MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 17980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_022221	TCT	2	6	2311365	2311370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9002	NC_022221	ATCAAT	2	12	2311469	2311480	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9003	NC_022221	CAT	2	6	2311490	2311495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9004	NC_022221	TTA	2	6	2311509	2311514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9005	NC_022221	TTA	2	6	2311525	2311530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9006	NC_022221	GTA	2	6	2311569	2311574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9007	NC_022221	CCA	2	6	2311600	2311605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9008	NC_022221	TTC	2	6	2311739	2311744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9009	NC_022221	CG	3	6	2311877	2311882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9010	NC_022221	CGT	2	6	2311916	2311921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9011	NC_022221	AGAA	2	8	2311925	2311932	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9012	NC_022221	CCG	2	6	2311941	2311946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9013	NC_022221	CGC	2	6	2312017	2312022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9014	NC_022221	CAG	3	9	2312033	2312041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9015	NC_022221	TGCT	2	8	2312054	2312061	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9016	NC_022221	GTT	2	6	2312080	2312085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9017	NC_022221	GCC	2	6	2312135	2312140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9018	NC_022221	AGG	2	6	2312161	2312166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9019	NC_022221	TCT	2	6	2312190	2312195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9020	NC_022221	CCACAA	2	12	2312233	2312244	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9021	NC_022221	ATT	2	6	2312261	2312266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9022	NC_022221	GCA	2	6	2312318	2312323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9023	NC_022221	GGTA	2	8	2312402	2312409	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9024	NC_022221	GCG	2	6	2312450	2312455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9025	NC_022221	A	6	6	2312463	2312468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9026	NC_022221	TAT	2	6	2312503	2312508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9027	NC_022221	CAC	2	6	2312516	2312521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9028	NC_022221	CAC	2	6	2312775	2312780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9029	NC_022221	T	7	7	2312785	2312791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9030	NC_022221	T	6	6	2312845	2312850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9031	NC_022221	TA	3	6	2312863	2312868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9032	NC_022221	CCT	2	6	2312945	2312950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9033	NC_022221	CGTG	2	8	2312993	2313000	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9034	NC_022221	GCTAT	2	10	2313006	2313015	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9035	NC_022221	ACC	2	6	2313028	2313033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9036	NC_022221	ACT	2	6	2313069	2313074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9037	NC_022221	GGA	2	6	2315670	2315675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9038	NC_022221	A	6	6	2319026	2319031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9039	NC_022221	A	7	7	2319045	2319051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9040	NC_022221	TGGGA	2	10	2319860	2319869	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
9041	NC_022221	CGC	2	6	2319917	2319922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9042	NC_022221	TAC	2	6	2319934	2319939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9043	NC_022221	CCG	2	6	2319948	2319953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9044	NC_022221	T	6	6	2320002	2320007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9045	NC_022221	ATT	2	6	2320024	2320029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9046	NC_022221	AGC	2	6	2320857	2320862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9047	NC_022221	TGCC	2	8	2325093	2325100	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9048	NC_022221	TAG	2	6	2325117	2325122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9049	NC_022221	T	7	7	2325128	2325134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9050	NC_022221	TCA	2	6	2325139	2325144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9051	NC_022221	CGT	2	6	2325149	2325154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9052	NC_022221	GTT	2	6	2326451	2326456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9053	NC_022221	T	7	7	2326458	2326464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9054	NC_022221	CT	3	6	2326814	2326819	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9055	NC_022221	T	6	6	2326819	2326824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9056	NC_022221	AT	3	6	2327532	2327537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9057	NC_022221	C	6	6	2327558	2327563	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9058	NC_022221	CTG	2	6	2327588	2327593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9059	NC_022221	GCC	2	6	2327596	2327601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9060	NC_022221	GGC	2	6	2327603	2327608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9061	NC_022221	ATG	2	6	2327627	2327632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9062	NC_022221	CTTAT	2	10	2327671	2327680	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9063	NC_022221	AT	3	6	2327695	2327700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9064	NC_022221	TAT	2	6	2327754	2327759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9065	NC_022221	ATA	2	6	2327762	2327767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9066	NC_022221	GAAT	2	8	2327769	2327776	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9067	NC_022221	ACGC	2	8	2328940	2328947	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9068	NC_022221	A	8	8	2329943	2329950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9069	NC_022221	T	7	7	2329966	2329972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9070	NC_022221	CTT	2	6	2330210	2330215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9071	NC_022221	CG	3	6	2330275	2330280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9072	NC_022221	CA	3	6	2330281	2330286	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9073	NC_022221	A	7	7	2330323	2330329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9074	NC_022221	CTC	2	6	2331175	2331180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9075	NC_022221	TAAA	2	8	2331193	2331200	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9076	NC_022221	CTT	2	6	2331220	2331225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9077	NC_022221	A	8	8	2331599	2331606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9078	NC_022221	CCG	2	6	2331608	2331613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9079	NC_022221	ACA	2	6	2331914	2331919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9080	NC_022221	TAAC	2	8	2331981	2331988	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9081	NC_022221	T	6	6	2332004	2332009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9082	NC_022221	ATA	2	6	2332644	2332649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9083	NC_022221	ACA	2	6	2332650	2332655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9084	NC_022221	AAT	2	6	2332693	2332698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9085	NC_022221	GA	3	6	2332701	2332706	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9086	NC_022221	TAA	2	6	2332758	2332763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9087	NC_022221	A	6	6	2332772	2332777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9088	NC_022221	CAA	2	6	2332792	2332797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9089	NC_022221	AATAA	2	10	2332805	2332814	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9090	NC_022221	TGA	2	6	2332873	2332878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9091	NC_022221	A	6	6	2332883	2332888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9092	NC_022221	GTC	2	6	2333030	2333035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9093	NC_022221	CCG	2	6	2336881	2336886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9094	NC_022221	ATTAA	2	10	2336895	2336904	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9095	NC_022221	A	6	6	2336907	2336912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9096	NC_022221	CAA	2	6	2337103	2337108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9097	NC_022221	ATG	2	6	2343896	2343901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9098	NC_022221	T	6	6	2343926	2343931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9099	NC_022221	ATC	2	6	2344923	2344928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9100	NC_022221	CGC	2	6	2344945	2344950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9101	NC_022221	ACT	2	6	2344989	2344994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9102	NC_022221	TGG	2	6	2347408	2347413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9103	NC_022221	CAT	2	6	2347464	2347469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9104	NC_022221	GGC	2	6	2350951	2350956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9105	NC_022221	GC	3	6	2350964	2350969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9106	NC_022221	TCC	2	6	2350986	2350991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9107	NC_022221	A	6	6	2351032	2351037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9108	NC_022221	AATA	2	8	2351627	2351634	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9109	NC_022221	A	6	6	2351665	2351670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9110	NC_022221	TCTT	2	8	2351699	2351706	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9111	NC_022221	A	7	7	2351711	2351717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9112	NC_022221	T	6	6	2351749	2351754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9113	NC_022221	AGA	2	6	2351776	2351781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9114	NC_022221	A	6	6	2351792	2351797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9115	NC_022221	TTA	2	6	2351805	2351810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9116	NC_022221	GAA	2	6	2351837	2351842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9117	NC_022221	CTT	2	6	2351951	2351956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9118	NC_022221	CT	3	6	2353533	2353538	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9119	NC_022221	CAT	3	9	2353544	2353552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9120	NC_022221	TGAAA	2	10	2353601	2353610	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9121	NC_022221	GGC	2	6	2353668	2353673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9122	NC_022221	AAGT	2	8	2353702	2353709	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9123	NC_022221	GAC	2	6	2353753	2353758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9125	NC_022221	GAG	2	6	2354353	2354358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9126	NC_022221	ATCAA	2	10	2354402	2354411	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
9127	NC_022221	TAAC	2	8	2354419	2354426	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9128	NC_022221	GCC	2	6	2354485	2354490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9129	NC_022221	GGC	2	6	2354496	2354501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9130	NC_022221	CAT	3	9	2354723	2354731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9132	NC_022221	ATT	2	6	2355689	2355694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9259	NC_022221	TGAAG	2	10	2403621	2403630	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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9265	NC_022221	CAT	2	6	2404605	2404610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9266	NC_022221	GGA	2	6	2404619	2404624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9267	NC_022221	TGG	2	6	2404630	2404635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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9269	NC_022221	T	6	6	2405707	2405712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9270	NC_022221	T	7	7	2405799	2405805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9273	NC_022221	TTA	2	6	2405865	2405870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9280	NC_022221	TAT	2	6	2406177	2406182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9282	NC_022221	GT	3	6	2406197	2406202	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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9297	NC_022221	CGG	2	6	2412897	2412902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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9391	NC_022221	TG	3	6	2431593	2431598	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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9395	NC_022221	CGT	2	6	2431759	2431764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9398	NC_022221	AAAT	2	8	2434741	2434748	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9399	NC_022221	ATAAA	2	10	2434749	2434758	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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