MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 17980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022221	GTG	2	6	132807	132812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
502	NC_022221	GT	3	6	132823	132828	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
503	NC_022221	ATG	2	6	132835	132840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_022221	CTT	2	6	132869	132874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_022221	CG	3	6	132931	132936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
506	NC_022221	GCC	2	6	132949	132954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
507	NC_022221	TCG	2	6	132982	132987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_022221	GAT	2	6	133002	133007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_022221	CCA	2	6	133133	133138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_022221	CG	3	6	133139	133144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
511	NC_022221	TCA	2	6	133195	133200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_022221	CG	3	6	133233	133238	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
513	NC_022221	TGC	2	6	133259	133264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_022221	TGG	2	6	133271	133276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
515	NC_022221	AAT	2	6	133578	133583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_022221	ATG	2	6	133597	133602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_022221	A	7	7	133639	133645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_022221	TTTG	2	8	133665	133672	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
519	NC_022221	GCC	2	6	133698	133703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
520	NC_022221	AGT	3	9	133735	133743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_022221	ACGA	2	8	133755	133762	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
522	NC_022221	TTG	2	6	133860	133865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_022221	TTTG	2	8	133976	133983	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
524	NC_022221	GGTTT	2	10	134024	134033	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
525	NC_022221	GGATAA	2	12	134083	134094	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_022221	TAA	2	6	134130	134135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_022221	TTGC	2	8	134211	134218	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
528	NC_022221	TA	3	6	135426	135431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_022221	A	6	6	135431	135436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_022221	TCG	2	6	135469	135474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_022221	ATT	2	6	135519	135524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_022221	TCT	2	6	135563	135568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_022221	CTT	2	6	135569	135574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_022221	CCT	2	6	135576	135581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_022221	ATT	2	6	135583	135588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_022221	AGCG	2	8	135637	135644	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
537	NC_022221	TGA	2	6	135666	135671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_022221	TGT	2	6	135702	135707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_022221	GTC	2	6	135722	135727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_022221	ATG	2	6	135795	135800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_022221	GATC	2	8	135820	135827	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
542	NC_022221	GTG	2	6	135902	135907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
543	NC_022221	ATTCC	2	10	135969	135978	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
544	NC_022221	ATTG	2	8	136012	136019	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
545	NC_022221	ATG	2	6	136023	136028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_022221	GGT	2	6	136066	136071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
547	NC_022221	CTGG	2	8	136132	136139	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
548	NC_022221	GGT	2	6	136162	136167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
549	NC_022221	A	6	6	136202	136207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_022221	A	6	6	136311	136316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_022221	GGT	2	6	136320	136325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
552	NC_022221	CAT	2	6	136377	136382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_022221	GGT	2	6	136401	136406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
554	NC_022221	GAC	2	6	136543	136548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_022221	ACG	2	6	136552	136557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_022221	AAT	2	6	136558	136563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_022221	GGT	2	6	136650	136655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
558	NC_022221	GAT	2	6	136726	136731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_022221	TGG	2	6	136741	136746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
560	NC_022221	CAG	2	6	136747	136752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_022221	AG	3	6	136755	136760	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
562	NC_022221	GC	3	6	136764	136769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
563	NC_022221	GAAAGC	2	12	136795	136806	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
564	NC_022221	ACA	2	6	136881	136886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_022221	CT	3	6	136901	136906	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
566	NC_022221	CGG	2	6	136944	136949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_022221	GAAA	2	8	137007	137014	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
568	NC_022221	TGG	2	6	137015	137020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
569	NC_022221	CTGAAC	2	12	137104	137115	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_022221	ACC	2	6	137249	137254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
571	NC_022221	TCG	2	6	137318	137323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_022221	CCCAA	2	10	138037	138046	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
573	NC_022221	T	8	8	138062	138069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_022221	CGG	2	6	139206	139211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_022221	CT	3	6	139221	139226	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
576	NC_022221	GCC	2	6	139230	139235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
577	NC_022221	CAAA	2	8	139238	139245	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
578	NC_022221	AAT	2	6	139271	139276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_022221	T	6	6	139309	139314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_022221	CTTT	2	8	139320	139327	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
581	NC_022221	TTGTT	2	10	139384	139393	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
582	NC_022221	TCG	2	6	139410	139415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_022221	CGG	2	6	139590	139595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_022221	T	7	7	139607	139613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_022221	T	6	6	139695	139700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_022221	CTTG	2	8	139720	139727	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
587	NC_022221	TCC	2	6	139737	139742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
588	NC_022221	AAG	2	6	139787	139792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_022221	CAG	2	6	141209	141214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_022221	TGCCT	2	10	141269	141278	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
591	NC_022221	CTT	2	6	143362	143367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_022221	GTGG	2	8	143373	143380	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
593	NC_022221	CG	3	6	143391	143396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
594	NC_022221	AAT	2	6	150926	150931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_022221	CGG	2	6	152664	152669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_022221	GCT	2	6	152700	152705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_022221	GCCT	2	8	152708	152715	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
598	NC_022221	GCG	2	6	152726	152731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_022221	CG	3	6	152822	152827	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
600	NC_022221	GAA	2	6	152851	152856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_022221	AGT	2	6	152937	152942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_022221	AGA	2	6	152943	152948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_022221	ATG	2	6	152987	152992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_022221	GAA	2	6	153052	153057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
605	NC_022221	TC	3	6	153117	153122	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
606	NC_022221	TGA	2	6	153123	153128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_022221	CTGCC	2	10	153141	153150	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
608	NC_022221	TC	3	6	153184	153189	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
609	NC_022221	CTG	2	6	153271	153276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_022221	GGC	2	6	153324	153329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_022221	GCC	2	6	155492	155497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
612	NC_022221	GA	4	8	155532	155539	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
613	NC_022221	CCG	2	6	156740	156745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
614	NC_022221	GAT	2	6	156793	156798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_022221	CAAA	2	8	156799	156806	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
616	NC_022221	AC	3	6	156847	156852	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
617	NC_022221	A	6	6	156857	156862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_022221	TCG	2	6	156910	156915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_022221	CT	3	6	157754	157759	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
620	NC_022221	T	8	8	157780	157787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_022221	CTG	2	6	157899	157904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_022221	A	6	6	158490	158495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_022221	CGCGG	2	10	158521	158530	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
624	NC_022221	ATT	2	6	161313	161318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_022221	T	6	6	161386	161391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_022221	CAA	2	6	161399	161404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_022221	GGCA	2	8	162853	162860	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
628	NC_022221	GGCT	2	8	162915	162922	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
629	NC_022221	CTA	2	6	165495	165500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_022221	A	7	7	165532	165538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_022221	CTGG	2	8	166686	166693	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
632	NC_022221	AAT	2	6	169889	169894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_022221	AGC	2	6	170904	170909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_022221	CAC	2	6	170916	170921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
635	NC_022221	TGC	2	6	172380	172385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_022221	AGT	2	6	176394	176399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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638	NC_022221	ATTT	2	8	176435	176442	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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776	NC_022221	CTG	2	6	207696	207701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
777	NC_022221	GTG	2	6	207748	207753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
778	NC_022221	TCG	3	9	207877	207885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
779	NC_022221	ATC	3	9	207888	207896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
780	NC_022221	TTG	2	6	207973	207978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
781	NC_022221	CTG	2	6	208002	208007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
782	NC_022221	TCT	2	6	208024	208029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
783	NC_022221	TCG	2	6	208129	208134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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785	NC_022221	GAC	2	6	208218	208223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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789	NC_022221	GTT	2	6	208458	208463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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793	NC_022221	TCG	2	6	208721	208726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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795	NC_022221	CGG	2	6	208832	208837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
796	NC_022221	TCG	2	6	208999	209004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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798	NC_022221	CGG	2	6	209088	209093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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803	NC_022221	TGC	2	6	209510	209515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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811	NC_022221	AT	4	8	211034	211041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
812	NC_022221	ATT	2	6	211049	211054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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819	NC_022221	A	7	7	211192	211198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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849	NC_022221	TAA	2	6	232103	232108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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852	NC_022221	A	7	7	232150	232156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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857	NC_022221	T	7	7	232251	232257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
858	NC_022221	T	7	7	232280	232286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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907	NC_022221	CGG	2	6	235202	235207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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909	NC_022221	CGG	2	6	235274	235279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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914	NC_022221	A	6	6	235521	235526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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917	NC_022221	ACA	2	6	235585	235590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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932	NC_022221	ATA	2	6	238193	238198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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949	NC_022221	GGC	2	6	239092	239097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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956	NC_022221	AGG	2	6	247988	247993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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958	NC_022221	GC	3	6	248040	248045	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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961	NC_022221	GCG	2	6	248107	248112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
962	NC_022221	GC	3	6	248143	248148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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964	NC_022221	ATG	2	6	248334	248339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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986	NC_022221	AC	3	6	249232	249237	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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989	NC_022221	CCA	2	6	249686	249691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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