MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 17980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_022221	AGA	2	6	4161853	4161858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16002	NC_022221	TTTAT	2	10	4161876	4161885	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16003	NC_022221	CAGGT	2	10	4161897	4161906	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16004	NC_022221	TTAT	2	8	4161928	4161935	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16005	NC_022221	ATGA	2	8	4161939	4161946	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16006	NC_022221	ATT	2	6	4161988	4161993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16007	NC_022221	AAT	2	6	4162052	4162057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16008	NC_022221	AGT	2	6	4162069	4162074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16009	NC_022221	TTG	2	6	4164348	4164353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16010	NC_022221	GCC	2	6	4164412	4164417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16011	NC_022221	A	7	7	4164458	4164464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16012	NC_022221	A	6	6	4164468	4164473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16013	NC_022221	AGG	2	6	4167580	4167585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16014	NC_022221	G	6	6	4167584	4167589	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16015	NC_022221	ATT	2	6	4168895	4168900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16016	NC_022221	T	6	6	4168923	4168928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16017	NC_022221	CAT	2	6	4168945	4168950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16018	NC_022221	CGT	2	6	4168971	4168976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16019	NC_022221	CTGGC	2	10	4169018	4169027	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
16020	NC_022221	CT	3	6	4169070	4169075	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16021	NC_022221	GCC	2	6	4169683	4169688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16022	NC_022221	TGC	2	6	4169723	4169728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16023	NC_022221	GCC	2	6	4170555	4170560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16024	NC_022221	T	6	6	4171146	4171151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16025	NC_022221	GGT	2	6	4171198	4171203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16026	NC_022221	CAAA	2	8	4174563	4174570	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16027	NC_022221	GGC	2	6	4175966	4175971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16028	NC_022221	AAT	2	6	4176941	4176946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16029	NC_022221	GTC	2	6	4178292	4178297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16030	NC_022221	GC	4	8	4178347	4178354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16031	NC_022221	TTG	2	6	4179022	4179027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16032	NC_022221	GC	3	6	4179049	4179054	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16033	NC_022221	CCG	2	6	4181113	4181118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16034	NC_022221	ACA	2	6	4181144	4181149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16035	NC_022221	GCC	2	6	4181171	4181176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16036	NC_022221	TC	3	6	4181197	4181202	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16037	NC_022221	GCG	2	6	4181214	4181219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16038	NC_022221	GAA	2	6	4181273	4181278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16039	NC_022221	AAC	2	6	4181297	4181302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16040	NC_022221	GTT	2	6	4181900	4181905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16041	NC_022221	CGG	2	6	4181914	4181919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16042	NC_022221	GGC	2	6	4181921	4181926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16043	NC_022221	GCC	2	6	4181937	4181942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16044	NC_022221	TCA	2	6	4182013	4182018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16045	NC_022221	CGA	2	6	4182026	4182031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16046	NC_022221	TTC	2	6	4182034	4182039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16047	NC_022221	CGT	2	6	4182056	4182061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16048	NC_022221	GCG	2	6	4182116	4182121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16049	NC_022221	TCGGCG	2	12	4182130	4182141	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16050	NC_022221	GCG	2	6	4182162	4182167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16051	NC_022221	ATT	2	6	4182179	4182184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16052	NC_022221	TGCT	2	8	4182187	4182194	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16053	NC_022221	GGC	2	6	4182209	4182214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16054	NC_022221	GTC	2	6	4182216	4182221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16055	NC_022221	CGA	2	6	4182389	4182394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16056	NC_022221	CTG	2	6	4182465	4182470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16057	NC_022221	TGC	2	6	4182491	4182496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16058	NC_022221	GCC	2	6	4182549	4182554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16059	NC_022221	TTAT	2	8	4182555	4182562	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16060	NC_022221	AG	3	6	4182620	4182625	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16061	NC_022221	GGC	2	6	4182750	4182755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16062	NC_022221	GTT	2	6	4182760	4182765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16063	NC_022221	GTC	2	6	4182772	4182777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16064	NC_022221	CTG	2	6	4182799	4182804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16065	NC_022221	AAG	2	6	4182822	4182827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16066	NC_022221	G	6	6	4182864	4182869	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16067	NC_022221	TTA	2	6	4182937	4182942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16069	NC_022221	CGC	2	6	4182974	4182979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16070	NC_022221	TGA	2	6	4182983	4182988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16072	NC_022221	ATG	2	6	4183037	4183042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16073	NC_022221	GAT	2	6	4183060	4183065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16074	NC_022221	GTC	2	6	4183081	4183086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16075	NC_022221	TCGC	2	8	4183112	4183119	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16076	NC_022221	GCT	2	6	4183233	4183238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16079	NC_022221	TGG	2	6	4183310	4183315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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16081	NC_022221	TTA	2	6	4183387	4183392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16082	NC_022221	GC	3	6	4183433	4183438	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16083	NC_022221	CG	3	6	4183495	4183500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16084	NC_022221	TCG	2	6	4183512	4183517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16085	NC_022221	TGC	2	6	4183532	4183537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16086	NC_022221	CG	3	6	4183577	4183582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16087	NC_022221	AG	3	6	4183585	4183590	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16088	NC_022221	GGA	2	6	4183605	4183610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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16091	NC_022221	GTC	2	6	4184575	4184580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16093	NC_022221	TAT	2	6	4184692	4184697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16094	NC_022221	ATC	2	6	4184712	4184717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16095	NC_022221	A	7	7	4184724	4184730	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16096	NC_022221	T	8	8	4184746	4184753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16097	NC_022221	TGT	2	6	4184991	4184996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16098	NC_022221	CGG	2	6	4185003	4185008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16099	NC_022221	ATA	2	6	4185094	4185099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16100	NC_022221	CTT	2	6	4185145	4185150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16101	NC_022221	GCC	2	6	4186024	4186029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16102	NC_022221	GCG	2	6	4186040	4186045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16103	NC_022221	T	7	7	4186047	4186053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16104	NC_022221	AT	3	6	4186065	4186070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16105	NC_022221	ATTTG	2	10	4186082	4186091	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16106	NC_022221	TTAAT	2	10	4186211	4186220	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16107	NC_022221	AAT	2	6	4186231	4186236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16108	NC_022221	T	8	8	4186281	4186288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16109	NC_022221	TG	3	6	4188116	4188121	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16110	NC_022221	TTA	2	6	4188130	4188135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16111	NC_022221	TAAG	2	8	4188561	4188568	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16112	NC_022221	AAACT	2	10	4188592	4188601	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16113	NC_022221	AAC	2	6	4188628	4188633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16114	NC_022221	GGCG	2	8	4189139	4189146	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16115	NC_022221	TAACT	2	10	4189172	4189181	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
16116	NC_022221	TTGAA	2	10	4192600	4192609	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16117	NC_022221	TTG	2	6	4192631	4192636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16118	NC_022221	TATT	2	8	4192658	4192665	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16119	NC_022221	T	8	8	4192971	4192978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16120	NC_022221	AG	3	6	4193007	4193012	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16121	NC_022221	GCGACA	2	12	4194019	4194030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16123	NC_022221	GAG	2	6	4194308	4194313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16124	NC_022221	AAT	2	6	4194333	4194338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16125	NC_022221	GGA	2	6	4196246	4196251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16126	NC_022221	AGG	2	6	4197380	4197385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16127	NC_022221	T	6	6	4199359	4199364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16128	NC_022221	T	7	7	4199415	4199421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16129	NC_022221	AGT	3	9	4199444	4199452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16130	NC_022221	AGT	2	6	4200176	4200181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16131	NC_022221	GGA	2	6	4201473	4201478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16132	NC_022221	GCCGA	2	10	4204973	4204982	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
16133	NC_022221	T	6	6	4205006	4205011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16134	NC_022221	AGCC	2	8	4205053	4205060	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16135	NC_022221	GTAC	2	8	4205121	4205128	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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16138	NC_022221	AG	3	6	4206582	4206587	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16139	NC_022221	GTA	2	6	4208011	4208016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16142	NC_022221	T	7	7	4208042	4208048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16143	NC_022221	TCC	2	6	4208052	4208057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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16150	NC_022221	CTCGA	2	10	4208674	4208683	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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16160	NC_022221	ATAA	2	8	4209690	4209697	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16164	NC_022221	CGCA	2	8	4214185	4214192	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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16248	NC_022221	CGTC	2	8	4221895	4221902	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16249	NC_022221	AAC	2	6	4221914	4221919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16251	NC_022221	CAT	2	6	4222010	4222015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16252	NC_022221	AAAG	2	8	4222018	4222025	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16253	NC_022221	AGCGA	2	10	4222144	4222153	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
16254	NC_022221	AGTCG	2	10	4222171	4222180	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16255	NC_022221	CGTT	2	8	4222192	4222199	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16256	NC_022221	G	6	6	4222436	4222441	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16257	NC_022221	GT	4	8	4222494	4222501	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16258	NC_022221	TGA	2	6	4222537	4222542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16259	NC_022221	GGT	2	6	4222636	4222641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16260	NC_022221	GA	3	6	4222666	4222671	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16261	NC_022221	AGTC	2	8	4222762	4222769	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16262	NC_022221	GCTG	2	8	4222780	4222787	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16263	NC_022221	TTA	2	6	4222795	4222800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16264	NC_022221	CGG	2	6	4222919	4222924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16265	NC_022221	ATG	2	6	4222995	4223000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16266	NC_022221	ACC	2	6	4223190	4223195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16267	NC_022221	TGG	2	6	4223250	4223255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16268	NC_022221	TCC	2	6	4223276	4223281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16269	NC_022221	GGA	2	6	4223293	4223298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16270	NC_022221	AGG	2	6	4223331	4223336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16271	NC_022221	GGT	2	6	4223413	4223418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16272	NC_022221	CGG	2	6	4223500	4223505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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16277	NC_022221	GT	3	6	4223861	4223866	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16278	NC_022221	GA	3	6	4223948	4223953	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16279	NC_022221	CAG	2	6	4223961	4223966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16280	NC_022221	AAT	2	6	4223987	4223992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16288	NC_022221	CGTC	2	8	4224254	4224261	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16289	NC_022221	CTT	2	6	4224270	4224275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16291	NC_022221	TTCTA	2	10	4224858	4224867	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16292	NC_022221	TCT	2	6	4225923	4225928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16293	NC_022221	T	6	6	4225984	4225989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16296	NC_022221	AATTA	2	10	4226056	4226065	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16297	NC_022221	TTTTGA	2	12	4226080	4226091	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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16299	NC_022221	TTCG	2	8	4226143	4226150	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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16303	NC_022221	GCGCT	2	10	4232293	4232302	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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16306	NC_022221	GAAG	2	8	4236259	4236266	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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16316	NC_022221	ATTA	2	8	4243318	4243325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16324	NC_022221	TTG	2	6	4243557	4243562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16374	NC_022221	T	7	7	4246904	4246910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16389	NC_022221	ATA	2	6	4247201	4247206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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