MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 complete genome

Total Repeats: 13443

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_022241	TGT	2	6	1741998	1742003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_022241	CGT	2	6	1742015	1742020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_022241	TTTTA	2	10	1742112	1742121	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_022241	TATAGT	2	12	1742124	1742135	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_022241	GA	3	6	1742165	1742170	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_022241	ATA	2	6	1742425	1742430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_022241	GCG	2	6	1743645	1743650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_022241	GTT	2	6	1743708	1743713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_022241	TGT	2	6	1743736	1743741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_022241	T	7	7	1743756	1743762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_022241	CG	3	6	1745336	1745341	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5012	NC_022241	CCA	2	6	1745356	1745361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5013	NC_022241	GAT	2	6	1745365	1745370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_022241	TAAG	2	8	1746181	1746188	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_022241	GCCT	2	8	1746974	1746981	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5016	NC_022241	CTC	2	6	1749686	1749691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5017	NC_022241	ACAA	2	8	1749748	1749755	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5018	NC_022241	AAC	2	6	1749772	1749777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_022241	ATAA	2	8	1749835	1749842	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_022241	ATA	2	6	1749907	1749912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_022241	TGC	2	6	1750010	1750015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_022241	TAA	2	6	1750020	1750025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_022241	TAA	2	6	1750034	1750039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_022241	ATT	2	6	1750067	1750072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_022241	GCT	2	6	1750112	1750117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_022241	GTG	2	6	1750134	1750139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_022241	ATC	2	6	1750176	1750181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_022241	ATC	2	6	1750428	1750433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_022241	TAAA	2	8	1750449	1750456	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_022241	AATC	2	8	1750503	1750510	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5031	NC_022241	GGC	2	6	1750614	1750619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_022241	TGCCA	2	10	1750626	1750635	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5033	NC_022241	ATA	2	6	1751777	1751782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_022241	AAT	2	6	1751799	1751804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_022241	GAGT	2	8	1751829	1751836	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_022241	ATGG	2	8	1751934	1751941	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_022241	TA	3	6	1751989	1751994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_022241	A	6	6	1751994	1751999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_022241	GAC	2	6	1752031	1752036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_022241	TTC	2	6	1754665	1754670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_022241	CGA	2	6	1754707	1754712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_022241	AT	3	6	1754720	1754725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_022241	TCTGCG	2	12	1754730	1754741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_022241	T	6	6	1754807	1754812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_022241	CA	3	6	1754814	1754819	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5046	NC_022241	ACG	2	6	1754831	1754836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_022241	TTA	2	6	1754920	1754925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_022241	CTCA	2	8	1756242	1756249	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5049	NC_022241	CGC	2	6	1756268	1756273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5050	NC_022241	TGCGT	2	10	1756283	1756292	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5051	NC_022241	CAG	2	6	1756305	1756310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_022241	CCA	2	6	1756328	1756333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5053	NC_022241	ACA	2	6	1756373	1756378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_022241	ACA	2	6	1756427	1756432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_022241	AGTC	2	8	1756441	1756448	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5056	NC_022241	TC	3	6	1756447	1756452	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5057	NC_022241	GAA	2	6	1756474	1756479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_022241	A	8	8	1756530	1756537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_022241	CAC	2	6	1756600	1756605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5060	NC_022241	GAG	2	6	1756612	1756617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_022241	GCC	2	6	1757997	1758002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5062	NC_022241	TGA	2	6	1758025	1758030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_022241	CTTC	2	8	1758938	1758945	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5064	NC_022241	GTA	2	6	1759013	1759018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_022241	GGC	2	6	1760532	1760537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_022241	CAT	2	6	1760566	1760571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_022241	ATT	2	6	1760608	1760613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_022241	TGG	2	6	1760692	1760697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_022241	GCGG	2	8	1760712	1760719	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5070	NC_022241	T	8	8	1760774	1760781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_022241	AAT	2	6	1760788	1760793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_022241	A	6	6	1765326	1765331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_022241	GGC	2	6	1767358	1767363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5074	NC_022241	CAT	2	6	1767408	1767413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_022241	CAA	2	6	1767547	1767552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_022241	TTA	2	6	1767595	1767600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_022241	AT	3	6	1767655	1767660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_022241	T	6	6	1767674	1767679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_022241	T	6	6	1767778	1767783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_022241	AGCA	2	8	1767785	1767792	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5081	NC_022241	TGTAA	2	10	1768000	1768009	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_022241	TCT	2	6	1768044	1768049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_022241	TAT	2	6	1768622	1768627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_022241	AGA	2	6	1769064	1769069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_022241	A	6	6	1769158	1769163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_022241	ATA	2	6	1769167	1769172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_022241	AGG	2	6	1769176	1769181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_022241	GT	3	6	1770084	1770089	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_022241	T	6	6	1770097	1770102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_022241	T	6	6	1770122	1770127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_022241	TGA	2	6	1770815	1770820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_022241	TAA	2	6	1770838	1770843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_022241	GGCT	2	8	1771004	1771011	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5094	NC_022241	T	6	6	1771105	1771110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_022241	TGA	2	6	1772334	1772339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_022241	ATC	2	6	1772906	1772911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_022241	TTC	2	6	1772939	1772944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_022241	CA	3	6	1772995	1773000	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5099	NC_022241	TAG	2	6	1773008	1773013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_022241	T	6	6	1773028	1773033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_022241	CGC	2	6	1773467	1773472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5102	NC_022241	CAG	2	6	1773473	1773478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_022241	GGC	2	6	1773498	1773503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_022241	GAT	2	6	1774332	1774337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_022241	CA	3	6	1774353	1774358	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5106	NC_022241	CTA	2	6	1774958	1774963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5107	NC_022241	AAC	2	6	1775082	1775087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_022241	AAG	2	6	1777837	1777842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_022241	A	6	6	1781810	1781815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_022241	TGG	2	6	1783563	1783568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_022241	TTTA	2	8	1783608	1783615	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_022241	TTCG	2	8	1783625	1783632	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5113	NC_022241	TCG	2	6	1783641	1783646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_022241	ACG	2	6	1783656	1783661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_022241	CAA	2	6	1783716	1783721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_022241	TCT	2	6	1783729	1783734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5117	NC_022241	TAA	2	6	1784007	1784012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_022241	AAT	2	6	1784019	1784024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_022241	TCA	2	6	1784028	1784033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_022241	AATAA	2	10	1784053	1784062	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_022241	ATA	2	6	1784098	1784103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_022241	TAA	2	6	1784111	1784116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_022241	AAAT	2	8	1784117	1784124	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_022241	T	6	6	1784145	1784150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_022241	AAG	2	6	1784181	1784186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_022241	GGC	2	6	1784208	1784213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5127	NC_022241	GCC	2	6	1784224	1784229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5128	NC_022241	CAG	2	6	1784237	1784242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5129	NC_022241	TGA	2	6	1784802	1784807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_022241	AAT	2	6	1784815	1784820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_022241	AGA	2	6	1784957	1784962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_022241	TTAT	2	8	1785024	1785031	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_022241	CACT	2	8	1785052	1785059	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5249	NC_022241	AATG	2	8	1825313	1825320	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5250	NC_022241	A	6	6	1825324	1825329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5257	NC_022241	GTA	2	6	1826829	1826834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5259	NC_022241	GCG	2	6	1826878	1826883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5261	NC_022241	TTCTT	2	10	1827150	1827159	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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5265	NC_022241	ATC	2	6	1828497	1828502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5362	NC_022241	TC	3	6	1859293	1859298	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5382	NC_022241	T	7	7	1872489	1872495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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