MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 17980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_022221	ACT	2	6	3472145	3472150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13502	NC_022221	AAAAG	2	10	3473685	3473694	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
13503	NC_022221	AG	3	6	3473719	3473724	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13504	NC_022221	CTC	2	6	3474498	3474503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13505	NC_022221	AGA	2	6	3474521	3474526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13506	NC_022221	TCA	2	6	3474625	3474630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13507	NC_022221	AATA	2	8	3474632	3474639	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13508	NC_022221	AC	3	6	3474697	3474702	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13509	NC_022221	T	6	6	3474726	3474731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13510	NC_022221	CATC	2	8	3474762	3474769	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13511	NC_022221	TGTT	2	8	3475579	3475586	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13512	NC_022221	CAA	2	6	3475617	3475622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13513	NC_022221	A	6	6	3476954	3476959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13514	NC_022221	TGC	2	6	3477297	3477302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13515	NC_022221	CT	3	6	3479602	3479607	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13516	NC_022221	GGC	2	6	3479658	3479663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13517	NC_022221	AAGT	2	8	3479692	3479699	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13518	NC_022221	GCT	2	6	3480814	3480819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13519	NC_022221	AGT	2	6	3480843	3480848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13520	NC_022221	ATT	2	6	3480866	3480871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13521	NC_022221	CCA	2	6	3480943	3480948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13522	NC_022221	CCG	2	6	3481027	3481032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13523	NC_022221	CCA	2	6	3481033	3481038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13524	NC_022221	TGC	2	6	3481074	3481079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13525	NC_022221	CCA	2	6	3481114	3481119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13526	NC_022221	GGTC	2	8	3481177	3481184	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13527	NC_022221	AAT	2	6	3481199	3481204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13528	NC_022221	ACG	2	6	3481256	3481261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13529	NC_022221	TCA	2	6	3481267	3481272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13530	NC_022221	GCG	2	6	3481297	3481302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13531	NC_022221	CAG	3	9	3481316	3481324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13532	NC_022221	ATG	2	6	3481371	3481376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13533	NC_022221	CCA	2	6	3481393	3481398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13534	NC_022221	GCC	2	6	3481464	3481469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13535	NC_022221	ATG	2	6	3481566	3481571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13536	NC_022221	AACA	2	8	3481649	3481656	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13537	NC_022221	T	6	6	3483529	3483534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13538	NC_022221	CGT	2	6	3483536	3483541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13539	NC_022221	ACACA	2	10	3483547	3483556	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
13540	NC_022221	TGG	2	6	3483618	3483623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13541	NC_022221	CTG	2	6	3483648	3483653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13542	NC_022221	GAC	2	6	3483689	3483694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13543	NC_022221	TGG	2	6	3483772	3483777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13544	NC_022221	CGCT	2	8	3483804	3483811	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13545	NC_022221	CTTAT	2	10	3483847	3483856	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13546	NC_022221	CTGG	2	8	3483857	3483864	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13547	NC_022221	GC	3	6	3483878	3483883	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13548	NC_022221	TCTT	2	8	3483985	3483992	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13549	NC_022221	GCC	2	6	3483993	3483998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13550	NC_022221	TCA	2	6	3484012	3484017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13551	NC_022221	GCA	2	6	3484022	3484027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13552	NC_022221	CAC	2	6	3484061	3484066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13553	NC_022221	TGG	2	6	3484072	3484077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13554	NC_022221	TGA	2	6	3484087	3484092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13555	NC_022221	GCGCA	2	10	3484110	3484119	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13556	NC_022221	GCC	2	6	3484122	3484127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13557	NC_022221	GTT	2	6	3484178	3484183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13558	NC_022221	GC	3	6	3484195	3484200	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13559	NC_022221	GAT	2	6	3484238	3484243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13560	NC_022221	T	6	6	3484934	3484939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13561	NC_022221	GA	3	6	3486830	3486835	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13562	NC_022221	AC	3	6	3487800	3487805	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13563	NC_022221	GTTA	2	8	3487812	3487819	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13564	NC_022221	CTT	2	6	3487823	3487828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13565	NC_022221	AAC	2	6	3487838	3487843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13566	NC_022221	AAG	2	6	3487848	3487853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13567	NC_022221	ATA	2	6	3487855	3487860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13568	NC_022221	TGT	2	6	3488377	3488382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13569	NC_022221	ATA	2	6	3489296	3489301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13570	NC_022221	TAT	2	6	3489312	3489317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13571	NC_022221	CATT	2	8	3489643	3489650	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13572	NC_022221	ATA	2	6	3489669	3489674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13573	NC_022221	ATT	2	6	3489681	3489686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13574	NC_022221	ATTA	2	8	3489718	3489725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13575	NC_022221	AT	3	6	3489755	3489760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13576	NC_022221	A	6	6	3489796	3489801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13577	NC_022221	CA	3	6	3491230	3491235	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13578	NC_022221	A	6	6	3491286	3491291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13579	NC_022221	GT	3	6	3491387	3491392	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13580	NC_022221	AAT	2	6	3491481	3491486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13581	NC_022221	AT	3	6	3491553	3491558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13582	NC_022221	GGC	2	6	3491567	3491572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13583	NC_022221	CCG	2	6	3493824	3493829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13584	NC_022221	ACT	2	6	3493943	3493948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13585	NC_022221	ATC	2	6	3497374	3497379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13586	NC_022221	AAGC	2	8	3497396	3497403	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13587	NC_022221	GCG	2	6	3497433	3497438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13588	NC_022221	ATT	2	6	3497449	3497454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13589	NC_022221	TCA	2	6	3497484	3497489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13590	NC_022221	T	6	6	3497548	3497553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13591	NC_022221	GCG	2	6	3497632	3497637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13592	NC_022221	CCAG	2	8	3497648	3497655	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13593	NC_022221	AGCCC	2	10	3497756	3497765	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
13594	NC_022221	CAGC	2	8	3497923	3497930	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13595	NC_022221	AAT	2	6	3497996	3498001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13596	NC_022221	ATC	3	9	3498008	3498016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13597	NC_022221	CGCAGG	2	12	3498021	3498032	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13598	NC_022221	GCC	2	6	3498870	3498875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13599	NC_022221	CGA	2	6	3501562	3501567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13600	NC_022221	A	6	6	3501567	3501572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13601	NC_022221	AAAG	2	8	3501616	3501623	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13602	NC_022221	TACA	2	8	3501630	3501637	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13603	NC_022221	ATT	2	6	3501695	3501700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13604	NC_022221	GAC	2	6	3501711	3501716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13605	NC_022221	CTCA	2	8	3501732	3501739	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13606	NC_022221	CT	3	6	3501762	3501767	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13607	NC_022221	TGAT	2	8	3501790	3501797	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13608	NC_022221	A	7	7	3505950	3505956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13609	NC_022221	ACA	2	6	3506000	3506005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13610	NC_022221	TGA	2	6	3506044	3506049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13611	NC_022221	CAT	2	6	3506099	3506104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13612	NC_022221	ATT	2	6	3506164	3506169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13613	NC_022221	A	6	6	3506198	3506203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13614	NC_022221	A	7	7	3506218	3506224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13615	NC_022221	C	6	6	3506250	3506255	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13616	NC_022221	A	6	6	3506434	3506439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13617	NC_022221	CCG	2	6	3506442	3506447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13618	NC_022221	GA	3	6	3506472	3506477	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13619	NC_022221	T	6	6	3506550	3506555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13620	NC_022221	GTG	2	6	3506582	3506587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13621	NC_022221	G	8	8	3506591	3506598	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13622	NC_022221	CCA	2	6	3506762	3506767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13623	NC_022221	ACC	2	6	3506792	3506797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13624	NC_022221	TAAA	2	8	3506812	3506819	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13625	NC_022221	ATA	2	6	3506918	3506923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13626	NC_022221	TAAA	2	8	3506956	3506963	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13627	NC_022221	GTA	2	6	3508416	3508421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13628	NC_022221	TTG	2	6	3508447	3508452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13629	NC_022221	A	7	7	3508495	3508501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13630	NC_022221	ATC	2	6	3508521	3508526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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