MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 17980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_022221	AGG	2	6	3859458	3859463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15002	NC_022221	TAA	2	6	3861852	3861857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15003	NC_022221	TAA	2	6	3861886	3861891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15004	NC_022221	TTAT	2	8	3861892	3861899	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15005	NC_022221	CAT	2	6	3861921	3861926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15006	NC_022221	TAAAT	2	10	3861971	3861980	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15007	NC_022221	GCC	2	6	3861999	3862004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15008	NC_022221	AG	3	6	3862961	3862966	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15009	NC_022221	TGC	2	6	3862981	3862986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15010	NC_022221	GA	3	6	3864810	3864815	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15011	NC_022221	T	7	7	3865656	3865662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15012	NC_022221	ATG	2	6	3865680	3865685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15013	NC_022221	TAT	2	6	3867103	3867108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15014	NC_022221	GGC	2	6	3868818	3868823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15015	NC_022221	CGT	2	6	3868846	3868851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15016	NC_022221	TC	3	6	3868910	3868915	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15017	NC_022221	A	6	6	3868946	3868951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15018	NC_022221	TAC	2	6	3869697	3869702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15019	NC_022221	AAAT	2	8	3870095	3870102	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15020	NC_022221	CGG	2	6	3870303	3870308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15021	NC_022221	T	6	6	3870311	3870316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15022	NC_022221	CA	3	6	3870351	3870356	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15023	NC_022221	GGAA	2	8	3871196	3871203	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15024	NC_022221	AGA	2	6	3872943	3872948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15025	NC_022221	ATT	2	6	3873093	3873098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15026	NC_022221	GCC	2	6	3873129	3873134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15027	NC_022221	AG	3	6	3873170	3873175	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15028	NC_022221	A	7	7	3873208	3873214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15029	NC_022221	ATT	2	6	3873230	3873235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15030	NC_022221	TGC	2	6	3873246	3873251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15031	NC_022221	AAG	2	6	3873254	3873259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15032	NC_022221	T	6	6	3873334	3873339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15033	NC_022221	TTAT	2	8	3873344	3873351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15034	NC_022221	GAA	2	6	3873396	3873401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15035	NC_022221	TAA	2	6	3876365	3876370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15036	NC_022221	TGAG	2	8	3876394	3876401	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15037	NC_022221	TTTAA	2	10	3880565	3880574	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15038	NC_022221	GACT	3	12	3880577	3880588	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15039	NC_022221	TGC	2	6	3880595	3880600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15040	NC_022221	GA	3	6	3880618	3880623	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15041	NC_022221	ATTT	2	8	3880657	3880664	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15042	NC_022221	T	6	6	3880690	3880695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15043	NC_022221	CAT	2	6	3881516	3881521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15044	NC_022221	TAA	2	6	3882785	3882790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15045	NC_022221	TGC	2	6	3887105	3887110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15046	NC_022221	TGA	2	6	3887123	3887128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15047	NC_022221	GAT	2	6	3889446	3889451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15048	NC_022221	T	6	6	3889507	3889512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15049	NC_022221	TAACG	2	10	3889595	3889604	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15050	NC_022221	TGCT	2	8	3889622	3889629	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15051	NC_022221	ATTA	2	8	3889643	3889650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15052	NC_022221	GGC	2	6	3889652	3889657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15053	NC_022221	AAT	2	6	3894576	3894581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15054	NC_022221	TAC	2	6	3894592	3894597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15055	NC_022221	AGA	2	6	3894621	3894626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15056	NC_022221	AAAG	2	8	3894629	3894636	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15057	NC_022221	T	8	8	3894674	3894681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15058	NC_022221	T	6	6	3894761	3894766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15059	NC_022221	GTT	2	6	3894783	3894788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15060	NC_022221	C	6	6	3894790	3894795	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15061	NC_022221	CGT	2	6	3895233	3895238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15062	NC_022221	A	7	7	3895294	3895300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15063	NC_022221	ACA	2	6	3895587	3895592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15064	NC_022221	A	6	6	3898011	3898016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15065	NC_022221	GAA	2	6	3898055	3898060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15066	NC_022221	GAT	2	6	3898087	3898092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15067	NC_022221	CGA	2	6	3898118	3898123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15068	NC_022221	GCG	2	6	3898223	3898228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15069	NC_022221	CGC	2	6	3898265	3898270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15070	NC_022221	CTTC	2	8	3898286	3898293	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15071	NC_022221	A	6	6	3898344	3898349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15072	NC_022221	CGC	2	6	3898362	3898367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15073	NC_022221	AG	3	6	3898416	3898421	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15074	NC_022221	CG	3	6	3898450	3898455	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15075	NC_022221	CGC	2	6	3898499	3898504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15076	NC_022221	GCC	2	6	3898512	3898517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15077	NC_022221	GAA	2	6	3898614	3898619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15078	NC_022221	ATC	3	9	3898663	3898671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15079	NC_022221	AG	3	6	3898735	3898740	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15080	NC_022221	CCA	2	6	3898747	3898752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15081	NC_022221	ATA	2	6	3898860	3898865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15082	NC_022221	AT	3	6	3898933	3898938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15083	NC_022221	ATT	2	6	3898977	3898982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15084	NC_022221	AGGC	2	8	3899021	3899028	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15085	NC_022221	CAG	2	6	3899046	3899051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15086	NC_022221	AGAT	2	8	3899089	3899096	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15087	NC_022221	CAAT	2	8	3899129	3899136	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15088	NC_022221	CCG	2	6	3899182	3899187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15089	NC_022221	GAG	2	6	3899221	3899226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15090	NC_022221	AGGCC	2	10	3899228	3899237	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15091	NC_022221	ATT	2	6	3899272	3899277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15092	NC_022221	TAT	2	6	3899373	3899378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15093	NC_022221	CTC	2	6	3899394	3899399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15094	NC_022221	GTAAG	2	10	3899422	3899431	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
15095	NC_022221	AG	3	6	3899430	3899435	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15096	NC_022221	TAT	2	6	3900700	3900705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15097	NC_022221	GTTGAT	2	12	3900729	3900740	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15098	NC_022221	ATA	2	6	3900824	3900829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15099	NC_022221	ATG	2	6	3900834	3900839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15100	NC_022221	G	7	7	3902538	3902544	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15101	NC_022221	TTG	2	6	3906293	3906298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15102	NC_022221	ACA	2	6	3906312	3906317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15103	NC_022221	TTAT	2	8	3906334	3906341	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15104	NC_022221	GTT	2	6	3906488	3906493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15105	NC_022221	GCCATC	2	12	3906693	3906704	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
15106	NC_022221	CCG	2	6	3906717	3906722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15107	NC_022221	CTT	2	6	3906793	3906798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15108	NC_022221	CCG	2	6	3906847	3906852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15109	NC_022221	GTG	2	6	3906873	3906878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15110	NC_022221	GTT	2	6	3906998	3907003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15111	NC_022221	GTT	2	6	3907033	3907038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15112	NC_022221	AGA	2	6	3907043	3907048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15113	NC_022221	GCA	2	6	3907116	3907121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15114	NC_022221	AGAGCC	2	12	3907124	3907135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15115	NC_022221	CGC	2	6	3907373	3907378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15116	NC_022221	GT	3	6	3907444	3907449	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15117	NC_022221	TGT	2	6	3907453	3907458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15118	NC_022221	AGTC	2	8	3907468	3907475	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15119	NC_022221	CGC	2	6	3907480	3907485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15120	NC_022221	GCGT	2	8	3907535	3907542	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15121	NC_022221	ACCAAT	2	12	3907595	3907606	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15122	NC_022221	TCT	2	6	3907674	3907679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15123	NC_022221	GTA	2	6	3907697	3907702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15124	NC_022221	GTA	2	6	3907713	3907718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15125	NC_022221	CT	3	6	3907847	3907852	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15126	NC_022221	TGT	2	6	3907856	3907861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15127	NC_022221	GAC	2	6	3907874	3907879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15128	NC_022221	TTG	2	6	3907888	3907893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15129	NC_022221	TGC	4	12	3907969	3907980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15130	NC_022221	CGT	2	6	3908023	3908028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15131	NC_022221	TGGC	2	8	3908295	3908302	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15132	NC_022221	CTT	2	6	3908314	3908319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15133	NC_022221	CA	3	6	3908416	3908421	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15134	NC_022221	CGG	2	6	3908467	3908472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15135	NC_022221	GGC	2	6	3908645	3908650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15136	NC_022221	TTC	2	6	3908723	3908728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15137	NC_022221	GCA	2	6	3908742	3908747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15138	NC_022221	TAC	2	6	3908770	3908775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15140	NC_022221	GAAC	2	8	3908792	3908799	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15141	NC_022221	TGGT	2	8	3908892	3908899	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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15149	NC_022221	TGAT	2	8	3909112	3909119	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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15155	NC_022221	TGG	2	6	3909353	3909358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15156	NC_022221	TGG	2	6	3909362	3909367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15160	NC_022221	TGCC	2	8	3909455	3909462	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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15163	NC_022221	GTG	2	6	3909802	3909807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15178	NC_022221	TTAT	2	8	3911261	3911268	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15182	NC_022221	TTAT	2	8	3911370	3911377	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15189	NC_022221	AGTG	2	8	3912112	3912119	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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15258	NC_022221	CAT	2	6	3952489	3952494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15259	NC_022221	TGG	2	6	3952763	3952768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15260	NC_022221	T	7	7	3952914	3952920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15261	NC_022221	ACT	2	6	3952947	3952952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15262	NC_022221	AC	3	6	3952953	3952958	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15263	NC_022221	CAG	2	6	3952983	3952988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15264	NC_022221	TGT	2	6	3953038	3953043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15267	NC_022221	GTAA	2	8	3953210	3953217	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15268	NC_022221	TTCT	2	8	3953231	3953238	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15269	NC_022221	TGA	2	6	3953307	3953312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15278	NC_022221	CT	3	6	3953964	3953969	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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15280	NC_022221	TC	3	6	3954069	3954074	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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15292	NC_022221	A	8	8	3955302	3955309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15302	NC_022221	TTA	3	9	3958359	3958367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15388	NC_022221	GGC	2	6	3969091	3969096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15389	NC_022221	GTG	2	6	3969143	3969148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15392	NC_022221	TGG	2	6	3969334	3969339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15399	NC_022221	T	7	7	3971610	3971616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15401	NC_022221	GA	3	6	3971678	3971683	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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15414	NC_022221	ACA	2	6	3975917	3975922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15426	NC_022221	CCTG	2	8	3978327	3978334	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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15499	NC_022221	GTC	2	6	4004777	4004782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15500	NC_022221	TCA	2	6	4004878	4004883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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