MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus CN1

Total Repeats: 10977

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022226	ATT	2	6	125	130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022226	CACT	2	8	149	156	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_022226	AC	3	6	234	239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_022226	TG	3	6	307	312	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022226	GTC	2	6	318	323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_022226	ATTT	2	8	344	351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022226	TAA	2	6	384	389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022226	TTA	2	6	415	420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022226	ATT	2	6	432	437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022226	GT	3	6	444	449	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022226	AAGA	2	8	497	504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022226	TA	3	6	1907	1912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022226	TAA	3	9	1920	1928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022226	T	6	6	1935	1940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022226	TA	3	6	1948	1953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022226	AC	3	6	2007	2012	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_022226	CCA	2	6	2071	2076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_022226	CTA	3	9	2088	2096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_022226	TA	3	6	2116	2121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022226	TA	4	8	2124	2131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022226	TAAATA	2	12	3299	3310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022226	ATTA	2	8	3323	3330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022226	T	6	6	3346	3351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022226	AAT	2	6	3358	3363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022226	AAAT	2	8	3380	3387	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022226	TAA	2	6	3453	3458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022226	TTTAAA	2	12	3475	3486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022226	A	6	6	3543	3548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022226	A	6	6	3569	3574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022226	AATT	2	8	3579	3586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022226	A	7	7	3635	3641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022226	AT	3	6	3648	3653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022226	TGAAC	2	10	6981	6990	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_022226	A	7	7	9682	9688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022226	TAC	2	6	9743	9748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_022226	AT	3	6	10634	10639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022226	TAT	2	6	10659	10664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022226	ATT	3	9	10679	10687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022226	ATT	2	6	10745	10750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022226	ACA	2	6	10761	10766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_022226	ATA	2	6	10804	10809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022226	AAG	2	6	10864	10869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022226	TAA	2	6	12490	12495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022226	AT	3	6	12518	12523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022226	AG	3	6	12537	12542	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022226	AT	4	8	12571	12578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022226	CTAC	2	8	12583	12590	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_022226	T	7	7	12721	12727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022226	A	6	6	12735	12740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022226	ACGT	2	8	12746	12753	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_022226	ATA	2	6	12760	12765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022226	ATT	2	6	12773	12778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022226	TA	3	6	14111	14116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022226	ATA	2	6	14153	14158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022226	GTG	2	6	14168	14173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022226	T	7	7	14190	14196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022226	AAC	2	6	14232	14237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_022226	CAA	2	6	14285	14290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_022226	ATG	2	6	14303	14308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022226	TAT	2	6	14348	14353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022226	A	6	6	14369	14374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022226	GTA	2	6	14391	14396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022226	GTAGG	2	10	14414	14423	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022226	GAT	3	9	14431	14439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022226	TCA	2	6	14475	14480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_022226	A	6	6	14489	14494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022226	AAC	2	6	14515	14520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_022226	TAAA	2	8	14551	14558	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022226	A	6	6	14556	14561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022226	A	6	6	14573	14578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022226	TAT	2	6	14684	14689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022226	T	7	7	14689	14695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022226	TA	3	6	14702	14707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022226	AAC	2	6	15897	15902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_022226	TCA	2	6	15923	15928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_022226	AT	5	10	17090	17099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022226	TAAATC	2	12	17177	17188	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_022226	AAT	2	6	17216	17221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022226	CA	3	6	17239	17244	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_022226	TTA	2	6	17290	17295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022226	AAT	2	6	22193	22198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022226	GAT	2	6	22205	22210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022226	AT	3	6	22248	22253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022226	TA	3	6	23743	23748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022226	AGG	2	6	23797	23802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022226	TCGAT	2	10	23826	23835	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_022226	GAT	2	6	23896	23901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022226	AAG	2	6	23915	23920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022226	TAA	2	6	23934	23939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022226	ATT	2	6	24027	24032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022226	ATA	2	6	24033	24038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022226	TTC	2	6	24078	24083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_022226	A	6	6	24084	24089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022226	A	6	6	24107	24112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022226	ATCT	2	8	24145	24152	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_022226	CGG	2	6	24203	24208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_022226	T	6	6	24241	24246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022226	GCCT	2	8	24273	24280	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_022226	T	7	7	24349	24355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022226	ATATT	2	10	24363	24372	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022226	AT	3	6	24381	24386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022226	TTA	2	6	24498	24503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022226	TTC	2	6	24535	24540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_022226	CCA	2	6	24552	24557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_022226	TCC	2	6	24559	24564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_022226	AAT	2	6	24596	24601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022226	ATTT	2	8	24605	24612	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022226	TAT	2	6	24657	24662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022226	TCA	2	6	24676	24681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_022226	CCG	2	6	24707	24712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_022226	TAA	2	6	24721	24726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022226	A	6	6	24725	24730	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022226	AT	3	6	24736	24741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022226	TA	3	6	24787	24792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022226	T	6	6	24861	24866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022226	A	6	6	24891	24896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022226	ATA	2	6	24904	24909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022226	TAA	2	6	29606	29611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022226	TCA	2	6	29627	29632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_022226	TAT	2	6	29671	29676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022226	TAA	2	6	29793	29798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022226	ATA	2	6	29867	29872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022226	AG	3	6	29957	29962	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022226	GA	3	6	30788	30793	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022226	GAC	2	6	30822	30827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_022226	T	7	7	30840	30846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022226	TGT	2	6	30848	30853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022226	TGG	2	6	30854	30859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022226	TGT	2	6	30868	30873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022226	A	6	6	30900	30905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022226	AAT	2	6	30932	30937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022226	ATCA	2	8	30947	30954	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_022226	AT	3	6	33333	33338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022226	TAC	2	6	33348	33353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_022226	T	7	7	33384	33390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022226	A	6	6	33395	33400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022226	TAA	2	6	33444	33449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022226	ATT	2	6	33609	33614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022226	TAA	2	6	33619	33624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022226	TAA	2	6	33646	33651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022226	GGA	2	6	33684	33689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022226	T	6	6	34184	34189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022226	AAG	2	6	34261	34266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022226	TTTCA	2	10	34320	34329	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_022226	ATA	2	6	34335	34340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022226	TTCT	2	8	34399	34406	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_022226	ATAA	2	8	34437	34444	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022226	TAAAA	2	10	35773	35782	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_022226	TAA	2	6	35791	35796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_022226	TAAA	2	8	35814	35821	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_022226	A	6	6	35845	35850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_022226	T	6	6	35902	35907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_022226	AGATA	2	10	35931	35940	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
154	NC_022226	TAA	2	6	35946	35951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_022226	T	7	7	38427	38433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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175	NC_022226	TTA	2	6	40691	40696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_022226	TAA	2	6	40780	40785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_022226	GTA	2	6	44924	44929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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188	NC_022226	T	6	6	46266	46271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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294	NC_022226	AGCT	2	8	69447	69454	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
295	NC_022226	T	7	7	69457	69463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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432	NC_022226	TAA	2	6	117307	117312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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436	NC_022226	TAG	2	6	118174	118179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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439	NC_022226	TAAA	2	8	120416	120423	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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452	NC_022226	AT	3	6	129372	129377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_022226	T	7	7	129853	129859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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