MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 complete genome

Total Repeats: 13443

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_022241	GCA	2	6	2737659	2737664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8002	NC_022241	TTC	2	6	2737735	2737740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8003	NC_022241	GCC	2	6	2737978	2737983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8004	NC_022241	TCC	2	6	2737998	2738003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8005	NC_022241	C	6	6	2738042	2738047	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8006	NC_022241	TGCG	2	8	2738130	2738137	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8007	NC_022241	GCT	2	6	2738188	2738193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8008	NC_022241	CTT	2	6	2738213	2738218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8009	NC_022241	TGC	2	6	2738236	2738241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8010	NC_022241	TTA	2	6	2738244	2738249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_022241	TCC	2	6	2738262	2738267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8012	NC_022241	CTT	2	6	2738297	2738302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8013	NC_022241	CTG	2	6	2738356	2738361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8014	NC_022241	TCG	2	6	2738431	2738436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8015	NC_022241	AGT	2	6	2738556	2738561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_022241	AGC	2	6	2738622	2738627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8017	NC_022241	GCT	2	6	2738630	2738635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8018	NC_022241	GCC	2	6	2738670	2738675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8019	NC_022241	CA	3	6	2738824	2738829	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8020	NC_022241	CTT	2	6	2738951	2738956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8021	NC_022241	CGG	2	6	2738975	2738980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8022	NC_022241	GTT	2	6	2738991	2738996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_022241	GTG	2	6	2739005	2739010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_022241	TTA	2	6	2739026	2739031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_022241	CTC	2	6	2741744	2741749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8026	NC_022241	ATT	2	6	2741799	2741804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_022241	AAAG	2	8	2741831	2741838	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_022241	CTT	2	6	2743586	2743591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8029	NC_022241	CAA	2	6	2744457	2744462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8030	NC_022241	T	7	7	2744489	2744495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_022241	CTT	2	6	2744586	2744591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8032	NC_022241	AAT	2	6	2744636	2744641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_022241	CA	3	6	2744653	2744658	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8034	NC_022241	T	6	6	2745100	2745105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_022241	GTACT	2	10	2745130	2745139	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8036	NC_022241	TTC	2	6	2745180	2745185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8037	NC_022241	T	6	6	2745192	2745197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_022241	AAG	2	6	2745253	2745258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_022241	T	6	6	2745279	2745284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_022241	A	6	6	2745294	2745299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_022241	A	6	6	2747355	2747360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_022241	TCA	2	6	2747390	2747395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8043	NC_022241	AAC	2	6	2748518	2748523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8044	NC_022241	TCC	2	6	2749635	2749640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8045	NC_022241	TCG	2	6	2749720	2749725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8046	NC_022241	ACA	2	6	2749760	2749765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8047	NC_022241	ATT	2	6	2749921	2749926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_022241	AAT	2	6	2749962	2749967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_022241	ACAA	2	8	2749979	2749986	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8050	NC_022241	TGG	2	6	2750021	2750026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_022241	A	6	6	2751856	2751861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_022241	CTT	2	6	2751884	2751889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8053	NC_022241	TTA	2	6	2753103	2753108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_022241	GGT	2	6	2753119	2753124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_022241	ACC	2	6	2753678	2753683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8056	NC_022241	TG	3	6	2753951	2753956	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_022241	AAC	2	6	2753962	2753967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8058	NC_022241	TAA	2	6	2754052	2754057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_022241	CTG	2	6	2754060	2754065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8060	NC_022241	CGG	2	6	2754077	2754082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8061	NC_022241	GC	3	6	2754106	2754111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8062	NC_022241	TC	3	6	2755557	2755562	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8063	NC_022241	CGC	2	6	2755585	2755590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8064	NC_022241	TGT	2	6	2755639	2755644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_022241	CCA	3	9	2756544	2756552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8066	NC_022241	ATC	2	6	2756570	2756575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8067	NC_022241	T	6	6	2757842	2757847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_022241	AAT	2	6	2757898	2757903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_022241	T	7	7	2759182	2759188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_022241	TTA	2	6	2759212	2759217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_022241	TCA	2	6	2759259	2759264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8072	NC_022241	A	6	6	2760195	2760200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_022241	T	6	6	2761919	2761924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_022241	CAA	2	6	2761947	2761952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8075	NC_022241	TGA	2	6	2761989	2761994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_022241	TAT	2	6	2762001	2762006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8077	NC_022241	TGA	2	6	2762419	2762424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8078	NC_022241	TCA	2	6	2762433	2762438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8079	NC_022241	ATA	2	6	2763316	2763321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_022241	A	8	8	2763338	2763345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8081	NC_022241	AGAT	2	8	2763400	2763407	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8082	NC_022241	TCA	2	6	2763417	2763422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8083	NC_022241	T	6	6	2763964	2763969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_022241	CATG	2	8	2764012	2764019	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8085	NC_022241	AT	3	6	2764028	2764033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8086	NC_022241	AATA	2	8	2764061	2764068	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8087	NC_022241	CCACA	2	10	2764069	2764078	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
8088	NC_022241	AT	3	6	2764085	2764090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8089	NC_022241	A	6	6	2764100	2764105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8090	NC_022241	GTT	2	6	2764264	2764269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8091	NC_022241	T	7	7	2764357	2764363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8092	NC_022241	ATC	2	6	2764372	2764377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8093	NC_022241	A	6	6	2764403	2764408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_022241	A	6	6	2764454	2764459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_022241	A	6	6	2776053	2776058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8096	NC_022241	ACG	2	6	2776071	2776076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8097	NC_022241	CAA	2	6	2776084	2776089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8098	NC_022241	AAG	2	6	2780886	2780891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_022241	CTTAC	2	10	2780930	2780939	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8100	NC_022241	A	7	7	2781023	2781029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_022241	ACG	2	6	2781039	2781044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8102	NC_022241	AGC	2	6	2781058	2781063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8103	NC_022241	TAA	2	6	2781065	2781070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_022241	CT	3	6	2781084	2781089	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8105	NC_022241	AG	3	6	2781120	2781125	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_022241	CG	3	6	2781144	2781149	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8107	NC_022241	CCTG	2	8	2781155	2781162	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8108	NC_022241	GTCC	2	8	2781207	2781214	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8109	NC_022241	GACT	2	8	2781237	2781244	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8110	NC_022241	GTA	2	6	2781251	2781256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_022241	CCA	2	6	2781302	2781307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8112	NC_022241	ATG	2	6	2781309	2781314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_022241	T	6	6	2781370	2781375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_022241	ATT	2	6	2781416	2781421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8115	NC_022241	ACA	2	6	2781501	2781506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8116	NC_022241	GC	3	6	2781533	2781538	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8117	NC_022241	AGC	2	6	2781649	2781654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8118	NC_022241	CCA	2	6	2783263	2783268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8119	NC_022241	TTC	2	6	2783310	2783315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8120	NC_022241	AT	3	6	2784249	2784254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8121	NC_022241	AGC	2	6	2784419	2784424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8122	NC_022241	GC	3	6	2784423	2784428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8123	NC_022241	CCCCG	2	10	2784437	2784446	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
8124	NC_022241	T	6	6	2784610	2784615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8125	NC_022241	GCG	2	6	2785100	2785105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8126	NC_022241	CTG	2	6	2785165	2785170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8127	NC_022241	TC	3	6	2785195	2785200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8128	NC_022241	TGTT	2	8	2786330	2786337	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_022241	T	7	7	2786336	2786342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_022241	ACT	2	6	2786357	2786362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8131	NC_022241	GAAAA	2	10	2786370	2786379	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8132	NC_022241	ACT	2	6	2786443	2786448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8264	NC_022241	TTAA	2	8	2811000	2811007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8265	NC_022241	CA	3	6	2813250	2813255	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8266	NC_022241	TCT	2	6	2813294	2813299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8267	NC_022241	CTG	2	6	2816295	2816300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8390	NC_022241	GGC	2	6	2877530	2877535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8393	NC_022241	GCA	2	6	2882108	2882113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8396	NC_022241	GC	3	6	2884429	2884434	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8397	NC_022241	CT	3	6	2884805	2884810	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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