410377	3410382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9130	NC_022525	TTCG	2	8	3410424	3410431	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9131	NC_022525	T	6	6	3410470	3410475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9132	NC_022525	AGA	2	6	3410489	3410494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9133	NC_022525	CA	3	6	3410499	3410504	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9134	NC_022525	T	6	6	3412530	3412535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9135	NC_022525	CAT	2	6	3412558	3412563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9138	NC_022525	CA	3	6	3415215	3415220	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9139	NC_022525	CAT	2	6	3415250	3415255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9146	NC_022525	CATT	2	8	3415557	3415564	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9147	NC_022525	A	7	7	3415582	3415588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9153	NC_022525	ATTT	2	8	3415706	3415713	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9155	NC_022525	A	6	6	3415784	3415789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9166	NC_022525	GCG	2	6	3418954	3418959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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9394	NC_022525	A	8	8	3465423	3465430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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