MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus CN1

Total Repeats: 10977

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_022226	AAAT	2	8	2615709	2615716	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10502	NC_022226	CAT	2	6	2615772	2615777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10503	NC_022226	ATA	2	6	2615801	2615806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10504	NC_022226	ATAAAA	2	12	2615838	2615849	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10505	NC_022226	CTA	2	6	2615877	2615882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10506	NC_022226	TAT	2	6	2617976	2617981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10507	NC_022226	GAAAG	2	10	2618009	2618018	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
10508	NC_022226	AAG	3	9	2618016	2618024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10509	NC_022226	ACC	2	6	2618927	2618932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10510	NC_022226	ACT	2	6	2619738	2619743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10511	NC_022226	ATA	2	6	2619804	2619809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10512	NC_022226	ATT	3	9	2619819	2619827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10513	NC_022226	TGCT	2	8	2619854	2619861	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10514	NC_022226	A	7	7	2619862	2619868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10515	NC_022226	AT	3	6	2619923	2619928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10516	NC_022226	TAAT	2	8	2619932	2619939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10517	NC_022226	CCTAA	2	10	2620923	2620932	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
10518	NC_022226	ATTT	2	8	2620937	2620944	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10519	NC_022226	ATTTT	2	10	2620994	2621003	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10520	NC_022226	AATA	2	8	2621077	2621084	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10521	NC_022226	T	7	7	2621194	2621200	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10522	NC_022226	TA	3	6	2621240	2621245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10523	NC_022226	CCT	2	6	2621247	2621252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10524	NC_022226	TCA	2	6	2621269	2621274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10525	NC_022226	A	6	6	2621299	2621304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10526	NC_022226	A	6	6	2621390	2621395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10527	NC_022226	A	6	6	2621441	2621446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10528	NC_022226	GTT	2	6	2621490	2621495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10529	NC_022226	ATT	2	6	2621525	2621530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10530	NC_022226	A	6	6	2621552	2621557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10531	NC_022226	A	7	7	2623053	2623059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10532	NC_022226	T	6	6	2623098	2623103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10533	NC_022226	CT	3	6	2624511	2624516	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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10535	NC_022226	AT	3	6	2624612	2624617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10536	NC_022226	TTAA	2	8	2625144	2625151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10537	NC_022226	ATT	2	6	2625159	2625164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10538	NC_022226	T	6	6	2626168	2626173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10539	NC_022226	ACT	2	6	2626181	2626186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10540	NC_022226	T	6	6	2626231	2626236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10541	NC_022226	GTAT	2	8	2626256	2626263	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10542	NC_022226	A	7	7	2626274	2626280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10543	NC_022226	ATC	2	6	2627873	2627878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10544	NC_022226	TAGT	2	8	2627973	2627980	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10545	NC_022226	AGCA	2	8	2628000	2628007	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10546	NC_022226	GTAAAT	2	12	2628011	2628022	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10547	NC_022226	ATT	2	6	2628027	2628032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10548	NC_022226	AT	3	6	2628046	2628051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10549	NC_022226	AGA	2	6	2628068	2628073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10550	NC_022226	ATCAA	2	10	2628079	2628088	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10551	NC_022226	ATT	2	6	2628094	2628099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10552	NC_022226	ACA	2	6	2628102	2628107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10554	NC_022226	TGA	2	6	2630157	2630162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10555	NC_022226	TA	4	8	2630186	2630193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10556	NC_022226	ACACT	2	10	2630252	2630261	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
10557	NC_022226	TTTTA	2	10	2631011	2631020	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10558	NC_022226	TC	3	6	2631262	2631267	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10559	NC_022226	TA	3	6	2631276	2631281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10560	NC_022226	ATC	2	6	2631383	2631388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10561	NC_022226	CA	3	6	2631426	2631431	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10562	NC_022226	AAC	2	6	2631441	2631446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10563	NC_022226	A	7	7	2631475	2631481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10564	NC_022226	CAATA	2	10	2631491	2631500	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10565	NC_022226	CTA	2	6	2631518	2631523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10566	NC_022226	TA	3	6	2631522	2631527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10567	NC_022226	ACAAA	2	10	2633446	2633455	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
10568	NC_022226	TTTA	2	8	2635021	2635028	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10569	NC_022226	AAC	2	6	2635083	2635088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10570	NC_022226	TTTA	2	8	2635121	2635128	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10571	NC_022226	T	7	7	2635170	2635176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10572	NC_022226	TATT	2	8	2635201	2635208	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10573	NC_022226	AAC	2	6	2635818	2635823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10574	NC_022226	ATG	2	6	2635828	2635833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10575	NC_022226	AATA	2	8	2635892	2635899	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10576	NC_022226	CAAT	2	8	2635926	2635933	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10577	NC_022226	TA	3	6	2635934	2635939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10578	NC_022226	ATT	2	6	2635964	2635969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10579	NC_022226	ATT	2	6	2637614	2637619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10580	NC_022226	TAA	2	6	2637656	2637661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10581	NC_022226	TAAC	2	8	2637687	2637694	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10582	NC_022226	TAA	3	9	2637698	2637706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10583	NC_022226	CTTC	2	8	2637913	2637920	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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10585	NC_022226	T	6	6	2637950	2637955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10586	NC_022226	A	6	6	2637956	2637961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10589	NC_022226	ACCTA	2	10	2638062	2638071	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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10593	NC_022226	TA	4	8	2640550	2640557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10594	NC_022226	TTA	2	6	2640572	2640577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10595	NC_022226	TTA	2	6	2640603	2640608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10598	NC_022226	TAT	2	6	2640702	2640707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10600	NC_022226	TAAT	2	8	2642181	2642188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10601	NC_022226	T	6	6	2642193	2642198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10602	NC_022226	A	7	7	2642223	2642229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10603	NC_022226	T	6	6	2642232	2642237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10604	NC_022226	TCCTG	2	10	2642304	2642313	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10605	NC_022226	TAT	2	6	2642338	2642343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10607	NC_022226	TTA	2	6	2642426	2642431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10609	NC_022226	AAG	2	6	2642572	2642577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10610	NC_022226	TAT	3	9	2642606	2642614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10611	NC_022226	CAT	2	6	2643245	2643250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10614	NC_022226	T	6	6	2645224	2645229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10615	NC_022226	AAAC	2	8	2645250	2645257	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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10619	NC_022226	ATTT	2	8	2645399	2645406	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10624	NC_022226	CATA	2	8	2646392	2646399	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10625	NC_022226	TTA	2	6	2646501	2646506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10627	NC_022226	TTA	2	6	2646521	2646526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10628	NC_022226	AC	3	6	2646559	2646564	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10629	NC_022226	CGA	2	6	2646582	2646587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10630	NC_022226	ATT	2	6	2646598	2646603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10632	NC_022226	AAT	2	6	2646663	2646668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10633	NC_022226	ATT	2	6	2646670	2646675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10634	NC_022226	ATT	2	6	2646678	2646683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10635	NC_022226	TA	3	6	2646704	2646709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10640	NC_022226	AT	3	6	2647079	2647084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10762	NC_022226	AT	3	6	2699612	2699617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.