MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 12819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_022525	ATA	2	6	2401785	2401790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6502	NC_022525	ATTA	2	8	2401791	2401798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_022525	CATT	2	8	2401809	2401816	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6504	NC_022525	C	6	6	2401842	2401847	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6505	NC_022525	GCC	2	6	2401848	2401853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6506	NC_022525	ATG	2	6	2401921	2401926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6507	NC_022525	TCT	3	9	2402096	2402104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6508	NC_022525	CGT	2	6	2402125	2402130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6509	NC_022525	TCCC	2	8	2403458	2403465	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6510	NC_022525	GGC	2	6	2404116	2404121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6511	NC_022525	AGCGC	2	10	2404170	2404179	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6512	NC_022525	CCTG	2	8	2404193	2404200	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6513	NC_022525	A	7	7	2407302	2407308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6514	NC_022525	CTT	2	6	2407325	2407330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6515	NC_022525	TGC	2	6	2407751	2407756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6516	NC_022525	A	7	7	2407774	2407780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_022525	A	6	6	2407839	2407844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6518	NC_022525	ACA	2	6	2407855	2407860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6519	NC_022525	GTC	2	6	2407957	2407962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6520	NC_022525	CAT	2	6	2408031	2408036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6521	NC_022525	A	7	7	2408041	2408047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6522	NC_022525	ATG	2	6	2408057	2408062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_022525	T	7	7	2408115	2408121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6524	NC_022525	GGC	2	6	2411594	2411599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6525	NC_022525	T	6	6	2411702	2411707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6526	NC_022525	CTT	2	6	2411742	2411747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6527	NC_022525	CTTTG	2	10	2411762	2411771	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
6528	NC_022525	CACG	2	8	2416852	2416859	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6529	NC_022525	A	6	6	2417552	2417557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6530	NC_022525	TGT	2	6	2417569	2417574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_022525	CTT	2	6	2419181	2419186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6532	NC_022525	CTC	2	6	2419787	2419792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6533	NC_022525	TTC	2	6	2420507	2420512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6534	NC_022525	CTG	2	6	2420534	2420539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6535	NC_022525	TGA	2	6	2420545	2420550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6536	NC_022525	CA	4	8	2420556	2420563	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6537	NC_022525	AGG	2	6	2420566	2420571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6538	NC_022525	CAT	2	6	2421283	2421288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6539	NC_022525	ATG	2	6	2421291	2421296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_022525	A	6	6	2421314	2421319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6541	NC_022525	TCC	2	6	2421374	2421379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6542	NC_022525	GCC	2	6	2422326	2422331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6543	NC_022525	CTT	2	6	2422335	2422340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6544	NC_022525	CCTGT	2	10	2424523	2424532	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6545	NC_022525	TG	4	8	2424533	2424540	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6546	NC_022525	AAG	2	6	2424548	2424553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_022525	GGC	2	6	2424589	2424594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6548	NC_022525	GCGCG	2	10	2425697	2425706	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6549	NC_022525	TG	3	6	2426548	2426553	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6550	NC_022525	AAT	2	6	2426766	2426771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6551	NC_022525	GCC	2	6	2428826	2428831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6552	NC_022525	CGG	2	6	2428844	2428849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6553	NC_022525	CTT	2	6	2431421	2431426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6554	NC_022525	ATC	2	6	2431427	2431432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6555	NC_022525	GAC	2	6	2431434	2431439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6556	NC_022525	T	6	6	2432944	2432949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6557	NC_022525	AAT	2	6	2432955	2432960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6558	NC_022525	TCA	2	6	2433013	2433018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6559	NC_022525	ACG	2	6	2433021	2433026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6560	NC_022525	ACA	2	6	2433049	2433054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6561	NC_022525	CAGC	2	8	2434513	2434520	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6562	NC_022525	CGC	2	6	2434528	2434533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6563	NC_022525	GC	3	6	2436878	2436883	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6564	NC_022525	GCT	2	6	2438840	2438845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6565	NC_022525	GCCCT	2	10	2438881	2438890	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6566	NC_022525	TAT	2	6	2439848	2439853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6567	NC_022525	A	6	6	2439934	2439939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6568	NC_022525	ATT	2	6	2442536	2442541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6569	NC_022525	AAG	2	6	2442556	2442561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6570	NC_022525	GCC	2	6	2443757	2443762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6571	NC_022525	AT	3	6	2443767	2443772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6572	NC_022525	TAAT	2	8	2443796	2443803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_022525	C	6	6	2446023	2446028	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6574	NC_022525	AG	3	6	2446100	2446105	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6575	NC_022525	TTTC	2	8	2446539	2446546	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6576	NC_022525	TGA	2	6	2446555	2446560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6577	NC_022525	TCT	2	6	2446573	2446578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6578	NC_022525	CTTT	2	8	2446595	2446602	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6579	NC_022525	CTTT	2	8	2446636	2446643	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6580	NC_022525	TCT	2	6	2446690	2446695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6581	NC_022525	CAA	2	6	2446996	2447001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6582	NC_022525	TAA	2	6	2447003	2447008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6583	NC_022525	TTA	2	6	2447019	2447024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6584	NC_022525	TTA	2	6	2447107	2447112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6585	NC_022525	TCA	2	6	2448067	2448072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6586	NC_022525	TA	3	6	2448736	2448741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6587	NC_022525	TGT	2	6	2448756	2448761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6588	NC_022525	TGAA	2	8	2448766	2448773	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6589	NC_022525	A	6	6	2448772	2448777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6590	NC_022525	TTG	2	6	2448803	2448808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6591	NC_022525	TAC	2	6	2448810	2448815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6592	NC_022525	CA	3	6	2450159	2450164	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6593	NC_022525	GTCA	2	8	2452210	2452217	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6594	NC_022525	GGC	2	6	2452227	2452232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6595	NC_022525	GTT	2	6	2455852	2455857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6596	NC_022525	TCC	2	6	2456809	2456814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6597	NC_022525	CGG	2	6	2456836	2456841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6598	NC_022525	CGG	2	6	2456881	2456886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6599	NC_022525	TCC	2	6	2456922	2456927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6600	NC_022525	GGC	2	6	2457538	2457543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6601	NC_022525	CAGC	2	8	2457569	2457576	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6602	NC_022525	AAGCG	2	10	2457594	2457603	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6603	NC_022525	GCA	2	6	2457611	2457616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6604	NC_022525	TGAA	2	8	2458209	2458216	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6605	NC_022525	T	6	6	2458223	2458228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6606	NC_022525	ATT	3	9	2458260	2458268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6607	NC_022525	AGG	2	6	2458278	2458283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6608	NC_022525	A	7	7	2461786	2461792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6609	NC_022525	T	6	6	2461830	2461835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6610	NC_022525	AG	3	6	2461850	2461855	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6611	NC_022525	AAAG	2	8	2461857	2461864	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6612	NC_022525	A	7	7	2461896	2461902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6613	NC_022525	GAT	3	9	2461919	2461927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6614	NC_022525	CGT	2	6	2461933	2461938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6615	NC_022525	TGG	2	6	2462323	2462328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6616	NC_022525	CG	3	6	2462381	2462386	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6617	NC_022525	CCG	2	6	2462405	2462410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6618	NC_022525	GCCA	2	8	2462416	2462423	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6619	NC_022525	A	6	6	2462449	2462454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6620	NC_022525	AAT	2	6	2462583	2462588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6621	NC_022525	TTTA	2	8	2463958	2463965	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6622	NC_022525	CCAT	2	8	2464765	2464772	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6623	NC_022525	CAA	2	6	2464879	2464884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6624	NC_022525	ATTTTT	2	12	2464930	2464941	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6625	NC_022525	TTA	2	6	2464985	2464990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6626	NC_022525	CAG	2	6	2465003	2465008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6627	NC_022525	ATC	2	6	2465011	2465016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6628	NC_022525	GGC	2	6	2465981	2465986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6629	NC_022525	A	6	6	2466008	2466013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6630	NC_022525	CCT	2	6	2466064	2466069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6631	NC_022525	TCT	2	6	2466127	2466132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6632	NC_022525	TGC	2	6	2466133	2466138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6633	NC_022525	GTC	2	6	2466224	2466229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6634	NC_022525	TGA	2	6	2467242	2467247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6710	NC_022525	CATGC	2	10	2489302	2489311	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6711	NC_022525	CAT	2	6	2489372	2489377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6753	NC_022525	A	6	6	2504433	2504438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6754	NC_022525	T	6	6	2504455	2504460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6755	NC_022525	TCACC	2	10	2504479	2504488	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
6756	NC_022525	GCC	2	6	2504738	2504743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6759	NC_022525	T	7	7	2507415	2507421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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