MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 12819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_022525	CT	3	6	2000042	2000047	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5502	NC_022525	TAA	2	6	2000049	2000054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_022525	T	6	6	2000078	2000083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_022525	TGT	2	6	2000170	2000175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_022525	T	6	6	2000201	2000206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_022525	A	7	7	2000263	2000269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_022525	GGT	2	6	2000279	2000284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_022525	ATT	2	6	2000309	2000314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_022525	CCA	2	6	2000402	2000407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5510	NC_022525	T	8	8	2000503	2000510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_022525	CAGC	2	8	2000517	2000524	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5512	NC_022525	TGC	2	6	2000680	2000685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5513	NC_022525	TCAC	2	8	2000741	2000748	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5514	NC_022525	GCG	2	6	2000767	2000772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5515	NC_022525	TGT	2	6	2001345	2001350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_022525	A	7	7	2003952	2003958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_022525	TGT	2	6	2003997	2004002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_022525	CGT	2	6	2004004	2004009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5519	NC_022525	GGC	2	6	2004040	2004045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5520	NC_022525	GCT	2	6	2004056	2004061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5521	NC_022525	AAT	2	6	2004131	2004136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_022525	TAA	2	6	2004155	2004160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_022525	GAA	2	6	2004170	2004175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_022525	A	6	6	2004559	2004564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_022525	ATT	2	6	2005379	2005384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_022525	TA	4	8	2005418	2005425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_022525	T	6	6	2005469	2005474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_022525	AG	3	6	2005485	2005490	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_022525	TAA	2	6	2005497	2005502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_022525	ATT	2	6	2005523	2005528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_022525	GT	3	6	2008025	2008030	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_022525	TAT	2	6	2008037	2008042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_022525	A	6	6	2008064	2008069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_022525	CGG	2	6	2008123	2008128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5535	NC_022525	CTGC	2	8	2008133	2008140	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5536	NC_022525	AAG	2	6	2010516	2010521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_022525	A	6	6	2011854	2011859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_022525	AATC	2	8	2011900	2011907	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5539	NC_022525	GGC	2	6	2013531	2013536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5540	NC_022525	CAT	2	6	2013554	2013559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5541	NC_022525	ATT	2	6	2013570	2013575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_022525	ACT	2	6	2013627	2013632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5543	NC_022525	GAA	2	6	2013649	2013654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_022525	TTC	2	6	2015875	2015880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_022525	CGG	2	6	2017418	2017423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_022525	AGA	2	6	2017876	2017881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_022525	CGC	2	6	2017910	2017915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5548	NC_022525	TTA	2	6	2017964	2017969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_022525	GTA	2	6	2017995	2018000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_022525	CTT	2	6	2018007	2018012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5551	NC_022525	CGG	2	6	2019505	2019510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5552	NC_022525	GTC	2	6	2019569	2019574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_022525	TAT	2	6	2019596	2019601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_022525	TTTG	2	8	2019622	2019629	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_022525	ATT	3	9	2019674	2019682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_022525	TGA	2	6	2019744	2019749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_022525	TTTA	2	8	2019750	2019757	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_022525	CAG	2	6	2019762	2019767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5559	NC_022525	GC	3	6	2020133	2020138	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5560	NC_022525	A	6	6	2020144	2020149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_022525	GCGTC	2	10	2020182	2020191	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5562	NC_022525	CGC	2	6	2020195	2020200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5563	NC_022525	TGT	2	6	2020237	2020242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_022525	GAT	2	6	2020580	2020585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_022525	T	6	6	2020585	2020590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_022525	GCA	2	6	2020593	2020598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5567	NC_022525	A	6	6	2020643	2020648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_022525	AAT	2	6	2020686	2020691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_022525	GAGT	2	8	2020725	2020732	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_022525	A	6	6	2020748	2020753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_022525	AGG	2	6	2025531	2025536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_022525	CGA	2	6	2025538	2025543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5573	NC_022525	GGACA	2	10	2027256	2027265	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5574	NC_022525	A	6	6	2031439	2031444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_022525	AT	3	6	2031456	2031461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_022525	TCAC	2	8	2031487	2031494	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5577	NC_022525	ACTTT	2	10	2031509	2031518	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5578	NC_022525	GAT	2	6	2031521	2031526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_022525	TGAG	2	8	2031662	2031669	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_022525	TCC	2	6	2032540	2032545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5581	NC_022525	A	7	7	2032900	2032906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_022525	AAG	2	6	2032944	2032949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_022525	T	7	7	2033005	2033011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_022525	T	6	6	2033028	2033033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_022525	ATGA	2	8	2033036	2033043	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_022525	TGC	2	6	2033088	2033093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5587	NC_022525	CTT	2	6	2033130	2033135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5588	NC_022525	CCG	2	6	2033171	2033176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5589	NC_022525	TCA	2	6	2035764	2035769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5590	NC_022525	AGC	2	6	2035802	2035807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5591	NC_022525	CGA	2	6	2035819	2035824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5592	NC_022525	CCT	2	6	2036062	2036067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5593	NC_022525	TCT	2	6	2037064	2037069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5594	NC_022525	CGG	2	6	2037109	2037114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5595	NC_022525	ATA	2	6	2037166	2037171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_022525	GTGA	2	8	2037210	2037217	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_022525	AAT	2	6	2040028	2040033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_022525	CT	3	6	2040785	2040790	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5599	NC_022525	TTA	2	6	2040807	2040812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_022525	CCA	2	6	2040851	2040856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5601	NC_022525	ATTA	2	8	2041206	2041213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_022525	ATTC	2	8	2041275	2041282	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5603	NC_022525	CTG	2	6	2041327	2041332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5604	NC_022525	AAC	2	6	2041389	2041394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5605	NC_022525	TTTTA	2	10	2041419	2041428	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_022525	TTA	2	6	2041456	2041461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_022525	ATTT	2	8	2041472	2041479	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_022525	T	8	8	2041513	2041520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_022525	A	6	6	2041555	2041560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_022525	CAA	2	6	2041577	2041582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5611	NC_022525	ATCAA	2	10	2041585	2041594	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5612	NC_022525	A	6	6	2041613	2041618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_022525	AT	4	8	2041632	2041639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_022525	TA	3	6	2041651	2041656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_022525	TAT	2	6	2041662	2041667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_022525	A	6	6	2041668	2041673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_022525	T	6	6	2041722	2041727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_022525	TTG	2	6	2041768	2041773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_022525	ATT	2	6	2041796	2041801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_022525	TTA	2	6	2043073	2043078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_022525	T	6	6	2043157	2043162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_022525	GAT	2	6	2043218	2043223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_022525	GAT	2	6	2043241	2043246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_022525	ATC	2	6	2043248	2043253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5625	NC_022525	A	6	6	2043261	2043266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_022525	ATT	2	6	2043290	2043295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5627	NC_022525	A	6	6	2043371	2043376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5628	NC_022525	TTA	2	6	2043469	2043474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5629	NC_022525	GAA	2	6	2043745	2043750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5630	NC_022525	AG	3	6	2043758	2043763	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5632	NC_022525	ATG	2	6	2043797	2043802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5764	NC_022525	AAT	2	6	2086051	2086056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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