MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 17980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_022221	GGT	2	6	1030136	1030141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_022221	TAA	2	6	1030154	1030159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_022221	GGT	2	6	1030190	1030195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_022221	ACC	2	6	1030278	1030283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4005	NC_022221	TCT	2	6	1030373	1030378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_022221	TCG	2	6	1030399	1030404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_022221	CAA	2	6	1030547	1030552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_022221	CAG	2	6	1030619	1030624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_022221	CAC	2	6	1030625	1030630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4010	NC_022221	CGA	2	6	1030691	1030696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_022221	CAG	2	6	1030722	1030727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_022221	TAT	2	6	1030728	1030733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_022221	A	6	6	1031972	1031977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_022221	ATT	2	6	1035233	1035238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_022221	GAC	2	6	1035247	1035252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_022221	AGC	2	6	1035405	1035410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_022221	AGA	2	6	1035429	1035434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_022221	TGC	2	6	1035506	1035511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_022221	TGA	2	6	1035514	1035519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_022221	CAT	2	6	1035585	1035590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_022221	T	6	6	1035655	1035660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_022221	TAA	2	6	1035683	1035688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_022221	TG	3	6	1035753	1035758	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_022221	C	6	6	1035788	1035793	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4025	NC_022221	CT	3	6	1036757	1036762	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4026	NC_022221	ATA	2	6	1036797	1036802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_022221	TTTTG	2	10	1036804	1036813	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_022221	G	6	6	1037683	1037688	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_022221	ACTGA	2	10	1037844	1037853	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4030	NC_022221	T	6	6	1038736	1038741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_022221	ATG	2	6	1038759	1038764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_022221	TG	3	6	1038848	1038853	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_022221	ATT	2	6	1038857	1038862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_022221	GC	3	6	1038923	1038928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4035	NC_022221	GCC	2	6	1040910	1040915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4036	NC_022221	TA	3	6	1040943	1040948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_022221	TTA	2	6	1043639	1043644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_022221	TCCC	2	8	1044074	1044081	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4039	NC_022221	GGA	2	6	1044083	1044088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_022221	CGT	2	6	1044103	1044108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_022221	AGAC	2	8	1045346	1045353	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4042	NC_022221	TAA	2	6	1045356	1045361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_022221	T	6	6	1045382	1045387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_022221	T	7	7	1049739	1049745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_022221	TAAT	2	8	1049754	1049761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_022221	CAAA	2	8	1049888	1049895	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4047	NC_022221	TATT	2	8	1049904	1049911	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_022221	TAA	2	6	1049922	1049927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_022221	TGTCC	2	10	1049945	1049954	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4050	NC_022221	CGG	2	6	1049956	1049961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_022221	C	6	6	1049968	1049973	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4052	NC_022221	ATG	2	6	1051468	1051473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_022221	A	6	6	1051482	1051487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_022221	T	6	6	1051506	1051511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_022221	GC	3	6	1051584	1051589	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4056	NC_022221	GTT	2	6	1051639	1051644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_022221	CGT	2	6	1051744	1051749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_022221	CGC	3	9	1051782	1051790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4059	NC_022221	GTG	3	9	1052078	1052086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_022221	TTA	2	6	1052129	1052134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_022221	GTC	2	6	1052467	1052472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_022221	GCC	2	6	1052527	1052532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4063	NC_022221	CAT	2	6	1052536	1052541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_022221	CCG	2	6	1052630	1052635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4065	NC_022221	CAT	2	6	1052707	1052712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_022221	GAA	2	6	1052794	1052799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_022221	TTTA	2	8	1052800	1052807	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_022221	TGT	2	6	1052814	1052819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_022221	TAC	2	6	1052841	1052846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_022221	GC	3	6	1052847	1052852	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4071	NC_022221	TGC	2	6	1052868	1052873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_022221	T	6	6	1052925	1052930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_022221	TGG	2	6	1052955	1052960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_022221	CCAG	2	8	1053021	1053028	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4075	NC_022221	ATT	2	6	1053034	1053039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_022221	GCT	2	6	1053103	1053108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4077	NC_022221	TGG	2	6	1053157	1053162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_022221	CCGGTC	2	12	1053201	1053212	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4079	NC_022221	CGC	2	6	1053226	1053231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4080	NC_022221	ACC	2	6	1053234	1053239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4081	NC_022221	CG	3	6	1053346	1053351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4082	NC_022221	TCA	2	6	1053409	1053414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_022221	CTG	2	6	1053434	1053439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4084	NC_022221	GCT	2	6	1053451	1053456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_022221	TTC	2	6	1053545	1053550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_022221	GTC	2	6	1053570	1053575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_022221	GGC	2	6	1053611	1053616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_022221	GCG	2	6	1053660	1053665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_022221	CGG	2	6	1053687	1053692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_022221	TGAA	2	8	1053696	1053703	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_022221	CTTG	2	8	1053719	1053726	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4092	NC_022221	T	6	6	1053863	1053868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_022221	AT	3	6	1053936	1053941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_022221	T	7	7	1057902	1057908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_022221	TTG	2	6	1058032	1058037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_022221	TTAA	2	8	1058038	1058045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_022221	TAA	2	6	1058055	1058060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_022221	TTAA	2	8	1058064	1058071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_022221	GCT	2	6	1059425	1059430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_022221	AGG	2	6	1059572	1059577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_022221	T	7	7	1060174	1060180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_022221	CGT	2	6	1060192	1060197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_022221	TC	3	6	1060862	1060867	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4104	NC_022221	TAT	2	6	1060868	1060873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_022221	AAAC	2	8	1060876	1060883	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4106	NC_022221	AAAT	2	8	1060913	1060920	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_022221	TA	3	6	1060958	1060963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_022221	AAG	2	6	1060978	1060983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_022221	ATCG	2	8	1061020	1061027	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4110	NC_022221	TCA	2	6	1061067	1061072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_022221	A	7	7	1061371	1061377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_022221	T	6	6	1061404	1061409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_022221	TAA	2	6	1062397	1062402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_022221	ATT	2	6	1062410	1062415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_022221	CCG	2	6	1066163	1066168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4116	NC_022221	TA	3	6	1066285	1066290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_022221	A	7	7	1070406	1070412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_022221	GTT	2	6	1070416	1070421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_022221	ACGTT	2	10	1071283	1071292	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4120	NC_022221	CTT	2	6	1073187	1073192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_022221	T	6	6	1073235	1073240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_022221	TC	3	6	1073254	1073259	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4123	NC_022221	CGT	2	6	1073479	1073484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_022221	T	6	6	1074750	1074755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_022221	ACC	2	6	1076856	1076861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4126	NC_022221	TTG	2	6	1076919	1076924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_022221	TTA	2	6	1077026	1077031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_022221	TGT	2	6	1077036	1077041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_022221	CGG	2	6	1079644	1079649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4130	NC_022221	GAA	2	6	1080854	1080859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_022221	TAA	2	6	1083078	1083083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_022221	GAA	2	6	1083110	1083115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4264	NC_022221	TGA	2	6	1097663	1097668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4266	NC_022221	GTA	2	6	1098112	1098117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4267	NC_022221	TAT	2	6	1098154	1098159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4268	NC_022221	TGA	2	6	1098183	1098188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4269	NC_022221	CAC	2	6	1098255	1098260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4270	NC_022221	GAA	2	6	1098286	1098291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4271	NC_022221	ATG	2	6	1098351	1098356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4272	NC_022221	TAT	2	6	1098364	1098369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4273	NC_022221	GCC	2	6	1098589	1098594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4274	NC_022221	TCATT	2	10	1098621	1098630	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4275	NC_022221	TCC	2	6	1098847	1098852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4277	NC_022221	GGC	2	6	1098869	1098874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4278	NC_022221	AACC	2	8	1098915	1098922	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4279	NC_022221	TGG	2	6	1098963	1098968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4280	NC_022221	A	7	7	1099051	1099057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4281	NC_022221	AGG	2	6	1099151	1099156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4282	NC_022221	TAT	2	6	1099737	1099742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4283	NC_022221	TCG	2	6	1099758	1099763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4287	NC_022221	AAT	3	9	1101043	1101051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4294	NC_022221	CAT	2	6	1101308	1101313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4297	NC_022221	GAG	2	6	1101394	1101399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4298	NC_022221	CCAGA	2	10	1101464	1101473	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4299	NC_022221	AGC	2	6	1101545	1101550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4301	NC_022221	AAC	2	6	1101637	1101642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4302	NC_022221	ACAG	2	8	1101704	1101711	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4303	NC_022221	CGG	2	6	1101743	1101748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4308	NC_022221	A	7	7	1102298	1102304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4333	NC_022221	CCAT	2	8	1112780	1112787	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4334	NC_022221	ACTC	2	8	1112885	1112892	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4339	NC_022221	TAA	2	6	1113277	1113282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4342	NC_022221	TGT	2	6	1113323	1113328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4344	NC_022221	TAA	2	6	1113429	1113434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4352	NC_022221	TTTA	2	8	1115700	1115707	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4353	NC_022221	AGA	2	6	1115812	1115817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4358	NC_022221	TAT	2	6	1117077	1117082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4359	NC_022221	ATA	2	6	1117218	1117223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4363	NC_022221	AGGCG	2	10	1119750	1119759	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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4373	NC_022221	AAT	2	6	1122135	1122140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4378	NC_022221	TTG	2	6	1122329	1122334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4379	NC_022221	GCTG	2	8	1122339	1122346	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4380	NC_022221	TTC	2	6	1122383	1122388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4382	NC_022221	TGA	2	6	1122548	1122553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4383	NC_022221	G	6	6	1122587	1122592	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4384	NC_022221	TCTT	2	8	1122611	1122618	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4385	NC_022221	GTG	2	6	1122630	1122635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4388	NC_022221	CTTT	2	8	1122721	1122728	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4389	NC_022221	GCA	2	6	1122731	1122736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4391	NC_022221	ATG	2	6	1122859	1122864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4392	NC_022221	ATG	2	6	1122892	1122897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4393	NC_022221	T	6	6	1122929	1122934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4394	NC_022221	TTG	2	6	1122975	1122980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4396	NC_022221	TGG	2	6	1123224	1123229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4399	NC_022221	GGC	2	6	1123318	1123323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4400	NC_022221	CAG	3	9	1123334	1123342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4401	NC_022221	CGG	2	6	1123408	1123413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4402	NC_022221	CGG	2	6	1123441	1123446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4456	NC_022221	AAT	2	6	1136301	1136306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4457	NC_022221	CGG	2	6	1136366	1136371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4458	NC_022221	TTG	2	6	1136418	1136423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4496	NC_022221	CAG	2	6	1141342	1141347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4497	NC_022221	CTGC	2	8	1141354	1141361	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4498	NC_022221	AATA	2	8	1141397	1141404	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4499	NC_022221	TACT	2	8	1142034	1142041	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4500	NC_022221	GAC	2	6	1145111	1145116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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