MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 complete genome

Total Repeats: 13443

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_022241	A	8	8	4056100	4056107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11502	NC_022241	A	6	6	4056135	4056140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11503	NC_022241	GCC	2	6	4056231	4056236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11504	NC_022241	CAGT	2	8	4056238	4056245	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11505	NC_022241	T	6	6	4056260	4056265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11506	NC_022241	GCG	2	6	4056317	4056322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11507	NC_022241	GTC	2	6	4056980	4056985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11508	NC_022241	GTCA	2	8	4056989	4056996	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11509	NC_022241	A	6	6	4057455	4057460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11510	NC_022241	GGC	2	6	4057461	4057466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11511	NC_022241	T	7	7	4057483	4057489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11512	NC_022241	TGCT	2	8	4057493	4057500	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11513	NC_022241	GCC	2	6	4058198	4058203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11514	NC_022241	GCGCT	2	10	4059652	4059661	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11515	NC_022241	CA	3	6	4059752	4059757	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11516	NC_022241	CGG	2	6	4059761	4059766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11517	NC_022241	TAA	2	6	4059818	4059823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11518	NC_022241	C	6	6	4059844	4059849	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11519	NC_022241	AGC	2	6	4059901	4059906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11520	NC_022241	ATT	2	6	4059919	4059924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11521	NC_022241	CAG	2	6	4062418	4062423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11522	NC_022241	TAC	2	6	4062467	4062472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11523	NC_022241	TTG	2	6	4062494	4062499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11524	NC_022241	A	6	6	4062506	4062511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11525	NC_022241	GCT	3	9	4062573	4062581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11526	NC_022241	CTAT	2	8	4062616	4062623	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11527	NC_022241	GCC	2	6	4062646	4062651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11528	NC_022241	GCA	2	6	4062654	4062659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11529	NC_022241	TCG	2	6	4062669	4062674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11530	NC_022241	GGTC	2	8	4064126	4064133	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11531	NC_022241	CTG	2	6	4064158	4064163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11532	NC_022241	CAC	2	6	4064259	4064264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11533	NC_022241	CAC	2	6	4064310	4064315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11534	NC_022241	GGA	2	6	4064395	4064400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11535	NC_022241	CAT	2	6	4064502	4064507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11536	NC_022241	GCT	2	6	4064547	4064552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11537	NC_022241	CG	3	6	4064574	4064579	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11538	NC_022241	CGG	2	6	4066341	4066346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11539	NC_022241	TGCG	2	8	4071005	4071012	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11540	NC_022241	ATGA	2	8	4072039	4072046	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11541	NC_022241	AAC	2	6	4072055	4072060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11542	NC_022241	AAT	2	6	4072095	4072100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11543	NC_022241	GGAT	2	8	4072837	4072844	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11544	NC_022241	CGT	2	6	4072856	4072861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11545	NC_022241	TTG	2	6	4074323	4074328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11546	NC_022241	TGTA	3	12	4088527	4088538	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11547	NC_022241	GTG	2	6	4088571	4088576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11548	NC_022241	GAT	3	9	4088586	4088594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11549	NC_022241	A	6	6	4088612	4088617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11550	NC_022241	ATG	3	9	4088661	4088669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11551	NC_022241	ATT	2	6	4088691	4088696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11552	NC_022241	GTC	2	6	4091840	4091845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11553	NC_022241	GTT	2	6	4094969	4094974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11554	NC_022241	TCC	2	6	4095023	4095028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11555	NC_022241	GAG	2	6	4095035	4095040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11556	NC_022241	GT	5	10	4095065	4095074	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11557	NC_022241	AAAG	2	8	4095088	4095095	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11558	NC_022241	GAA	2	6	4095113	4095118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11559	NC_022241	CT	3	6	4095159	4095164	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11560	NC_022241	C	6	6	4095186	4095191	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11561	NC_022241	TGA	2	6	4095196	4095201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11562	NC_022241	AT	4	8	4095958	4095965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11563	NC_022241	CT	3	6	4095983	4095988	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11564	NC_022241	CGAA	2	8	4096099	4096106	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11565	NC_022241	A	6	6	4096105	4096110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11566	NC_022241	ATA	2	6	4097246	4097251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11567	NC_022241	A	8	8	4097281	4097288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11568	NC_022241	A	6	6	4097312	4097317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11569	NC_022241	TATCAA	2	12	4097349	4097360	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11570	NC_022241	AG	3	6	4098662	4098667	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11571	NC_022241	TTA	2	6	4098668	4098673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11572	NC_022241	GGC	2	6	4098801	4098806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11573	NC_022241	TCA	2	6	4098814	4098819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11574	NC_022241	CGAA	2	8	4099854	4099861	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11575	NC_022241	TCGT	2	8	4099909	4099916	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11576	NC_022241	GGC	2	6	4100499	4100504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11577	NC_022241	A	6	6	4100527	4100532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11578	NC_022241	A	7	7	4102049	4102055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11579	NC_022241	AGCGC	2	10	4103045	4103054	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11580	NC_022241	CTT	2	6	4105867	4105872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11581	NC_022241	A	6	6	4105893	4105898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11582	NC_022241	ACCT	2	8	4105909	4105916	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11583	NC_022241	CAA	2	6	4105948	4105953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11584	NC_022241	CTA	2	6	4105986	4105991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11585	NC_022241	GTC	2	6	4106007	4106012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11586	NC_022241	A	7	7	4106044	4106050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11587	NC_022241	GC	3	6	4106061	4106066	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11588	NC_022241	AGG	2	6	4106131	4106136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11589	NC_022241	TGC	2	6	4107127	4107132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11590	NC_022241	A	6	6	4107158	4107163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11591	NC_022241	T	7	7	4107166	4107172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11592	NC_022241	TGA	2	6	4107175	4107180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11593	NC_022241	GCA	2	6	4107181	4107186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11594	NC_022241	A	6	6	4109164	4109169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11595	NC_022241	TCA	2	6	4109239	4109244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11596	NC_022241	CAA	2	6	4109270	4109275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11597	NC_022241	ATT	2	6	4109354	4109359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11598	NC_022241	GTT	2	6	4109362	4109367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11599	NC_022241	AT	3	6	4109389	4109394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11600	NC_022241	AAATAT	2	12	4109419	4109430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11601	NC_022241	GTT	2	6	4109451	4109456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11602	NC_022241	TTTTA	2	10	4109471	4109480	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11603	NC_022241	TTTTAA	2	12	4109615	4109626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11604	NC_022241	TAT	2	6	4110330	4110335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11605	NC_022241	T	8	8	4110371	4110378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11606	NC_022241	TGA	2	6	4110385	4110390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11607	NC_022241	ATT	2	6	4110401	4110406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11608	NC_022241	TAA	2	6	4113307	4113312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11609	NC_022241	CTT	2	6	4113349	4113354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11610	NC_022241	AAAG	2	8	4113387	4113394	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11611	NC_022241	TCA	2	6	4113435	4113440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11612	NC_022241	A	6	6	4113465	4113470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11613	NC_022241	T	7	7	4113474	4113480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11614	NC_022241	TTAA	2	8	4113547	4113554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11615	NC_022241	AAT	2	6	4113603	4113608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11616	NC_022241	GAT	2	6	4113612	4113617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11617	NC_022241	TTGCA	2	10	4114241	4114250	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11618	NC_022241	TGA	2	6	4114269	4114274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11619	NC_022241	T	7	7	4114280	4114286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11620	NC_022241	AGC	2	6	4114301	4114306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11621	NC_022241	AGGA	2	8	4115000	4115007	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11622	NC_022241	ATTA	2	8	4115497	4115504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11623	NC_022241	TCA	2	6	4117876	4117881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11624	NC_022241	GTT	2	6	4117906	4117911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11625	NC_022241	TC	3	6	4117954	4117959	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11626	NC_022241	ATG	2	6	4118543	4118548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11627	NC_022241	T	8	8	4118555	4118562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11628	NC_022241	TTA	2	6	4118583	4118588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11629	NC_022241	TAC	2	6	4118614	4118619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11630	NC_022241	AGA	2	6	4118624	4118629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11631	NC_022241	GCCAG	2	10	4119565	4119574	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11632	NC_022241	CCTGA	2	10	4119604	4119613	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11633	NC_022241	CAG	2	6	4119621	4119626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11634	NC_022241	GC	3	6	4120702	4120707	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11635	NC_022241	GCC	2	6	4120771	4120776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11637	NC_022241	TCA	2	6	4120866	4120871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11638	NC_022241	CAACA	2	10	4120872	4120881	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
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11652	NC_022241	TTATT	2	10	4129671	4129680	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11672	NC_022241	CAG	2	6	4144296	4144301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11707	NC_022241	A	6	6	4156482	4156487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11753	NC_022241	GA	3	6	4169884	4169889	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11754	NC_022241	A	6	6	4169902	4169907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11755	NC_022241	TGA	2	6	4169953	4169958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11756	NC_022241	CCTGG	2	10	4169973	4169982	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11757	NC_022241	TGT	2	6	4170040	4170045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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