MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 17980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_022221	CT	3	6	3351136	3351141	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13002	NC_022221	TCGG	2	8	3351237	3351244	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13003	NC_022221	ATA	2	6	3351260	3351265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13004	NC_022221	GCGCT	2	10	3351281	3351290	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13005	NC_022221	TGTTAT	2	12	3352426	3352437	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13006	NC_022221	CGT	2	6	3352457	3352462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13007	NC_022221	A	7	7	3352475	3352481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13008	NC_022221	TAT	2	6	3353082	3353087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13009	NC_022221	TTCA	2	8	3353144	3353151	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13010	NC_022221	AGC	2	6	3353161	3353166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13011	NC_022221	GATGT	2	10	3354567	3354576	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
13012	NC_022221	TGC	3	9	3354594	3354602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13013	NC_022221	T	6	6	3354610	3354615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13014	NC_022221	ACG	2	6	3354617	3354622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13015	NC_022221	ACG	2	6	3355703	3355708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13016	NC_022221	CGT	2	6	3355722	3355727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13017	NC_022221	CGA	2	6	3355729	3355734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13018	NC_022221	CAGG	2	8	3359845	3359852	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13019	NC_022221	ATA	2	6	3359886	3359891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13020	NC_022221	GCC	2	6	3359909	3359914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13021	NC_022221	TTA	3	9	3359933	3359941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13022	NC_022221	ACC	2	6	3359957	3359962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13023	NC_022221	CAAT	2	8	3362806	3362813	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13024	NC_022221	AT	3	6	3362815	3362820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13025	NC_022221	ATT	2	6	3362850	3362855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13026	NC_022221	GAA	2	6	3362958	3362963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13027	NC_022221	TAA	2	6	3364296	3364301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13028	NC_022221	GAG	2	6	3364314	3364319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13029	NC_022221	AAG	2	6	3364363	3364368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13030	NC_022221	TTA	2	6	3365353	3365358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13031	NC_022221	CGG	2	6	3365387	3365392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13032	NC_022221	CTCA	2	8	3365426	3365433	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13033	NC_022221	AG	3	6	3365504	3365509	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13034	NC_022221	GGT	2	6	3365523	3365528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13035	NC_022221	CTA	2	6	3365540	3365545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13036	NC_022221	ACA	2	6	3365556	3365561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13037	NC_022221	AATT	2	8	3365575	3365582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13038	NC_022221	ATT	2	6	3365664	3365669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13039	NC_022221	AAT	2	6	3365720	3365725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13040	NC_022221	GTT	2	6	3365726	3365731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13041	NC_022221	TCC	2	6	3366235	3366240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13042	NC_022221	GTC	2	6	3366241	3366246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13043	NC_022221	CGG	2	6	3366250	3366255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13044	NC_022221	CGC	2	6	3366280	3366285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13045	NC_022221	ATGA	2	8	3366336	3366343	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13046	NC_022221	A	7	7	3366350	3366356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13047	NC_022221	T	6	6	3366373	3366378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13048	NC_022221	T	6	6	3366399	3366404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_022221	GCG	2	6	3366413	3366418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13050	NC_022221	A	6	6	3366450	3366455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13051	NC_022221	ATTA	2	8	3366500	3366507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13052	NC_022221	TGA	2	6	3366537	3366542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13053	NC_022221	CGA	2	6	3366576	3366581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13054	NC_022221	TCG	2	6	3367230	3367235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13055	NC_022221	CGA	2	6	3367243	3367248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13056	NC_022221	T	6	6	3367271	3367276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13057	NC_022221	AGCC	2	8	3367558	3367565	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13058	NC_022221	GACA	2	8	3367575	3367582	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13059	NC_022221	TAC	2	6	3367594	3367599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13060	NC_022221	CAT	2	6	3367604	3367609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13061	NC_022221	A	7	7	3367693	3367699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13062	NC_022221	GA	4	8	3370862	3370869	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13063	NC_022221	CGC	2	6	3370896	3370901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13064	NC_022221	AAT	2	6	3370949	3370954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13065	NC_022221	TAT	2	6	3370988	3370993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13066	NC_022221	AAT	2	6	3371023	3371028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13067	NC_022221	GCGCT	2	10	3372023	3372032	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13068	NC_022221	CA	3	6	3372049	3372054	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13069	NC_022221	GTT	2	6	3373582	3373587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13071	NC_022221	A	6	6	3377489	3377494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13072	NC_022221	GGC	2	6	3377530	3377535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13073	NC_022221	CTA	2	6	3377569	3377574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13074	NC_022221	ACCA	2	8	3382344	3382351	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13075	NC_022221	GCA	2	6	3382355	3382360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13077	NC_022221	A	6	6	3382451	3382456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13078	NC_022221	CAG	2	6	3382458	3382463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13079	NC_022221	TGC	2	6	3382514	3382519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13080	NC_022221	GC	3	6	3382561	3382566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13081	NC_022221	GC	3	6	3384607	3384612	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13082	NC_022221	TAC	2	6	3384626	3384631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13083	NC_022221	ATCT	2	8	3384640	3384647	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13084	NC_022221	A	7	7	3385729	3385735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13085	NC_022221	TTAA	2	8	3385743	3385750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13086	NC_022221	TATT	2	8	3385752	3385759	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13087	NC_022221	AC	3	6	3385771	3385776	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13088	NC_022221	TGT	2	6	3385802	3385807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13090	NC_022221	TTCG	2	8	3387589	3387596	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13091	NC_022221	T	6	6	3387635	3387640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13092	NC_022221	AGA	2	6	3387654	3387659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13093	NC_022221	CA	3	6	3387664	3387669	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13094	NC_022221	T	6	6	3389695	3389700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13095	NC_022221	CAT	2	6	3389723	3389728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13097	NC_022221	TGCCA	2	10	3391458	3391467	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13098	NC_022221	CA	3	6	3392380	3392385	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13099	NC_022221	CAT	2	6	3392415	3392420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13100	NC_022221	TCA	2	6	3392426	3392431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13101	NC_022221	AATG	2	8	3392432	3392439	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13102	NC_022221	CTT	2	6	3392450	3392455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13103	NC_022221	GCT	2	6	3392480	3392485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13105	NC_022221	GCA	2	6	3392566	3392571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13106	NC_022221	CT	3	6	3392582	3392587	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13107	NC_022221	CATT	2	8	3392722	3392729	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13108	NC_022221	A	7	7	3392747	3392753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13109	NC_022221	ATT	2	6	3392758	3392763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13110	NC_022221	GAA	2	6	3392785	3392790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13111	NC_022221	AG	3	6	3392793	3392798	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13112	NC_022221	CCG	2	6	3392830	3392835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13113	NC_022221	AATA	2	8	3392838	3392845	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13114	NC_022221	ATTT	2	8	3392871	3392878	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13115	NC_022221	ACA	2	6	3392908	3392913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13116	NC_022221	A	6	6	3392949	3392954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13117	NC_022221	CGC	2	6	3392966	3392971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13118	NC_022221	TGGC	2	8	3393053	3393060	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13119	NC_022221	T	6	6	3394347	3394352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13120	NC_022221	ATT	2	6	3395532	3395537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13121	NC_022221	AAG	2	6	3395598	3395603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13122	NC_022221	A	6	6	3398480	3398485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13123	NC_022221	T	8	8	3398673	3398680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13124	NC_022221	TAA	2	6	3398735	3398740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13125	NC_022221	CTATT	2	10	3398760	3398769	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13126	NC_022221	CG	3	6	3398773	3398778	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13127	NC_022221	T	6	6	3398819	3398824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13128	NC_022221	C	6	6	3403179	3403184	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13129	NC_022221	TAA	2	6	3403610	3403615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13130	NC_022221	TATT	2	8	3403718	3403725	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13131	NC_022221	ATT	2	6	3403830	3403835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13132	NC_022221	ACAG	2	8	3403836	3403843	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13133	NC_022221	AAATA	2	10	3403913	3403922	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13134	NC_022221	TTA	2	6	3403968	3403973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13135	NC_022221	GTAA	2	8	3403979	3403986	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13136	NC_022221	GGCG	2	8	3404207	3404214	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13137	NC_022221	TGC	2	6	3404240	3404245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13139	NC_022221	TCC	2	6	3404277	3404282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13142	NC_022221	ACC	2	6	3404454	3404459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13145	NC_022221	ACC	2	6	3404699	3404704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13146	NC_022221	GCC	2	6	3404713	3404718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13149	NC_022221	GCC	2	6	3404827	3404832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13154	NC_022221	AC	3	6	3404973	3404978	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13155	NC_022221	CGT	3	9	3404991	3404999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13241	NC_022221	CTTA	2	8	3416232	3416239	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13242	NC_022221	TTC	2	6	3416256	3416261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13249	NC_022221	GGT	2	6	3417136	3417141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13250	NC_022221	GTA	2	6	3417174	3417179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13251	NC_022221	GCGATA	2	12	3417229	3417240	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13252	NC_022221	GCT	3	9	3417264	3417272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13253	NC_022221	C	7	7	3417277	3417283	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13254	NC_022221	CG	4	8	3417327	3417334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13255	NC_022221	GTC	2	6	3417411	3417416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13256	NC_022221	TGC	2	6	3417418	3417423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13257	NC_022221	TCGT	2	8	3417465	3417472	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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13391	NC_022221	ACC	2	6	3448912	3448917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13392	NC_022221	CCT	2	6	3448994	3448999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13500	NC_022221	AAG	2	6	3472095	3472100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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