MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 complete genome

Total Repeats: 13443

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_022241	CAA	2	6	3475010	3475015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10002	NC_022241	TTCAA	2	10	3475037	3475046	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10003	NC_022241	CAA	2	6	3475081	3475086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10004	NC_022241	GCC	2	6	3475106	3475111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10005	NC_022241	CGT	2	6	3475135	3475140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10006	NC_022241	AAC	2	6	3475166	3475171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10007	NC_022241	TGT	2	6	3475180	3475185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_022241	AGT	2	6	3475241	3475246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_022241	GAA	2	6	3475277	3475282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_022241	GCC	2	6	3475295	3475300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10011	NC_022241	TTC	2	6	3475391	3475396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10012	NC_022241	GCA	2	6	3475411	3475416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10013	NC_022241	CAG	2	6	3475451	3475456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10014	NC_022241	CTT	2	6	3475522	3475527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10015	NC_022241	TGA	2	6	3475537	3475542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_022241	AAC	2	6	3475565	3475570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10017	NC_022241	GCA	2	6	3475609	3475614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10018	NC_022241	AGCC	2	8	3475666	3475673	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10019	NC_022241	GAT	2	6	3475679	3475684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_022241	ACGA	2	8	3475733	3475740	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10021	NC_022241	GTC	2	6	3475748	3475753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10022	NC_022241	CAG	2	6	3475775	3475780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10023	NC_022241	CAG	2	6	3475808	3475813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10024	NC_022241	TCA	2	6	3475821	3475826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10025	NC_022241	GAT	2	6	3475853	3475858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_022241	GAC	2	6	3475876	3475881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10027	NC_022241	CAG	2	6	3475883	3475888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10028	NC_022241	GCA	2	6	3475926	3475931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10029	NC_022241	AGC	2	6	3475958	3475963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10030	NC_022241	TTC	2	6	3476081	3476086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10031	NC_022241	AGC	2	6	3476117	3476122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10032	NC_022241	CCG	2	6	3476124	3476129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10033	NC_022241	GGT	2	6	3476147	3476152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_022241	GA	3	6	3476284	3476289	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_022241	AGTTA	2	10	3478465	3478474	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_022241	GTT	2	6	3479013	3479018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_022241	AGTTT	2	10	3479045	3479054	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_022241	CTTA	2	8	3479078	3479085	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10039	NC_022241	TAA	2	6	3479511	3479516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_022241	CA	3	6	3479525	3479530	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10041	NC_022241	A	8	8	3481358	3481365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10042	NC_022241	ATT	2	6	3481410	3481415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10043	NC_022241	GAT	2	6	3481422	3481427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_022241	CAAAT	2	10	3481555	3481564	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10045	NC_022241	AT	3	6	3481576	3481581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_022241	A	8	8	3481593	3481600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_022241	CCG	2	6	3481601	3481606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10048	NC_022241	GCG	2	6	3481616	3481621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10049	NC_022241	AAG	2	6	3482497	3482502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_022241	TAT	2	6	3482548	3482553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_022241	CTT	2	6	3482556	3482561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10052	NC_022241	CCG	2	6	3482639	3482644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10053	NC_022241	ACA	2	6	3482651	3482656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10054	NC_022241	A	7	7	3482894	3482900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_022241	T	7	7	3482916	3482922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_022241	GAT	2	6	3482929	3482934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_022241	ATA	2	6	3482949	3482954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_022241	GGC	2	6	3482980	3482985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10059	NC_022241	GAC	2	6	3483066	3483071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10060	NC_022241	GAA	2	6	3483686	3483691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10061	NC_022241	A	7	7	3483741	3483747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_022241	GTT	2	6	3486344	3486349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_022241	TTC	2	6	3486368	3486373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10064	NC_022241	CCG	2	6	3486426	3486431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10065	NC_022241	GA	3	6	3486444	3486449	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10066	NC_022241	GGC	2	6	3486470	3486475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10067	NC_022241	GTT	3	9	3486495	3486503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10068	NC_022241	GCG	2	6	3486527	3486532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10069	NC_022241	GC	3	6	3488592	3488597	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10070	NC_022241	CAA	2	6	3488619	3488624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10071	NC_022241	GC	4	8	3489292	3489299	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10072	NC_022241	CT	3	6	3489313	3489318	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10073	NC_022241	GAC	2	6	3489349	3489354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10074	NC_022241	ATT	2	6	3490700	3490705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_022241	CGC	2	6	3491674	3491679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10076	NC_022241	ACA	2	6	3492147	3492152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10077	NC_022241	AC	3	6	3492204	3492209	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10078	NC_022241	TTTG	2	8	3493076	3493083	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10079	NC_022241	ACC	2	6	3496443	3496448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10080	NC_022241	A	6	6	3496495	3496500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_022241	GGC	2	6	3497086	3497091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10082	NC_022241	AG	3	6	3498571	3498576	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10083	NC_022241	GCCAG	2	10	3498619	3498628	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10084	NC_022241	ACG	2	6	3498670	3498675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10085	NC_022241	ATG	2	6	3498696	3498701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10086	NC_022241	A	6	6	3498718	3498723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10087	NC_022241	TAA	2	6	3498745	3498750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10088	NC_022241	CCT	2	6	3500116	3500121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10089	NC_022241	GC	3	6	3502931	3502936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10090	NC_022241	GGC	2	6	3502942	3502947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10091	NC_022241	AGC	2	6	3503093	3503098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10092	NC_022241	ACG	2	6	3503156	3503161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10093	NC_022241	CG	3	6	3503160	3503165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10094	NC_022241	GTG	2	6	3503179	3503184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10095	NC_022241	ATT	2	6	3503199	3503204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10096	NC_022241	T	6	6	3503228	3503233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_022241	T	8	8	3503237	3503244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10098	NC_022241	CGG	2	6	3503284	3503289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10099	NC_022241	CAA	2	6	3503349	3503354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10100	NC_022241	CGCGAC	2	12	3504246	3504257	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10101	NC_022241	TCG	2	6	3504265	3504270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10102	NC_022241	CTG	2	6	3504306	3504311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10103	NC_022241	ACT	2	6	3505628	3505633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10104	NC_022241	ATT	2	6	3505645	3505650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_022241	TAA	2	6	3505708	3505713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10106	NC_022241	ATTC	2	8	3505754	3505761	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10107	NC_022241	AATA	2	8	3505766	3505773	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10108	NC_022241	TGACC	2	10	3505794	3505803	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10109	NC_022241	ATAAA	2	10	3505817	3505826	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10110	NC_022241	TCT	2	6	3505844	3505849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10111	NC_022241	TCA	2	6	3505857	3505862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10112	NC_022241	CT	3	6	3505875	3505880	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10113	NC_022241	ATTA	2	8	3505907	3505914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_022241	A	6	6	3505936	3505941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10115	NC_022241	CTATCG	2	12	3505949	3505960	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10116	NC_022241	TTA	2	6	3505977	3505982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_022241	CGC	2	6	3505995	3506000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10118	NC_022241	GAT	2	6	3506011	3506016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_022241	TCC	2	6	3506041	3506046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10120	NC_022241	GGC	2	6	3506128	3506133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10121	NC_022241	TGC	2	6	3506136	3506141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10122	NC_022241	C	7	7	3506207	3506213	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10123	NC_022241	GGC	2	6	3506227	3506232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10124	NC_022241	CGA	2	6	3506247	3506252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10125	NC_022241	GGC	2	6	3506254	3506259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10126	NC_022241	CGA	2	6	3506280	3506285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10127	NC_022241	GCG	2	6	3506321	3506326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10128	NC_022241	CGA	2	6	3506346	3506351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10129	NC_022241	GCG	2	6	3506354	3506359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10130	NC_022241	CGA	2	6	3506379	3506384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10131	NC_022241	GCG	2	6	3506387	3506392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10132	NC_022241	CCCG	2	8	3506406	3506413	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10133	NC_022241	GCG	2	6	3506421	3506426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10134	NC_022241	GCG	2	6	3506455	3506460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10135	NC_022241	CGA	2	6	3506480	3506485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10136	NC_022241	GCG	2	6	3506488	3506493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10165	NC_022241	GC	3	6	3507679	3507684	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10166	NC_022241	GCG	2	6	3507691	3507696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10237	NC_022241	CCA	2	6	3510499	3510504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10238	NC_022241	CGAC	2	8	3510589	3510596	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10239	NC_022241	CAA	2	6	3510641	3510646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10240	NC_022241	CCG	2	6	3510679	3510684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10243	NC_022241	GTG	2	6	3510819	3510824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10244	NC_022241	GCCA	2	8	3510906	3510913	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10245	NC_022241	GGC	2	6	3510990	3510995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10246	NC_022241	TGA	2	6	3511034	3511039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10247	NC_022241	AAC	2	6	3511053	3511058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10248	NC_022241	CAG	2	6	3511088	3511093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10249	NC_022241	CAA	2	6	3511118	3511123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10250	NC_022241	CAG	2	6	3511146	3511151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10251	NC_022241	ATG	2	6	3511191	3511196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10252	NC_022241	AGG	2	6	3511253	3511258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10253	NC_022241	AGCGC	2	10	3511267	3511276	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10254	NC_022241	CGG	2	6	3511315	3511320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10255	NC_022241	GGC	2	6	3511392	3511397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10256	NC_022241	GCG	2	6	3511446	3511451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10257	NC_022241	GGC	3	9	3511485	3511493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10258	NC_022241	AGC	2	6	3511527	3511532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10261	NC_022241	TA	3	6	3511640	3511645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10262	NC_022241	TTA	3	9	3511663	3511671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10269	NC_022241	GCAA	2	8	3512122	3512129	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10270	NC_022241	ACTA	2	8	3515420	3515427	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10271	NC_022241	TTG	2	6	3516965	3516970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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