MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 17980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_022221	CAG	2	6	3624175	3624180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14002	NC_022221	AGC	2	6	3627590	3627595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14003	NC_022221	ATG	2	6	3627616	3627621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14004	NC_022221	TA	3	6	3627647	3627652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14005	NC_022221	CCA	2	6	3627659	3627664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14006	NC_022221	AG	3	6	3627686	3627691	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14007	NC_022221	G	6	6	3627816	3627821	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14008	NC_022221	A	6	6	3628646	3628651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14009	NC_022221	ATA	2	6	3628661	3628666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14010	NC_022221	TGT	2	6	3629694	3629699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14011	NC_022221	TGA	2	6	3629704	3629709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14012	NC_022221	A	7	7	3629748	3629754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14013	NC_022221	GGC	2	6	3629799	3629804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14014	NC_022221	GC	3	6	3629868	3629873	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14015	NC_022221	CTG	2	6	3630949	3630954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14016	NC_022221	TCAGG	2	10	3630962	3630971	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14017	NC_022221	CTGGC	2	10	3631001	3631010	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14018	NC_022221	TCT	2	6	3631946	3631951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14019	NC_022221	GTA	2	6	3631956	3631961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14020	NC_022221	TAA	2	6	3631987	3631992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14021	NC_022221	A	8	8	3632013	3632020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14022	NC_022221	CAT	2	6	3632027	3632032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14023	NC_022221	GA	3	6	3632616	3632621	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14024	NC_022221	AAC	2	6	3632664	3632669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14025	NC_022221	TGA	2	6	3632694	3632699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14026	NC_022221	AAT	2	6	3635069	3635074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14027	NC_022221	CAC	2	6	3635163	3635168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14028	NC_022221	CCTT	2	8	3635569	3635576	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14029	NC_022221	CTG	2	6	3636267	3636272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14030	NC_022221	A	7	7	3636289	3636295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14031	NC_022221	TCA	2	6	3636301	3636306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14032	NC_022221	TGCAA	2	10	3636325	3636334	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14033	NC_022221	ATC	2	6	3636958	3636963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14034	NC_022221	ATT	2	6	3636967	3636972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14035	NC_022221	CGC	2	6	3636993	3636998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14036	NC_022221	TTAA	2	8	3637021	3637028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14037	NC_022221	A	7	7	3637095	3637101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14038	NC_022221	T	6	6	3637105	3637110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14039	NC_022221	TGA	2	6	3637135	3637140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14040	NC_022221	TCTT	2	8	3637180	3637187	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14041	NC_022221	AAG	2	6	3637221	3637226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14042	NC_022221	ATT	2	6	3637262	3637267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14043	NC_022221	ATA	2	6	3640167	3640172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14044	NC_022221	TCA	2	6	3640185	3640190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14045	NC_022221	A	8	8	3640197	3640204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14046	NC_022221	AATA	2	8	3640235	3640242	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14047	NC_022221	ATTTA	2	10	3640942	3640951	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14048	NC_022221	GTT	2	6	3640962	3640967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14049	NC_022221	ATAAA	2	10	3641094	3641103	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14050	NC_022221	CAA	2	6	3641118	3641123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14051	NC_022221	TTATAT	2	12	3641143	3641154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14052	NC_022221	AT	3	6	3641181	3641186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14053	NC_022221	AAC	2	6	3641208	3641213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14054	NC_022221	AAT	2	6	3641216	3641221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14055	NC_022221	ATG	2	6	3641330	3641335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14056	NC_022221	A	8	8	3641348	3641355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14057	NC_022221	TAT	2	6	3641356	3641361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14058	NC_022221	T	6	6	3641406	3641411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14059	NC_022221	GCA	2	6	3643443	3643448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14060	NC_022221	CGC	2	6	3643500	3643505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14061	NC_022221	GCC	2	6	3643526	3643531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14062	NC_022221	CGA	2	6	3643568	3643573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14063	NC_022221	TCC	2	6	3644438	3644443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14064	NC_022221	GC	3	6	3644509	3644514	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14065	NC_022221	T	7	7	3644525	3644531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14066	NC_022221	GAC	2	6	3644563	3644568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14067	NC_022221	TAG	2	6	3644584	3644589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14068	NC_022221	TTG	2	6	3644622	3644627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14069	NC_022221	AGGT	2	8	3644659	3644666	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14070	NC_022221	T	6	6	3644677	3644682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14071	NC_022221	AAG	2	6	3644703	3644708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14072	NC_022221	GCGCT	2	10	3647521	3647530	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14073	NC_022221	T	7	7	3648520	3648526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14074	NC_022221	T	6	6	3650043	3650048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14075	NC_022221	CGC	2	6	3650070	3650075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14076	NC_022221	AACG	2	8	3650658	3650665	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14077	NC_022221	TTCG	2	8	3650714	3650721	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14078	NC_022221	TGA	2	6	3651756	3651761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14079	NC_022221	GCC	2	6	3651769	3651774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14080	NC_022221	CT	3	6	3651918	3651923	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14081	NC_022221	ATTGAT	2	12	3653194	3653205	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14082	NC_022221	T	6	6	3653238	3653243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14083	NC_022221	T	8	8	3653267	3653274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14084	NC_022221	ATT	2	6	3653305	3653310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14085	NC_022221	ATC	2	6	3653342	3653347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14086	NC_022221	ATT	2	6	3653349	3653354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14087	NC_022221	TGA	2	6	3653365	3653370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14088	NC_022221	TGA	2	6	3653390	3653395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14089	NC_022221	A	8	8	3653395	3653402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14090	NC_022221	AAC	2	6	3653410	3653415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14091	NC_022221	TCA	2	6	3653436	3653441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14092	NC_022221	ATTG	2	8	3653517	3653524	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14093	NC_022221	TAA	2	6	3653528	3653533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14094	NC_022221	CAGG	2	8	3653538	3653545	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14095	NC_022221	CGA	2	6	3653582	3653587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14096	NC_022221	GGC	3	9	3653681	3653689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14097	NC_022221	CT	3	6	3653711	3653716	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14098	NC_022221	TGC	2	6	3653723	3653728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14099	NC_022221	TTA	2	6	3653737	3653742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14100	NC_022221	ACT	2	6	3653753	3653758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14101	NC_022221	CAAT	2	8	3653767	3653774	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14102	NC_022221	AATA	2	8	3653781	3653788	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14103	NC_022221	GAT	2	6	3653811	3653816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14104	NC_022221	GC	3	6	3653883	3653888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14105	NC_022221	GCA	2	6	3653910	3653915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14106	NC_022221	GAA	2	6	3653943	3653948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14107	NC_022221	TGA	2	6	3654021	3654026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14108	NC_022221	GGC	2	6	3654039	3654044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14109	NC_022221	A	6	6	3654175	3654180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14110	NC_022221	ATC	2	6	3654323	3654328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14111	NC_022221	T	6	6	3654434	3654439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14112	NC_022221	AG	3	6	3654556	3654561	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14113	NC_022221	AT	4	8	3654579	3654586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14114	NC_022221	CAT	2	6	3655341	3655346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14115	NC_022221	G	6	6	3655353	3655358	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14116	NC_022221	AG	3	6	3655380	3655385	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14117	NC_022221	CTT	2	6	3655425	3655430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14118	NC_022221	CTTT	2	8	3655449	3655456	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14119	NC_022221	AC	5	10	3655470	3655479	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14120	NC_022221	CTC	2	6	3655504	3655509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14121	NC_022221	GGA	2	6	3655516	3655521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14122	NC_022221	AAC	2	6	3655570	3655575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14123	NC_022221	CAG	2	6	3655652	3655657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14124	NC_022221	GGCA	2	8	3655691	3655698	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14125	NC_022221	CGG	3	9	3655702	3655710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14126	NC_022221	CTG	2	6	3655761	3655766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14127	NC_022221	ATC	2	6	3655891	3655896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14128	NC_022221	GC	3	6	3655909	3655914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14129	NC_022221	TGG	2	6	3655936	3655941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14130	NC_022221	GCC	2	6	3655960	3655965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14131	NC_022221	CG	3	6	3655983	3655988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14132	NC_022221	GAA	2	6	3656022	3656027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14133	NC_022221	TGA	2	6	3656050	3656055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14134	NC_022221	CG	3	6	3656187	3656192	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14135	NC_022221	ACCA	2	8	3656283	3656290	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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14139	NC_022221	CTT	2	6	3656489	3656494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14141	NC_022221	CGTG	2	8	3656576	3656583	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14142	NC_022221	GAT	2	6	3656598	3656603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14147	NC_022221	CGG	3	9	3656957	3656965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14164	NC_022221	GTTC	2	8	3657808	3657815	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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14249	NC_022221	AGAC	2	8	3692120	3692127	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14250	NC_022221	TCA	2	6	3692145	3692150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14251	NC_022221	TTG	2	6	3692375	3692380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14252	NC_022221	GCC	3	9	3692390	3692398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14253	NC_022221	CGC	2	6	3692399	3692404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14254	NC_022221	T	6	6	3692432	3692437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14256	NC_022221	CCT	2	6	3692458	3692463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14257	NC_022221	ACG	2	6	3692486	3692491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14258	NC_022221	GGTT	2	8	3692525	3692532	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14259	NC_022221	ATG	2	6	3692537	3692542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14260	NC_022221	AGCA	2	8	3692597	3692604	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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14270	NC_022221	CCG	2	6	3693042	3693047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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14274	NC_022221	ACTG	2	8	3693851	3693858	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14275	NC_022221	GGC	2	6	3693860	3693865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14277	NC_022221	T	7	7	3693989	3693995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14278	NC_022221	A	6	6	3694061	3694066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14329	NC_022221	CTTT	2	8	3703663	3703670	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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14335	NC_022221	TCGGT	2	10	3704015	3704024	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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14337	NC_022221	GTAC	2	8	3704229	3704236	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14338	NC_022221	GTCA	2	8	3704312	3704319	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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14497	NC_022221	CTC	2	6	3766013	3766018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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14500	NC_022221	GCC	2	6	3766095	3766100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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