MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus CN1

Total Repeats: 10977

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022226	AT	3	6	316228	316233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_022226	ATA	2	6	316284	316289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_022226	TAA	2	6	316429	316434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_022226	ATTT	2	8	316496	316503	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_022226	GTAA	2	8	316556	316563	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_022226	AT	3	6	316587	316592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_022226	GAT	2	6	316601	316606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_022226	AT	3	6	316640	316645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_022226	AT	3	6	316702	316707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_022226	TTA	3	9	316710	316718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_022226	AT	3	6	317743	317748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_022226	AACC	2	8	317768	317775	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1013	NC_022226	AGA	2	6	317796	317801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_022226	ATT	2	6	317816	317821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_022226	CAT	2	6	317860	317865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_022226	TAAT	2	8	317885	317892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_022226	T	6	6	317975	317980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_022226	A	7	7	317993	317999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_022226	TA	3	6	318011	318016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_022226	T	6	6	318028	318033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_022226	TAAA	2	8	318067	318074	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_022226	TA	3	6	318075	318080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_022226	TAT	2	6	318140	318145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_022226	AAG	2	6	318203	318208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_022226	TAAT	2	8	318221	318228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_022226	CTTT	2	8	318747	318754	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1027	NC_022226	A	6	6	318774	318779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_022226	AAT	2	6	318798	318803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_022226	TA	4	8	318837	318844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_022226	ATA	3	9	318868	318876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_022226	TAAA	2	8	319326	319333	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_022226	CT	3	6	319337	319342	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1033	NC_022226	AG	3	6	319376	319381	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_022226	A	7	7	319436	319442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_022226	AAT	2	6	320388	320393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_022226	AATT	2	8	320401	320408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1039	NC_022226	TAAT	2	8	320469	320476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_022226	AGAC	2	8	320477	320484	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1041	NC_022226	A	6	6	320515	320520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_022226	AAGT	2	8	322063	322070	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_022226	TGAG	2	8	322113	322120	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1045	NC_022226	TTA	2	6	322266	322271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_022226	TC	4	8	322288	322295	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1047	NC_022226	ATA	2	6	322363	322368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_022226	TAAA	2	8	322398	322405	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_022226	TTA	2	6	325337	325342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_022226	CAT	2	6	325351	325356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_022226	TAT	2	6	325380	325385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_022226	TAA	3	9	325409	325417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_022226	TTA	2	6	325418	325423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_022226	ATA	2	6	325451	325456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_022226	T	6	6	325457	325462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_022226	GTA	2	6	325463	325468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_022226	CAT	3	9	326574	326582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_022226	T	7	7	326653	326659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_022226	ACTT	2	8	326764	326771	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1060	NC_022226	ACA	2	6	326835	326840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_022226	TGA	2	6	328934	328939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_022226	TAAAT	2	10	330179	330188	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_022226	CAT	2	6	330232	330237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_022226	ATA	2	6	332748	332753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_022226	AAG	2	6	333747	333752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_022226	GA	3	6	333786	333791	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_022226	TGT	2	6	333799	333804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_022226	CA	3	6	333811	333816	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1069	NC_022226	CAAC	2	8	333850	333857	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1070	NC_022226	AAATT	2	10	333872	333881	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_022226	GAA	2	6	333882	333887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_022226	A	7	7	333916	333922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_022226	A	6	6	333940	333945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_022226	GAT	2	6	333974	333979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_022226	TAC	2	6	334008	334013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_022226	TAT	2	6	334846	334851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_022226	AT	3	6	334850	334855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_022226	AT	3	6	334906	334911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_022226	A	6	6	334930	334935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_022226	A	7	7	335637	335643	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_022226	CAT	2	6	335653	335658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1083	NC_022226	TGTT	2	8	335719	335726	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_022226	ATTTT	2	10	335737	335746	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_022226	ATT	2	6	337187	337192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_022226	TA	4	8	337218	337225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_022226	TAA	2	6	337244	337249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_022226	TGT	3	9	337265	337273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1091	NC_022226	TTA	2	6	337372	337377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_022226	A	6	6	337395	337400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_022226	AT	3	6	337403	337408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_022226	GTT	2	6	337431	337436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_022226	A	7	7	337458	337464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1101	NC_022226	ATG	2	6	339764	339769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_022226	T	6	6	339780	339785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_022226	GAAT	2	8	341948	341955	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_022226	ATG	2	6	341961	341966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_022226	ATAGA	2	10	341977	341986	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_022226	TGACA	2	10	342169	342178	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1107	NC_022226	AGA	2	6	343213	343218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_022226	CAT	2	6	346425	346430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_022226	TTA	2	6	346448	346453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_022226	TTCATT	2	12	346502	346513	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1111	NC_022226	TA	3	6	346514	346519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_022226	CTA	2	6	346538	346543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_022226	TA	3	6	346553	346558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_022226	TAAG	2	8	347661	347668	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_022226	TA	3	6	347719	347724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_022226	GGT	2	6	349085	349090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_022226	CCT	2	6	349092	349097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1118	NC_022226	ATT	2	6	352495	352500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_022226	TCGG	2	8	353911	353918	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1120	NC_022226	A	7	7	353933	353939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_022226	AT	3	6	353943	353948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_022226	A	6	6	353961	353966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_022226	AT	3	6	354459	354464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_022226	GATAA	2	10	354473	354482	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_022226	T	6	6	354496	354501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_022226	TCC	2	6	355870	355875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1127	NC_022226	A	6	6	355998	356003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_022226	ATT	2	6	356036	356041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_022226	TAATAT	2	12	360219	360230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_022226	TTA	3	9	360232	360240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_022226	ATGA	2	8	360267	360274	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_022226	TGA	2	6	360854	360859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_022226	TTTA	2	8	360881	360888	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_022226	GTT	2	6	360906	360911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_022226	ATT	2	6	360918	360923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_022226	ATT	2	6	360949	360954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_022226	GAT	2	6	360963	360968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1139	NC_022226	TAT	2	6	361012	361017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1416	NC_022226	AGT	2	6	416214	416219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1417	NC_022226	T	6	6	416226	416231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1418	NC_022226	TAC	2	6	416241	416246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1420	NC_022226	TATT	2	8	416338	416345	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1424	NC_022226	GTT	2	6	416520	416525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1425	NC_022226	CATA	2	8	416545	416552	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1426	NC_022226	CCTA	2	8	416792	416799	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1429	NC_022226	AT	3	6	417345	417350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1430	NC_022226	ATA	2	6	417379	417384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1431	NC_022226	AT	3	6	417453	417458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1432	NC_022226	TAA	2	6	417462	417467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1433	NC_022226	ATA	2	6	417475	417480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1434	NC_022226	ATA	2	6	417492	417497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1438	NC_022226	AT	3	6	417604	417609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1439	NC_022226	TTC	2	6	417649	417654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1441	NC_022226	AAT	2	6	417711	417716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1449	NC_022226	ATT	2	6	419157	419162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1450	NC_022226	TAC	2	6	419235	419240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1451	NC_022226	ATG	2	6	419247	419252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1452	NC_022226	TAAAA	2	10	419284	419293	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1453	NC_022226	A	6	6	419317	419322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1454	NC_022226	TAA	2	6	419347	419352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1461	NC_022226	CA	3	6	420301	420306	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1477	NC_022226	ATG	2	6	422623	422628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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