MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 12819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_022525	CG	3	6	1887851	1887856	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5002	NC_022525	TAT	2	6	1888013	1888018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_022525	CCCT	2	8	1889395	1889402	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5004	NC_022525	TCG	2	6	1889444	1889449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_022525	GGC	2	6	1889512	1889517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_022525	GCT	2	6	1892867	1892872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_022525	CCTT	2	8	1892943	1892950	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5008	NC_022525	CA	3	6	1893025	1893030	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5009	NC_022525	T	7	7	1893036	1893042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_022525	AAT	2	6	1893053	1893058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_022525	A	6	6	1893125	1893130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_022525	AAT	2	6	1893157	1893162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_022525	AGG	2	6	1893165	1893170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_022525	CCG	2	6	1894146	1894151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5015	NC_022525	TGT	2	6	1895866	1895871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_022525	T	6	6	1895897	1895902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_022525	GGA	2	6	1895911	1895916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_022525	ATA	2	6	1896425	1896430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_022525	ATTTA	2	10	1896465	1896474	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_022525	TGA	2	6	1896484	1896489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_022525	ATA	2	6	1896528	1896533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_022525	TGT	2	6	1896543	1896548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_022525	GCC	2	6	1896664	1896669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5024	NC_022525	CTG	2	6	1896700	1896705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_022525	TGAT	2	8	1900000	1900007	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_022525	A	6	6	1900035	1900040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_022525	TAA	2	6	1900047	1900052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_022525	CAA	2	6	1900066	1900071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_022525	GTG	2	6	1900181	1900186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_022525	TCAACG	2	12	1900507	1900518	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_022525	CTT	2	6	1900532	1900537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_022525	CA	3	6	1900550	1900555	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5033	NC_022525	CAA	2	6	1900690	1900695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_022525	AT	3	6	1900707	1900712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_022525	CTG	2	6	1900745	1900750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_022525	CTT	2	6	1900786	1900791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_022525	A	6	6	1900873	1900878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_022525	ATA	2	6	1900894	1900899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_022525	GAAAA	2	10	1900900	1900909	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_022525	AACA	2	8	1900971	1900978	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5041	NC_022525	AG	4	8	1900993	1901000	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_022525	AT	3	6	1901093	1901098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_022525	GTA	2	6	1901118	1901123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_022525	GA	3	6	1901145	1901150	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_022525	CGT	2	6	1901483	1901488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_022525	CAC	2	6	1901495	1901500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5047	NC_022525	GGAA	2	8	1901537	1901544	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_022525	TCAA	2	8	1901811	1901818	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5049	NC_022525	CTAA	2	8	1901838	1901845	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5050	NC_022525	AAAAG	2	10	1901846	1901855	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_022525	GTA	2	6	1901858	1901863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_022525	AATA	2	8	1902109	1902116	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_022525	AAT	2	6	1902139	1902144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_022525	TGT	2	6	1902159	1902164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_022525	ATA	2	6	1902181	1902186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_022525	TAA	2	6	1902190	1902195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_022525	TAA	2	6	1902303	1902308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_022525	TAT	2	6	1903152	1903157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_022525	AAC	2	6	1903218	1903223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_022525	ATT	3	9	1903241	1903249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_022525	TTA	2	6	1903266	1903271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_022525	GAC	2	6	1905721	1905726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_022525	A	9	9	1905740	1905748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_022525	T	6	6	1905758	1905763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_022525	GGCCT	2	10	1907831	1907840	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5066	NC_022525	CAA	2	6	1908561	1908566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_022525	GCA	2	6	1908567	1908572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_022525	TA	3	6	1909128	1909133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_022525	ATT	2	6	1909201	1909206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_022525	ATT	2	6	1909228	1909233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_022525	A	7	7	1914668	1914674	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_022525	TTAT	2	8	1915040	1915047	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_022525	C	6	6	1915065	1915070	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5074	NC_022525	AGT	2	6	1915101	1915106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_022525	T	7	7	1916038	1916044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_022525	TGT	2	6	1916062	1916067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_022525	ATC	2	6	1916107	1916112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_022525	TCC	2	6	1916201	1916206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5079	NC_022525	CAT	2	6	1916414	1916419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5080	NC_022525	AAC	2	6	1916443	1916448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_022525	A	7	7	1916461	1916467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_022525	TAA	2	6	1916495	1916500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_022525	ATT	2	6	1916503	1916508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_022525	GAC	2	6	1916555	1916560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_022525	AT	3	6	1916591	1916596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_022525	GTATT	2	10	1916638	1916647	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_022525	TAC	2	6	1916648	1916653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_022525	A	6	6	1917438	1917443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_022525	ATTTT	2	10	1917488	1917497	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_022525	TTC	2	6	1917512	1917517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5091	NC_022525	T	8	8	1917532	1917539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_022525	TTCAA	2	10	1917610	1917619	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5093	NC_022525	ATT	3	9	1917649	1917657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_022525	TGT	2	6	1917666	1917671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_022525	GGCT	2	8	1917694	1917701	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5096	NC_022525	CGCCA	2	10	1917751	1917760	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5097	NC_022525	AATT	2	8	1917796	1917803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_022525	TA	3	6	1917814	1917819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_022525	AAATG	2	10	1917852	1917861	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_022525	A	7	7	1917885	1917891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_022525	AAT	2	6	1917904	1917909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_022525	ATT	3	9	1917965	1917973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_022525	GCT	2	6	1917998	1918003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_022525	CAA	2	6	1918010	1918015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_022525	ACA	2	6	1918025	1918030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5106	NC_022525	TAA	2	6	1918468	1918473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_022525	CCGA	2	8	1918569	1918576	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5108	NC_022525	GCA	2	6	1918578	1918583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_022525	ACA	2	6	1918603	1918608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_022525	TCTA	2	8	1918686	1918693	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5111	NC_022525	A	6	6	1918768	1918773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_022525	TCT	2	6	1919268	1919273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_022525	ATTA	2	8	1919310	1919317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_022525	CAG	2	6	1919336	1919341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_022525	TAT	2	6	1919364	1919369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_022525	TA	3	6	1919392	1919397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_022525	GCC	2	6	1919429	1919434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5118	NC_022525	GT	3	6	1919551	1919556	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_022525	AT	3	6	1919573	1919578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_022525	GCA	2	6	1919627	1919632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5121	NC_022525	TTAA	2	8	1920106	1920113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_022525	GTTT	2	8	1920129	1920136	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_022525	CAC	2	6	1920356	1920361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5124	NC_022525	GAT	2	6	1920410	1920415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_022525	AAGG	2	8	1920748	1920755	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_022525	AGA	2	6	1920792	1920797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_022525	ACA	2	6	1920805	1920810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_022525	TCAA	2	8	1920846	1920853	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5129	NC_022525	CAA	2	6	1920943	1920948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5130	NC_022525	CAG	2	6	1920977	1920982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5131	NC_022525	AGA	2	6	1921019	1921024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_022525	TTA	2	6	1921143	1921148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_022525	ATA	2	6	1921180	1921185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5135	NC_022525	T	6	6	1921230	1921235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5266	NC_022525	GTT	2	6	1929751	1929756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5268	NC_022525	TGAG	2	8	1929807	1929814	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5392	NC_022525	CAGGTA	2	12	1969589	1969600	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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5394	NC_022525	CCG	2	6	1972714	1972719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5395	NC_022525	AAGCT	2	10	1972743	1972752	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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