MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus SA40

Total Repeats: 12897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_022443	AAT	2	6	2340486	2340491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11003	NC_022443	CTA	2	6	2340517	2340522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11004	NC_022443	AAG	2	6	2340537	2340542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11005	NC_022443	TGA	2	6	2340572	2340577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11006	NC_022443	AAT	2	6	2340600	2340605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11007	NC_022443	T	6	6	2340640	2340645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11008	NC_022443	T	7	7	2340675	2340681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11009	NC_022443	AGTT	2	8	2340715	2340722	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11010	NC_022443	T	6	6	2340741	2340746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11011	NC_022443	ATTA	2	8	2340771	2340778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11012	NC_022443	TAATT	2	10	2340788	2340797	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11013	NC_022443	AT	4	8	2341010	2341017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_022443	GA	4	8	2341025	2341032	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11015	NC_022443	GAT	2	6	2343201	2343206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11016	NC_022443	TA	4	8	2343708	2343715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11017	NC_022443	TAT	2	6	2343756	2343761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11018	NC_022443	GT	3	6	2343808	2343813	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11019	NC_022443	AATT	2	8	2343821	2343828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11020	NC_022443	TGT	2	6	2343859	2343864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11021	NC_022443	TGA	2	6	2343904	2343909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11022	NC_022443	AT	3	6	2344290	2344295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11023	NC_022443	AGC	2	6	2344307	2344312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11024	NC_022443	CTG	2	6	2344345	2344350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11025	NC_022443	GCAT	2	8	2344401	2344408	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11026	NC_022443	AAC	2	6	2344419	2344424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11027	NC_022443	CTTCG	2	10	2344434	2344443	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
11028	NC_022443	GCAT	2	8	2344461	2344468	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11029	NC_022443	AAC	2	6	2344479	2344484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11030	NC_022443	GCAT	2	8	2344522	2344529	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11031	NC_022443	AAC	2	6	2344540	2344545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11032	NC_022443	A	6	6	2345924	2345929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11033	NC_022443	AAT	2	6	2345995	2346000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11034	NC_022443	ATTT	2	8	2346453	2346460	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11035	NC_022443	T	7	7	2346490	2346496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11036	NC_022443	ATT	2	6	2346506	2346511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11037	NC_022443	TACA	2	8	2346525	2346532	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11038	NC_022443	A	6	6	2346543	2346548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11039	NC_022443	TAA	2	6	2346551	2346556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11040	NC_022443	CTAT	2	8	2346571	2346578	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11041	NC_022443	ACT	2	6	2346590	2346595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11042	NC_022443	GAT	2	6	2346609	2346614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11043	NC_022443	T	7	7	2346624	2346630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11044	NC_022443	A	6	6	2346637	2346642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11045	NC_022443	AT	3	6	2346685	2346690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11046	NC_022443	ATT	2	6	2346696	2346701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11047	NC_022443	ATA	2	6	2346773	2346778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11048	NC_022443	T	6	6	2347386	2347391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11049	NC_022443	T	6	6	2347412	2347417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11050	NC_022443	TAC	2	6	2347420	2347425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11051	NC_022443	TA	3	6	2347453	2347458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11052	NC_022443	ACT	2	6	2347916	2347921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11053	NC_022443	AATG	2	8	2347981	2347988	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11054	NC_022443	TTCACC	2	12	2349177	2349188	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
11055	NC_022443	ATTT	2	8	2349195	2349202	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11056	NC_022443	T	6	6	2349200	2349205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11057	NC_022443	TA	3	6	2349227	2349232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11058	NC_022443	AT	4	8	2349305	2349312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11059	NC_022443	TAT	2	6	2349315	2349320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11060	NC_022443	TTAT	2	8	2349353	2349360	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11061	NC_022443	CAT	2	6	2349416	2349421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11062	NC_022443	ATT	2	6	2349431	2349436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11063	NC_022443	T	6	6	2349454	2349459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11064	NC_022443	T	6	6	2349464	2349469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11065	NC_022443	ACGTT	2	10	2349499	2349508	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11066	NC_022443	AGG	2	6	2349530	2349535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11067	NC_022443	TTCA	2	8	2351331	2351338	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11068	NC_022443	A	7	7	2351345	2351351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11069	NC_022443	AGA	2	6	2351378	2351383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11072	NC_022443	ATGT	2	8	2352100	2352107	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11073	NC_022443	TCC	2	6	2360123	2360128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11074	NC_022443	T	6	6	2360212	2360217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11075	NC_022443	ATA	2	6	2360291	2360296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11076	NC_022443	AT	3	6	2360376	2360381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11077	NC_022443	TC	3	6	2360382	2360387	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11078	NC_022443	CTTA	2	8	2360397	2360404	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11079	NC_022443	ATTT	2	8	2360408	2360415	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11082	NC_022443	AT	3	6	2365064	2365069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11083	NC_022443	CATT	2	8	2365084	2365091	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11084	NC_022443	AGCA	2	8	2365094	2365101	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11085	NC_022443	AT	3	6	2365105	2365110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11086	NC_022443	TAT	3	9	2365128	2365136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11095	NC_022443	TAT	2	6	2366930	2366935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11097	NC_022443	GATA	2	8	2367048	2367055	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11098	NC_022443	ATC	2	6	2367301	2367306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11099	NC_022443	TTCA	2	8	2367308	2367315	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11100	NC_022443	TAA	2	6	2367318	2367323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11101	NC_022443	TTA	3	9	2367331	2367339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11102	NC_022443	T	6	6	2367361	2367366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11103	NC_022443	CAA	2	6	2367376	2367381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11104	NC_022443	A	6	6	2367980	2367985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11106	NC_022443	TA	3	6	2369623	2369628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11107	NC_022443	ATA	2	6	2369665	2369670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11108	NC_022443	ATA	2	6	2369774	2369779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11109	NC_022443	A	6	6	2369784	2369789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11110	NC_022443	CTG	2	6	2370082	2370087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11111	NC_022443	CCT	2	6	2370404	2370409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11112	NC_022443	AC	3	6	2370414	2370419	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11113	NC_022443	AT	3	6	2370433	2370438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11114	NC_022443	A	8	8	2370460	2370467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11115	NC_022443	CTA	2	6	2370468	2370473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11118	NC_022443	TAA	2	6	2370627	2370632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11119	NC_022443	ACTT	2	8	2370642	2370649	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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11122	NC_022443	AACT	2	8	2371673	2371680	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11123	NC_022443	TAAT	2	8	2371688	2371695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11124	NC_022443	ACT	2	6	2371727	2371732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11125	NC_022443	AT	3	6	2371791	2371796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11126	NC_022443	ATAAA	2	10	2371831	2371840	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11127	NC_022443	A	7	7	2371838	2371844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11128	NC_022443	ATT	2	6	2371849	2371854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11129	NC_022443	AG	3	6	2371883	2371888	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11130	NC_022443	CAT	2	6	2373193	2373198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11131	NC_022443	CAT	2	6	2373207	2373212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11132	NC_022443	AT	3	6	2375459	2375464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11134	NC_022443	TA	3	6	2375555	2375560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11255	NC_022443	T	6	6	2401779	2401784	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11256	NC_022443	A	7	7	2401794	2401800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11259	NC_022443	T	6	6	2401862	2401867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11260	NC_022443	GAG	2	6	2401882	2401887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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