MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 complete genome

Total Repeats: 13443

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_022241	GAA	2	6	4533689	4533694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13002	NC_022241	AGG	2	6	4535135	4535140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13003	NC_022241	CGA	2	6	4535211	4535216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13004	NC_022241	ATT	2	6	4536368	4536373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13005	NC_022241	ACCC	2	8	4536402	4536409	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
13006	NC_022241	TTTTCC	2	12	4536428	4536439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13007	NC_022241	GCCT	2	8	4536445	4536452	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13008	NC_022241	CTG	2	6	4536453	4536458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13009	NC_022241	GT	3	6	4536467	4536472	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13010	NC_022241	TTTA	2	8	4536501	4536508	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13011	NC_022241	GAA	2	6	4536543	4536548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13012	NC_022241	CTAT	2	8	4539365	4539372	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13013	NC_022241	AACC	2	8	4539833	4539840	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13014	NC_022241	A	8	8	4541277	4541284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13015	NC_022241	GAAA	2	8	4541322	4541329	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13016	NC_022241	T	6	6	4541347	4541352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_022241	TAT	2	6	4541986	4541991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13018	NC_022241	TCA	2	6	4542015	4542020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13019	NC_022241	A	6	6	4542081	4542086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13020	NC_022241	TC	3	6	4543565	4543570	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13021	NC_022241	AAG	2	6	4546925	4546930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13022	NC_022241	GTT	2	6	4547010	4547015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13023	NC_022241	AAAAT	2	10	4547201	4547210	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13024	NC_022241	ATT	2	6	4547212	4547217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13025	NC_022241	TAT	2	6	4547253	4547258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13026	NC_022241	AAT	2	6	4547271	4547276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13027	NC_022241	GTT	2	6	4547371	4547376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13028	NC_022241	AT	3	6	4547446	4547451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13029	NC_022241	GTA	2	6	4547503	4547508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13030	NC_022241	GGC	2	6	4548038	4548043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13031	NC_022241	CAT	2	6	4548083	4548088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13032	NC_022241	GAT	2	6	4549153	4549158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_022241	CGG	2	6	4549214	4549219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13034	NC_022241	CTG	2	6	4549712	4549717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13035	NC_022241	T	7	7	4549723	4549729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13036	NC_022241	CAT	2	6	4550708	4550713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13037	NC_022241	AAT	2	6	4551243	4551248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13038	NC_022241	ATT	2	6	4551281	4551286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13039	NC_022241	ATA	2	6	4551300	4551305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13040	NC_022241	ATAA	2	8	4551316	4551323	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13041	NC_022241	ATTT	2	8	4551859	4551866	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13042	NC_022241	ACC	2	6	4551882	4551887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13043	NC_022241	TAT	2	6	4551992	4551997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13044	NC_022241	TGT	2	6	4553258	4553263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13045	NC_022241	GGC	2	6	4553269	4553274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13046	NC_022241	AAGCG	2	10	4553336	4553345	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
13047	NC_022241	GGC	2	6	4556752	4556757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13048	NC_022241	ACA	2	6	4558333	4558338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13049	NC_022241	GTG	2	6	4558339	4558344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13050	NC_022241	TCG	2	6	4558358	4558363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13051	NC_022241	GCC	2	6	4558445	4558450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13052	NC_022241	TTA	2	6	4558542	4558547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13053	NC_022241	GAT	2	6	4558609	4558614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13054	NC_022241	CGA	2	6	4558617	4558622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13055	NC_022241	A	7	7	4558672	4558678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13056	NC_022241	TCT	2	6	4558776	4558781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13057	NC_022241	CGGCG	2	10	4558807	4558816	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13058	NC_022241	CCG	2	6	4560960	4560965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13059	NC_022241	ATG	2	6	4560996	4561001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13060	NC_022241	GTA	2	6	4561075	4561080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13061	NC_022241	GAT	2	6	4562144	4562149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13062	NC_022241	TC	3	6	4563478	4563483	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13063	NC_022241	TTA	2	6	4563484	4563489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13064	NC_022241	AGC	2	6	4563500	4563505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13065	NC_022241	ATT	2	6	4565411	4565416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13066	NC_022241	TTC	2	6	4565484	4565489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13067	NC_022241	A	6	6	4565502	4565507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13068	NC_022241	TGTGG	2	10	4565539	4565548	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
13069	NC_022241	CTG	2	6	4567219	4567224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13070	NC_022241	ATT	2	6	4567246	4567251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13071	NC_022241	GCT	2	6	4567268	4567273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13072	NC_022241	GGC	2	6	4567320	4567325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13073	NC_022241	AAT	2	6	4567464	4567469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13074	NC_022241	G	6	6	4567481	4567486	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13075	NC_022241	T	7	7	4567488	4567494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13076	NC_022241	ATTT	2	8	4567545	4567552	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13077	NC_022241	ATTT	2	8	4567568	4567575	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13078	NC_022241	TGT	2	6	4567576	4567581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13079	NC_022241	ATA	2	6	4567659	4567664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13080	NC_022241	T	7	7	4569623	4569629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13081	NC_022241	GCC	2	6	4569742	4569747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13082	NC_022241	TAG	2	6	4569767	4569772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13083	NC_022241	GATT	2	8	4569903	4569910	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13084	NC_022241	GAT	2	6	4569917	4569922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13085	NC_022241	TTA	2	6	4570021	4570026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13086	NC_022241	AC	3	6	4570041	4570046	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13087	NC_022241	AAC	2	6	4570080	4570085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13088	NC_022241	GCT	2	6	4570103	4570108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13089	NC_022241	GC	3	6	4570133	4570138	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13090	NC_022241	GATGCA	2	12	4570181	4570192	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13091	NC_022241	CAGC	2	8	4570203	4570210	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13092	NC_022241	A	6	6	4570245	4570250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13093	NC_022241	CATG	2	8	4572182	4572189	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13094	NC_022241	TG	3	6	4572188	4572193	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13095	NC_022241	ATC	2	6	4572231	4572236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13096	NC_022241	AATC	2	8	4572243	4572250	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13097	NC_022241	CTA	2	6	4572381	4572386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13098	NC_022241	CGG	2	6	4572405	4572410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13099	NC_022241	TGAA	2	8	4572493	4572500	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13100	NC_022241	GGA	2	6	4572578	4572583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13101	NC_022241	A	6	6	4572617	4572622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13102	NC_022241	CAT	2	6	4572660	4572665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13103	NC_022241	TTG	2	6	4572733	4572738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13104	NC_022241	TCG	2	6	4572765	4572770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13105	NC_022241	TA	3	6	4572799	4572804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13106	NC_022241	TA	3	6	4572897	4572902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13107	NC_022241	T	6	6	4572918	4572923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13108	NC_022241	ATT	2	6	4573719	4573724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13109	NC_022241	TAA	2	6	4573741	4573746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13110	NC_022241	ATA	2	6	4573775	4573780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13111	NC_022241	TA	3	6	4573779	4573784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13112	NC_022241	ATG	2	6	4573856	4573861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13113	NC_022241	TTC	2	6	4573881	4573886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13114	NC_022241	T	6	6	4573893	4573898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13115	NC_022241	TAA	2	6	4573904	4573909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13116	NC_022241	GCA	2	6	4573917	4573922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13117	NC_022241	TGG	2	6	4573938	4573943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13118	NC_022241	TCA	2	6	4573950	4573955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13119	NC_022241	TAC	2	6	4574085	4574090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13120	NC_022241	GC	3	6	4574109	4574114	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13121	NC_022241	TGG	2	6	4574149	4574154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13122	NC_022241	AT	3	6	4574171	4574176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13123	NC_022241	TTG	2	6	4574199	4574204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13124	NC_022241	CCT	2	6	4574243	4574248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13125	NC_022241	GAA	2	6	4576154	4576159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13126	NC_022241	ATC	2	6	4576168	4576173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13127	NC_022241	AC	3	6	4576191	4576196	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13128	NC_022241	GAT	2	6	4576269	4576274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13129	NC_022241	GTTGA	2	10	4576301	4576310	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
13130	NC_022241	CGT	2	6	4576321	4576326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13131	NC_022241	T	7	7	4576533	4576539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13132	NC_022241	A	6	6	4576624	4576629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13133	NC_022241	ACG	2	6	4577289	4577294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13138	NC_022241	A	6	6	4577481	4577486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13139	NC_022241	T	6	6	4577568	4577573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13144	NC_022241	AG	3	6	4579875	4579880	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13145	NC_022241	GTT	2	6	4579917	4579922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13255	NC_022241	GTA	2	6	4621647	4621652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13256	NC_022241	AT	3	6	4621712	4621717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13257	NC_022241	CTCCCG	2	12	4621725	4621736	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
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13259	NC_022241	GGC	2	6	4621852	4621857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13260	NC_022241	ACC	2	6	4621860	4621865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13261	NC_022241	AT	3	6	4621891	4621896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13262	NC_022241	AG	3	6	4621924	4621929	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13263	NC_022241	A	6	6	4621980	4621985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13267	NC_022241	TAA	2	6	4622108	4622113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13376	NC_022241	T	8	8	4663570	4663577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13377	NC_022241	T	7	7	4663590	4663596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13378	NC_022241	ATT	2	6	4663614	4663619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13379	NC_022241	ATTTT	2	10	4663641	4663650	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13380	NC_022241	TAA	2	6	4663659	4663664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13381	NC_022241	GC	4	8	4667714	4667721	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13382	NC_022241	CCA	2	6	4669454	4669459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13384	NC_022241	AGT	2	6	4671367	4671372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13385	NC_022241	TCCG	2	8	4671432	4671439	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13386	NC_022241	TCA	2	6	4671444	4671449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13387	NC_022241	A	6	6	4671489	4671494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13388	NC_022241	GCCA	2	8	4671614	4671621	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13389	NC_022241	GTT	2	6	4671700	4671705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13390	NC_022241	TTA	2	6	4671735	4671740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13391	NC_022241	CTG	2	6	4671742	4671747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13392	NC_022241	T	6	6	4671749	4671754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13393	NC_022241	T	6	6	4671771	4671776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13394	NC_022241	TTA	2	6	4671792	4671797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13395	NC_022241	CTGC	2	8	4671826	4671833	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13396	NC_022241	C	7	7	4671833	4671839	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13397	NC_022241	TCA	2	6	4671879	4671884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13398	NC_022241	AAAGT	2	10	4672022	4672031	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13399	NC_022241	CCTG	2	8	4672770	4672777	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13400	NC_022241	TTG	2	6	4673351	4673356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13401	NC_022241	ATAAA	2	10	4673392	4673401	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13402	NC_022241	ATATT	2	10	4673402	4673411	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13403	NC_022241	CTT	2	6	4673426	4673431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13421	NC_022241	GGA	2	6	4674638	4674643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13422	NC_022241	GA	3	6	4674651	4674656	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13423	NC_022241	GGCG	2	8	4674672	4674679	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13424	NC_022241	CGC	2	6	4674699	4674704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13430	NC_022241	CAA	2	6	4676180	4676185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13440	NC_022241	TAAA	2	8	4676480	4676487	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13442	NC_022241	AT	3	6	4677438	4677443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13443	NC_022241	CAG	2	6	4677447	4677452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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